MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Vibrio cholerae O1 biovar El Tor str. N16961 chromosome II

Total Repeats: 3773

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_002506	CAA	2	6	987416	987421	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3502	NC_002506	GCA	2	6	987439	987444	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3503	NC_002506	CG	3	6	987460	987465	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3504	NC_002506	CGT	2	6	987473	987478	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3505	NC_002506	GAC	2	6	987480	987485	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3506	NC_002506	TGG	2	6	987524	987529	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3507	NC_002506	TCT	2	6	987544	987549	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3508	NC_002506	CAT	2	6	987559	987564	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3509	NC_002506	CTT	2	6	987583	987588	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3510	NC_002506	TTC	2	6	987653	987658	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3511	NC_002506	TAAA	2	8	987702	987709	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3512	NC_002506	ATA	2	6	987751	987756	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3513	NC_002506	A	6	6	987790	987795	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3514	NC_002506	A	6	6	989400	989405	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3515	NC_002506	AATA	2	8	991223	991230	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3516	NC_002506	AT	3	6	992992	992997	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3517	NC_002506	AG	3	6	993013	993018	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3518	NC_002506	TC	3	6	993024	993029	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3519	NC_002506	TTC	2	6	994305	994310	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3520	NC_002506	AAC	2	6	994379	994384	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3521	NC_002506	A	7	7	994441	994447	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3522	NC_002506	ATT	2	6	994541	994546	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3523	NC_002506	TTTAA	2	10	994547	994556	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
3524	NC_002506	A	6	6	994752	994757	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3525	NC_002506	TG	3	6	994783	994788	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3526	NC_002506	TAC	2	6	994835	994840	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3527	NC_002506	ACCTC	2	10	996878	996887	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
3528	NC_002506	GA	3	6	996895	996900	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3529	NC_002506	AGGT	2	8	996915	996922	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
3530	NC_002506	A	6	6	998102	998107	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3531	NC_002506	TGA	2	6	998805	998810	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3532	NC_002506	CCA	2	6	999770	999775	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3533	NC_002506	AG	3	6	999792	999797	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3534	NC_002506	TGA	2	6	999839	999844	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3535	NC_002506	CTGA	2	8	1000863	1000870	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3536	NC_002506	GTT	2	6	1002238	1002243	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3537	NC_002506	GCG	2	6	1002272	1002277	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3538	NC_002506	ATGA	2	8	1002292	1002299	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3539	NC_002506	ACTC	2	8	1003127	1003134	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
3540	NC_002506	G	11	11	1003184	1003194	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3541	NC_002506	AAGC	2	8	1003197	1003204	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
3542	NC_002506	GCAC	2	8	1003680	1003687	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
3543	NC_002506	TG	3	6	1003718	1003723	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3544	NC_002506	GT	3	6	1004397	1004402	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3545	NC_002506	ATG	2	6	1004454	1004459	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3546	NC_002506	TCAG	2	8	1007761	1007768	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3547	NC_002506	A	6	6	1007873	1007878	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3548	NC_002506	A	7	7	1007936	1007942	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3549	NC_002506	TGT	2	6	1007968	1007973	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3550	NC_002506	C	7	7	1008023	1008029	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
3551	NC_002506	ATCT	2	8	1008039	1008046	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3552	NC_002506	CCT	2	6	1008071	1008076	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3553	NC_002506	AGT	2	6	1008090	1008095	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3554	NC_002506	T	6	6	1008120	1008125	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3555	NC_002506	TTG	2	6	1008933	1008938	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3556	NC_002506	AT	3	6	1008939	1008944	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3557	NC_002506	GCA	2	6	1009933	1009938	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3558	NC_002506	GC	3	6	1009959	1009964	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3559	NC_002506	TCA	2	6	1010625	1010630	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3560	NC_002506	TGA	2	6	1010645	1010650	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3561	NC_002506	TTC	2	6	1010672	1010677	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3562	NC_002506	A	6	6	1011348	1011353	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3563	NC_002506	CGC	2	6	1011425	1011430	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3564	NC_002506	GT	3	6	1011444	1011449	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3565	NC_002506	TC	4	8	1011457	1011464	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3566	NC_002506	CTG	2	6	1011504	1011509	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3567	NC_002506	CGA	2	6	1011514	1011519	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3568	NC_002506	ACC	2	6	1011551	1011556	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3569	NC_002506	CGCCC	2	10	1011569	1011578	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
3570	NC_002506	TTG	2	6	1011587	1011592	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3571	NC_002506	CGC	2	6	1011613	1011618	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3572	NC_002506	CAGA	2	8	1011717	1011724	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
3573	NC_002506	TGC	2	6	1011756	1011761	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3574	NC_002506	T	8	8	1015360	1015367	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3575	NC_002506	ATT	2	6	1015390	1015395	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3576	NC_002506	AAAT	2	8	1015422	1015429	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3577	NC_002506	AAT	2	6	1015456	1015461	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3578	NC_002506	TAA	2	6	1015502	1015507	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3579	NC_002506	AGC	2	6	1015666	1015671	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3580	NC_002506	AGATG	2	10	1015688	1015697	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
3581	NC_002506	AAAG	2	8	1015708	1015715	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
3582	NC_002506	AGT	2	6	1015716	1015721	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3583	NC_002506	AGT	2	6	1015725	1015730	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3584	NC_002506	CAT	2	6	1015744	1015749	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3585	NC_002506	TG	3	6	1015770	1015775	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3586	NC_002506	AAT	2	6	1015817	1015822	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3587	NC_002506	CGT	2	6	1015838	1015843	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3588	NC_002506	AAAATT	2	12	1015881	1015892	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3589	NC_002506	AT	4	8	1015922	1015929	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3590	NC_002506	ATTT	2	8	1015935	1015942	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3591	NC_002506	CAA	2	6	1015945	1015950	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3592	NC_002506	AT	4	8	1015965	1015972	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3593	NC_002506	ATA	2	6	1016001	1016006	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3594	NC_002506	AAC	2	6	1016029	1016034	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3595	NC_002506	AAC	2	6	1016079	1016084	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3596	NC_002506	AAATA	2	10	1017784	1017793	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
3597	NC_002506	TA	3	6	1017792	1017797	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3598	NC_002506	ACT	2	6	1017799	1017804	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3599	NC_002506	AGG	2	6	1017818	1017823	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3600	NC_002506	CGC	2	6	1017887	1017892	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3601	NC_002506	C	6	6	1017920	1017925	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
3602	NC_002506	AATAC	2	10	1018455	1018464	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
3603	NC_002506	GAA	2	6	1020570	1020575	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3604	NC_002506	TCA	2	6	1020676	1020681	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3605	NC_002506	CAGC	2	8	1020788	1020795	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
3606	NC_002506	TGT	2	6	1021169	1021174	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3607	NC_002506	AAT	2	6	1021208	1021213	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3608	NC_002506	CAGA	2	8	1021217	1021224	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
3609	NC_002506	AAAG	2	8	1021229	1021236	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
3610	NC_002506	TGGC	2	8	1026728	1026735	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3611	NC_002506	GAA	2	6	1026754	1026759	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3612	NC_002506	AACAA	2	10	1026805	1026814	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
3613	NC_002506	CAAG	2	8	1026834	1026841	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
3614	NC_002506	ATT	2	6	1026853	1026858	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3615	NC_002506	TTG	2	6	1026865	1026870	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3616	NC_002506	CAA	2	6	1026876	1026881	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3617	NC_002506	GCAG	2	8	1026913	1026920	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3618	NC_002506	TCA	2	6	1026943	1026948	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3619	NC_002506	TAA	2	6	1027951	1027956	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3620	NC_002506	A	6	6	1028042	1028047	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3621	NC_002506	AAAATG	2	12	1028097	1028108	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
3622	NC_002506	A	6	6	1028125	1028130	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3623	NC_002506	TGA	2	6	1028155	1028160	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3624	NC_002506	TAA	2	6	1028190	1028195	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3625	NC_002506	ACC	2	6	1029533	1029538	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3626	NC_002506	G	6	6	1031383	1031388	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3627	NC_002506	C	6	6	1031393	1031398	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
3628	NC_002506	TG	3	6	1031481	1031486	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3629	NC_002506	CAG	2	6	1031489	1031494	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3630	NC_002506	GGCT	2	8	1031571	1031578	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3631	NC_002506	T	7	7	1031578	1031584	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3632	NC_002506	CGC	2	6	1031648	1031653	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3633	NC_002506	GGA	2	6	1031663	1031668	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3634	NC_002506	TGAT	2	8	1032431	1032438	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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3753	NC_002506	CTT	2	6	1062292	1062297	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3754	NC_002506	A	6	6	1062303	1062308	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3757	NC_002506	AGA	2	6	1062556	1062561	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3758	NC_002506	GCCA	2	8	1062572	1062579	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
3759	NC_002506	CG	3	6	1062629	1062634	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3760	NC_002506	CGGTA	2	10	1062675	1062684	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
3761	NC_002506	CCT	2	6	1063629	1063634	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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3763	NC_002506	AGC	2	6	1066580	1066585	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3764	NC_002506	GCCA	2	8	1066588	1066595	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
3765	NC_002506	TGA	2	6	1066608	1066613	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3766	NC_002506	CCG	2	6	1066658	1066663	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3767	NC_002506	T	6	6	1068818	1068823	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3768	NC_002506	A	6	6	1068857	1068862	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3769	NC_002506	TGGGC	2	10	1068893	1068902	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
3770	NC_002506	TTA	2	6	1072223	1072228	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3771	NC_002506	TTTA	2	8	1072256	1072263	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3772	NC_002506	ACA	2	6	1072266	1072271	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3773	NC_002506	CA	3	6	1072303	1072308	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding

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