MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Vibrio cholerae O395 chromosome 1

Total Repeats: 2897

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_009456	GCA	3	9	439442	439450	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1002	NC_009456	AAT	2	6	439644	439649	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1003	NC_009456	AT	3	6	439656	439661	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1004	NC_009456	TAG	2	6	439669	439674	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1005	NC_009456	TGA	2	6	439681	439686	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1006	NC_009456	T	6	6	439775	439780	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1007	NC_009456	AG	3	6	439877	439882	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1008	NC_009456	A	6	6	439883	439888	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1009	NC_009456	GCT	2	6	439913	439918	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1010	NC_009456	TAC	2	6	439983	439988	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1011	NC_009456	GTT	2	6	440022	440027	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1012	NC_009456	TC	3	6	440692	440697	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1013	NC_009456	TGT	2	6	440698	440703	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1014	NC_009456	CTT	2	6	440790	440795	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1015	NC_009456	TTTGT	2	10	440871	440880	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
1016	NC_009456	ATTT	2	8	440894	440901	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1017	NC_009456	TAA	2	6	440933	440938	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1018	NC_009456	CAG	2	6	440991	440996	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1019	NC_009456	TAA	2	6	441109	441114	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1020	NC_009456	CAG	2	6	441234	441239	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1021	NC_009456	CT	3	6	441858	441863	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1022	NC_009456	TC	3	6	441914	441919	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1023	NC_009456	TCT	2	6	441925	441930	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1024	NC_009456	GCA	2	6	443374	443379	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1025	NC_009456	ACG	2	6	446031	446036	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1026	NC_009456	AGA	2	6	446037	446042	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1027	NC_009456	AAAT	2	8	446064	446071	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1028	NC_009456	TTAA	2	8	446089	446096	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1029	NC_009456	AGG	3	9	446145	446153	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1030	NC_009456	ATA	2	6	447066	447071	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1031	NC_009456	TGC	2	6	447086	447091	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1032	NC_009456	T	6	6	447861	447866	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1033	NC_009456	CGTT	2	8	447916	447923	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1034	NC_009456	TCTA	2	8	447940	447947	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1035	NC_009456	CT	3	6	447960	447965	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1036	NC_009456	GCC	2	6	447971	447976	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1037	NC_009456	GTT	2	6	447992	447997	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1038	NC_009456	TCAT	2	8	448024	448031	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1039	NC_009456	CTT	2	6	448104	448109	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1040	NC_009456	ATT	2	6	451469	451474	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1041	NC_009456	GTT	2	6	452736	452741	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1042	NC_009456	A	6	6	452756	452761	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1043	NC_009456	AAC	2	6	452818	452823	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1044	NC_009456	TTAA	2	8	452849	452856	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1045	NC_009456	TG	3	6	452908	452913	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1046	NC_009456	ATCC	2	8	453009	453016	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1047	NC_009456	T	6	6	453257	453262	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1048	NC_009456	TATT	2	8	453276	453283	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1049	NC_009456	GTT	2	6	453355	453360	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1050	NC_009456	TTG	2	6	457078	457083	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1051	NC_009456	A	6	6	457102	457107	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1052	NC_009456	CCT	2	6	457361	457366	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1053	NC_009456	TCC	2	6	458988	458993	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1054	NC_009456	TGC	2	6	458997	459002	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1055	NC_009456	CCT	2	6	459308	459313	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1056	NC_009456	CAAT	2	8	459391	459398	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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1058	NC_009456	T	6	6	459478	459483	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1059	NC_009456	TGTA	2	8	461451	461458	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1060	NC_009456	AAC	2	6	461468	461473	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1061	NC_009456	GTTG	2	8	461502	461509	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1062	NC_009456	GAAT	2	8	461545	461552	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1063	NC_009456	TAAC	2	8	461713	461720	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1064	NC_009456	ATT	2	6	461738	461743	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1065	NC_009456	AC	3	6	461752	461757	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1066	NC_009456	GA	3	6	464723	464728	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1067	NC_009456	T	6	6	464736	464741	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1068	NC_009456	GTTC	2	8	464782	464789	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1069	NC_009456	TCTA	2	8	464805	464812	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1070	NC_009456	TCAC	2	8	464826	464833	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1071	NC_009456	GTT	2	6	464857	464862	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1073	NC_009456	GTT	2	6	467875	467880	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1077	NC_009456	TC	3	6	467984	467989	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1078	NC_009456	ACG	2	6	468002	468007	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1080	NC_009456	GGT	2	6	468023	468028	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1081	NC_009456	GCT	2	6	468069	468074	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1082	NC_009456	GAA	2	6	468097	468102	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1083	NC_009456	A	6	6	468130	468135	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1084	NC_009456	GAT	2	6	468156	468161	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1091	NC_009456	TAA	2	6	471826	471831	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1092	NC_009456	AAT	2	6	471832	471837	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1093	NC_009456	TTG	2	6	471871	471876	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1095	NC_009456	CAA	2	6	472674	472679	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1096	NC_009456	TG	4	8	472721	472728	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1097	NC_009456	GAA	2	6	472738	472743	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1098	NC_009456	GTA	2	6	472771	472776	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1099	NC_009456	A	7	7	473653	473659	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1100	NC_009456	GAA	2	6	474247	474252	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1101	NC_009456	TGAA	2	8	474260	474267	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1102	NC_009456	T	6	6	476326	476331	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1103	NC_009456	TAC	2	6	476379	476384	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1104	NC_009456	TTTA	2	8	476415	476422	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1105	NC_009456	TGA	2	6	476509	476514	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1106	NC_009456	T	7	7	476533	476539	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1107	NC_009456	AAT	2	6	476552	476557	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1108	NC_009456	CA	3	6	478632	478637	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1109	NC_009456	T	6	6	478677	478682	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1110	NC_009456	TTTCA	2	10	478701	478710	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
1111	NC_009456	ATAA	2	8	478732	478739	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1112	NC_009456	CAAT	2	8	478746	478753	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1113	NC_009456	GT	3	6	479780	479785	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1114	NC_009456	AT	3	6	479831	479836	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1115	NC_009456	AC	3	6	479837	479842	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1116	NC_009456	AAG	2	6	481844	481849	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1117	NC_009456	CTT	2	6	481865	481870	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1118	NC_009456	A	6	6	483228	483233	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1119	NC_009456	CAT	2	6	483242	483247	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1121	NC_009456	GC	3	6	483864	483869	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1122	NC_009456	CAT	2	6	483964	483969	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1123	NC_009456	TCA	2	6	484025	484030	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1124	NC_009456	TGA	2	6	484061	484066	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1127	NC_009456	AGA	2	6	484119	484124	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1128	NC_009456	GGA	2	6	484765	484770	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1129	NC_009456	T	6	6	485498	485503	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1130	NC_009456	TCAC	2	8	485562	485569	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1131	NC_009456	CGG	2	6	485583	485588	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1132	NC_009456	AAT	2	6	485621	485626	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1133	NC_009456	AACG	2	8	485638	485645	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1134	NC_009456	CAG	2	6	485887	485892	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1135	NC_009456	A	6	6	485894	485899	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1136	NC_009456	TTG	2	6	485983	485988	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1138	NC_009456	GCT	2	6	486050	486055	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1413	NC_009456	AAT	2	6	607899	607904	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1414	NC_009456	TA	3	6	607911	607916	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1415	NC_009456	GAT	2	6	608477	608482	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1417	NC_009456	TAG	2	6	610481	610486	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1419	NC_009456	GCC	2	6	611857	611862	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1420	NC_009456	AGT	2	6	611877	611882	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1424	NC_009456	GC	3	6	617340	617345	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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1433	NC_009456	CTT	2	6	618833	618838	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1444	NC_009456	GTG	2	6	624624	624629	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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1452	NC_009456	ACT	2	6	626669	626674	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1453	NC_009456	CTAG	2	8	626712	626719	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1454	NC_009456	TC	3	6	629300	629305	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1455	NC_009456	ATG	2	6	629803	629808	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1485	NC_009456	AT	3	6	652071	652076	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1486	NC_009456	TCAGG	2	10	653127	653136	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
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1489	NC_009456	GCA	2	6	653262	653267	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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