MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Vibrio nigripulchritudo str. SFn1 chromosome

Total Repeats: 2271

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022528	ACCAC	2	10	1403	1412	40 %	0 %	0 %	60 %	549687643
2	NC_022528	CGTTG	2	10	2513	2522	0 %	40 %	40 %	20 %	549687644
3	NC_022528	GAAGT	2	10	4764	4773	40 %	20 %	40 %	0 %	549687646
4	NC_022528	GTTGG	2	10	7769	7778	0 %	40 %	60 %	0 %	549687648
5	NC_022528	CATCC	2	10	8061	8070	20 %	20 %	0 %	60 %	549687648
6	NC_022528	GCAAG	2	10	9271	9280	40 %	0 %	40 %	20 %	549687650
7	NC_022528	ACGCG	2	10	11713	11722	20 %	0 %	40 %	40 %	549687652
8	NC_022528	TGCCC	2	10	12998	13007	0 %	20 %	20 %	60 %	549687653
9	NC_022528	TTGGC	2	10	13727	13736	0 %	40 %	40 %	20 %	549687654
10	NC_022528	CAATC	2	10	13980	13989	40 %	20 %	0 %	40 %	549687655
11	NC_022528	AAGTT	2	10	15112	15121	40 %	40 %	20 %	0 %	549687656
12	NC_022528	TTGCC	2	10	17181	17190	0 %	40 %	20 %	40 %	549687658
13	NC_022528	CCCAG	2	10	19847	19856	20 %	0 %	20 %	60 %	549687661
14	NC_022528	TTCCC	2	10	20740	20749	0 %	40 %	0 %	60 %	549687662
15	NC_022528	TGAGT	2	10	22319	22328	20 %	40 %	40 %	0 %	549687664
16	NC_022528	GTTCA	2	10	22861	22870	20 %	40 %	20 %	20 %	549687664
17	NC_022528	TGAGC	2	10	28196	28205	20 %	20 %	40 %	20 %	549687671
18	NC_022528	TCAAA	2	10	28249	28258	60 %	20 %	0 %	20 %	549687671
19	NC_022528	AAGTT	2	10	29176	29185	40 %	40 %	20 %	0 %	549687671
20	NC_022528	GAAGT	2	10	29526	29535	40 %	20 %	40 %	0 %	549687671
21	NC_022528	CAATG	2	10	30882	30891	40 %	20 %	20 %	20 %	549687672
22	NC_022528	TACCG	2	10	31206	31215	20 %	20 %	20 %	40 %	549687672
23	NC_022528	AAGCT	2	10	34037	34046	40 %	20 %	20 %	20 %	549687673
24	NC_022528	AGAGA	2	10	45583	45592	60 %	0 %	40 %	0 %	549687678
25	NC_022528	GGCTT	2	10	46086	46095	0 %	40 %	40 %	20 %	549687678
26	NC_022528	AAAGG	2	10	48963	48972	60 %	0 %	40 %	0 %	549687679
27	NC_022528	AGAGC	2	10	50120	50129	40 %	0 %	40 %	20 %	549687681
28	NC_022528	GTTTT	2	10	50749	50758	0 %	80 %	20 %	0 %	549687681
29	NC_022528	TAAGC	2	10	51717	51726	40 %	20 %	20 %	20 %	549687682
30	NC_022528	GGGCA	2	10	51915	51924	20 %	0 %	60 %	20 %	549687683
31	NC_022528	CAAAC	2	10	52539	52548	60 %	0 %	0 %	40 %	549687683
32	NC_022528	GTTTT	2	10	57477	57486	0 %	80 %	20 %	0 %	549687690
33	NC_022528	GATGC	2	10	59653	59662	20 %	20 %	40 %	20 %	549687691
34	NC_022528	TGGAA	2	10	64282	64291	40 %	20 %	40 %	0 %	549687698
35	NC_022528	ATGGA	2	10	64502	64511	40 %	20 %	40 %	0 %	549687698
36	NC_022528	AATAA	2	10	67284	67293	80 %	20 %	0 %	0 %	549687700
37	NC_022528	TAAGT	2	10	68334	68343	40 %	40 %	20 %	0 %	549687702
38	NC_022528	GCAGA	2	10	69361	69370	40 %	0 %	40 %	20 %	549687703
39	NC_022528	TTTGC	2	10	69925	69934	0 %	60 %	20 %	20 %	549687703
40	NC_022528	TGCAA	2	10	70277	70286	40 %	20 %	20 %	20 %	549687703
41	NC_022528	ATTCC	2	10	74159	74168	20 %	40 %	0 %	40 %	549687707
42	NC_022528	AAAGC	2	10	75813	75822	60 %	0 %	20 %	20 %	549687708
43	NC_022528	GGGAG	2	10	77273	77282	20 %	0 %	80 %	0 %	549687710
44	NC_022528	GTCAC	2	10	77416	77425	20 %	20 %	20 %	40 %	549687710
45	NC_022528	AACGT	2	10	78101	78110	40 %	20 %	20 %	20 %	549687711
46	NC_022528	GGTTG	2	10	78263	78272	0 %	40 %	60 %	0 %	549687711
47	NC_022528	CACTT	2	10	79707	79716	20 %	40 %	0 %	40 %	549687712
48	NC_022528	AATCG	2	10	81262	81271	40 %	20 %	20 %	20 %	549687712
49	NC_022528	GGCTT	2	10	81463	81472	0 %	40 %	40 %	20 %	549687713
50	NC_022528	TGGTG	2	10	82815	82824	0 %	40 %	60 %	0 %	549687714
51	NC_022528	GAAAA	2	10	83383	83392	80 %	0 %	20 %	0 %	549687715
52	NC_022528	TTCTC	2	10	84761	84770	0 %	60 %	0 %	40 %	549687716
53	NC_022528	ATTCC	2	10	86549	86558	20 %	40 %	0 %	40 %	549687717
54	NC_022528	CCCAA	2	10	87284	87293	40 %	0 %	0 %	60 %	549687718
55	NC_022528	GATTA	2	10	87466	87475	40 %	40 %	20 %	0 %	549687719
56	NC_022528	ACTGA	2	10	89128	89137	40 %	20 %	20 %	20 %	549687720
57	NC_022528	ATCTT	2	10	90410	90419	20 %	60 %	0 %	20 %	549687721
58	NC_022528	GTGAC	2	10	92831	92840	20 %	20 %	40 %	20 %	549687725
59	NC_022528	AGTGA	2	10	93367	93376	40 %	20 %	40 %	0 %	549687725
60	NC_022528	CAGAC	2	10	94095	94104	40 %	0 %	20 %	40 %	549687726
61	NC_022528	GAAAA	2	10	101402	101411	80 %	0 %	20 %	0 %	549687734
62	NC_022528	GTGAT	2	10	101581	101590	20 %	40 %	40 %	0 %	549687735
63	NC_022528	GCTTC	2	10	102011	102020	0 %	40 %	20 %	40 %	549687735
64	NC_022528	TCAAA	2	10	102211	102220	60 %	20 %	0 %	20 %	549687736
65	NC_022528	TCGTG	2	10	102499	102508	0 %	40 %	40 %	20 %	549687736
66	NC_022528	CAGGT	2	10	103229	103238	20 %	20 %	40 %	20 %	549687737
67	NC_022528	AACTT	2	10	103846	103855	40 %	40 %	0 %	20 %	549687738
68	NC_022528	GCTGA	2	10	106492	106501	20 %	20 %	40 %	20 %	549687740
69	NC_022528	GTGCG	2	10	109353	109362	0 %	20 %	60 %	20 %	549687743
70	NC_022528	GGTCT	2	10	111243	111252	0 %	40 %	40 %	20 %	549687745
71	NC_022528	GAGTT	2	10	114001	114010	20 %	40 %	40 %	0 %	549687748
72	NC_022528	GAATG	2	10	115128	115137	40 %	20 %	40 %	0 %	549687748
73	NC_022528	AAATA	2	10	116412	116421	80 %	20 %	0 %	0 %	549687749
74	NC_022528	GAGAT	2	10	119922	119931	40 %	20 %	40 %	0 %	549687750
75	NC_022528	GTGAA	2	10	121976	121985	40 %	20 %	40 %	0 %	549687752
76	NC_022528	TACCT	2	10	122543	122552	20 %	40 %	0 %	40 %	549687752
77	NC_022528	GCAAC	2	10	122801	122810	40 %	0 %	20 %	40 %	549687752
78	NC_022528	AATGG	2	10	125532	125541	40 %	20 %	40 %	0 %	549687755
79	NC_022528	TGCGC	2	10	129300	129309	0 %	20 %	40 %	40 %	549687760
80	NC_022528	GCATG	2	10	132788	132797	20 %	20 %	40 %	20 %	549687763
81	NC_022528	TGCGT	2	10	133163	133172	0 %	40 %	40 %	20 %	549687763
82	NC_022528	GATCT	2	10	134406	134415	20 %	40 %	20 %	20 %	549687764
83	NC_022528	CTGAA	2	10	136257	136266	40 %	20 %	20 %	20 %	549687765
84	NC_022528	TGACC	2	10	137852	137861	20 %	20 %	20 %	40 %	549687766
85	NC_022528	CTTCG	2	10	138530	138539	0 %	40 %	20 %	40 %	549687766
86	NC_022528	AACCA	2	10	142005	142014	60 %	0 %	0 %	40 %	549687766
87	NC_022528	ATAGC	2	10	149992	150001	40 %	20 %	20 %	20 %	549687773
88	NC_022528	CGGCG	2	10	153217	153226	0 %	0 %	60 %	40 %	549687776
89	NC_022528	GGGTT	2	10	155285	155294	0 %	40 %	60 %	0 %	549687778
90	NC_022528	GTATC	2	10	158088	158097	20 %	40 %	20 %	20 %	549687780
91	NC_022528	AATGA	2	10	159043	159052	60 %	20 %	20 %	0 %	549687780
92	NC_022528	TTTTG	2	10	162451	162460	0 %	80 %	20 %	0 %	549687784
93	NC_022528	AACAT	2	10	162505	162514	60 %	20 %	0 %	20 %	549687784
94	NC_022528	GTCCA	2	10	163923	163932	20 %	20 %	20 %	40 %	549687785
95	NC_022528	TCACA	2	10	167108	167117	40 %	20 %	0 %	40 %	549687787
96	NC_022528	AAAGA	2	10	167289	167298	80 %	0 %	20 %	0 %	549687787
97	NC_022528	AGCTA	2	10	168224	168233	40 %	20 %	20 %	20 %	549687788
98	NC_022528	CAGCT	2	10	171489	171498	20 %	20 %	20 %	40 %	549687794
99	NC_022528	CATCG	2	10	175552	175561	20 %	20 %	20 %	40 %	549687798
100	NC_022528	CGATG	2	10	177301	177310	20 %	20 %	40 %	20 %	549687800
101	NC_022528	CATTG	2	10	177467	177476	20 %	40 %	20 %	20 %	549687800
102	NC_022528	TTACA	2	10	182007	182016	40 %	40 %	0 %	20 %	549687803
103	NC_022528	TGGTG	2	10	187537	187546	0 %	40 %	60 %	0 %	549687808
104	NC_022528	CAACC	2	10	188769	188778	40 %	0 %	0 %	60 %	549687809
105	NC_022528	AGCAC	2	10	188931	188940	40 %	0 %	20 %	40 %	549687809
106	NC_022528	CACTT	2	10	191105	191114	20 %	40 %	0 %	40 %	549687811
107	NC_022528	CTTTT	2	10	191246	191255	0 %	80 %	0 %	20 %	549687811
108	NC_022528	TGGTC	2	10	191303	191312	0 %	40 %	40 %	20 %	549687811
109	NC_022528	CAGCA	2	10	200319	200328	40 %	0 %	20 %	40 %	549687816
110	NC_022528	GTTTT	2	10	203290	203299	0 %	80 %	20 %	0 %	549687818
111	NC_022528	TCACC	2	10	212449	212458	20 %	20 %	0 %	60 %	549687826
112	NC_022528	AGAAA	2	10	214307	214316	80 %	0 %	20 %	0 %	549687828
113	NC_022528	CGTTG	2	10	216167	216176	0 %	40 %	40 %	20 %	549687830
114	NC_022528	ATTCC	3	15	217909	217923	20 %	40 %	0 %	40 %	549687832
115	NC_022528	GATGG	2	10	219076	219085	20 %	20 %	60 %	0 %	549687833
116	NC_022528	TGCGA	2	10	221146	221155	20 %	20 %	40 %	20 %	549687837
117	NC_022528	TGAGC	2	10	223136	223145	20 %	20 %	40 %	20 %	549687839
118	NC_022528	GCAGC	2	10	223583	223592	20 %	0 %	40 %	40 %	549687839
119	NC_022528	GTTCT	2	10	226342	226351	0 %	60 %	20 %	20 %	549687842
120	NC_022528	CAGCT	2	10	228721	228730	20 %	20 %	20 %	40 %	549687845
121	NC_022528	TTCTC	2	10	229385	229394	0 %	60 %	0 %	40 %	549687845
122	NC_022528	CATTA	2	10	230737	230746	40 %	40 %	0 %	20 %	549687846
123	NC_022528	TGGCT	2	10	230836	230845	0 %	40 %	40 %	20 %	549687846
124	NC_022528	TCGGG	2	10	230861	230870	0 %	20 %	60 %	20 %	549687846
125	NC_022528	TGCTG	2	10	232116	232125	0 %	40 %	40 %	20 %	549687847
126	NC_022528	GCCAA	2	10	233079	233088	40 %	0 %	20 %	40 %	549687848
127	NC_022528	GTTTG	2	10	234287	234296	0 %	60 %	40 %	0 %	549687849
128	NC_022528	CCAAT	2	10	248374	248383	40 %	20 %	0 %	40 %	549687860
129	NC_022528	TCAAA	2	10	252982	252991	60 %	20 %	0 %	20 %	549687863
130	NC_022528	ACGCT	2	10	253983	253992	20 %	20 %	20 %	40 %	549687864
131	NC_022528	TCAAT	2	10	256400	256409	40 %	40 %	0 %	20 %	549687865
132	NC_022528	GAAAG	2	10	258560	258569	60 %	0 %	40 %	0 %	549687868
133	NC_022528	CGCCA	2	10	258577	258586	20 %	0 %	20 %	60 %	549687868
134	NC_022528	CTGCA	2	10	259622	259631	20 %	20 %	20 %	40 %	549687869
135	NC_022528	TCATT	2	10	261518	261527	20 %	60 %	0 %	20 %	549687870
136	NC_022528	CGAGC	2	10	262171	262180	20 %	0 %	40 %	40 %	549687871
137	NC_022528	ACCCC	2	10	262380	262389	20 %	0 %	0 %	80 %	549687871
138	NC_022528	GGCTG	2	10	265989	265998	0 %	20 %	60 %	20 %	549687874
139	NC_022528	ATCTC	2	10	266792	266801	20 %	40 %	0 %	40 %	549687875
140	NC_022528	CCAGG	2	10	267451	267460	20 %	0 %	40 %	40 %	549687875
141	NC_022528	AGTGA	2	10	273418	273427	40 %	20 %	40 %	0 %	549687880
142	NC_022528	GGGAT	2	10	273573	273582	20 %	20 %	60 %	0 %	549687880
143	NC_022528	AAAGC	2	10	273967	273976	60 %	0 %	20 %	20 %	549687880
144	NC_022528	CCATG	2	10	275635	275644	20 %	20 %	20 %	40 %	549687881
145	NC_022528	CTTCG	2	10	278104	278113	0 %	40 %	20 %	40 %	549687884
146	NC_022528	ATCGC	2	10	278262	278271	20 %	20 %	20 %	40 %	549687884
147	NC_022528	AGACC	2	10	278665	278674	40 %	0 %	20 %	40 %	549687885
148	NC_022528	AGCAA	2	10	279374	279383	60 %	0 %	20 %	20 %	549687885
149	NC_022528	GGGAT	2	10	282399	282408	20 %	20 %	60 %	0 %	549687888
150	NC_022528	GAAGT	2	10	283436	283445	40 %	20 %	40 %	0 %	549687889
151	NC_022528	ACATC	2	10	283713	283722	40 %	20 %	0 %	40 %	549687889
152	NC_022528	GAAGG	2	10	284439	284448	40 %	0 %	60 %	0 %	549687890
153	NC_022528	GAGAA	2	10	284807	284816	60 %	0 %	40 %	0 %	549687890
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155	NC_022528	AATCC	2	10	288519	288528	40 %	20 %	0 %	40 %	549687893
156	NC_022528	TTGGT	2	10	290474	290483	0 %	60 %	40 %	0 %	549687895
157	NC_022528	ACCAC	2	10	291088	291097	40 %	0 %	0 %	60 %	549687896
158	NC_022528	ATGCC	2	10	291425	291434	20 %	20 %	20 %	40 %	549687896
159	NC_022528	GTACC	2	10	293384	293393	20 %	20 %	20 %	40 %	549687896
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161	NC_022528	CGGGT	2	10	299226	299235	0 %	20 %	60 %	20 %	549687898
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164	NC_022528	CCACC	2	10	310354	310363	20 %	0 %	0 %	80 %	549687906
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166	NC_022528	GCTGT	2	10	320962	320971	0 %	40 %	40 %	20 %	549687915
167	NC_022528	CAAAC	2	10	321979	321988	60 %	0 %	0 %	40 %	549687916
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173	NC_022528	GTCCA	2	10	332149	332158	20 %	20 %	20 %	40 %	549687925
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196	NC_022528	ATTCT	2	10	362024	362033	20 %	60 %	0 %	20 %	549687950
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251	NC_022528	TCGAG	2	10	483902	483911	20 %	20 %	40 %	20 %	549688051
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253	NC_022528	TGGGT	2	10	486013	486022	0 %	40 %	60 %	0 %	549688053
254	NC_022528	TATTG	2	10	487010	487019	20 %	60 %	20 %	0 %	549688054
255	NC_022528	ATTTG	2	10	490241	490250	20 %	60 %	20 %	0 %	549688056
256	NC_022528	ACTGG	2	10	490886	490895	20 %	20 %	40 %	20 %	549688056
257	NC_022528	TGACC	2	10	495479	495488	20 %	20 %	20 %	40 %	549688058
258	NC_022528	CAGTC	2	10	500504	500513	20 %	20 %	20 %	40 %	549688063
259	NC_022528	CAAAG	2	10	501684	501693	60 %	0 %	20 %	20 %	549688063
260	NC_022528	GAGAA	2	10	505931	505940	60 %	0 %	40 %	0 %	549688067
261	NC_022528	CAAAA	2	10	506504	506513	80 %	0 %	0 %	20 %	549688068
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263	NC_022528	TTTCA	2	10	512101	512110	20 %	60 %	0 %	20 %	549688073
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380	NC_022528	TGACA	2	10	704775	704784	40 %	20 %	20 %	20 %	549688240
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382	NC_022528	TCTGA	2	10	712366	712375	20 %	40 %	20 %	20 %	549688248
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384	NC_022528	CCGCA	2	10	717296	717305	20 %	0 %	20 %	60 %	549688252
385	NC_022528	CATTC	2	10	725577	725586	20 %	40 %	0 %	40 %	549688260
386	NC_022528	TAAAG	2	10	727250	727259	60 %	20 %	20 %	0 %	549688262
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388	NC_022528	AATGA	2	10	732356	732365	60 %	20 %	20 %	0 %	549688267
389	NC_022528	ACTGG	2	10	735604	735613	20 %	20 %	40 %	20 %	549688270
390	NC_022528	GATCT	2	10	736089	736098	20 %	40 %	20 %	20 %	549688270
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