MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Vibrio vulnificus YJ016 chromosome II

Total Repeats: 195

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_005140	AATTG	2	10	9808	9817	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
2	NC_005140	GAAAA	2	10	39051	39060	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
3	NC_005140	TTAAC	2	10	43632	43641	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
4	NC_005140	ATTTT	2	10	66986	66995	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_005140	GAAAG	2	10	67088	67097	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
6	NC_005140	GAAGG	2	10	74760	74769	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
7	NC_005140	GTTTG	2	10	74837	74846	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
8	NC_005140	AAGCA	2	10	92096	92105	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
9	NC_005140	CCAAA	2	10	107232	107241	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
10	NC_005140	AAGGA	2	10	135178	135187	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
11	NC_005140	ATGAA	2	10	137123	137132	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
12	NC_005140	CACAA	2	10	137185	137194	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
13	NC_005140	TGTTA	2	10	147858	147867	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
14	NC_005140	TTGGT	2	10	176960	176969	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
15	NC_005140	AGGGC	2	10	186243	186252	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
16	NC_005140	GGCTT	2	10	190174	190183	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
17	NC_005140	CGATA	2	10	196161	196170	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
18	NC_005140	CCTAT	2	10	202555	202564	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
19	NC_005140	AAATT	2	10	237957	237966	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_005140	TATTC	2	10	238075	238084	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
21	NC_005140	TTTAT	2	10	238085	238094	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_005140	AAATA	2	10	246381	246390	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_005140	CTTTT	2	10	248351	248360	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
24	NC_005140	AGTTC	2	10	254927	254936	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
25	NC_005140	TGCTT	2	10	269710	269719	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
26	NC_005140	AAACA	2	10	272075	272084	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
27	NC_005140	GAAAA	2	10	281031	281040	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
28	NC_005140	TTTGT	2	10	290247	290256	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
29	NC_005140	TGTGA	2	10	292321	292330	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
30	NC_005140	AAAAG	2	10	293183	293192	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
31	NC_005140	CGCCC	2	10	298494	298503	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
32	NC_005140	TAGCT	2	10	301609	301618	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
33	NC_005140	TGTTT	2	10	305549	305558	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
34	NC_005140	AGTCG	2	10	308878	308887	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
35	NC_005140	TTGGC	2	10	338397	338406	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
36	NC_005140	ATGGA	2	10	344219	344228	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
37	NC_005140	ACGCA	2	10	351259	351268	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
38	NC_005140	TTTTC	2	10	357555	357564	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
39	NC_005140	TGAAT	2	10	371752	371761	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
40	NC_005140	ATTTA	2	10	371827	371836	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_005140	AAAGG	2	10	389392	389401	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
42	NC_005140	AATTG	2	10	408550	408559	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
43	NC_005140	TGTGT	2	10	419154	419163	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
44	NC_005140	AAAAG	2	10	439809	439818	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
45	NC_005140	TTCCA	2	10	458576	458585	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
46	NC_005140	TTTGG	2	10	471202	471211	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
47	NC_005140	TGAGA	2	10	471410	471419	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
48	NC_005140	TCAGT	2	10	471750	471759	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
49	NC_005140	CTTAG	2	10	471840	471849	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
50	NC_005140	TTTTG	2	10	486589	486598	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
51	NC_005140	TTTTG	2	10	507600	507609	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
52	NC_005140	GGACC	2	10	516925	516934	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
53	NC_005140	GAAAA	2	10	528077	528086	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
54	NC_005140	TAGAG	2	10	529389	529398	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
55	NC_005140	TCTAG	2	10	548854	548863	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
56	NC_005140	TATCG	2	10	565870	565879	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
57	NC_005140	TTCCA	2	10	571677	571686	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
58	NC_005140	TTTAA	2	10	574042	574051	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_005140	AACAA	2	10	578895	578904	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
60	NC_005140	TCAAT	2	10	589504	589513	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
61	NC_005140	AATAA	2	10	605262	605271	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_005140	GCCTT	2	10	614397	614406	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
63	NC_005140	TTGAA	2	10	626920	626929	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
64	NC_005140	GTTAA	2	10	630630	630639	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
65	NC_005140	GCATA	2	10	639292	639301	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
66	NC_005140	TCAGT	2	10	649349	649358	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
67	NC_005140	AAGAT	2	10	650498	650507	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
68	NC_005140	AAAAT	2	10	667726	667735	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_005140	TTCTC	2	10	683019	683028	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
70	NC_005140	GAATT	2	10	714400	714409	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
71	NC_005140	ACTCA	2	10	729451	729460	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
72	NC_005140	TTGTT	2	10	731609	731618	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
73	NC_005140	GAATG	2	10	731696	731705	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
74	NC_005140	TTTGA	2	10	732092	732101	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
75	NC_005140	GAACC	2	10	742589	742598	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
76	NC_005140	TGCCG	2	10	745923	745932	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
77	NC_005140	GTTGG	2	10	756895	756904	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
78	NC_005140	TTGTG	2	10	773093	773102	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
79	NC_005140	ACAAA	2	10	777999	778008	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
80	NC_005140	TGCTT	2	10	801082	801091	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
81	NC_005140	CTTAA	2	10	801188	801197	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
82	NC_005140	ATTTG	2	10	805968	805977	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
83	NC_005140	TAAAT	2	10	815615	815624	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_005140	AAAAG	2	10	823698	823707	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
85	NC_005140	CTTAC	2	10	825697	825706	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
86	NC_005140	ATGGT	2	10	825801	825810	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
87	NC_005140	TCACA	2	10	863091	863100	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
88	NC_005140	CACTT	2	10	873400	873409	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
89	NC_005140	CAAAT	2	10	873523	873532	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
90	NC_005140	AATTT	2	10	880349	880358	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_005140	CTAGG	2	10	892723	892732	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
92	NC_005140	CTAGG	2	10	897084	897093	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
93	NC_005140	TCGCT	2	10	899043	899052	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
94	NC_005140	ATTCA	2	10	899113	899122	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
95	NC_005140	ACTCA	2	10	899133	899142	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
96	NC_005140	TAATT	2	10	899357	899366	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_005140	GTCAG	2	10	899388	899397	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
98	NC_005140	TATCA	2	10	911515	911524	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
99	NC_005140	TACTT	2	10	912617	912626	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
100	NC_005140	GGCGC	2	10	920088	920097	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
101	NC_005140	CAAGC	2	10	920301	920310	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
102	NC_005140	GCCGT	2	10	920877	920886	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
103	NC_005140	GTTGT	2	10	924052	924061	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
104	NC_005140	CACTC	2	10	948216	948225	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
105	NC_005140	AAAGG	2	10	957847	957856	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
106	NC_005140	GATAT	2	10	975658	975667	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
107	NC_005140	TTAAA	2	10	1065015	1065024	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_005140	TAAAT	2	10	1065133	1065142	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_005140	TTTTA	2	10	1065231	1065240	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_005140	CTCTT	2	10	1080837	1080846	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
111	NC_005140	ATCAT	2	10	1080908	1080917	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
112	NC_005140	CTCTA	2	10	1080961	1080970	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
113	NC_005140	GCTAT	2	10	1121342	1121351	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
114	NC_005140	AGCGA	2	10	1175330	1175339	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
115	NC_005140	AATAG	2	10	1178853	1178862	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
116	NC_005140	AACAG	2	10	1181866	1181875	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
117	NC_005140	CAAAG	2	10	1183658	1183667	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
118	NC_005140	CTATT	2	10	1183804	1183813	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
119	NC_005140	GAAAA	2	10	1183826	1183835	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
120	NC_005140	TTAGC	2	10	1193387	1193396	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
121	NC_005140	TTAGC	2	10	1193409	1193418	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
122	NC_005140	AAAAG	2	10	1193575	1193584	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
123	NC_005140	CCAAC	2	10	1196900	1196909	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
124	NC_005140	AAACA	2	10	1196968	1196977	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
125	NC_005140	AAATC	2	10	1225952	1225961	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
126	NC_005140	AAAAG	2	10	1235642	1235651	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
127	NC_005140	ATTTA	2	10	1246398	1246407	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_005140	CCTCT	2	10	1262610	1262619	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
129	NC_005140	TAACC	2	10	1282023	1282032	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
130	NC_005140	CTCTT	2	10	1286114	1286123	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
131	NC_005140	GCCAT	2	10	1288296	1288305	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
132	NC_005140	CTAAC	2	10	1288487	1288496	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
133	NC_005140	CCTTT	2	10	1294698	1294707	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
134	NC_005140	AATGA	2	10	1302797	1302806	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
135	NC_005140	AAAAG	2	10	1328391	1328400	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
136	NC_005140	AGGAA	2	10	1333091	1333100	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
137	NC_005140	ATAAA	2	10	1333265	1333274	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_005140	CAAAA	2	10	1359046	1359055	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
139	NC_005140	AAACC	2	10	1368054	1368063	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
140	NC_005140	CATTG	2	10	1368237	1368246	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
141	NC_005140	CCATT	2	10	1368279	1368288	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
142	NC_005140	CTTTC	2	10	1373707	1373716	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
143	NC_005140	CTATT	2	10	1374953	1374962	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
144	NC_005140	TTCTT	2	10	1397052	1397061	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
145	NC_005140	CAAAA	2	10	1399734	1399743	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
146	NC_005140	CATTG	2	10	1400881	1400890	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
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192	NC_005140	TAAAA	2	10	1836099	1836108	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
193	NC_005140	GCTTT	2	10	1837167	1837176	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
194	NC_005140	TAAAA	2	10	1839004	1839013	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
195	NC_005140	TTAGA	2	10	1856684	1856693	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.