MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Vibrio cholerae O1 biovar El Tor str. N16961 chromosome II

Total Repeats: 50

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_002506	TTCATA	2	12	48311	48322	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_002506	TTCAAT	2	12	53172	53183	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_002506	AATAAA	2	12	86561	86572	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_002506	ATATTT	2	12	180074	180085	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_002506	GGTATG	2	12	180287	180298	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
6	NC_002506	CTGTTT	2	12	185683	185694	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
7	NC_002506	GGATGT	2	12	186320	186331	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
8	NC_002506	AAGTGA	2	12	195285	195296	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9	NC_002506	TGTTGA	2	12	196482	196493	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10	NC_002506	TTATTT	2	12	202017	202028	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_002506	GAAGGA	2	12	243970	243981	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
12	NC_002506	GATGGA	2	12	258698	258709	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
13	NC_002506	CTTGTT	2	12	295667	295678	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_002506	GTTTGG	2	12	314204	314215	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
15	NC_002506	GTTTGG	2	12	316929	316940	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
16	NC_002506	GTTTGG	2	12	335950	335961	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
17	NC_002506	GAGTTT	2	12	338907	338918	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18	NC_002506	GTTTGG	2	12	345881	345892	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
19	NC_002506	GGTTGT	2	12	359926	359937	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
20	NC_002506	GTTTGA	2	12	382705	382716	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21	NC_002506	GTTTGG	2	12	383217	383228	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
22	NC_002506	TTTGGT	2	12	403859	403870	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_002506	GTTTGG	2	12	412297	412308	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
24	NC_002506	TTTTCA	2	12	445101	445112	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
25	NC_002506	TAGTGG	2	12	483895	483906	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
26	NC_002506	TGGTTA	2	12	584418	584429	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27	NC_002506	GATCAA	2	12	592835	592846	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
28	NC_002506	TCTTTT	2	12	594539	594550	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_002506	AAACTC	2	12	596206	596217	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_002506	AAATAA	2	12	630402	630413	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_002506	CAAATA	2	12	630676	630687	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
32	NC_002506	AATCGA	2	12	630805	630816	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
33	NC_002506	ATGGCG	2	12	630848	630859	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
34	NC_002506	CAACCC	2	12	677661	677672	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
35	NC_002506	GACACT	2	12	687719	687730	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_002506	AAAACC	2	12	704558	704569	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_002506	AGGAAT	2	12	719646	719657	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38	NC_002506	CTAAGC	2	12	783790	783801	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_002506	CAATAA	2	12	811752	811763	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
40	NC_002506	AAATTA	2	12	832426	832437	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_002506	TTATTG	2	12	845024	845035	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
42	NC_002506	CAAAAT	2	12	908435	908446	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
43	NC_002506	AATCAC	2	12	940616	940627	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_002506	TAGAAA	2	12	986488	986499	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
45	NC_002506	AAAATT	2	12	1015881	1015892	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_002506	AAAATG	2	12	1028097	1028108	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
47	NC_002506	CCATCA	2	12	1036272	1036283	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
48	NC_002506	TCCGCT	2	12	1039525	1039536	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
49	NC_002506	ATTTTG	2	12	1045363	1045374	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
50	NC_002506	AATTAA	2	12	1060950	1060961	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.