MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Vibrio harveyi ATCC BAA-1116 plasmid pVIBHAR

Total Repeats: 50

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009777	TTCT	2	8	1546	1553	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
2	NC_009777	GTTG	2	8	4529	4536	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3	NC_009777	GTAT	2	8	5959	5966	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4	NC_009777	GGTA	2	8	6162	6169	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
5	NC_009777	AATT	2	8	11645	11652	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_009777	TTTA	2	8	11674	11681	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_009777	ATCA	2	8	16215	16222	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
8	NC_009777	ATCA	2	8	18482	18489	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
9	NC_009777	TCAC	2	8	19169	19176	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
10	NC_009777	TCAT	2	8	27034	27041	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
11	NC_009777	CATT	2	8	27137	27144	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
12	NC_009777	TAAC	2	8	27149	27156	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
13	NC_009777	CTTT	2	8	27446	27453	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
14	NC_009777	TAAG	2	8	29346	29353	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
15	NC_009777	TCAG	2	8	29514	29521	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
16	NC_009777	ACCA	2	8	35571	35578	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
17	NC_009777	ATAA	2	8	47631	47638	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_009777	AAAT	2	8	47651	47658	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_009777	TTTC	2	8	49111	49118	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
20	NC_009777	AATA	2	8	49289	49296	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_009777	AATA	2	8	49301	49308	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_009777	CAGC	2	8	49407	49414	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
23	NC_009777	GCTG	2	8	49453	49460	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
24	NC_009777	GAAG	2	8	52344	52351	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
25	NC_009777	TTAG	2	8	52785	52792	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
26	NC_009777	AGTT	2	8	52899	52906	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
27	NC_009777	CAAC	2	8	52955	52962	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
28	NC_009777	TTTG	2	8	53696	53703	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
29	NC_009777	TATG	3	12	53704	53715	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
30	NC_009777	GTTT	2	8	53719	53726	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
31	NC_009777	ACAA	2	8	53743	53750	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
32	NC_009777	CGTT	2	8	55404	55411	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
33	NC_009777	TAAG	2	8	58603	58610	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
34	NC_009777	TAAA	2	8	58776	58783	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_009777	AACG	2	8	59990	59997	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
36	NC_009777	TGAG	2	8	62092	62099	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
37	NC_009777	GCTA	2	8	62133	62140	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
38	NC_009777	AGAA	2	8	64221	64228	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
39	NC_009777	TAGG	2	8	64535	64542	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
40	NC_009777	TGAT	2	8	66166	66173	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
41	NC_009777	CAAT	2	8	66191	66198	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
42	NC_009777	CTGT	2	8	66222	66229	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
43	NC_009777	GGTT	2	8	66232	66239	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
44	NC_009777	CTAA	2	8	66328	66335	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
45	NC_009777	CACC	2	8	66493	66500	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
46	NC_009777	CGCA	2	8	66671	66678	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
47	NC_009777	GATT	2	8	74303	74310	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
48	NC_009777	TGAT	2	8	81705	81712	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
49	NC_009777	AGAA	2	8	84162	84169	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
50	NC_009777	GATA	2	8	87256	87263	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.