MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Vibrio cholerae O1 biovar El Tor str. N16961 chromosome I

Total Repeats: 1150

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_002505	TCAA	2	8	2261	2268	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
2	NC_002505	ACTC	2	8	4784	4791	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
3	NC_002505	TCCT	2	8	6283	6290	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4	NC_002505	CATT	2	8	13774	13781	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5	NC_002505	GTTC	2	8	16709	16716	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
6	NC_002505	ACAA	2	8	20205	20212	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
7	NC_002505	TGAC	2	8	21863	21870	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
8	NC_002505	TTTC	2	8	21997	22004	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
9	NC_002505	ATGG	2	8	23062	23069	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
10	NC_002505	CTAT	2	8	23102	23109	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
11	NC_002505	TATC	2	8	29658	29665	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
12	NC_002505	GTCT	2	8	29705	29712	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
13	NC_002505	TCAA	2	8	35858	35865	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
14	NC_002505	ACTT	2	8	36084	36091	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
15	NC_002505	ATTT	2	8	36903	36910	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_002505	TTTG	2	8	41948	41955	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
17	NC_002505	CCAT	2	8	43310	43317	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
18	NC_002505	TTAT	2	8	49964	49971	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_002505	CAAG	2	8	49976	49983	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
20	NC_002505	GGTA	2	8	53333	53340	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
21	NC_002505	CAAT	2	8	53640	53647	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
22	NC_002505	TTAA	2	8	53754	53761	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_002505	GATT	2	8	55390	55397	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
24	NC_002505	CTGA	2	8	56208	56215	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
25	NC_002505	GTAC	2	8	56292	56299	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
26	NC_002505	AGTA	2	8	56694	56701	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
27	NC_002505	CGTC	2	8	56731	56738	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
28	NC_002505	AAAG	2	8	56853	56860	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
29	NC_002505	TAAT	2	8	59170	59177	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_002505	CCAG	2	8	66313	66320	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
31	NC_002505	ATCT	2	8	86394	86401	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
32	NC_002505	CAGA	2	8	95049	95056	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
33	NC_002505	TTGA	2	8	99563	99570	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
34	NC_002505	ATAA	2	8	102942	102949	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_002505	TTAC	2	8	103071	103078	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
36	NC_002505	GGTC	2	8	106240	106247	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
37	NC_002505	GATT	2	8	106266	106273	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
38	NC_002505	GATT	2	8	107341	107348	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
39	NC_002505	TGCG	2	8	114736	114743	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
40	NC_002505	CAAA	2	8	128537	128544	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
41	NC_002505	GACC	2	8	132727	132734	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
42	NC_002505	TATT	2	8	134668	134675	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_002505	TTGT	2	8	134700	134707	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
44	NC_002505	GTTT	2	8	134745	134752	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
45	NC_002505	TCTA	2	8	140923	140930	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
46	NC_002505	CGTT	2	8	140969	140976	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
47	NC_002505	CTTG	2	8	142594	142601	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
48	NC_002505	CCAA	2	8	142713	142720	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
49	NC_002505	ATTG	2	8	145051	145058	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
50	NC_002505	TTCA	2	8	145108	145115	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
51	NC_002505	AACG	2	8	145225	145232	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
52	NC_002505	GAAA	2	8	149073	149080	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
53	NC_002505	CAAT	2	8	150893	150900	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
54	NC_002505	GATT	2	8	152624	152631	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
55	NC_002505	CTGA	2	8	153448	153455	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
56	NC_002505	GTAC	2	8	153532	153539	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
57	NC_002505	AGTA	2	8	153934	153941	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
58	NC_002505	CGTC	2	8	153971	153978	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
59	NC_002505	AAAG	2	8	154093	154100	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
60	NC_002505	CTTT	2	8	159001	159008	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
61	NC_002505	TAAA	2	8	164382	164389	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_002505	ATTT	2	8	167655	167662	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_002505	AAGA	2	8	167690	167697	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
64	NC_002505	GTTG	2	8	168193	168200	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
65	NC_002505	GATT	2	8	173973	173980	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
66	NC_002505	ATTT	2	8	174038	174045	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_002505	CTTT	2	8	175147	175154	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
68	NC_002505	TTAA	2	8	177416	177423	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_002505	TCTA	2	8	177441	177448	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
70	NC_002505	GGAT	2	8	178746	178753	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
71	NC_002505	CATC	2	8	178784	178791	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
72	NC_002505	TCAA	2	8	179064	179071	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
73	NC_002505	GAGT	2	8	191902	191909	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
74	NC_002505	TTTA	2	8	197012	197019	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_002505	GTGG	2	8	198758	198765	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
76	NC_002505	TTAA	2	8	206404	206411	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_002505	ACGG	2	8	215921	215928	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
78	NC_002505	CTTT	2	8	215959	215966	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
79	NC_002505	TAAA	2	8	216519	216526	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_002505	AAGT	2	8	218629	218636	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
81	NC_002505	GATA	2	8	229958	229965	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
82	NC_002505	TAAG	2	8	260529	260536	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
83	NC_002505	TCAA	2	8	260798	260805	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
84	NC_002505	TAAG	2	8	261888	261895	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
85	NC_002505	ATCA	2	8	270509	270516	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
86	NC_002505	TCCC	2	8	270534	270541	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
87	NC_002505	AATC	2	8	271944	271951	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
88	NC_002505	TAGG	2	8	274415	274422	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
89	NC_002505	CTTA	2	8	280834	280841	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
90	NC_002505	TGAT	2	8	283187	283194	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
91	NC_002505	CTGA	2	8	285101	285108	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
92	NC_002505	GATG	2	8	285242	285249	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
93	NC_002505	CCTC	2	8	285321	285328	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
94	NC_002505	GTTG	2	8	292248	292255	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
95	NC_002505	AGCA	2	8	293358	293365	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
96	NC_002505	TATT	2	8	294007	294014	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_002505	TGAT	2	8	302368	302375	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
98	NC_002505	GCAA	2	8	305059	305066	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
99	NC_002505	TCAG	2	8	307153	307160	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
100	NC_002505	AGTA	2	8	314794	314801	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
101	NC_002505	TTAA	2	8	318197	318204	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_002505	ACTA	2	8	318271	318278	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
103	NC_002505	TTTG	2	8	319590	319597	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
104	NC_002505	GAAC	2	8	319630	319637	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
105	NC_002505	TAGA	2	8	323631	323638	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
106	NC_002505	ATAA	2	8	323705	323712	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_002505	CAAT	2	8	323960	323967	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
108	NC_002505	GATT	2	8	325710	325717	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
109	NC_002505	GCCT	2	8	325851	325858	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
110	NC_002505	CTGA	2	8	326613	326620	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
111	NC_002505	GTAC	2	8	326697	326704	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
112	NC_002505	AGTA	2	8	327099	327106	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
113	NC_002505	CGTC	2	8	327136	327143	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
114	NC_002505	AAAG	2	8	327258	327265	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
115	NC_002505	GTAG	2	8	334828	334835	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
116	NC_002505	TAAA	2	8	339727	339734	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_002505	GTAA	2	8	350297	350304	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
118	NC_002505	CCAG	2	8	352384	352391	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
119	NC_002505	TACT	2	8	361037	361044	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
120	NC_002505	TCAT	2	8	363107	363114	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
121	NC_002505	TGCT	2	8	363311	363318	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
122	NC_002505	GCTA	2	8	370098	370105	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
123	NC_002505	GTTG	2	8	375525	375532	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
124	NC_002505	TAAG	2	8	378900	378907	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
125	NC_002505	AGGA	2	8	381738	381745	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
126	NC_002505	ATGA	2	8	383219	383226	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
127	NC_002505	AAGA	2	8	385124	385131	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
128	NC_002505	CATG	2	8	389139	389146	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
129	NC_002505	CGGT	2	8	389679	389686	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
130	NC_002505	ATTA	2	8	389747	389754	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_002505	AATG	2	8	395443	395450	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
132	NC_002505	TTCT	2	8	396826	396833	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
133	NC_002505	ATAA	2	8	401326	401333	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_002505	CAAT	2	8	401581	401588	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
135	NC_002505	GATT	2	8	403313	403320	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
136	NC_002505	GCCT	2	8	403454	403461	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
137	NC_002505	CTGA	2	8	404217	404224	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
138	NC_002505	GTAC	2	8	404301	404308	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
139	NC_002505	AGTA	2	8	404703	404710	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
140	NC_002505	CGTC	2	8	404740	404747	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
141	NC_002505	AAAG	2	8	404862	404869	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
142	NC_002505	TCCA	2	8	412723	412730	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
143	NC_002505	GCAA	2	8	420528	420535	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
144	NC_002505	CACT	2	8	421631	421638	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
145	NC_002505	ACGA	2	8	442136	442143	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
146	NC_002505	TCCT	2	8	454164	454171	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
147	NC_002505	GTAG	2	8	454198	454205	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
148	NC_002505	CGTT	2	8	454246	454253	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
149	NC_002505	TATT	2	8	454580	454587	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_002505	AAAG	2	8	454760	454767	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
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