MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Vibrio cholerae O395 chromosome 2

Total Repeats: 7045

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_009457	AAC	2	6	1411465	1411470	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3002	NC_009457	TTCTT	2	10	1411474	1411483	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
3003	NC_009457	CA	3	6	1411540	1411545	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3004	NC_009457	AGCC	2	8	1412246	1412253	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
3005	NC_009457	TATC	2	8	1412259	1412266	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3006	NC_009457	AATT	2	8	1412327	1412334	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3007	NC_009457	TGAA	2	8	1412356	1412363	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3008	NC_009457	GA	3	6	1412377	1412382	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3009	NC_009457	ATCC	2	8	1412396	1412403	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
3010	NC_009457	CGG	2	6	1412445	1412450	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3011	NC_009457	T	6	6	1412457	1412462	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3012	NC_009457	TTA	2	6	1412475	1412480	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3013	NC_009457	TACG	2	8	1412507	1412514	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3014	NC_009457	CTG	2	6	1412575	1412580	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3015	NC_009457	GCA	2	6	1412607	1412612	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3016	NC_009457	TAT	2	6	1413717	1413722	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3017	NC_009457	TAG	2	6	1413723	1413728	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3018	NC_009457	AGA	2	6	1413858	1413863	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3019	NC_009457	GGTA	2	8	1413867	1413874	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
3020	NC_009457	TCA	2	6	1413914	1413919	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3021	NC_009457	ATGC	2	8	1413932	1413939	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3022	NC_009457	TGG	2	6	1413966	1413971	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3023	NC_009457	TCA	2	6	1414604	1414609	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3024	NC_009457	ATC	2	6	1414619	1414624	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3025	NC_009457	AC	3	6	1414635	1414640	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3026	NC_009457	T	7	7	1414676	1414682	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3027	NC_009457	GAAA	2	8	1414683	1414690	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
3028	NC_009457	CT	3	6	1414721	1414726	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3029	NC_009457	CGG	2	6	1414804	1414809	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3030	NC_009457	TG	3	6	1414814	1414819	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3031	NC_009457	GAA	2	6	1414856	1414861	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3032	NC_009457	AGGA	2	8	1415657	1415664	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3033	NC_009457	C	6	6	1416855	1416860	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
3034	NC_009457	A	6	6	1416889	1416894	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3035	NC_009457	GA	3	6	1416912	1416917	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3036	NC_009457	CTG	2	6	1416957	1416962	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3037	NC_009457	TGT	2	6	1419664	1419669	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3038	NC_009457	CAGC	2	8	1419766	1419773	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
3039	NC_009457	CCT	2	6	1419978	1419983	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3040	NC_009457	ATA	2	6	1419986	1419991	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3041	NC_009457	ATG	2	6	1419995	1420000	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3042	NC_009457	GAA	2	6	1420008	1420013	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3043	NC_009457	TAG	2	6	1420152	1420157	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3044	NC_009457	TGA	3	9	1420205	1420213	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3045	NC_009457	TTGA	2	8	1420305	1420312	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3046	NC_009457	TCA	2	6	1422978	1422983	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3047	NC_009457	T	8	8	1423026	1423033	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3048	NC_009457	AAG	2	6	1423052	1423057	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3049	NC_009457	T	6	6	1423067	1423072	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3050	NC_009457	CGA	2	6	1423101	1423106	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3051	NC_009457	TGT	2	6	1423109	1423114	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3052	NC_009457	CTG	2	6	1423116	1423121	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3053	NC_009457	ACG	2	6	1423172	1423177	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3054	NC_009457	T	6	6	1423567	1423572	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3055	NC_009457	CGC	2	6	1426625	1426630	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3056	NC_009457	CAA	2	6	1426940	1426945	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3057	NC_009457	TTTTG	2	10	1426968	1426977	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
3058	NC_009457	ATCA	2	8	1426989	1426996	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3059	NC_009457	GCT	2	6	1427127	1427132	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3060	NC_009457	CTG	2	6	1427151	1427156	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3061	NC_009457	A	6	6	1427180	1427185	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3062	NC_009457	TAAGA	2	10	1427206	1427215	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
3063	NC_009457	A	6	6	1428445	1428450	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3064	NC_009457	TCG	2	6	1428451	1428456	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3065	NC_009457	TC	3	6	1428494	1428499	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3066	NC_009457	A	6	6	1428563	1428568	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3067	NC_009457	TCAA	2	8	1428570	1428577	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3068	NC_009457	TGA	2	6	1428597	1428602	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3069	NC_009457	TATTT	2	10	1428619	1428628	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
3070	NC_009457	GCA	2	6	1431708	1431713	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3071	NC_009457	A	7	7	1431732	1431738	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3072	NC_009457	AAT	2	6	1431745	1431750	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3073	NC_009457	GCT	2	6	1431866	1431871	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3074	NC_009457	TTA	2	6	1431881	1431886	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3075	NC_009457	ATC	2	6	1435492	1435497	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3076	NC_009457	A	6	6	1435523	1435528	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3077	NC_009457	TAT	2	6	1435566	1435571	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3078	NC_009457	ATCA	2	8	1435621	1435628	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3079	NC_009457	CTG	2	6	1435669	1435674	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3080	NC_009457	CAA	2	6	1439671	1439676	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3081	NC_009457	CGG	2	6	1439724	1439729	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3082	NC_009457	CAC	2	6	1439758	1439763	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3083	NC_009457	GCT	2	6	1439796	1439801	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3084	NC_009457	TTGAT	2	10	1439850	1439859	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
3085	NC_009457	TTG	2	6	1439881	1439886	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3086	NC_009457	TTGA	2	8	1439926	1439933	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3087	NC_009457	CT	3	6	1439938	1439943	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3088	NC_009457	TCT	2	6	1439949	1439954	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3089	NC_009457	ACT	2	6	1439980	1439985	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3090	NC_009457	CCAA	2	8	1439989	1439996	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3091	NC_009457	AG	3	6	1440064	1440069	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3092	NC_009457	GTT	2	6	1440156	1440161	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3093	NC_009457	CGA	2	6	1440177	1440182	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3094	NC_009457	T	6	6	1440201	1440206	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3095	NC_009457	T	7	7	1440245	1440251	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3096	NC_009457	TTGC	2	8	1440291	1440298	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
3097	NC_009457	AT	3	6	1440323	1440328	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3098	NC_009457	AGT	3	9	1440391	1440399	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3099	NC_009457	AAT	2	6	1440461	1440466	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3100	NC_009457	TCA	2	6	1440534	1440539	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3101	NC_009457	ATAA	2	8	1440701	1440708	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3102	NC_009457	ATG	2	6	1444316	1444321	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3103	NC_009457	TGG	2	6	1444340	1444345	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3104	NC_009457	TGCC	2	8	1444352	1444359	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3105	NC_009457	GAG	2	6	1444434	1444439	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3106	NC_009457	AC	3	6	1444442	1444447	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3107	NC_009457	CCAA	2	8	1448617	1448624	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3108	NC_009457	TTA	2	6	1448644	1448649	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3109	NC_009457	T	7	7	1448727	1448733	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3110	NC_009457	GT	3	6	1448844	1448849	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3111	NC_009457	TC	3	6	1448876	1448881	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3112	NC_009457	T	6	6	1448923	1448928	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3113	NC_009457	TAG	2	6	1448966	1448971	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3114	NC_009457	CCA	2	6	1449096	1449101	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3115	NC_009457	AGT	2	6	1449129	1449134	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3116	NC_009457	T	6	6	1449157	1449162	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3117	NC_009457	AGT	2	6	1450445	1450450	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3118	NC_009457	AC	3	6	1450452	1450457	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3119	NC_009457	ATTG	2	8	1450495	1450502	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3120	NC_009457	GCT	2	6	1450998	1451003	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3122	NC_009457	TTC	2	6	1458875	1458880	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3123	NC_009457	GTT	2	6	1461962	1461967	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3124	NC_009457	TGA	2	6	1461973	1461978	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3125	NC_009457	TCT	2	6	1469118	1469123	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3126	NC_009457	AAT	2	6	1469152	1469157	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3127	NC_009457	GAT	2	6	1469161	1469166	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3128	NC_009457	TAG	2	6	1469195	1469200	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3129	NC_009457	CATT	2	8	1475869	1475876	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3130	NC_009457	A	6	6	1475907	1475912	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3131	NC_009457	TTA	2	6	1478163	1478168	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3132	NC_009457	TTC	2	6	1478239	1478244	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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