MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Vibrio fischeri ES114 plasmid pES100

Total Repeats: 62

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_006842	TTA	2	6	347	352	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_006842	ATA	2	6	378	383	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_006842	TAC	2	6	394	399	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_006842	AGT	2	6	430	435	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_006842	GAG	2	6	509	514	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6	NC_006842	GAA	2	6	600	605	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_006842	TCA	2	6	649	654	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_006842	TCG	3	9	1674	1682	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_006842	AAT	2	6	1818	1823	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_006842	AGG	2	6	1980	1985	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11	NC_006842	ACG	2	6	1992	1997	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_006842	GAT	2	6	2047	2052	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13	NC_006842	CAG	2	6	2229	2234	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_006842	AGC	2	6	3714	3719	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_006842	TTC	2	6	4521	4526	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_006842	GCG	2	6	5014	5019	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_006842	AAT	2	6	5103	5108	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_006842	AGG	2	6	5252	5257	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
19	NC_006842	ACG	2	6	5264	5269	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_006842	ATT	3	9	5333	5341	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_006842	CAA	2	6	5493	5498	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_006842	CGG	2	6	5551	5556	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_006842	TAA	2	6	5590	5595	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_006842	ATA	2	6	5652	5657	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_006842	TGA	2	6	6071	6076	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_006842	GGC	2	6	7401	7406	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_006842	AAC	2	6	8764	8769	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_006842	GAT	2	6	9883	9888	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29	NC_006842	TCT	2	6	10135	10140	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_006842	GAG	2	6	10159	10164	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
31	NC_006842	ATT	2	6	10232	10237	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_006842	GCA	2	6	10278	10283	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_006842	ACT	2	6	10332	10337	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_006842	CAA	2	6	10380	10385	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_006842	ATG	2	6	10409	10414	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36	NC_006842	ATT	2	6	10429	10434	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_006842	TCA	2	6	11344	11349	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_006842	CAA	2	6	11526	11531	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_006842	GTA	2	6	11653	11658	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40	NC_006842	TAT	2	6	12353	12358	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_006842	AAT	2	6	12378	12383	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_006842	GCT	2	6	12739	12744	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_006842	TTA	2	6	12795	12800	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_006842	CAG	2	6	12824	12829	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_006842	TTA	2	6	12886	12891	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_006842	ATC	2	6	12924	12929	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_006842	AGG	2	6	23485	23490	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
48	NC_006842	CTC	2	6	23496	23501	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
49	NC_006842	ACA	2	6	24849	24854	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_006842	CAA	2	6	25614	25619	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_006842	TAT	2	6	32643	32648	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_006842	ATC	2	6	32693	32698	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_006842	GAA	2	6	34540	34545	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54	NC_006842	TTC	2	6	36956	36961	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_006842	CCT	2	6	36962	36967	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
56	NC_006842	ACG	2	6	37552	37557	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_006842	AGT	2	6	41773	41778	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58	NC_006842	GTA	2	6	41832	41837	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59	NC_006842	CGT	2	6	41855	41860	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_006842	TCC	2	6	43886	43891	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
61	NC_006842	GCC	2	6	43994	43999	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
62	NC_006842	TTG	2	6	44030	44035	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.