MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Vibrio cholerae O1 biovar El Tor str. N16961 chromosome II

Total Repeats: 3773

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_002506	TCT	2	6	159107	159112	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
502	NC_002506	AAAG	2	8	160260	160267	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
503	NC_002506	TTC	2	6	160280	160285	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
504	NC_002506	CCG	2	6	160299	160304	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
505	NC_002506	GCT	2	6	160322	160327	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
506	NC_002506	TCT	2	6	163755	163760	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
507	NC_002506	TA	3	6	163783	163788	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
508	NC_002506	TCA	2	6	163789	163794	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
509	NC_002506	ATT	2	6	163805	163810	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
510	NC_002506	T	7	7	163851	163857	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
511	NC_002506	AAG	2	6	163877	163882	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
512	NC_002506	TAA	3	9	163954	163962	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
513	NC_002506	T	6	6	167877	167882	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
514	NC_002506	GA	3	6	167928	167933	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
515	NC_002506	CGC	2	6	167947	167952	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
516	NC_002506	GCC	2	6	168526	168531	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
517	NC_002506	GGC	2	6	168541	168546	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
518	NC_002506	TGA	2	6	169993	169998	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
519	NC_002506	AGT	2	6	170001	170006	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
520	NC_002506	CTGG	2	8	170020	170027	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
521	NC_002506	GCA	2	6	170041	170046	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
522	NC_002506	CGC	2	6	175666	175671	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
523	NC_002506	TTG	2	6	175683	175688	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
524	NC_002506	CTA	2	6	175714	175719	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
525	NC_002506	TGG	2	6	175762	175767	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
526	NC_002506	TCC	2	6	175986	175991	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
527	NC_002506	CTT	2	6	177162	177167	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
528	NC_002506	TTG	2	6	178433	178438	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
529	NC_002506	TGT	2	6	178443	178448	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
530	NC_002506	A	7	7	178464	178470	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
531	NC_002506	GATT	2	8	179991	179998	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
532	NC_002506	ATA	2	6	180020	180025	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
533	NC_002506	ATATTT	2	12	180074	180085	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
534	NC_002506	TAGA	2	8	180131	180138	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
535	NC_002506	GTT	2	6	180197	180202	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
536	NC_002506	CGTT	2	8	180208	180215	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
537	NC_002506	CTA	2	6	180266	180271	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
538	NC_002506	GGTATG	2	12	180287	180298	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
539	NC_002506	CAAG	2	8	180312	180319	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
540	NC_002506	AGA	2	6	180408	180413	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
541	NC_002506	GTT	2	6	180451	180456	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
542	NC_002506	A	6	6	180570	180575	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
543	NC_002506	GTGG	2	8	180583	180590	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
544	NC_002506	CGCTT	2	10	180655	180664	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
545	NC_002506	CGA	2	6	180685	180690	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
546	NC_002506	TGC	2	6	180930	180935	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
547	NC_002506	TGT	2	6	180940	180945	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
548	NC_002506	AAAC	2	8	181487	181494	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
549	NC_002506	TCT	2	6	181516	181521	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
550	NC_002506	AG	3	6	181581	181586	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
551	NC_002506	TCGG	2	8	181609	181616	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
552	NC_002506	GGA	2	6	181617	181622	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
553	NC_002506	A	6	6	181663	181668	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
554	NC_002506	AAC	2	6	181726	181731	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
555	NC_002506	GCTG	2	8	181743	181750	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
556	NC_002506	A	7	7	181775	181781	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
557	NC_002506	GCG	2	6	181784	181789	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
558	NC_002506	ATTG	2	8	181815	181822	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
559	NC_002506	CAG	2	6	184019	184024	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
560	NC_002506	AAAT	2	8	184051	184058	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
561	NC_002506	A	6	6	184070	184075	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
562	NC_002506	GTT	2	6	184110	184115	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
563	NC_002506	AT	4	8	184238	184245	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
564	NC_002506	GATT	2	8	184478	184485	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
565	NC_002506	GTG	2	6	184497	184502	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
566	NC_002506	A	6	6	184572	184577	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
567	NC_002506	AATG	2	8	184587	184594	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
568	NC_002506	CATT	2	8	184601	184608	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
569	NC_002506	T	6	6	184607	184612	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
570	NC_002506	TGC	2	6	184733	184738	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
571	NC_002506	TCC	2	6	185480	185485	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
572	NC_002506	ATTG	2	8	185487	185494	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
573	NC_002506	GAC	2	6	185506	185511	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
574	NC_002506	CCA	2	6	185540	185545	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
575	NC_002506	CCT	2	6	185616	185621	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
576	NC_002506	CGG	2	6	185641	185646	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
577	NC_002506	GCTGC	2	10	185662	185671	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
578	NC_002506	CTGTTT	2	12	185683	185694	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
579	NC_002506	CTC	2	6	185794	185799	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
580	NC_002506	TTG	2	6	185863	185868	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
581	NC_002506	CAG	2	6	186001	186006	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
582	NC_002506	CAG	2	6	186013	186018	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
583	NC_002506	AT	3	6	186023	186028	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
584	NC_002506	CGA	2	6	186045	186050	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
585	NC_002506	GGCT	2	8	186074	186081	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
586	NC_002506	TTC	2	6	186103	186108	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
587	NC_002506	TGCC	2	8	186132	186139	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
588	NC_002506	CCA	2	6	186174	186179	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
589	NC_002506	GCCT	2	8	186210	186217	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
590	NC_002506	CTTG	2	8	186233	186240	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
591	NC_002506	CT	3	6	186307	186312	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
592	NC_002506	GGATGT	2	12	186320	186331	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
593	NC_002506	TTG	3	9	186339	186347	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
594	NC_002506	ATGGC	2	10	186385	186394	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
595	NC_002506	TTG	2	6	186432	186437	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
596	NC_002506	AGT	2	6	186527	186532	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
597	NC_002506	GCCT	2	8	186633	186640	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
598	NC_002506	GCTC	2	8	186716	186723	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
599	NC_002506	G	6	6	186759	186764	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
600	NC_002506	CGA	2	6	186785	186790	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
601	NC_002506	GTTC	2	8	186851	186858	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
602	NC_002506	CTT	2	6	186885	186890	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
603	NC_002506	AGT	2	6	187026	187031	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
604	NC_002506	TGA	2	6	187038	187043	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
605	NC_002506	GAG	2	6	187052	187057	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
606	NC_002506	CAA	2	6	187074	187079	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
607	NC_002506	A	6	6	187078	187083	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
608	NC_002506	TGAC	2	8	187133	187140	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
609	NC_002506	CAG	2	6	187237	187242	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
610	NC_002506	A	6	6	187251	187256	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
611	NC_002506	A	6	6	192611	192616	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
612	NC_002506	CAGC	2	8	192622	192629	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
613	NC_002506	A	6	6	192640	192645	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
614	NC_002506	AATG	2	8	192687	192694	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
615	NC_002506	AGC	2	6	192698	192703	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
616	NC_002506	TCA	2	6	195054	195059	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
617	NC_002506	GGC	2	6	195127	195132	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
618	NC_002506	ATAG	2	8	195155	195162	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
619	NC_002506	GAAC	2	8	195178	195185	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
620	NC_002506	ATA	2	6	195228	195233	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
621	NC_002506	AAGTGA	2	12	195285	195296	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
622	NC_002506	TCC	2	6	195962	195967	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
623	NC_002506	TGA	2	6	195979	195984	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
624	NC_002506	GTGA	2	8	196025	196032	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
625	NC_002506	A	6	6	196064	196069	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
626	NC_002506	CTT	2	6	196080	196085	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
627	NC_002506	GTT	2	6	196113	196118	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
628	NC_002506	AAT	2	6	196135	196140	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
629	NC_002506	GCT	2	6	196160	196165	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
630	NC_002506	A	6	6	196316	196321	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
631	NC_002506	A	6	6	196345	196350	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
632	NC_002506	TGA	2	6	196353	196358	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
633	NC_002506	T	7	7	196365	196371	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
634	NC_002506	AGGAC	2	10	196450	196459	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
635	NC_002506	TGTTGA	2	12	196482	196493	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
636	NC_002506	CCT	2	6	196521	196526	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
637	NC_002506	AC	3	6	196546	196551	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
638	NC_002506	CAA	2	6	197818	197823	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
639	NC_002506	T	6	6	197856	197861	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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642	NC_002506	GTA	2	6	197977	197982	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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645	NC_002506	ATG	2	6	199335	199340	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
646	NC_002506	AGC	2	6	199351	199356	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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648	NC_002506	GTA	2	6	199450	199455	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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662	NC_002506	T	6	6	204396	204401	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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681	NC_002506	A	8	8	213059	213066	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
682	NC_002506	T	7	7	213112	213118	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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776	NC_002506	AT	3	6	247380	247385	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
777	NC_002506	ATAAA	2	10	247411	247420	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
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