MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Vibrio vulnificus YJ016 chromosome I

Total Repeats: 97

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_005139	TAACCA	2	12	7212	7223	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_005139	GTCCCC	2	12	13827	13838	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
3	NC_005139	TGAAAT	2	12	36764	36775	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
4	NC_005139	GGCAAT	2	12	46322	46333	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
5	NC_005139	GGATTC	2	12	52646	52657	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_005139	GCAAAA	2	12	86606	86617	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
7	NC_005139	TTTGTG	2	12	96580	96591	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_005139	AGAAAA	2	12	127852	127863	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
9	NC_005139	CAGTTT	2	12	145564	145575	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_005139	AGGTTT	2	12	173126	173137	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_005139	TGAAAT	2	12	182165	182176	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
12	NC_005139	AAAAAT	2	12	201303	201314	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_005139	ATAAAA	2	12	250168	250179	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_005139	CAAAAA	2	12	343091	343102	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_005139	ATAGTT	2	12	354870	354881	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
16	NC_005139	GCTCTT	2	12	376760	376771	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_005139	AGTTTC	2	12	394578	394589	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
18	NC_005139	ATAGGC	2	12	456392	456403	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_005139	TCAAAT	2	12	477357	477368	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
20	NC_005139	AAATAA	2	12	495042	495053	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_005139	AATTAA	2	12	501193	501204	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_005139	ATCTCA	2	12	511030	511041	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_005139	TTATTT	2	12	524626	524637	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_005139	GTTTTC	2	12	524638	524649	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
25	NC_005139	TTTTTA	2	12	568035	568046	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_005139	TTTTCG	2	12	580708	580719	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
27	NC_005139	TGACGT	2	12	589375	589386	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
28	NC_005139	CAATAA	2	12	607135	607146	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_005139	TAGAAA	2	12	701526	701537	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
30	NC_005139	TGAAAT	2	12	721433	721444	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
31	NC_005139	GAAAAA	2	12	811951	811962	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
32	NC_005139	GAGATG	2	12	956978	956989	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
33	NC_005139	CAAAAA	2	12	974635	974646	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
34	NC_005139	TGATTC	2	12	999807	999818	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
35	NC_005139	TCAAAG	2	12	1155480	1155491	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
36	NC_005139	TGAATT	2	12	1171106	1171117	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
37	NC_005139	TTTTTG	2	12	1196682	1196693	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
38	NC_005139	TTTGTT	2	12	1259244	1259255	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
39	NC_005139	TAATGT	2	12	1306964	1306975	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
40	NC_005139	TCACTA	2	12	1309334	1309345	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_005139	CAAGGT	2	12	1383017	1383028	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
42	NC_005139	CCCTAG	2	12	1441733	1441744	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
43	NC_005139	GAAAGG	2	12	1476902	1476913	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
44	NC_005139	ATTGAG	2	12	1496836	1496847	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45	NC_005139	AATGAA	2	12	1580845	1580856	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
46	NC_005139	ATTGAA	2	12	1587201	1587212	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
47	NC_005139	GTAAAT	2	12	1587306	1587317	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
48	NC_005139	AAGAAT	2	12	1608276	1608287	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
49	NC_005139	GACAAA	2	12	1623562	1623573	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
50	NC_005139	AAACTA	2	12	1720668	1720679	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
51	NC_005139	AAAAAG	2	12	1743571	1743582	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
52	NC_005139	AAAATA	2	12	1800895	1800906	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_005139	ACTTGG	2	12	1833677	1833688	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
54	NC_005139	AAAACC	2	12	1876022	1876033	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_005139	TAGATT	2	12	1878047	1878058	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
56	NC_005139	AAAACC	2	12	1901032	1901043	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_005139	AAAACC	2	12	1901966	1901977	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_005139	TTTTAA	2	12	1902023	1902034	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_005139	AAAACC	2	12	1925470	1925481	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_005139	GAGATT	2	12	2025641	2025652	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
61	NC_005139	ATTTAT	2	12	2162125	2162136	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_005139	CACAAA	2	12	2203694	2203705	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_005139	ATGAAC	2	12	2237464	2237475	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
64	NC_005139	TTTTAG	2	12	2255870	2255881	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
65	NC_005139	GTTATT	2	12	2325689	2325700	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
66	NC_005139	AGTATC	2	12	2348549	2348560	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
67	NC_005139	GCTTTT	2	12	2372250	2372261	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
68	NC_005139	CTTGTG	2	12	2399646	2399657	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
69	NC_005139	ATCTCA	2	12	2404571	2404582	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_005139	GAATCT	2	12	2452088	2452099	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
71	NC_005139	ATCATT	2	12	2470052	2470063	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
72	NC_005139	TCTCAT	2	12	2585187	2585198	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_005139	AAGCAA	2	12	2630390	2630401	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
74	NC_005139	TTATTG	2	12	2701853	2701864	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
75	NC_005139	GGTGAT	2	12	2744292	2744303	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
76	NC_005139	AAAAAT	2	12	2797694	2797705	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_005139	ATGGAA	2	12	2799490	2799501	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
78	NC_005139	TGCTAA	3	18	2872396	2872413	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
79	NC_005139	TATTCT	2	12	2902127	2902138	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
80	NC_005139	ATTTCA	2	12	2944506	2944517	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
81	NC_005139	ATTTCA	2	12	2949923	2949934	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
82	NC_005139	ATTTCA	2	12	3038895	3038906	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
83	NC_005139	TTCATC	2	12	3073880	3073891	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_005139	CCACTC	2	12	3084078	3084089	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
85	NC_005139	ATCACC	2	12	3084245	3084256	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
86	NC_005139	CTTTTG	2	12	3106797	3106808	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
87	NC_005139	ATCATT	2	12	3107616	3107627	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
88	NC_005139	AAAATT	2	12	3111814	3111825	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_005139	CGCTTG	2	12	3117557	3117568	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_005139	GCAAAA	2	12	3132196	3132207	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
91	NC_005139	GAAAAA	2	12	3181958	3181969	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
92	NC_005139	AAAAAC	2	12	3185840	3185851	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
93	NC_005139	AATCTC	2	12	3211824	3211835	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_005139	ATTTCA	2	12	3259021	3259032	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
95	NC_005139	AAAATG	2	12	3274426	3274437	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
96	NC_005139	ATTTCA	2	12	3301007	3301018	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
97	NC_005139	CTTTAA	2	12	3317022	3317033	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.