MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Vibrio fischeri ES114 chromosome I

Total Repeats: 146

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_006840	ATAACT	2	12	219	230	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_006840	TTATTT	2	12	13654	13665	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_006840	ATATAA	2	12	32283	32294	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_006840	TGATCA	2	12	57930	57941	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
5	NC_006840	AAAAGC	2	12	58660	58671	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_006840	TTTGAT	2	12	89839	89850	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
7	NC_006840	AAGAGC	2	12	119881	119892	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_006840	AAGAGC	2	12	121208	121219	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_006840	AATTAA	2	12	158520	158531	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_006840	TATAAC	2	12	172021	172032	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_006840	CATAAC	2	12	172340	172351	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_006840	AAAAGC	2	12	181066	181077	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_006840	TAAAAT	2	12	184838	184849	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_006840	TAAATA	2	12	208174	208185	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_006840	TTCACT	2	12	230514	230525	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_006840	AGTATA	2	12	309315	309326	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
17	NC_006840	GATGGA	2	12	309381	309392	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
18	NC_006840	TGAAAT	2	12	350786	350797	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
19	NC_006840	TTGAAT	2	12	351892	351903	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
20	NC_006840	TGAAAT	2	12	356372	356383	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
21	NC_006840	TAAAAA	2	12	417465	417476	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_006840	CTTTTT	2	12	432574	432585	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_006840	CTAGTA	2	12	447635	447646	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
24	NC_006840	CTTTTT	2	12	495222	495233	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
25	NC_006840	TTTGTT	2	12	571336	571347	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
26	NC_006840	TTTGTT	2	12	571833	571844	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
27	NC_006840	TTTTAT	2	12	582805	582816	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_006840	AAGTTG	2	12	618641	618652	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29	NC_006840	TGAAAT	2	12	620948	620959	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
30	NC_006840	GATGTT	2	12	636786	636797	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31	NC_006840	GTTAAT	2	12	656007	656018	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
32	NC_006840	ATTTTT	2	12	659911	659922	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_006840	TTTTTC	2	12	662232	662243	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
34	NC_006840	TTTTGG	2	12	689298	689309	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_006840	TCTTTA	2	12	697453	697464	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
36	NC_006840	AAAATG	2	12	705508	705519	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
37	NC_006840	TACTTT	2	12	711137	711148	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_006840	AGATCT	2	12	730014	730025	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
39	NC_006840	ATGAAT	2	12	739209	739220	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
40	NC_006840	TAAAAA	2	12	739343	739354	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_006840	GAGAAA	2	12	830753	830764	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42	NC_006840	TTAAAA	2	12	844211	844222	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_006840	TGTTTT	2	12	880366	880377	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
44	NC_006840	CTTTGT	2	12	892963	892974	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
45	NC_006840	ATTTAT	2	12	988850	988861	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_006840	GTTACA	3	18	1024311	1024328	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
47	NC_006840	ATAATT	2	12	1041322	1041333	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_006840	TGATCT	2	12	1076648	1076659	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
49	NC_006840	TCCTTA	2	12	1098806	1098817	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_006840	CAATTT	2	12	1138666	1138677	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
51	NC_006840	ATTAAA	2	12	1144157	1144168	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_006840	TTTGAG	2	12	1209457	1209468	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53	NC_006840	TATCAA	2	12	1233251	1233262	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
54	NC_006840	AGTGAT	2	12	1244981	1244992	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55	NC_006840	ACAAGC	2	12	1245647	1245658	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_006840	CTAAAC	2	12	1276225	1276236	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_006840	ATATAG	2	12	1327884	1327895	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
58	NC_006840	CTTAAG	2	12	1339825	1339836	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
59	NC_006840	ATTGAT	2	12	1339957	1339968	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
60	NC_006840	TCATTT	2	12	1372037	1372048	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
61	NC_006840	ATTTAG	2	12	1376018	1376029	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
62	NC_006840	TTCAAC	2	12	1408993	1409004	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_006840	ATTTTT	2	12	1470590	1470601	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_006840	AATAAA	2	12	1472997	1473008	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_006840	AAAGAA	2	12	1484191	1484202	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
66	NC_006840	TAACTA	2	12	1577974	1577985	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
67	NC_006840	CTAAAA	2	12	1586534	1586545	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
68	NC_006840	AAAACA	2	12	1591021	1591032	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
69	NC_006840	CTTTTC	2	12	1594620	1594631	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_006840	TGTATT	2	12	1599908	1599919	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
71	NC_006840	TAAAAA	2	12	1606508	1606519	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_006840	TTTTAG	2	12	1609589	1609600	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
73	NC_006840	CTCATT	2	12	1645494	1645505	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_006840	GAACTA	2	12	1683570	1683581	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
75	NC_006840	TATAAA	2	12	1714883	1714894	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_006840	TTTTCA	2	12	1728125	1728136	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
77	NC_006840	TAAAAA	2	12	1768495	1768506	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_006840	TATCAA	2	12	1775949	1775960	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
79	NC_006840	TAAAAA	2	12	1794976	1794987	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_006840	ATCCCT	2	12	1859741	1859752	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
81	NC_006840	ATCCCT	2	12	1861037	1861048	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
82	NC_006840	ATCCCT	2	12	1861464	1861475	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
83	NC_006840	AAAAAG	2	12	1897446	1897457	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
84	NC_006840	TTGCTC	2	12	1920957	1920968	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_006840	ATCACT	2	12	1925950	1925961	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_006840	TTTTTA	2	12	1931708	1931719	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_006840	AAAAAG	2	12	1935733	1935744	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
88	NC_006840	TATAAA	2	12	1945274	1945285	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_006840	AAACGT	2	12	1957473	1957484	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
90	NC_006840	AAAATA	2	12	2012176	2012187	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_006840	TAAAAA	2	12	2037273	2037284	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_006840	TAAAAT	2	12	2046642	2046653	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_006840	TATAAA	2	12	2046772	2046783	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_006840	AATTAT	2	12	2057582	2057593	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_006840	ACTTCT	2	12	2071723	2071734	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_006840	AATAAC	2	12	2100519	2100530	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
97	NC_006840	ATTTTT	2	12	2114887	2114898	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_006840	AACTCT	2	12	2115945	2115956	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_006840	ACAAAA	2	12	2116082	2116093	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
100	NC_006840	TATAAA	2	12	2124384	2124395	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_006840	GGAAAT	2	12	2154936	2154947	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
102	NC_006840	TCAGGT	2	12	2228133	2228144	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
103	NC_006840	GGTAAC	2	12	2250266	2250277	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
104	NC_006840	ATATAA	2	12	2296806	2296817	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_006840	AATTTT	2	12	2313466	2313477	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_006840	ATTTCA	2	12	2369881	2369892	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
107	NC_006840	GATAAC	2	12	2413014	2413025	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
108	NC_006840	TTAAAA	2	12	2418295	2418306	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_006840	ATTTCA	2	12	2422229	2422240	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
110	NC_006840	AGTGTC	2	12	2425660	2425671	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
111	NC_006840	CTTGTT	2	12	2426928	2426939	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
112	NC_006840	ATACAT	2	12	2427020	2427031	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
113	NC_006840	TTTGAT	2	12	2456369	2456380	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
114	NC_006840	TTTTAG	2	12	2511005	2511016	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
115	NC_006840	GAAAAA	2	12	2526464	2526475	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
116	NC_006840	TTAATT	2	12	2544213	2544224	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_006840	TATAAA	2	12	2548740	2548751	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_006840	ACTCAA	2	12	2592006	2592017	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_006840	CAAAAA	2	12	2596146	2596157	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
120	NC_006840	TGTAAT	2	12	2610693	2610704	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
121	NC_006840	AATTTC	2	12	2630047	2630058	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
122	NC_006840	CATTTT	2	12	2682725	2682736	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
123	NC_006840	TATAGA	2	12	2690965	2690976	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
124	NC_006840	TTTTAC	2	12	2709442	2709453	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
125	NC_006840	ATTTCA	2	12	2716275	2716286	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
126	NC_006840	AGTGTC	2	12	2719807	2719818	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
127	NC_006840	ATTCAA	2	12	2720958	2720969	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
128	NC_006840	ATTTCA	2	12	2722060	2722071	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
129	NC_006840	AGTGTC	2	12	2725381	2725392	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
130	NC_006840	ATTCAA	2	12	2726534	2726545	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
131	NC_006840	ATTTCA	2	12	2727640	2727651	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
132	NC_006840	AGTGTC	2	12	2730862	2730873	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
133	NC_006840	CGTTTC	2	12	2731809	2731820	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_006840	GCTATT	2	12	2775026	2775037	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
135	NC_006840	ACCACT	2	12	2775057	2775068	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
136	NC_006840	GAAAAA	2	12	2790150	2790161	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
137	NC_006840	ATTTCC	2	12	2807585	2807596	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_006840	ATTTCA	2	12	2840064	2840075	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
139	NC_006840	AGTGTC	2	12	2843482	2843493	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
140	NC_006840	ATTCAA	2	12	2844634	2844645	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
141	NC_006840	ATTTCA	2	12	2845737	2845748	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
142	NC_006840	AGTGTC	2	12	2849155	2849166	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
143	NC_006840	ATTCAA	2	12	2850307	2850318	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
144	NC_006840	ATTTCA	2	12	2851408	2851419	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
145	NC_006840	AGTGTC	2	12	2854527	2854538	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
146	NC_006840	CTTTTT	2	12	2870984	2870995	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.