MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Vibrio vulnificus YJ016 chromosome I

Total Repeats: 323

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_005139	AGGAT	2	10	13944	13953	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
2	NC_005139	AATAA	2	10	21760	21769	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_005139	TTAGA	2	10	34307	34316	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
4	NC_005139	AGTCG	2	10	35862	35871	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
5	NC_005139	TAAAT	2	10	73878	73887	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_005139	TTGTT	2	10	74054	74063	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
7	NC_005139	TACTC	2	10	96542	96551	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
8	NC_005139	TGAGC	2	10	116404	116413	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
9	NC_005139	TAACT	2	10	116681	116690	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
10	NC_005139	TTTGT	2	10	131457	131466	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
11	NC_005139	TAAGA	2	10	134116	134125	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
12	NC_005139	TAGTG	2	10	136631	136640	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
13	NC_005139	GTGAG	2	10	145349	145358	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
14	NC_005139	TAAAA	2	10	158140	158149	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_005139	TAAAA	2	10	160293	160302	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_005139	TTATG	2	10	166836	166845	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
17	NC_005139	ATTTA	2	10	167099	167108	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_005139	ATCTA	2	10	173317	173326	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
19	NC_005139	AAATT	2	10	177527	177536	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_005139	AGTCG	2	10	181263	181272	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
21	NC_005139	ATTCC	2	10	183213	183222	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
22	NC_005139	TCCGC	2	10	183393	183402	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
23	NC_005139	ATGAA	2	10	192972	192981	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
24	NC_005139	AGCGA	2	10	199650	199659	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
25	NC_005139	GTTAT	2	10	211016	211025	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
26	NC_005139	GCGAG	2	10	211066	211075	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
27	NC_005139	ATTTC	2	10	212601	212610	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
28	NC_005139	TTTGT	2	10	212689	212698	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
29	NC_005139	GAGCT	2	10	235588	235597	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
30	NC_005139	AAAAG	2	10	237104	237113	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
31	NC_005139	GAAGA	2	10	247179	247188	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
32	NC_005139	GTTTG	2	10	253424	253433	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
33	NC_005139	TTAAA	2	10	315894	315903	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_005139	TTTTC	2	10	341463	341472	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
35	NC_005139	GTTTC	2	10	341557	341566	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
36	NC_005139	TTTTC	2	10	342211	342220	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
37	NC_005139	TTTTC	2	10	342982	342991	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
38	NC_005139	TGTCT	2	10	380584	380593	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
39	NC_005139	TGTCT	2	10	383040	383049	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
40	NC_005139	CCCGA	2	10	389099	389108	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
41	NC_005139	GTAAG	2	10	397758	397767	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
42	NC_005139	GAGAT	2	10	397840	397849	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
43	NC_005139	GTTTC	2	10	433480	433489	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
44	NC_005139	ATTGA	2	10	442995	443004	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
45	NC_005139	TCCAA	2	10	453004	453013	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
46	NC_005139	TTTTC	2	10	488042	488051	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
47	NC_005139	TGGTT	2	10	495172	495181	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
48	NC_005139	AGGTT	2	10	498745	498754	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
49	NC_005139	GTCTT	2	10	500833	500842	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
50	NC_005139	ATTGT	2	10	510946	510955	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
51	NC_005139	GATCT	2	10	524799	524808	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
52	NC_005139	GTTAA	2	10	611548	611557	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
53	NC_005139	GCTTG	2	10	616432	616441	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
54	NC_005139	GGATT	2	10	629652	629661	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
55	NC_005139	GAATA	2	10	642893	642902	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
56	NC_005139	ACATA	2	10	642917	642926	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
57	NC_005139	TTATT	2	10	650458	650467	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_005139	TTCCA	2	10	651627	651636	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
59	NC_005139	TGAAA	2	10	680393	680402	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
60	NC_005139	AGAAA	2	10	681970	681979	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
61	NC_005139	GAAAA	2	10	689328	689337	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
62	NC_005139	GTAGA	2	10	709896	709905	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
63	NC_005139	TTTTA	2	10	714068	714077	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_005139	AAAGC	2	10	717066	717075	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
65	NC_005139	AGTCG	2	10	720531	720540	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
66	NC_005139	ATTCC	2	10	722480	722489	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
67	NC_005139	TCCGC	2	10	722661	722670	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
68	NC_005139	AAGGA	2	10	740372	740381	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
69	NC_005139	CTTTG	2	10	743005	743014	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
70	NC_005139	ATGCA	2	10	743929	743938	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
71	NC_005139	ACTTT	2	10	743954	743963	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
72	NC_005139	AATTA	2	10	746073	746082	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_005139	CCATT	2	10	762344	762353	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
74	NC_005139	AAAAT	2	10	777482	777491	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_005139	AAGAT	2	10	777504	777513	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
76	NC_005139	GATTG	2	10	780491	780500	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
77	NC_005139	GCATT	2	10	783648	783657	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
78	NC_005139	AAATA	2	10	804003	804012	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_005139	TAATT	2	10	804104	804113	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_005139	TTGGT	2	10	810370	810379	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
81	NC_005139	TAACA	2	10	832095	832104	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
82	NC_005139	GCGGA	2	10	835015	835024	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
83	NC_005139	CTGAA	2	10	839225	839234	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
84	NC_005139	CATTT	2	10	839445	839454	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
85	NC_005139	AGGGG	2	10	844619	844628	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
86	NC_005139	GCTTA	2	10	847739	847748	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
87	NC_005139	TAGAT	2	10	858240	858249	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
88	NC_005139	TAATT	2	10	858432	858441	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_005139	TTTCA	2	10	863104	863113	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
90	NC_005139	TTAGC	2	10	886053	886062	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
91	NC_005139	GTGTC	2	10	906596	906605	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
92	NC_005139	AGAAA	2	10	924024	924033	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
93	NC_005139	TTGAT	2	10	941633	941642	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
94	NC_005139	CAGCT	2	10	944691	944700	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
95	NC_005139	GCTTG	2	10	952529	952538	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
96	NC_005139	CTTTT	2	10	955107	955116	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
97	NC_005139	TGATT	2	10	966852	966861	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
98	NC_005139	CCTTA	2	10	977060	977069	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
99	NC_005139	ATAAA	2	10	982832	982841	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_005139	TTGAT	2	10	986750	986759	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
101	NC_005139	TTATT	2	10	999819	999828	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_005139	AAATT	2	10	1019360	1019369	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_005139	CTCTG	2	10	1019457	1019466	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
104	NC_005139	TCTGT	2	10	1026751	1026760	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
105	NC_005139	CGTCA	2	10	1043220	1043229	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
106	NC_005139	TTCAA	2	10	1048777	1048786	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
107	NC_005139	TAAAT	2	10	1060368	1060377	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_005139	GTAGC	2	10	1091191	1091200	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
109	NC_005139	TTGAT	2	10	1122514	1122523	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
110	NC_005139	GCTTT	2	10	1141976	1141985	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
111	NC_005139	CTTTT	2	10	1183848	1183857	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
112	NC_005139	TTACA	2	10	1186663	1186672	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
113	NC_005139	TGCCA	2	10	1194713	1194722	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
114	NC_005139	AAGGT	2	10	1208586	1208595	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
115	NC_005139	AGTGT	2	10	1209019	1209028	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
116	NC_005139	GGTGT	2	10	1209307	1209316	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
117	NC_005139	TTATT	2	10	1214651	1214660	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_005139	ACAAT	2	10	1217695	1217704	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
119	NC_005139	TTTTG	2	10	1238268	1238277	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
120	NC_005139	TAAGC	2	10	1240675	1240684	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
121	NC_005139	TTCGT	2	10	1250272	1250281	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
122	NC_005139	GTAGG	2	10	1250457	1250466	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
123	NC_005139	GATAA	2	10	1256150	1256159	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
124	NC_005139	AAGGA	2	10	1270512	1270521	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
125	NC_005139	TTGTC	2	10	1281268	1281277	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
126	NC_005139	GAAAA	2	10	1296758	1296767	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
127	NC_005139	GTTTT	2	10	1298395	1298404	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
128	NC_005139	GTTTT	2	10	1312326	1312335	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
129	NC_005139	GATGT	2	10	1347324	1347333	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
130	NC_005139	AGTCT	2	10	1367377	1367386	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
131	NC_005139	AATTA	2	10	1373151	1373160	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_005139	CAATA	2	10	1373201	1373210	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
133	NC_005139	GGAAA	2	10	1383122	1383131	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
134	NC_005139	CTGTT	2	10	1385052	1385061	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
135	NC_005139	TGTTT	2	10	1386450	1386459	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
136	NC_005139	TGGGG	2	10	1396658	1396667	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
137	NC_005139	TGAAA	2	10	1442199	1442208	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
138	NC_005139	TTCCT	2	10	1447256	1447265	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
139	NC_005139	AATAA	2	10	1492265	1492274	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_005139	TGAGT	2	10	1495350	1495359	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
141	NC_005139	TTGTT	2	10	1498438	1498447	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
142	NC_005139	ATCAA	2	10	1501249	1501258	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
143	NC_005139	TTTTG	2	10	1503800	1503809	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
144	NC_005139	AAAAG	2	10	1510840	1510849	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
145	NC_005139	GAAAA	2	10	1523185	1523194	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
146	NC_005139	CCTAT	2	10	1527132	1527141	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
147	NC_005139	TGCTT	2	10	1552450	1552459	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
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149	NC_005139	TATCT	2	10	1584452	1584461	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
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154	NC_005139	TAAAT	2	10	1650266	1650275	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
155	NC_005139	GAAAG	2	10	1680147	1680156	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
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160	NC_005139	TTTAT	2	10	1735821	1735830	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
161	NC_005139	AAAAG	2	10	1774853	1774862	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
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164	NC_005139	AGAAA	2	10	1803201	1803210	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
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179	NC_005139	TTTGA	2	10	1867811	1867820	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
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182	NC_005139	ACTGA	2	10	1876157	1876166	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
183	NC_005139	AAAGA	2	10	1876274	1876283	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
184	NC_005139	TTTTA	2	10	1881884	1881893	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
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189	NC_005139	ACGCA	2	10	1912886	1912895	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
190	NC_005139	TTTGA	2	10	1917712	1917721	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
191	NC_005139	ACGCA	2	10	1918122	1918131	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
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195	NC_005139	CCTTT	2	10	1936222	1936231	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
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261	NC_005139	TGAAA	2	10	2777504	2777513	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
262	NC_005139	TGAAC	2	10	2818133	2818142	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
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277	NC_005139	GTTTT	2	10	2943099	2943108	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
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279	NC_005139	TCGGT	2	10	2945784	2945793	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
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281	NC_005139	CGACT	2	10	2950825	2950834	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
282	NC_005139	TCGGT	2	10	2951201	2951210	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
283	NC_005139	GCTTT	2	10	2954364	2954373	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
284	NC_005139	TTAAC	2	10	2968917	2968926	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
285	NC_005139	TTTAT	2	10	2974172	2974181	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
286	NC_005139	AAGCA	2	10	2977001	2977010	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
287	NC_005139	CAAAA	2	10	2977059	2977068	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
288	NC_005139	AATAG	2	10	3019625	3019634	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
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291	NC_005139	CGACT	2	10	3039799	3039808	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
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318	NC_005139	CGACT	2	10	3301911	3301920	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
319	NC_005139	TCGGT	2	10	3302285	3302294	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
320	NC_005139	AGCGA	2	10	3315352	3315361	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
321	NC_005139	ATAAC	2	10	3326465	3326474	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
322	NC_005139	AATAG	2	10	3338465	3338474	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
323	NC_005139	GAGGC	2	10	3339803	3339812	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.