MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Vibrio nigripulchritudo str. SFn1 chromosome

Total Repeats: 34971

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_022543	TGA	2	6	29456	29461	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549718304
502	NC_022543	CAC	2	6	29483	29488	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549718304
503	NC_022543	AAG	2	6	29530	29535	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549718304
504	NC_022543	CG	3	6	29571	29576	0 %	0 %	50 %	50 %	549718304
505	NC_022543	GTT	2	6	29585	29590	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549718304
506	NC_022543	GTT	2	6	29709	29714	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549718304
507	NC_022543	CTT	2	6	29720	29725	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549718304
508	NC_022543	ATG	2	6	29737	29742	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549718304
509	NC_022543	ACC	2	6	29770	29775	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549718304
510	NC_022543	CAC	3	9	29784	29792	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549718304
511	NC_022543	AAT	2	6	29796	29801	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	549718304
512	NC_022543	TGA	2	6	29876	29881	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549718304
513	NC_022543	AGCC	2	8	29902	29909	25 %	0 %	25 %	50 %	549718304
514	NC_022543	CCG	2	6	29922	29927	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549718304
515	NC_022543	AAAT	2	8	29943	29950	75 %	25 %	0 %	0 %	549718304
516	NC_022543	TAA	2	6	30074	30079	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	549718304
517	NC_022543	TGT	2	6	30169	30174	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549718304
518	NC_022543	TCA	2	6	30224	30229	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549718304
519	NC_022543	CAG	2	6	30231	30236	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549718304
520	NC_022543	TA	3	6	30269	30274	50 %	50 %	0 %	0 %	549718304
521	NC_022543	TCA	2	6	30291	30296	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549718305
522	NC_022543	TAAT	2	8	30297	30304	50 %	50 %	0 %	0 %	549718305
523	NC_022543	GAC	2	6	30369	30374	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549718305
524	NC_022543	TCA	2	6	30406	30411	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549718305
525	NC_022543	TAA	2	6	30446	30451	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	549718305
526	NC_022543	AGC	2	6	30615	30620	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549718305
527	NC_022543	CAG	2	6	30658	30663	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549718305
528	NC_022543	AGT	2	6	30694	30699	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549718305
529	NC_022543	GTC	2	6	30722	30727	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549718305
530	NC_022543	GAA	2	6	30746	30751	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549718305
531	NC_022543	CT	3	6	30777	30782	0 %	50 %	0 %	50 %	549718305
532	NC_022543	GCG	2	6	30834	30839	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549718305
533	NC_022543	GCT	2	6	30877	30882	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549718305
534	NC_022543	T	6	6	30884	30889	0 %	100 %	0 %	0 %	549718305
535	NC_022543	GC	3	6	30895	30900	0 %	0 %	50 %	50 %	549718305
536	NC_022543	AAAG	2	8	30909	30916	75 %	0 %	25 %	0 %	549718305
537	NC_022543	AGCA	2	8	30921	30928	50 %	0 %	25 %	25 %	549718305
538	NC_022543	GCCT	2	8	30941	30948	0 %	25 %	25 %	50 %	549718305
539	NC_022543	ATT	2	6	31052	31057	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549718306
540	NC_022543	AATA	2	8	31096	31103	75 %	25 %	0 %	0 %	549718306
541	NC_022543	TAA	2	6	31127	31132	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	549718306
542	NC_022543	GCT	2	6	31169	31174	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549718306
543	NC_022543	CGAACA	2	12	31204	31215	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	549718306
544	NC_022543	GCAG	2	8	31327	31334	25 %	0 %	50 %	25 %	549718306
545	NC_022543	CTA	2	6	31379	31384	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549718306
546	NC_022543	CCA	2	6	31441	31446	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549718306
547	NC_022543	T	6	6	31464	31469	0 %	100 %	0 %	0 %	549718306
548	NC_022543	AGA	2	6	31545	31550	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549718306
549	NC_022543	AGC	2	6	31605	31610	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549718306
550	NC_022543	AGC	2	6	31720	31725	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549718306
551	NC_022543	TTG	2	6	31842	31847	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549718306
552	NC_022543	CAG	2	6	31869	31874	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549718306
553	NC_022543	ATT	2	6	31893	31898	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549718306
554	NC_022543	CAA	2	6	31931	31936	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	549718306
555	NC_022543	GTT	2	6	31958	31963	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549718306
556	NC_022543	TC	3	6	32002	32007	0 %	50 %	0 %	50 %	549718306
557	NC_022543	AC	3	6	32069	32074	50 %	0 %	0 %	50 %	549718306
558	NC_022543	TGT	2	6	32095	32100	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549718306
559	NC_022543	GT	3	6	32129	32134	0 %	50 %	50 %	0 %	549718306
560	NC_022543	ATCA	2	8	32136	32143	50 %	25 %	0 %	25 %	549718306
561	NC_022543	AAC	2	6	32223	32228	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	549718306
562	NC_022543	GAA	2	6	32239	32244	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549718306
563	NC_022543	CCTTG	2	10	32252	32261	0 %	40 %	20 %	40 %	549718306
564	NC_022543	CGATGG	2	12	32303	32314	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	549718306
565	NC_022543	A	6	6	32316	32321	100 %	0 %	0 %	0 %	549718306
566	NC_022543	CAA	2	6	32337	32342	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	549718306
567	NC_022543	ACT	2	6	32352	32357	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549718306
568	NC_022543	TGC	2	6	32376	32381	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549718306
569	NC_022543	GTC	2	6	32388	32393	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549718306
570	NC_022543	T	6	6	32421	32426	0 %	100 %	0 %	0 %	549718306
571	NC_022543	TCG	2	6	32808	32813	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549718307
572	NC_022543	GGGC	2	8	32826	32833	0 %	0 %	75 %	25 %	549718307
573	NC_022543	GCA	2	6	32886	32891	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549718307
574	NC_022543	CTGA	2	8	32908	32915	25 %	25 %	25 %	25 %	549718307
575	NC_022543	T	6	6	33008	33013	0 %	100 %	0 %	0 %	549718307
576	NC_022543	TCT	2	6	33160	33165	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549718307
577	NC_022543	AAAG	2	8	33172	33179	75 %	0 %	25 %	0 %	549718307
578	NC_022543	TGC	2	6	33233	33238	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549718307
579	NC_022543	A	6	6	33258	33263	100 %	0 %	0 %	0 %	549718307
580	NC_022543	GAA	2	6	33271	33276	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549718307
581	NC_022543	AGA	2	6	33387	33392	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549718307
582	NC_022543	GTA	2	6	33523	33528	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549718308
583	NC_022543	TTC	2	6	33556	33561	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549718308
584	NC_022543	GTTT	2	8	33612	33619	0 %	75 %	25 %	0 %	549718308
585	NC_022543	CGT	2	6	33621	33626	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549718308
586	NC_022543	TCG	2	6	33662	33667	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549718308
587	NC_022543	GTA	3	9	33748	33756	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549718308
588	NC_022543	GTTG	2	8	33811	33818	0 %	50 %	50 %	0 %	549718308
589	NC_022543	TTG	3	9	33816	33824	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549718308
590	NC_022543	GTT	2	6	34085	34090	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549718308
591	NC_022543	ACC	2	6	34168	34173	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549718308
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593	NC_022543	TGT	2	6	35349	35354	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549718309
594	NC_022543	T	6	6	35444	35449	0 %	100 %	0 %	0 %	549718309
595	NC_022543	T	7	7	35539	35545	0 %	100 %	0 %	0 %	549718309
596	NC_022543	AAG	2	6	35555	35560	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549718309
597	NC_022543	GTTG	2	8	35580	35587	0 %	50 %	50 %	0 %	549718309
598	NC_022543	T	7	7	35589	35595	0 %	100 %	0 %	0 %	549718309
599	NC_022543	GC	3	6	35771	35776	0 %	0 %	50 %	50 %	549718309
600	NC_022543	CA	3	6	35868	35873	50 %	0 %	0 %	50 %	549718309
601	NC_022543	GAT	2	6	35922	35927	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549718309
602	NC_022543	ATA	2	6	36020	36025	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	549718309
603	NC_022543	AG	3	6	36030	36035	50 %	0 %	50 %	0 %	549718309
604	NC_022543	TTA	2	6	36546	36551	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549718310
605	NC_022543	AGT	2	6	36581	36586	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549718310
606	NC_022543	ACG	2	6	36588	36593	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549718310
607	NC_022543	CAT	2	6	36599	36604	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549718310
608	NC_022543	TGGC	2	8	36625	36632	0 %	25 %	50 %	25 %	549718310
609	NC_022543	ACCA	2	8	36685	36692	50 %	0 %	0 %	50 %	549718310
610	NC_022543	CTG	2	6	36721	36726	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549718310
611	NC_022543	CTT	2	6	36773	36778	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549718310
612	NC_022543	GCG	2	6	36790	36795	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549718310
613	NC_022543	GTTA	2	8	36929	36936	25 %	50 %	25 %	0 %	549718310
614	NC_022543	ACA	2	6	36964	36969	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	549718310
615	NC_022543	AAC	2	6	37000	37005	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	549718310
616	NC_022543	CAG	2	6	37042	37047	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549718310
617	NC_022543	TGGT	2	8	37056	37063	0 %	50 %	50 %	0 %	549718310
618	NC_022543	AAG	2	6	37111	37116	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549718310
619	NC_022543	TACC	2	8	37324	37331	25 %	25 %	0 %	50 %	549718310
620	NC_022543	CTT	2	6	37341	37346	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549718310
621	NC_022543	ACC	2	6	37353	37358	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549718310
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625	NC_022543	CT	3	6	37562	37567	0 %	50 %	0 %	50 %	549718311
626	NC_022543	TGG	2	6	37623	37628	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549718311
627	NC_022543	ACAA	2	8	37743	37750	75 %	0 %	0 %	25 %	549718311
628	NC_022543	A	6	6	37829	37834	100 %	0 %	0 %	0 %	549718311
629	NC_022543	TCTT	2	8	37839	37846	0 %	75 %	0 %	25 %	549718311
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752	NC_022543	GCCA	2	8	45929	45936	25 %	0 %	25 %	50 %	549718318
753	NC_022543	GGC	2	6	46039	46044	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549718318
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758	NC_022543	GAAGCC	2	12	46313	46324	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549718318
759	NC_022543	CATT	2	8	46340	46347	25 %	50 %	0 %	25 %	549718318
760	NC_022543	TGA	2	6	46348	46353	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549718318
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791	NC_022543	AG	3	6	48273	48278	50 %	0 %	50 %	0 %	549718319
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880	NC_022543	CAA	2	6	54497	54502	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	549718323
881	NC_022543	GAAT	2	8	55056	55063	50 %	25 %	25 %	0 %	549718324
882	NC_022543	TCGC	2	8	55072	55079	0 %	25 %	25 %	50 %	549718324
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