MICAS: Microsatellite Analysis Server

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Vibrio fischeri MJ11 chromosome I

Total Repeats: 1436

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011184	GATC	2	8	114	121	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
2	NC_011184	TCTT	2	8	133	140	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
3	NC_011184	TGGG	2	8	3928	3935	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
4	NC_011184	TTAA	2	8	4666	4673	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_011184	CTTG	2	8	6280	6287	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
6	NC_011184	GATG	2	8	6333	6340	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
7	NC_011184	GTAA	2	8	6341	6348	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
8	NC_011184	ACTT	2	8	6351	6358	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
9	NC_011184	ATTA	2	8	7400	7407	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_011184	AAAT	2	8	13728	13735	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_011184	TATT	2	8	14362	14369	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_011184	ATTG	2	8	15835	15842	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
13	NC_011184	TATT	2	8	15998	16005	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_011184	TGAA	2	8	21938	21945	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
15	NC_011184	TAGG	2	8	23011	23018	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
16	NC_011184	CTAA	2	8	24460	24467	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
17	NC_011184	TAGA	2	8	24712	24719	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
18	NC_011184	TTTG	2	8	28292	28299	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
19	NC_011184	ATTA	2	8	29021	29028	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_011184	GCAC	2	8	31187	31194	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
21	NC_011184	TAAT	2	8	34516	34523	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_011184	CACT	2	8	36600	36607	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
23	NC_011184	CTTT	2	8	36665	36672	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
24	NC_011184	ACAG	2	8	36920	36927	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
25	NC_011184	GCAA	2	8	36977	36984	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
26	NC_011184	TGAA	2	8	41484	41491	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
27	NC_011184	TTGA	2	8	46982	46989	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
28	NC_011184	TGAG	2	8	48416	48423	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
29	NC_011184	TTTA	2	8	53041	53048	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_011184	TTAT	2	8	55743	55750	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_011184	CTAC	2	8	61528	61535	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
32	NC_011184	TTTG	2	8	64050	64057	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
33	NC_011184	TAAT	2	8	76418	76425	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_011184	AAAT	2	8	76704	76711	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_011184	AATA	2	8	76749	76756	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_011184	GTTC	2	8	81557	81564	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
37	NC_011184	TAAA	2	8	81626	81633	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_011184	TAAA	2	8	81779	81786	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_011184	TTGA	2	8	83027	83034	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
40	NC_011184	TATC	2	8	86049	86056	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
41	NC_011184	ATTT	2	8	86456	86463	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_011184	ATTT	2	8	86497	86504	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_011184	ATAG	2	8	86567	86574	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
44	NC_011184	CTTA	2	8	86664	86671	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
45	NC_011184	TAAA	2	8	87613	87620	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_011184	AAGT	2	8	90228	90235	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
47	NC_011184	TATT	2	8	92032	92039	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_011184	ACTG	2	8	92678	92685	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
49	NC_011184	TGAT	2	8	94009	94016	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
50	NC_011184	TGGT	2	8	100534	100541	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
51	NC_011184	GAGT	2	8	100552	100559	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
52	NC_011184	GATT	2	8	112972	112979	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
53	NC_011184	GGAC	2	8	117678	117685	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
54	NC_011184	CTAG	2	8	117811	117818	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
55	NC_011184	CTAA	2	8	118805	118812	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
56	NC_011184	CTAG	2	8	121366	121373	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
57	NC_011184	TGAA	2	8	122148	122155	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
58	NC_011184	TTAA	2	8	122217	122224	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_011184	TGTA	2	8	123468	123475	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
60	NC_011184	AGGA	2	8	125394	125401	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
61	NC_011184	TAAA	2	8	126374	126381	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_011184	CAAT	2	8	127863	127870	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
63	NC_011184	AACC	2	8	128992	128999	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
64	NC_011184	CTTT	2	8	129064	129071	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
65	NC_011184	ACCA	2	8	129114	129121	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
66	NC_011184	AACC	2	8	130749	130756	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
67	NC_011184	TGCT	2	8	130923	130930	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
68	NC_011184	AACC	2	8	132873	132880	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
69	NC_011184	TAAT	2	8	133778	133785	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_011184	TTTA	2	8	134580	134587	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_011184	TGTT	2	8	137577	137584	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
72	NC_011184	ACTA	2	8	137607	137614	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
73	NC_011184	TACA	2	8	154519	154526	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
74	NC_011184	AGGA	2	8	158180	158187	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
75	NC_011184	GATT	2	8	160830	160837	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
76	NC_011184	ATTG	2	8	162216	162223	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
77	NC_011184	AAAG	2	8	162233	162240	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
78	NC_011184	AAGT	2	8	162279	162286	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
79	NC_011184	ATGA	2	8	162338	162345	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
80	NC_011184	ATGA	2	8	162384	162391	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
81	NC_011184	CTTT	2	8	162495	162502	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
82	NC_011184	TTTA	2	8	164159	164166	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_011184	AGAA	2	8	164532	164539	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
84	NC_011184	CTAG	2	8	164571	164578	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
85	NC_011184	ATTT	2	8	164638	164645	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_011184	AGAA	2	8	165427	165434	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
87	NC_011184	TAAT	2	8	168563	168570	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_011184	TTTA	2	8	169271	169278	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_011184	GTTT	2	8	169290	169297	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
90	NC_011184	AATG	2	8	169756	169763	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
91	NC_011184	TCAT	2	8	169944	169951	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
92	NC_011184	TTAA	2	8	171364	171371	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_011184	CTAA	2	8	172746	172753	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
94	NC_011184	AATA	2	8	174962	174969	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_011184	AGGT	2	8	181134	181141	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
96	NC_011184	TGAT	2	8	186786	186793	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
97	NC_011184	AAGT	2	8	186819	186826	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
98	NC_011184	ATTA	2	8	187099	187106	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_011184	TTTA	2	8	187390	187397	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_011184	TAAT	2	8	188461	188468	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_011184	AATA	2	8	188837	188844	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_011184	TAAA	2	8	201359	201366	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_011184	ATTT	2	8	201378	201385	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_011184	ATGA	2	8	202523	202530	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
105	NC_011184	ATAG	2	8	203718	203725	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
106	NC_011184	GGAC	2	8	210908	210915	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
107	NC_011184	AACC	2	8	211037	211044	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
108	NC_011184	CTTT	2	8	211178	211185	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
109	NC_011184	AATA	2	8	215192	215199	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_011184	GGAC	2	8	215273	215280	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
111	NC_011184	TAGT	2	8	215569	215576	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
112	NC_011184	CAAT	2	8	217220	217227	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
113	NC_011184	TAAA	2	8	217640	217647	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_011184	AAAT	2	8	220559	220566	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_011184	CTGA	2	8	230026	230033	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
116	NC_011184	GATA	2	8	230109	230116	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
117	NC_011184	AAGC	2	8	235980	235987	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
118	NC_011184	TAAA	2	8	237117	237124	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_011184	TAAG	2	8	238332	238339	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
120	NC_011184	AGGA	2	8	241207	241214	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
121	NC_011184	GTTT	2	8	242497	242504	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
122	NC_011184	AATC	2	8	242743	242750	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
123	NC_011184	TTGT	2	8	242787	242794	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
124	NC_011184	TATT	2	8	242796	242803	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_011184	AGTA	2	8	243783	243790	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
126	NC_011184	TTTA	2	8	247827	247834	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_011184	TAAA	2	8	255040	255047	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_011184	ATTT	2	8	257620	257627	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_011184	ATTC	2	8	257657	257664	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
130	NC_011184	AATT	2	8	263495	263502	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_011184	TATT	2	8	270469	270476	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_011184	TATT	2	8	271687	271694	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_011184	TAAA	2	8	271782	271789	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_011184	GAAC	2	8	272685	272692	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
135	NC_011184	GAAA	2	8	273694	273701	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
136	NC_011184	TTTA	2	8	275590	275597	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_011184	TTAA	2	8	275737	275744	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_011184	TGTT	2	8	285545	285552	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
139	NC_011184	TTAT	2	8	290759	290766	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_011184	AGTA	2	8	292547	292554	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
141	NC_011184	TAAT	2	8	292686	292693	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_011184	AATT	2	8	292714	292721	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_011184	TAAT	2	8	292749	292756	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_011184	TCGG	2	8	304668	304675	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
145	NC_011184	CTTG	2	8	304718	304725	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
146	NC_011184	GTGA	2	8	305412	305419	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
147	NC_011184	TTCT	2	8	308338	308345	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
148	NC_011184	TTAG	2	8	318995	319002	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
149	NC_011184	TGAA	2	8	319058	319065	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
150	NC_011184	AAGG	2	8	320179	320186	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
151	NC_011184	TTAG	2	8	325211	325218	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
152	NC_011184	TTTA	2	8	325239	325246	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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155	NC_011184	TGCT	2	8	336202	336209	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
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158	NC_011184	GACA	2	8	337357	337364	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
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161	NC_011184	TGAC	2	8	339003	339010	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
162	NC_011184	GTAC	2	8	339086	339093	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
163	NC_011184	AGTA	2	8	339488	339495	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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171	NC_011184	GTAC	2	8	344048	344055	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
172	NC_011184	AGTA	2	8	344450	344457	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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192	NC_011184	ATTA	2	8	428265	428272	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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500	NC_011184	AATG	2	8	1083739	1083746	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding

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