MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Vibrio vulnificus CMCP6 chromosome I

Total Repeats: 404

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_004459	CTTTT	2	10	10346	10355	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
2	NC_004459	TGATG	2	10	14003	14012	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
3	NC_004459	TAGAA	2	10	14028	14037	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
4	NC_004459	ATTTC	2	10	14662	14671	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
5	NC_004459	CAAGA	2	10	14712	14721	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
6	NC_004459	CGCTA	2	10	44837	44846	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
7	NC_004459	AACAA	2	10	78381	78390	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
8	NC_004459	ATTTA	2	10	118036	118045	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_004459	ACAGC	2	10	122996	123005	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
10	NC_004459	TTGAA	2	10	129631	129640	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
11	NC_004459	ATTCA	2	10	131486	131495	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
12	NC_004459	GTGAC	2	10	135136	135145	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
13	NC_004459	ACAGA	2	10	151606	151615	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
14	NC_004459	CAATA	2	10	153930	153939	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
15	NC_004459	CAGAG	2	10	158900	158909	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
16	NC_004459	AATTT	2	10	158998	159007	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_004459	ATCAA	2	10	191597	191606	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
18	NC_004459	AGAAA	2	10	193641	193650	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
19	NC_004459	TAAGG	2	10	201300	201309	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
20	NC_004459	AAAAG	2	10	223224	223233	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
21	NC_004459	AGCTG	2	10	233642	233651	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
22	NC_004459	ATCAA	2	10	236700	236709	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
23	NC_004459	TTTCT	2	10	254430	254439	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
24	NC_004459	GTTTT	2	10	254973	254982	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
25	NC_004459	CTTTC	2	10	255056	255065	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
26	NC_004459	GACAC	2	10	271859	271868	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
27	NC_004459	TAAAT	2	10	273537	273546	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_004459	GCTAA	2	10	292404	292413	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
29	NC_004459	TCACA	2	10	299124	299133	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
30	NC_004459	GTTCA	2	10	299185	299194	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
31	NC_004459	AATTA	2	10	320023	320032	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_004459	ATCTA	2	10	320215	320224	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
33	NC_004459	TAAGC	2	10	330716	330725	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
34	NC_004459	TCCAA	2	10	330914	330923	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
35	NC_004459	CCCCT	2	10	333836	333845	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
36	NC_004459	TCCGC	2	10	343548	343557	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
37	NC_004459	ATGTT	2	10	346467	346476	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
38	NC_004459	TATAA	2	10	358806	358815	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_004459	AAAAT	2	10	358969	358978	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_004459	TTTTA	2	10	361376	361385	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_004459	CTTTT	2	10	369293	369302	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
42	NC_004459	AATTA	2	10	369394	369403	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_004459	AGAAA	2	10	369405	369414	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
44	NC_004459	CAATG	2	10	369495	369504	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
45	NC_004459	CCGAC	2	10	370117	370126	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
46	NC_004459	AAGAC	2	10	372062	372071	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
47	NC_004459	AGGTC	2	10	375168	375177	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
48	NC_004459	GATTT	2	10	380046	380055	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
49	NC_004459	ACATT	2	10	381826	381835	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
50	NC_004459	TAAAA	2	10	381953	381962	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_004459	CTTTA	2	10	386882	386891	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
52	NC_004459	TTTAT	2	10	386966	386975	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_004459	TAATA	2	10	387195	387204	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_004459	ACTTC	2	10	387409	387418	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
55	NC_004459	TTTTA	2	10	390129	390138	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_004459	ATATT	2	10	390607	390616	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_004459	TATTT	2	10	393988	393997	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_004459	ACTAA	2	10	394032	394041	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
59	NC_004459	CAATG	2	10	411851	411860	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
60	NC_004459	CAATC	2	10	415009	415018	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
61	NC_004459	ATCTT	2	10	417996	418005	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
62	NC_004459	TTATT	2	10	418016	418025	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_004459	AATGG	2	10	433157	433166	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
64	NC_004459	AGGAA	2	10	445243	445252	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
65	NC_004459	AAACC	2	10	448450	448459	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
66	NC_004459	TAATT	2	10	448683	448692	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_004459	TAAAG	2	10	450801	450810	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
68	NC_004459	TGCAT	2	10	450827	450836	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
69	NC_004459	CTTTT	2	10	450841	450850	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
70	NC_004459	CAAAG	2	10	451751	451760	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
71	NC_004459	CCTTT	2	10	454334	454343	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
72	NC_004459	GCGGA	2	10	472045	472054	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
73	NC_004459	CGACT	2	10	474176	474185	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
74	NC_004459	TCGGT	2	10	474550	474559	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
75	NC_004459	CATGC	2	10	475593	475602	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
76	NC_004459	TCTAC	2	10	483121	483130	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
77	NC_004459	TTTTC	2	10	503693	503702	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
78	NC_004459	CTTTT	2	10	511050	511059	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
79	NC_004459	TGGAA	2	10	541395	541404	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
80	NC_004459	AATAA	2	10	542564	542573	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_004459	CTTTC	2	10	549435	549444	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
82	NC_004459	TATGT	2	10	550105	550114	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
83	NC_004459	TATTC	2	10	550129	550138	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
84	NC_004459	AATCC	2	10	563371	563380	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
85	NC_004459	CAAGC	2	10	576067	576076	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
86	NC_004459	AACAA	2	10	580916	580925	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
87	NC_004459	TTAAC	2	10	580950	580959	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
88	NC_004459	CCAAA	2	10	654589	654598	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
89	NC_004459	GAAAA	2	10	661718	661727	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
90	NC_004459	GATTG	2	10	696662	696671	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
91	NC_004459	TCAAT	2	10	706673	706682	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
92	NC_004459	GAAAC	2	10	716188	716197	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
93	NC_004459	AAGCG	2	10	751632	751641	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
94	NC_004459	ATCTC	2	10	751756	751765	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
95	NC_004459	CCTTA	2	10	751837	751846	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
96	NC_004459	TCGGG	2	10	760497	760506	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
97	NC_004459	CTCAC	2	10	765963	765972	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
98	NC_004459	CAAAA	2	10	771727	771736	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
99	NC_004459	ATCCA	2	10	795616	795625	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
100	NC_004459	AAGAA	2	10	797853	797862	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
101	NC_004459	AAAAC	2	10	828322	828331	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
102	NC_004459	CACAA	2	10	849875	849884	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
103	NC_004459	CCAAA	2	10	858081	858090	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
104	NC_004459	ATTTT	2	10	872150	872159	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_004459	GTGTG	2	10	873755	873764	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
106	NC_004459	CTTTT	2	10	874506	874515	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
107	NC_004459	AATGA	2	10	899011	899020	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
108	NC_004459	CTCGC	2	10	900549	900558	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
109	NC_004459	TCGCT	2	10	911965	911974	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
110	NC_004459	TTCAT	2	10	918636	918645	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
111	NC_004459	TGCTT	2	10	924873	924882	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
112	NC_004459	CGACT	2	10	930347	930356	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
113	NC_004459	TCGGT	2	10	930721	930730	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
114	NC_004459	GCAAT	2	10	931674	931683	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
115	NC_004459	GCTTT	2	10	933888	933897	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
116	NC_004459	CGACT	2	10	936085	936094	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
117	NC_004459	TCGGT	2	10	936459	936468	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
118	NC_004459	GTTTG	2	10	949207	949216	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
119	NC_004459	CTGAC	2	10	961545	961554	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
120	NC_004459	TAAGA	2	10	964709	964718	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
121	NC_004459	TGATT	2	10	973185	973194	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
122	NC_004459	GCGGA	2	10	974657	974666	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
123	NC_004459	CGACT	2	10	976788	976797	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
124	NC_004459	TCGGT	2	10	977162	977171	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
125	NC_004459	TTATT	2	10	990890	990899	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_004459	ATCCT	2	10	998705	998714	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
127	NC_004459	TCCAC	2	10	998799	998808	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
128	NC_004459	GCCTC	2	10	1027372	1027381	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
129	NC_004459	CTATT	2	10	1028710	1028719	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
130	NC_004459	GTTAT	2	10	1040710	1040719	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
131	NC_004459	CAAAA	2	10	1045960	1045969	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
132	NC_004459	TCGCT	2	10	1051822	1051831	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
133	NC_004459	AGTCG	2	10	1064006	1064015	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
134	NC_004459	AAGCC	2	10	1079377	1079386	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
135	NC_004459	CACAA	2	10	1101124	1101133	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
136	NC_004459	TAAAT	2	10	1103184	1103193	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_004459	TTGTT	2	10	1103360	1103369	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
138	NC_004459	TGAGC	2	10	1145739	1145748	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
139	NC_004459	TAACT	2	10	1146016	1146025	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
140	NC_004459	CAAAA	2	10	1157191	1157200	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
141	NC_004459	TTTGT	2	10	1160670	1160679	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
142	NC_004459	AGTCG	2	10	1173515	1173524	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
143	NC_004459	TCCGC	2	10	1175646	1175655	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
144	NC_004459	CTCTT	2	10	1210874	1210883	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
145	NC_004459	TGCGC	2	10	1212992	1213001	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
146	NC_004459	GCAAG	2	10	1220429	1220438	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
147	NC_004459	ATCAA	2	10	1226447	1226456	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
148	NC_004459	GCTTT	2	10	1227081	1227090	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
149	NC_004459	TTGAG	2	10	1255298	1255307	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
150	NC_004459	GTTTT	2	10	1268901	1268910	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
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152	NC_004459	TTCAT	2	10	1295340	1295349	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
153	NC_004459	CTTTT	2	10	1295447	1295456	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
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159	NC_004459	AAAAT	2	10	1337756	1337765	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
160	NC_004459	GTGTG	2	10	1340354	1340363	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
161	NC_004459	GCAGT	2	10	1358187	1358196	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
162	NC_004459	GTATA	2	10	1358602	1358611	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
163	NC_004459	ATGTT	2	10	1358777	1358786	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
164	NC_004459	GCTCA	2	10	1383661	1383670	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
165	NC_004459	GTGAT	2	10	1389556	1389565	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
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167	NC_004459	TCCGC	2	10	1394923	1394932	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
168	NC_004459	TTATT	2	10	1395207	1395216	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
169	NC_004459	GCTGA	2	10	1404672	1404681	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
170	NC_004459	CTATT	2	10	1412977	1412986	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
171	NC_004459	TTTTG	2	10	1455414	1455423	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
172	NC_004459	TGCTT	2	10	1455472	1455481	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
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174	NC_004459	GTTAA	2	10	1463555	1463564	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
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179	NC_004459	AGTCG	2	10	1481461	1481470	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
180	NC_004459	ATTCC	2	10	1483375	1483384	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
181	NC_004459	ATTCC	2	10	1483624	1483633	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
182	NC_004459	AAAAC	2	10	1483737	1483746	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
183	NC_004459	TCCGC	2	10	1483837	1483846	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
184	NC_004459	TGCAA	2	10	1485800	1485809	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
185	NC_004459	TGAAA	2	10	1488261	1488270	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
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189	NC_004459	TTTTG	2	10	1520477	1520486	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
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192	NC_004459	TTTGA	2	10	1551073	1551082	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
193	NC_004459	CGTCC	2	10	1551152	1551161	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
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195	NC_004459	ATTTA	2	10	1588010	1588019	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
196	NC_004459	TGTGG	2	10	1591136	1591145	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
197	NC_004459	GATGC	2	10	1594761	1594770	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
198	NC_004459	ATCTT	2	10	1595733	1595742	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
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215	NC_004459	TAACA	2	10	1837131	1837140	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
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282	NC_004459	ATTTA	2	10	2462835	2462844	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
283	NC_004459	TCTCA	2	10	2462930	2462939	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
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285	NC_004459	TGCGT	2	10	2467351	2467360	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
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403	NC_004459	AACTC	2	10	3259273	3259282	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
404	NC_004459	CATCA	2	10	3272518	3272527	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.