MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Vibrio nigripulchritudo str. SFn1 chromosome

Total Repeats: 34971

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_022543	GGTGAA	2	12	60860	60871	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	549718325
1002	NC_022543	TGA	2	6	60910	60915	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549718325
1003	NC_022543	CTT	2	6	60940	60945	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549718325
1004	NC_022543	TCTG	2	8	60984	60991	0 %	50 %	25 %	25 %	549718325
1005	NC_022543	AGA	2	6	61018	61023	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549718325
1006	NC_022543	CAGC	2	8	61076	61083	25 %	0 %	25 %	50 %	549718325
1007	NC_022543	GAT	2	6	61093	61098	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549718325
1008	NC_022543	TGA	2	6	61129	61134	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549718325
1009	NC_022543	A	6	6	61219	61224	100 %	0 %	0 %	0 %	549718325
1010	NC_022543	AAG	2	6	61242	61247	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549718325
1011	NC_022543	TGA	2	6	61390	61395	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549718325
1012	NC_022543	CAC	2	6	61656	61661	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549718325
1013	NC_022543	TTC	2	6	61675	61680	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549718325
1014	NC_022543	GCGT	2	8	61725	61732	0 %	25 %	50 %	25 %	549718325
1015	NC_022543	GAA	2	6	61793	61798	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549718325
1016	NC_022543	CGT	2	6	61804	61809	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549718325
1017	NC_022543	TGGT	2	8	61875	61882	0 %	50 %	50 %	0 %	549718325
1018	NC_022543	CGGGTA	2	12	61884	61895	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	549718325
1019	NC_022543	TGC	2	6	62016	62021	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549718325
1020	NC_022543	GGT	2	6	62108	62113	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549718325
1021	NC_022543	GCG	2	6	62139	62144	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549718325
1022	NC_022543	CTT	2	6	62149	62154	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549718325
1023	NC_022543	CTA	2	6	62170	62175	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549718325
1024	NC_022543	CAA	2	6	62227	62232	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	549718325
1025	NC_022543	AGA	2	6	62239	62244	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549718325
1026	NC_022543	AGAAAC	2	12	62271	62282	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	549718325
1027	NC_022543	TACG	2	8	62285	62292	25 %	25 %	25 %	25 %	549718325
1028	NC_022543	CTA	2	6	62299	62304	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549718325
1029	NC_022543	T	6	6	62361	62366	0 %	100 %	0 %	0 %	549718326
1030	NC_022543	TGC	2	6	62370	62375	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549718326
1031	NC_022543	CA	3	6	62391	62396	50 %	0 %	0 %	50 %	549718326
1032	NC_022543	AGA	2	6	62450	62455	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549718326
1033	NC_022543	TA	3	6	62529	62534	50 %	50 %	0 %	0 %	549718326
1034	NC_022543	GCA	2	6	62606	62611	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549718326
1035	NC_022543	AG	3	6	62624	62629	50 %	0 %	50 %	0 %	549718326
1036	NC_022543	GAT	2	6	62821	62826	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549718326
1037	NC_022543	TTC	2	6	62935	62940	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549718326
1038	NC_022543	GGC	2	6	63013	63018	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549718326
1039	NC_022543	CTGG	2	8	63043	63050	0 %	25 %	50 %	25 %	549718326
1040	NC_022543	TCAG	2	8	63074	63081	25 %	25 %	25 %	25 %	549718326
1041	NC_022543	GAC	2	6	63167	63172	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549718326
1042	NC_022543	TTC	2	6	63178	63183	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549718326
1043	NC_022543	CGA	2	6	63219	63224	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549718326
1044	NC_022543	AAG	2	6	63238	63243	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549718326
1045	NC_022543	AT	3	6	63246	63251	50 %	50 %	0 %	0 %	549718326
1046	NC_022543	TGT	2	6	63252	63257	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549718326
1047	NC_022543	ATG	2	6	63368	63373	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549718327
1048	NC_022543	AAGA	2	8	63383	63390	75 %	0 %	25 %	0 %	549718327
1049	NC_022543	T	6	6	63398	63403	0 %	100 %	0 %	0 %	549718327
1050	NC_022543	TTAT	2	8	63431	63438	25 %	75 %	0 %	0 %	549718327
1051	NC_022543	GCA	2	6	63479	63484	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549718327
1052	NC_022543	CAGG	2	8	63488	63495	25 %	0 %	50 %	25 %	549718327
1053	NC_022543	AGA	2	6	63631	63636	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549718327
1054	NC_022543	ATA	2	6	63687	63692	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	549718327
1055	NC_022543	TGG	2	6	63715	63720	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549718327
1056	NC_022543	CCTC	2	8	63901	63908	0 %	25 %	0 %	75 %	549718327
1057	NC_022543	ACT	2	6	63963	63968	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549718327
1058	NC_022543	TCC	2	6	64011	64016	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	549718327
1059	NC_022543	CTT	2	6	64085	64090	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549718327
1060	NC_022543	GGC	2	6	64141	64146	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549718327
1061	NC_022543	AGG	2	6	64150	64155	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549718327
1062	NC_022543	GTT	2	6	64169	64174	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549718327
1063	NC_022543	ATG	2	6	64203	64208	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549718327
1064	NC_022543	AC	3	6	64711	64716	50 %	0 %	0 %	50 %	549718328
1065	NC_022543	CGG	2	6	64748	64753	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549718328
1066	NC_022543	GAA	2	6	64881	64886	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549718328
1067	NC_022543	CAT	2	6	64928	64933	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549718328
1068	NC_022543	TTG	2	6	64969	64974	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549718328
1069	NC_022543	ATG	2	6	65368	65373	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549718328
1070	NC_022543	CAG	2	6	65393	65398	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549718328
1071	NC_022543	GAAA	2	8	65423	65430	75 %	0 %	25 %	0 %	549718328
1072	NC_022543	CGG	2	6	65443	65448	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549718328
1073	NC_022543	TGA	2	6	65528	65533	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549718328
1074	NC_022543	AAG	2	6	65544	65549	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549718328
1075	NC_022543	TAAG	2	8	65756	65763	50 %	25 %	25 %	0 %	549718329
1076	NC_022543	GAT	2	6	65791	65796	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549718329
1077	NC_022543	CAC	2	6	65836	65841	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549718329
1078	NC_022543	ATG	2	6	66003	66008	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549718329
1079	NC_022543	TCG	2	6	66036	66041	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549718329
1080	NC_022543	GA	3	6	66050	66055	50 %	0 %	50 %	0 %	549718329
1081	NC_022543	CTT	2	6	66071	66076	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549718329
1082	NC_022543	AGG	2	6	66119	66124	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549718329
1083	NC_022543	TCC	2	6	66418	66423	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	549718330
1084	NC_022543	CGC	2	6	66451	66456	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549718330
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1086	NC_022543	A	6	6	66527	66532	100 %	0 %	0 %	0 %	549718330
1087	NC_022543	GAAA	2	8	66600	66607	75 %	0 %	25 %	0 %	549718330
1088	NC_022543	CGA	2	6	66612	66617	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549718330
1089	NC_022543	CTG	2	6	66653	66658	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549718330
1090	NC_022543	CAG	2	6	66665	66670	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549718330
1091	NC_022543	TGC	2	6	66695	66700	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549718330
1092	NC_022543	TGGC	2	8	66719	66726	0 %	25 %	50 %	25 %	549718330
1093	NC_022543	TGG	2	6	66795	66800	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549718330
1094	NC_022543	CGT	2	6	66815	66820	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549718330
1095	NC_022543	TTC	2	6	66873	66878	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549718330
1096	NC_022543	GCAGG	2	10	67064	67073	20 %	0 %	60 %	20 %	549718330
1097	NC_022543	GTGA	2	8	67085	67092	25 %	25 %	50 %	0 %	549718330
1098	NC_022543	TAC	2	6	67169	67174	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549718330
1099	NC_022543	CA	3	6	67188	67193	50 %	0 %	0 %	50 %	549718330
1100	NC_022543	T	6	6	67297	67302	0 %	100 %	0 %	0 %	549718331
1101	NC_022543	GTT	2	6	67344	67349	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549718331
1102	NC_022543	GGGT	2	8	67350	67357	0 %	25 %	75 %	0 %	549718331
1103	NC_022543	GGTTCA	2	12	67447	67458	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	549718331
1104	NC_022543	AGC	2	6	67568	67573	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549718331
1105	NC_022543	CTT	2	6	67610	67615	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549718331
1106	NC_022543	TGG	2	6	67666	67671	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549718331
1107	NC_022543	CTT	2	6	67840	67845	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549718331
1108	NC_022543	AAG	2	6	67861	67866	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549718331
1109	NC_022543	TTCA	2	8	67874	67881	25 %	50 %	0 %	25 %	549718331
1110	NC_022543	ATTG	2	8	67900	67907	25 %	50 %	25 %	0 %	549718331
1111	NC_022543	CGC	2	6	67913	67918	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549718331
1112	NC_022543	CCG	2	6	67920	67925	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549718331
1113	NC_022543	TTTA	2	8	68093	68100	25 %	75 %	0 %	0 %	549718331
1114	NC_022543	CATAA	2	10	68114	68123	60 %	20 %	0 %	20 %	549718331
1115	NC_022543	GTTG	2	8	68155	68162	0 %	50 %	50 %	0 %	549718331
1116	NC_022543	GT	3	6	68245	68250	0 %	50 %	50 %	0 %	549718331
1117	NC_022543	ACC	2	6	68284	68289	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549718331
1118	NC_022543	CAG	2	6	68382	68387	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549718331
1119	NC_022543	T	6	6	68401	68406	0 %	100 %	0 %	0 %	549718331
1120	NC_022543	GGA	2	6	68441	68446	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549718331
1121	NC_022543	GTA	2	6	68521	68526	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549718331
1122	NC_022543	CGA	2	6	68775	68780	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549718332
1123	NC_022543	TC	3	6	68814	68819	0 %	50 %	0 %	50 %	549718332
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1125	NC_022543	TAG	2	6	69235	69240	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549718333
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1232	NC_022543	TGC	2	6	78114	78119	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549718342
1233	NC_022543	CTGG	3	12	78230	78241	0 %	25 %	50 %	25 %	549718342
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1239	NC_022543	ATT	2	6	78502	78507	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549718342
1240	NC_022543	TGA	2	6	78518	78523	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549718342
1241	NC_022543	TCAT	2	8	78563	78570	25 %	50 %	0 %	25 %	549718342
1242	NC_022543	CTG	2	6	78589	78594	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549718342
1243	NC_022543	AGTC	2	8	78629	78636	25 %	25 %	25 %	25 %	549718342
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1247	NC_022543	CAAT	2	8	78833	78840	50 %	25 %	0 %	25 %	549718342
1248	NC_022543	AATC	2	8	78888	78895	50 %	25 %	0 %	25 %	549718342
1249	NC_022543	CACT	2	8	78925	78932	25 %	25 %	0 %	50 %	549718342
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1251	NC_022543	AAG	2	6	78952	78957	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549718342
1252	NC_022543	AG	3	6	79011	79016	50 %	0 %	50 %	0 %	549718342
1253	NC_022543	GC	3	6	79036	79041	0 %	0 %	50 %	50 %	549718342
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1498	NC_022543	CCT	2	6	94011	94016	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	549718355
1499	NC_022543	GAT	2	6	94057	94062	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549718355
1500	NC_022543	AGC	2	6	94166	94171	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549718355

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