MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Vibrio nigripulchritudo str. SFn1 chromosome

Total Repeats: 34971

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_022543	CCGC	2	8	254946	254953	0 %	0 %	25 %	75 %	549718499
4002	NC_022543	TGC	2	6	254991	254996	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549718499
4003	NC_022543	AGA	2	6	255010	255015	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549718499
4004	NC_022543	CCG	2	6	255066	255071	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549718499
4005	NC_022543	TGGAG	2	10	255088	255097	20 %	20 %	60 %	0 %	549718499
4006	NC_022543	ATCA	2	8	255167	255174	50 %	25 %	0 %	25 %	549718499
4007	NC_022543	TGA	2	6	255210	255215	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549718499
4008	NC_022543	GAT	2	6	255397	255402	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549718499
4009	NC_022543	GA	3	6	255447	255452	50 %	0 %	50 %	0 %	549718499
4010	NC_022543	GAA	2	6	255669	255674	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549718500
4011	NC_022543	ATC	2	6	255718	255723	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549718500
4012	NC_022543	CTT	2	6	255834	255839	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549718500
4013	NC_022543	ATC	2	6	255859	255864	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549718500
4014	NC_022543	TCAG	2	8	255917	255924	25 %	25 %	25 %	25 %	549718500
4015	NC_022543	TGC	2	6	256004	256009	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549718500
4016	NC_022543	GGC	2	6	256117	256122	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549718500
4017	NC_022543	GCA	2	6	256185	256190	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549718500
4018	NC_022543	GTAC	2	8	256267	256274	25 %	25 %	25 %	25 %	549718500
4019	NC_022543	GAA	2	6	256593	256598	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549718500
4020	NC_022543	AGA	2	6	256605	256610	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549718500
4021	NC_022543	TGG	2	6	256619	256624	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549718500
4022	NC_022543	TTC	2	6	256659	256664	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549718500
4023	NC_022543	CAT	2	6	256743	256748	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549718500
4024	NC_022543	G	6	6	256756	256761	0 %	0 %	100 %	0 %	549718500
4025	NC_022543	TGG	2	6	256784	256789	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549718500
4026	NC_022543	GCG	2	6	256879	256884	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549718500
4027	NC_022543	GGTG	2	8	256890	256897	0 %	25 %	75 %	0 %	549718500
4028	NC_022543	TTC	2	6	256906	256911	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549718500
4029	NC_022543	TCA	3	9	256919	256927	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549718500
4030	NC_022543	GGC	2	6	257013	257018	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549718500
4031	NC_022543	CAA	2	6	257106	257111	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	549718500
4032	NC_022543	TGG	2	6	257117	257122	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549718500
4033	NC_022543	GCT	2	6	257136	257141	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549718500
4034	NC_022543	CGA	2	6	257276	257281	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549718500
4035	NC_022543	GA	3	6	257312	257317	50 %	0 %	50 %	0 %	549718500
4036	NC_022543	GCA	2	6	257322	257327	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549718500
4037	NC_022543	CAA	2	6	257331	257336	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	549718500
4038	NC_022543	GAT	2	6	257421	257426	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549718500
4039	NC_022543	CGG	2	6	257801	257806	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549718500
4040	NC_022543	C	6	6	257982	257987	0 %	0 %	0 %	100 %	549718500
4041	NC_022543	GAT	2	6	257988	257993	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549718500
4042	NC_022543	GCA	2	6	258075	258080	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549718500
4043	NC_022543	CCG	2	6	258107	258112	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549718500
4044	NC_022543	GAGC	2	8	258151	258158	25 %	0 %	50 %	25 %	549718500
4045	NC_022543	GTC	2	6	258175	258180	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549718500
4046	NC_022543	CAT	2	6	258198	258203	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549718500
4047	NC_022543	TGC	3	9	258206	258214	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549718500
4048	NC_022543	ATC	2	6	258250	258255	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549718500
4049	NC_022543	GGTTGG	2	12	258330	258341	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549718500
4050	NC_022543	TCA	2	6	258380	258385	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549718500
4051	NC_022543	TCAA	2	8	258398	258405	50 %	25 %	0 %	25 %	549718500
4052	NC_022543	GCA	2	6	258430	258435	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549718500
4053	NC_022543	GAC	2	6	258460	258465	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549718500
4054	NC_022543	ATG	2	6	258514	258519	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549718500
4055	NC_022543	CAT	2	6	258552	258557	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549718500
4056	NC_022543	TGC	2	6	258597	258602	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549718500
4057	NC_022543	TGG	2	6	258612	258617	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549718500
4058	NC_022543	TTG	2	6	258643	258648	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549718500
4059	NC_022543	A	6	6	258767	258772	100 %	0 %	0 %	0 %	549718501
4060	NC_022543	CAA	2	6	258801	258806	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	549718501
4061	NC_022543	ATG	2	6	258887	258892	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549718501
4062	NC_022543	GTA	2	6	258950	258955	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549718501
4063	NC_022543	CGA	2	6	258970	258975	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549718501
4064	NC_022543	AAGA	2	8	258992	258999	75 %	0 %	25 %	0 %	549718501
4065	NC_022543	ATG	2	6	259017	259022	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549718501
4066	NC_022543	ATG	2	6	259109	259114	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549718501
4067	NC_022543	ACG	2	6	259543	259548	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549718502
4068	NC_022543	AGGGTT	2	12	259589	259600	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	549718502
4069	NC_022543	GGA	2	6	259607	259612	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549718502
4070	NC_022543	A	7	7	259684	259690	100 %	0 %	0 %	0 %	549718502
4071	NC_022543	A	6	6	259710	259715	100 %	0 %	0 %	0 %	549718502
4072	NC_022543	A	6	6	259726	259731	100 %	0 %	0 %	0 %	549718502
4073	NC_022543	GAA	2	6	259737	259742	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549718502
4074	NC_022543	AAT	2	6	259804	259809	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	549718502
4075	NC_022543	TCA	2	6	259905	259910	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549718503
4076	NC_022543	TAA	2	6	260131	260136	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	549718503
4077	NC_022543	CA	3	6	260171	260176	50 %	0 %	0 %	50 %	549718503
4078	NC_022543	AATG	2	8	260278	260285	50 %	25 %	25 %	0 %	549718503
4079	NC_022543	GCT	2	6	260297	260302	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549718503
4080	NC_022543	CAGCCT	2	12	260306	260317	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	549718503
4081	NC_022543	TTGT	2	8	260410	260417	0 %	75 %	25 %	0 %	549718503
4082	NC_022543	CTT	2	6	260440	260445	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549718503
4083	NC_022543	AG	3	6	260564	260569	50 %	0 %	50 %	0 %	549718503
4084	NC_022543	CAG	2	6	260644	260649	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549718503
4085	NC_022543	GAA	2	6	260656	260661	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549718503
4086	NC_022543	GC	3	6	260789	260794	0 %	0 %	50 %	50 %	549718504
4087	NC_022543	GAT	2	6	260812	260817	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549718504
4088	NC_022543	CTGA	2	8	260827	260834	25 %	25 %	25 %	25 %	549718504
4089	NC_022543	AGA	2	6	260847	260852	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549718504
4090	NC_022543	CTTA	2	8	260854	260861	25 %	50 %	0 %	25 %	549718504
4091	NC_022543	ATG	2	6	260957	260962	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549718504
4092	NC_022543	TTG	2	6	260978	260983	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549718504
4093	NC_022543	GTTT	2	8	261027	261034	0 %	75 %	25 %	0 %	549718504
4094	NC_022543	TGCT	2	8	261080	261087	0 %	50 %	25 %	25 %	549718504
4095	NC_022543	A	6	6	261156	261161	100 %	0 %	0 %	0 %	549718504
4096	NC_022543	AAG	2	6	261203	261208	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549718504
4097	NC_022543	AAAGA	2	10	261220	261229	80 %	0 %	20 %	0 %	549718504
4098	NC_022543	GTT	2	6	261255	261260	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549718504
4099	NC_022543	AGA	2	6	261331	261336	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549718505
4100	NC_022543	GCC	2	6	261386	261391	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549718505
4101	NC_022543	GTC	2	6	261464	261469	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549718505
4102	NC_022543	GTG	2	6	261494	261499	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549718505
4103	NC_022543	CAAA	2	8	261541	261548	75 %	0 %	0 %	25 %	549718505
4104	NC_022543	GAT	2	6	261607	261612	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549718505
4105	NC_022543	CGA	2	6	261616	261621	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549718505
4106	NC_022543	AAG	2	6	261664	261669	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549718505
4107	NC_022543	TAC	2	6	261809	261814	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549718506
4108	NC_022543	GTT	2	6	261844	261849	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549718506
4109	NC_022543	AGT	2	6	261883	261888	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549718506
4110	NC_022543	TTAC	2	8	261939	261946	25 %	50 %	0 %	25 %	549718506
4111	NC_022543	TCT	2	6	261965	261970	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549718506
4112	NC_022543	ATGCA	2	10	262023	262032	40 %	20 %	20 %	20 %	549718506
4113	NC_022543	AGA	2	6	262120	262125	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549718506
4114	NC_022543	ACA	2	6	262168	262173	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	549718506
4115	NC_022543	CTTT	2	8	262225	262232	0 %	75 %	0 %	25 %	549718507
4116	NC_022543	GTC	2	6	262241	262246	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549718507
4117	NC_022543	CCG	2	6	262254	262259	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549718507
4118	NC_022543	CAGTTC	2	12	262268	262279	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	549718507
4119	NC_022543	AAG	2	6	262290	262295	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549718507
4120	NC_022543	GTA	2	6	262405	262410	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549718507
4121	NC_022543	CT	3	6	262414	262419	0 %	50 %	0 %	50 %	549718507
4122	NC_022543	TCA	2	6	262443	262448	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549718507
4123	NC_022543	CTA	2	6	262474	262479	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549718507
4124	NC_022543	CAT	2	6	262525	262530	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549718507
4125	NC_022543	TGC	2	6	262558	262563	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549718507
4126	NC_022543	GTC	2	6	262628	262633	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549718507
4127	NC_022543	TGA	2	6	262636	262641	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549718507
4128	NC_022543	T	6	6	262654	262659	0 %	100 %	0 %	0 %	549718507
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4130	NC_022543	CGG	2	6	262711	262716	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549718507
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4139	NC_022543	CTCA	2	8	263279	263286	25 %	25 %	0 %	50 %	549718507
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4145	NC_022543	GGTA	2	8	264140	264147	25 %	25 %	50 %	0 %	549718508
4146	NC_022543	TTG	2	6	264172	264177	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549718508
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4149	NC_022543	CGG	2	6	264493	264498	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549718509
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4151	NC_022543	TCG	2	6	264709	264714	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549718509
4152	NC_022543	TG	3	6	264717	264722	0 %	50 %	50 %	0 %	549718509
4153	NC_022543	AGAA	2	8	264792	264799	75 %	0 %	25 %	0 %	549718509
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4158	NC_022543	AAG	2	6	265130	265135	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549718510
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4163	NC_022543	TG	3	6	265426	265431	0 %	50 %	50 %	0 %	549718511
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4222	NC_022543	TGGA	2	8	269882	269889	25 %	25 %	50 %	0 %	549718515
4223	NC_022543	ACCG	2	8	269920	269927	25 %	0 %	25 %	50 %	549718515
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4225	NC_022543	CA	3	6	269973	269978	50 %	0 %	0 %	50 %	549718515
4226	NC_022543	AAC	2	6	270087	270092	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	549718515
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4228	NC_022543	CAA	2	6	270208	270213	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	549718515
4229	NC_022543	AGA	2	6	270259	270264	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549718515
4230	NC_022543	CGTT	2	8	270277	270284	0 %	50 %	25 %	25 %	549718515
4231	NC_022543	ACA	2	6	270309	270314	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	549718515
4232	NC_022543	TGA	2	6	270408	270413	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549718515
4233	NC_022543	CAG	2	6	270423	270428	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549718515
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4235	NC_022543	AAT	2	6	270554	270559	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	549718515
4236	NC_022543	CTG	2	6	270612	270617	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549718515
4237	NC_022543	AGC	2	6	270660	270665	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549718515
4238	NC_022543	T	6	6	270774	270779	0 %	100 %	0 %	0 %	549718516
4239	NC_022543	GCT	2	6	270784	270789	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549718516
4240	NC_022543	ACC	2	6	270813	270818	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549718516
4241	NC_022543	GCAA	2	8	270883	270890	50 %	0 %	25 %	25 %	549718516
4242	NC_022543	TCA	2	6	270950	270955	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549718516
4243	NC_022543	GCT	2	6	270968	270973	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549718516
4244	NC_022543	T	6	6	270996	271001	0 %	100 %	0 %	0 %	549718516
4245	NC_022543	CTA	2	6	271052	271057	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549718516
4246	NC_022543	TACT	2	8	271085	271092	25 %	50 %	0 %	25 %	549718516
4247	NC_022543	TCA	2	6	271208	271213	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549718516
4248	NC_022543	GCA	3	9	271231	271239	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549718516
4249	NC_022543	GT	3	6	271246	271251	0 %	50 %	50 %	0 %	549718516
4250	NC_022543	TG	3	6	271420	271425	0 %	50 %	50 %	0 %	549718517
4251	NC_022543	AAG	2	6	271487	271492	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549718517
4252	NC_022543	CT	3	6	271609	271614	0 %	50 %	0 %	50 %	549718517
4253	NC_022543	ATC	2	6	271648	271653	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549718517
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4255	NC_022543	TGC	2	6	271766	271771	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549718517
4256	NC_022543	TTC	2	6	271785	271790	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549718517
4257	NC_022543	GGC	2	6	271858	271863	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549718517
4258	NC_022543	CTT	2	6	271909	271914	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549718517
4259	NC_022543	GTG	2	6	271927	271932	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549718517
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4263	NC_022543	GGC	2	6	272162	272167	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549718518
4264	NC_022543	GTG	2	6	272171	272176	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549718518
4265	NC_022543	TTC	2	6	272204	272209	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549718518
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4270	NC_022543	TGGATT	2	12	272523	272534	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	549718518
4271	NC_022543	CCTG	2	8	272571	272578	0 %	25 %	25 %	50 %	549718518
4272	NC_022543	TCA	2	6	272598	272603	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549718518
4273	NC_022543	GTT	2	6	272623	272628	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549718518
4274	NC_022543	CTG	2	6	272639	272644	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549718518
4275	NC_022543	AGA	2	6	272662	272667	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549718518
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4278	NC_022543	AAT	2	6	272981	272986	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	549718518
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4282	NC_022543	GTATTG	2	12	273297	273308	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	549718518
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4285	NC_022543	A	6	6	273501	273506	100 %	0 %	0 %	0 %	549718518
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4295	NC_022543	TTCA	2	8	274218	274225	25 %	50 %	0 %	25 %	549718519
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4350	NC_022543	CCG	2	6	277515	277520	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549718521
4351	NC_022543	TGAT	2	8	277556	277563	25 %	50 %	25 %	0 %	549718521
4352	NC_022543	TTC	2	6	277729	277734	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549718521
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4363	NC_022543	GAAG	2	8	278258	278265	50 %	0 %	50 %	0 %	549718521
4364	NC_022543	AGA	2	6	278293	278298	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549718521
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4487	NC_022543	ATCA	2	8	285639	285646	50 %	25 %	0 %	25 %	549718526
4488	NC_022543	CGC	2	6	285668	285673	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549718526
4489	NC_022543	GAC	2	6	285685	285690	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549718526
4490	NC_022543	TG	3	6	285713	285718	0 %	50 %	50 %	0 %	549718526
4491	NC_022543	TGT	2	6	285725	285730	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549718526
4492	NC_022543	GGT	2	6	285743	285748	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549718526
4493	NC_022543	GTT	2	6	285762	285767	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549718526
4494	NC_022543	GCTG	2	8	285768	285775	0 %	25 %	50 %	25 %	549718526
4495	NC_022543	GGA	2	6	285795	285800	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549718526
4496	NC_022543	CA	3	6	285815	285820	50 %	0 %	0 %	50 %	549718526
4497	NC_022543	TTCT	2	8	285906	285913	0 %	75 %	0 %	25 %	549718526
4498	NC_022543	GA	3	6	286004	286009	50 %	0 %	50 %	0 %	549718526
4499	NC_022543	TTC	2	6	286012	286017	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549718526
4500	NC_022543	AGT	2	6	286057	286062	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549718526

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