MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Vibrio parahaemolyticus RIMD 2210633 chromosome 1

Total Repeats: 1293

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_004603	ATTA	2	8	2311	2318	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_004603	GTTA	2	8	4013	4020	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3	NC_004603	TTCA	2	8	4065	4072	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4	NC_004603	CCGG	2	8	4918	4925	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5	NC_004603	GTTA	2	8	7289	7296	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
6	NC_004603	TAAA	2	8	7304	7311	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_004603	TTAA	2	8	15053	15060	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_004603	GTTC	2	8	22691	22698	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
9	NC_004603	TAAC	2	8	24175	24182	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
10	NC_004603	CGTT	2	8	24199	24206	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
11	NC_004603	TCAA	2	8	24488	24495	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
12	NC_004603	AGTT	2	8	30371	30378	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
13	NC_004603	TCAA	2	8	31171	31178	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
14	NC_004603	GAAA	2	8	33311	33318	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
15	NC_004603	GTAG	2	8	35076	35083	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
16	NC_004603	TGAC	2	8	36277	36284	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
17	NC_004603	GTAC	2	8	36360	36367	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
18	NC_004603	AGTA	2	8	36763	36770	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
19	NC_004603	CGTC	2	8	36800	36807	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
20	NC_004603	AAAG	2	8	36922	36929	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
21	NC_004603	CAGA	2	8	41619	41626	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
22	NC_004603	TGAA	2	8	47000	47007	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
23	NC_004603	TTCA	2	8	47010	47017	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
24	NC_004603	CAAA	2	8	49204	49211	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
25	NC_004603	TTCT	2	8	50473	50480	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
26	NC_004603	TCCT	2	8	57725	57732	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
27	NC_004603	ATTT	2	8	61566	61573	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_004603	AGGA	2	8	61590	61597	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
29	NC_004603	ATTT	2	8	66727	66734	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_004603	ACTT	2	8	68959	68966	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
31	NC_004603	CAAA	2	8	69891	69898	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
32	NC_004603	AAAT	2	8	72385	72392	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_004603	ACAA	2	8	72405	72412	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
34	NC_004603	ATAG	2	8	77861	77868	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
35	NC_004603	GCAC	2	8	79060	79067	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
36	NC_004603	TACT	2	8	79093	79100	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
37	NC_004603	CTAA	2	8	86138	86145	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
38	NC_004603	TGGT	2	8	92257	92264	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
39	NC_004603	TTTC	2	8	92310	92317	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
40	NC_004603	CATC	2	8	93591	93598	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
41	NC_004603	ACAA	2	8	95816	95823	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
42	NC_004603	TTAT	2	8	96513	96520	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_004603	GAAG	2	8	97679	97686	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
44	NC_004603	GAGT	2	8	103177	103184	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
45	NC_004603	GGTT	2	8	109538	109545	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
46	NC_004603	TATT	2	8	112072	112079	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_004603	AAAT	2	8	112531	112538	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_004603	CGAA	2	8	113066	113073	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
49	NC_004603	AGAT	2	8	113076	113083	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
50	NC_004603	CAGT	2	8	116195	116202	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
51	NC_004603	GAAA	2	8	116230	116237	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
52	NC_004603	TCAT	2	8	116340	116347	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
53	NC_004603	GAAA	2	8	116386	116393	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
54	NC_004603	CTTT	2	8	116444	116451	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
55	NC_004603	GATT	2	8	117389	117396	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
56	NC_004603	GTTT	2	8	120627	120634	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
57	NC_004603	TGAC	2	8	129396	129403	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
58	NC_004603	ATCT	2	8	131394	131401	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
59	NC_004603	TAAA	2	8	154109	154116	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_004603	TGAC	2	8	158849	158856	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
61	NC_004603	TCAT	2	8	161321	161328	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
62	NC_004603	GCGA	2	8	164028	164035	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
63	NC_004603	CCAA	2	8	166866	166873	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
64	NC_004603	TAAA	2	8	171421	171428	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_004603	GTGG	2	8	171460	171467	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
66	NC_004603	GACT	2	8	174070	174077	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
67	NC_004603	ATTG	3	12	174737	174748	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
68	NC_004603	GACT	2	8	174976	174983	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
69	NC_004603	AGTC	2	8	180007	180014	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
70	NC_004603	TATT	2	8	183123	183130	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_004603	GATA	2	8	183396	183403	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
72	NC_004603	GCAT	2	8	185547	185554	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
73	NC_004603	TAAA	2	8	189191	189198	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_004603	CCAA	2	8	190802	190809	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
75	NC_004603	CTTC	2	8	204829	204836	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
76	NC_004603	TAGT	2	8	217488	217495	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
77	NC_004603	GGAA	2	8	225674	225681	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
78	NC_004603	ATTT	2	8	229827	229834	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_004603	TAAC	2	8	229895	229902	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
80	NC_004603	AAGT	2	8	229921	229928	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
81	NC_004603	GAAC	2	8	233840	233847	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
82	NC_004603	GATA	2	8	234906	234913	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
83	NC_004603	AGCA	2	8	247436	247443	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
84	NC_004603	AAAT	2	8	249641	249648	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_004603	CATG	2	8	250859	250866	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
86	NC_004603	TAAG	2	8	251884	251891	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
87	NC_004603	GTTG	2	8	253350	253357	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
88	NC_004603	TGAG	2	8	253366	253373	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
89	NC_004603	CAAA	2	8	253514	253521	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
90	NC_004603	TTCT	2	8	255033	255040	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
91	NC_004603	TAGG	2	8	258083	258090	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
92	NC_004603	AGGC	2	8	260022	260029	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
93	NC_004603	TTCA	2	8	267103	267110	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
94	NC_004603	CTTC	2	8	267193	267200	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
95	NC_004603	AATC	2	8	267365	267372	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
96	NC_004603	TTGT	2	8	267409	267416	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
97	NC_004603	AGTA	2	8	268410	268417	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
98	NC_004603	ATTT	2	8	281762	281769	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_004603	CTGA	2	8	281780	281787	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
100	NC_004603	CAAA	2	8	288217	288224	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
101	NC_004603	GTTT	2	8	291817	291824	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
102	NC_004603	ATTT	2	8	299931	299938	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_004603	TTTA	2	8	301126	301133	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_004603	ATTT	2	8	309369	309376	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_004603	ATTC	2	8	309394	309401	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
106	NC_004603	ATCC	2	8	311579	311586	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
107	NC_004603	TCAA	2	8	311621	311628	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
108	NC_004603	GAGC	2	8	311784	311791	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
109	NC_004603	AGTG	2	8	318532	318539	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
110	NC_004603	TGAT	2	8	319705	319712	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
111	NC_004603	AGTT	2	8	319737	319744	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
112	NC_004603	ATAA	2	8	319842	319849	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_004603	TTTC	2	8	319867	319874	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
114	NC_004603	ATTG	2	8	320644	320651	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
115	NC_004603	CACG	2	8	324079	324086	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
116	NC_004603	GGAT	2	8	335291	335298	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
117	NC_004603	TTCT	2	8	336139	336146	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
118	NC_004603	GTTT	2	8	344166	344173	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
119	NC_004603	TTGT	2	8	344181	344188	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
120	NC_004603	TGTT	2	8	344422	344429	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
121	NC_004603	ATAC	2	8	344452	344459	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
122	NC_004603	TTAA	2	8	345829	345836	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_004603	GTAA	2	8	346009	346016	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
124	NC_004603	GAAT	2	8	355109	355116	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
125	NC_004603	AAAT	2	8	355184	355191	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_004603	TGCT	2	8	356068	356075	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
127	NC_004603	GTAA	2	8	358638	358645	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
128	NC_004603	GATT	2	8	362124	362131	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
129	NC_004603	TGAT	2	8	364167	364174	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
130	NC_004603	CACG	2	8	368398	368405	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
131	NC_004603	TACC	2	8	370214	370221	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
132	NC_004603	CAAT	2	8	372353	372360	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
133	NC_004603	AATT	2	8	372457	372464	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_004603	AATT	2	8	372555	372562	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_004603	TTTG	2	8	372630	372637	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
136	NC_004603	TAAA	2	8	377170	377177	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_004603	ATCA	2	8	378055	378062	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
138	NC_004603	TTAT	2	8	378135	378142	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_004603	GTTA	2	8	378147	378154	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
140	NC_004603	ATAG	2	8	379222	379229	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
141	NC_004603	AGCA	2	8	379638	379645	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
142	NC_004603	TAGG	2	8	380956	380963	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
143	NC_004603	GATT	2	8	383684	383691	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
144	NC_004603	AGTA	2	8	384517	384524	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
145	NC_004603	TTAG	2	8	385055	385062	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
146	NC_004603	AATT	2	8	385120	385127	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_004603	CAAT	2	8	385691	385698	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
148	NC_004603	TAAA	3	12	385860	385871	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_004603	TAAT	2	8	385914	385921	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_004603	TGGT	2	8	387419	387426	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
151	NC_004603	ACTG	2	8	390751	390758	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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