MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Vibrio harveyi ATCC BAA-1116 chromosome I

Total Repeats: 119

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009783	GTTTTA	2	12	7893	7904	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
2	NC_009783	TCTTTC	2	12	15330	15341	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_009783	GTATCA	2	12	18179	18190	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_009783	GCATAG	2	12	59415	59426	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
5	NC_009783	CTTTTT	2	12	74890	74901	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_009783	TATTCA	2	12	125332	125343	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
7	NC_009783	CTCACA	2	12	128904	128915	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
8	NC_009783	CATTAA	2	12	150400	150411	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_009783	ATTATC	2	12	162160	162171	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_009783	ATTTCA	2	12	191941	191952	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_009783	ATTTCA	2	12	197562	197573	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_009783	CAAAAA	2	12	214841	214852	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_009783	ATTTCA	2	12	244399	244410	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_009783	ATTTCA	2	12	312725	312736	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_009783	TGAATT	2	12	359390	359401	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
16	NC_009783	ATTTCA	2	12	360686	360697	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
17	NC_009783	CAAAAA	2	12	418449	418460	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
18	NC_009783	GAAAAA	2	12	432299	432310	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
19	NC_009783	TGAAAT	2	12	453893	453904	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
20	NC_009783	AATTCA	2	12	455159	455170	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_009783	TAAAAT	2	12	499766	499777	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_009783	TGAGTG	2	12	551998	552009	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
23	NC_009783	CAACCA	2	12	619799	619810	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
24	NC_009783	GTGCTA	2	12	667396	667407	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
25	NC_009783	GTAGAA	4	24	671200	671223	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_009783	GTTGAA	2	12	671230	671241	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27	NC_009783	CTACTG	2	12	671291	671302	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_009783	ATTGTT	2	12	736323	736334	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
29	NC_009783	GAATAA	2	12	829569	829580	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
30	NC_009783	TGACGT	2	12	884593	884604	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
31	NC_009783	ACGCAA	2	12	901822	901833	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_009783	CTAGTT	2	12	949704	949715	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
33	NC_009783	ACCTTT	2	12	951661	951672	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_009783	TCAAGT	2	12	1019731	1019742	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
35	NC_009783	TGAAAT	2	12	1024388	1024399	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
36	NC_009783	TATTAG	2	12	1049297	1049308	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
37	NC_009783	CTGACA	2	12	1073164	1073175	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_009783	ATTACA	2	12	1214976	1214987	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
39	NC_009783	AAAATA	2	12	1221861	1221872	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_009783	TCTCGT	2	12	1253932	1253943	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_009783	CTCTTT	2	12	1282633	1282644	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_009783	GAGATG	2	12	1291058	1291069	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
43	NC_009783	CTTTCT	2	12	1302819	1302830	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_009783	AAGATT	2	12	1355939	1355950	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
45	NC_009783	TGATAT	2	12	1408282	1408293	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
46	NC_009783	TTTTAT	2	12	1440912	1440923	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_009783	AATCAT	2	12	1453600	1453611	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
48	NC_009783	TATGAG	2	12	1459837	1459848	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49	NC_009783	TTAAGG	2	12	1497798	1497809	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50	NC_009783	GGGTGA	2	12	1520842	1520853	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
51	NC_009783	GTTTCT	2	12	1524956	1524967	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
52	NC_009783	AGTAAG	2	12	1532448	1532459	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53	NC_009783	TTTGTA	2	12	1601216	1601227	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
54	NC_009783	AGAGCA	2	12	1623300	1623311	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
55	NC_009783	ATCAAA	2	12	1632025	1632036	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
56	NC_009783	ATTAAA	2	12	1646135	1646146	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_009783	TTTAAA	2	12	1674001	1674012	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_009783	GAAATG	2	12	1674755	1674766	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59	NC_009783	AATAAA	2	12	1758137	1758148	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_009783	ACAAAA	2	12	1769712	1769723	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
61	NC_009783	TTTAGG	2	12	1784713	1784724	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
62	NC_009783	TTTAGG	2	12	1786327	1786338	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
63	NC_009783	TGAGCT	2	12	1806199	1806210	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
64	NC_009783	TTGAAA	2	12	1867661	1867672	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
65	NC_009783	ACATAA	2	12	1940625	1940636	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
66	NC_009783	TGCGAA	2	12	2023721	2023732	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
67	NC_009783	TGATTT	2	12	2034190	2034201	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
68	NC_009783	TAAGAG	2	12	2099573	2099584	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
69	NC_009783	CTTTGT	2	12	2118023	2118034	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
70	NC_009783	CGTTAA	2	12	2165481	2165492	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
71	NC_009783	TTTAAT	2	12	2190921	2190932	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_009783	ACCTCA	2	12	2197882	2197893	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
73	NC_009783	TATCGC	2	12	2219167	2219178	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_009783	GAGTTG	2	12	2234741	2234752	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
75	NC_009783	TGCAGA	2	12	2235436	2235447	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
76	NC_009783	TTAGAG	2	12	2239483	2239494	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
77	NC_009783	TTTAAA	2	12	2298510	2298521	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_009783	CAAAAA	2	12	2396821	2396832	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
79	NC_009783	AAATAC	2	12	2448077	2448088	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
80	NC_009783	TGATAA	2	12	2457172	2457183	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
81	NC_009783	TTGAAA	2	12	2463633	2463644	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
82	NC_009783	AAAAAC	2	12	2487257	2487268	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
83	NC_009783	TATACA	2	12	2553443	2553454	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
84	NC_009783	ATTGTT	4	24	2631676	2631699	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
85	NC_009783	AACCCA	2	12	2639680	2639691	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
86	NC_009783	CAAAAA	2	12	2685188	2685199	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
87	NC_009783	AGCAAA	2	12	2694163	2694174	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
88	NC_009783	GATACA	2	12	2749915	2749926	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
89	NC_009783	TTCATT	2	12	2767292	2767303	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
90	NC_009783	TATTTT	2	12	2768084	2768095	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_009783	CCTAAG	2	12	2815434	2815445	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_009783	TGAAAA	2	12	2874359	2874370	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
93	NC_009783	CTTTCA	2	12	2916049	2916060	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_009783	GCATGA	2	12	2928187	2928198	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
95	NC_009783	TAAGAA	2	12	2957999	2958010	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
96	NC_009783	CTGAGG	2	12	3005903	3005914	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
97	NC_009783	TGAAAG	2	12	3018626	3018637	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
98	NC_009783	CATTAA	2	12	3042808	3042819	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
99	NC_009783	GAACAG	2	12	3045706	3045717	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
100	NC_009783	ACCTAA	2	12	3076127	3076138	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_009783	CCACAA	2	12	3136710	3136721	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
102	NC_009783	TAAAAA	2	12	3165527	3165538	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_009783	AGGTTT	2	12	3206052	3206063	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
104	NC_009783	TGTCTG	2	12	3213079	3213090	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
105	NC_009783	TTTAGT	2	12	3216517	3216528	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
106	NC_009783	TTTACA	2	12	3318960	3318971	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
107	NC_009783	CTTTTT	2	12	3349104	3349115	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
108	NC_009783	CTTTTT	2	12	3359351	3359362	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
109	NC_009783	AAGATA	14	84	3378225	3378308	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
110	NC_009783	AGTTAT	2	12	3422113	3422124	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
111	NC_009783	TTTTTA	2	12	3456654	3456665	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_009783	ATTTCA	2	12	3647553	3647564	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
113	NC_009783	ATTTAT	2	12	3659105	3659116	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_009783	TGAATT	2	12	3661858	3661869	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
115	NC_009783	CTTAAT	2	12	3663303	3663314	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
116	NC_009783	CAGCTA	2	12	3683825	3683836	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_009783	AATAAA	2	12	3703622	3703633	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_009783	AGATAA	2	12	3759454	3759465	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
119	NC_009783	ATTTCA	2	12	3761110	3761121	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.