MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Vibrio nigripulchritudo str. SFn1 chromosome

Total Repeats: 66358

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_022528	GGT	2	6	244515	244520	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549687857
4002	NC_022528	TCG	2	6	244553	244558	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549687857
4003	NC_022528	GTC	2	6	244588	244593	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549687857
4004	NC_022528	TTC	2	6	244607	244612	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549687857
4005	NC_022528	CTG	2	6	244641	244646	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549687857
4006	NC_022528	GAA	2	6	244695	244700	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549687857
4007	NC_022528	TGT	2	6	244723	244728	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549687857
4008	NC_022528	CTT	2	6	244791	244796	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549687857
4009	NC_022528	TGA	2	6	244802	244807	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549687857
4010	NC_022528	AGT	2	6	244829	244834	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549687857
4011	NC_022528	TGA	2	6	244847	244852	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549687857
4012	NC_022528	TGA	2	6	244855	244860	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549687857
4013	NC_022528	TGA	2	6	244865	244870	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549687857
4014	NC_022528	CCA	2	6	244935	244940	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549687857
4015	NC_022528	GAC	2	6	245037	245042	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549687857
4016	NC_022528	GAA	2	6	245052	245057	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549687857
4017	NC_022528	CAG	2	6	245083	245088	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549687857
4018	NC_022528	AGAA	2	8	245104	245111	75 %	0 %	25 %	0 %	549687857
4019	NC_022528	GTG	2	6	245115	245120	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549687857
4020	NC_022528	TTC	2	6	245131	245136	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549687857
4021	NC_022528	GGC	2	6	245195	245200	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549687857
4022	NC_022528	AGA	2	6	245245	245250	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549687857
4023	NC_022528	GTT	2	6	245285	245290	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549687857
4024	NC_022528	CAG	2	6	245352	245357	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549687857
4025	NC_022528	GAA	2	6	245361	245366	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549687857
4026	NC_022528	CGT	2	6	245388	245393	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549687857
4027	NC_022528	TCG	2	6	245414	245419	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549687857
4028	NC_022528	GAT	2	6	245460	245465	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549687857
4029	NC_022528	CAG	2	6	245484	245489	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549687857
4030	NC_022528	TGA	2	6	245501	245506	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549687857
4031	NC_022528	AGC	2	6	245748	245753	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549687858
4032	NC_022528	GCG	2	6	245870	245875	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549687858
4033	NC_022528	ACG	2	6	246019	246024	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549687858
4034	NC_022528	TGA	2	6	246054	246059	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549687858
4035	NC_022528	GCT	2	6	246126	246131	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549687858
4036	NC_022528	GCC	2	6	246139	246144	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549687858
4037	NC_022528	ACT	2	6	246158	246163	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549687858
4038	NC_022528	CAT	2	6	246187	246192	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549687858
4039	NC_022528	GAAC	2	8	246310	246317	50 %	0 %	25 %	25 %	549687858
4040	NC_022528	TTG	2	6	246359	246364	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549687858
4041	NC_022528	TTAA	2	8	246531	246538	50 %	50 %	0 %	0 %	549687858
4042	NC_022528	AGA	2	6	247042	247047	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549687859
4043	NC_022528	TCCT	2	8	247150	247157	0 %	50 %	0 %	50 %	549687859
4044	NC_022528	CAA	2	6	247163	247168	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	549687859
4045	NC_022528	CTTA	2	8	247178	247185	25 %	50 %	0 %	25 %	549687859
4046	NC_022528	CGAAGA	2	12	247216	247227	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	549687859
4047	NC_022528	TTG	2	6	247410	247415	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549687859
4048	NC_022528	TGA	2	6	247429	247434	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549687859
4049	NC_022528	GCAAAA	2	12	247448	247459	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	549687859
4050	NC_022528	TAC	2	6	247501	247506	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549687859
4051	NC_022528	AAG	2	6	247509	247514	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549687859
4052	NC_022528	GCC	2	6	247656	247661	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549687859
4053	NC_022528	GTT	2	6	247667	247672	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549687859
4054	NC_022528	CTG	2	6	247674	247679	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549687859
4055	NC_022528	AGA	2	6	247690	247695	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549687859
4056	NC_022528	CTGGCA	2	12	247838	247849	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	549687859
4057	NC_022528	CAC	2	6	247883	247888	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549687859
4058	NC_022528	ACC	2	6	247896	247901	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549687859
4059	NC_022528	TGA	2	6	247929	247934	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549687859
4060	NC_022528	TGC	2	6	247957	247962	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549687859
4061	NC_022528	AAGC	2	8	248079	248086	50 %	0 %	25 %	25 %	549687859
4062	NC_022528	ACG	2	6	248097	248102	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549687859
4063	NC_022528	TTA	2	6	248133	248138	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549687859
4064	NC_022528	GAA	2	6	248287	248292	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549687860
4065	NC_022528	CCA	2	6	248327	248332	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549687860
4066	NC_022528	TGAC	2	8	248336	248343	25 %	25 %	25 %	25 %	549687860
4067	NC_022528	CCAAT	2	10	248374	248383	40 %	20 %	0 %	40 %	549687860
4068	NC_022528	GGT	2	6	248443	248448	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549687860
4069	NC_022528	TGCT	2	8	248492	248499	0 %	50 %	25 %	25 %	549687860
4070	NC_022528	GAT	2	6	248514	248519	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549687860
4071	NC_022528	AGA	2	6	248550	248555	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549687860
4072	NC_022528	TAT	2	6	248670	248675	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549687860
4073	NC_022528	TTCA	2	8	248682	248689	25 %	50 %	0 %	25 %	549687860
4074	NC_022528	GGT	2	6	248695	248700	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549687860
4075	NC_022528	GGC	2	6	248704	248709	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549687860
4076	NC_022528	ACA	2	6	248720	248725	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	549687860
4077	NC_022528	AAG	2	6	248726	248731	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549687860
4078	NC_022528	GAA	2	6	248737	248742	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549687860
4079	NC_022528	GTC	2	6	248747	248752	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549687860
4080	NC_022528	CCAA	2	8	248770	248777	50 %	0 %	0 %	50 %	549687860
4081	NC_022528	ATC	2	6	248857	248862	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549687860
4082	NC_022528	CT	3	6	248973	248978	0 %	50 %	0 %	50 %	549687860
4083	NC_022528	GGT	2	6	249010	249015	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549687860
4084	NC_022528	ATC	2	6	249061	249066	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549687860
4085	NC_022528	TGA	2	6	249168	249173	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549687860
4086	NC_022528	TGG	2	6	249192	249197	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549687860
4087	NC_022528	AACC	2	8	249218	249225	50 %	0 %	0 %	50 %	549687860
4088	NC_022528	GAC	2	6	249294	249299	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549687860
4089	NC_022528	CAA	2	6	249343	249348	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	549687860
4090	NC_022528	TGA	2	6	249399	249404	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549687860
4091	NC_022528	TGG	2	6	249407	249412	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549687860
4092	NC_022528	AAG	2	6	249458	249463	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549687860
4093	NC_022528	GTCT	2	8	249509	249516	0 %	50 %	25 %	25 %	549687860
4094	NC_022528	TGG	2	6	249606	249611	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549687860
4095	NC_022528	CTA	2	6	249685	249690	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549687860
4096	NC_022528	CGT	2	6	249712	249717	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549687860
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4099	NC_022528	GGT	2	6	249868	249873	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549687860
4100	NC_022528	ACT	2	6	249905	249910	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549687860
4101	NC_022528	CAT	2	6	249957	249962	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549687860
4102	NC_022528	GGT	2	6	250096	250101	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549687860
4103	NC_022528	CTC	2	6	250106	250111	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	549687860
4104	NC_022528	AGC	2	6	250134	250139	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549687860
4105	NC_022528	ATC	2	6	250150	250155	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549687860
4106	NC_022528	AGA	2	6	250185	250190	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549687860
4107	NC_022528	GCA	2	6	250207	250212	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549687860
4108	NC_022528	CTT	2	6	250316	250321	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549687860
4109	NC_022528	GGT	2	6	250330	250335	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549687860
4110	NC_022528	ACG	2	6	250355	250360	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549687860
4111	NC_022528	CGT	2	6	250485	250490	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549687860
4112	NC_022528	CGG	2	6	250494	250499	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549687860
4113	NC_022528	TGA	2	6	250643	250648	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549687860
4114	NC_022528	TGC	2	6	250704	250709	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549687860
4115	NC_022528	CAC	2	6	250745	250750	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549687860
4116	NC_022528	TCC	2	6	250821	250826	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	549687860
4117	NC_022528	TAC	2	6	250828	250833	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549687860
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4119	NC_022528	CAA	2	6	250860	250865	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	549687860
4120	NC_022528	GGT	2	6	250993	250998	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549687860
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4160	NC_022528	GT	3	6	253334	253339	0 %	50 %	50 %	0 %	549687863
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4226	NC_022528	TGAG	2	8	257990	257997	25 %	25 %	50 %	0 %	549687867
4227	NC_022528	CGT	2	6	258125	258130	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549687867
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4233	NC_022528	CGCCA	2	10	258577	258586	20 %	0 %	20 %	60 %	549687868
4234	NC_022528	ACC	2	6	258587	258592	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549687868
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4236	NC_022528	ACC	2	6	258641	258646	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549687868
4237	NC_022528	TGA	2	6	258675	258680	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549687868
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4241	NC_022528	AGC	2	6	258949	258954	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549687868
4242	NC_022528	TTC	2	6	259057	259062	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549687868
4243	NC_022528	GC	3	6	259111	259116	0 %	0 %	50 %	50 %	549687868
4244	NC_022528	TCTG	2	8	259121	259128	0 %	50 %	25 %	25 %	549687868
4245	NC_022528	TCCG	2	8	259135	259142	0 %	25 %	25 %	50 %	549687868
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4248	NC_022528	CTG	2	6	259306	259311	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549687869
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4250	NC_022528	TAG	2	6	259383	259388	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549687869
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4252	NC_022528	CTGC	2	8	259473	259480	0 %	25 %	25 %	50 %	549687869
4253	NC_022528	CTT	3	9	259517	259525	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549687869
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4255	NC_022528	CTT	2	6	259598	259603	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549687869
4256	NC_022528	CTGCA	2	10	259622	259631	20 %	20 %	20 %	40 %	549687869
4257	NC_022528	GTAA	2	8	259673	259680	50 %	25 %	25 %	0 %	549687869
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4261	NC_022528	TGCC	2	8	259928	259935	0 %	25 %	25 %	50 %	549687869
4262	NC_022528	GCC	2	6	259950	259955	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549687869
4263	NC_022528	GGT	2	6	259962	259967	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549687869
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4342	NC_022528	TCAT	2	8	264277	264284	25 %	50 %	0 %	25 %	549687872
4343	NC_022528	TCC	2	6	264294	264299	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	549687873
4344	NC_022528	AC	3	6	264333	264338	50 %	0 %	0 %	50 %	549687873
4345	NC_022528	GAT	3	9	264343	264351	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549687873
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4352	NC_022528	CAATCA	2	12	264483	264494	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	549687873
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4359	NC_022528	GCAG	2	8	264779	264786	25 %	0 %	50 %	25 %	549687873
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4361	NC_022528	ACC	2	6	264829	264834	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549687873
4362	NC_022528	ATC	2	6	264842	264847	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549687873
4363	NC_022528	CAAT	2	8	264864	264871	50 %	25 %	0 %	25 %	549687873
4364	NC_022528	CAAA	2	8	264927	264934	75 %	0 %	0 %	25 %	549687873
4365	NC_022528	CATC	2	8	264981	264988	25 %	25 %	0 %	50 %	549687873
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4382	NC_022528	GCT	2	6	265645	265650	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549687874
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4390	NC_022528	GCG	2	6	266272	266277	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549687874
4391	NC_022528	CTG	2	6	266288	266293	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549687874
4392	NC_022528	TCA	2	6	266294	266299	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549687874
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4394	NC_022528	TGC	2	6	266447	266452	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549687875
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4400	NC_022528	ATCA	2	8	266860	266867	50 %	25 %	0 %	25 %	549687875
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4479	NC_022528	TCA	2	6	272528	272533	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549687879
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4481	NC_022528	TCT	2	6	272599	272604	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549687879
4482	NC_022528	TAA	2	6	272608	272613	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	549687879
4483	NC_022528	GTG	2	6	272634	272639	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549687879
4484	NC_022528	GCA	2	6	272666	272671	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549687879
4485	NC_022528	CA	3	6	272833	272838	50 %	0 %	0 %	50 %	549687879
4486	NC_022528	AACA	2	8	272856	272863	75 %	0 %	0 %	25 %	549687879
4487	NC_022528	CAA	2	6	272951	272956	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	549687879
4488	NC_022528	AGG	2	6	272977	272982	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549687879
4489	NC_022528	TTG	2	6	272989	272994	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549687879
4490	NC_022528	TCA	2	6	273080	273085	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549687879
4491	NC_022528	ACC	2	6	273116	273121	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549687879
4492	NC_022528	GCACCT	2	12	273130	273141	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	549687879
4493	NC_022528	AAT	2	6	273186	273191	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	549687879
4494	NC_022528	ATA	2	6	273226	273231	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	549687879
4495	NC_022528	CTG	2	6	273376	273381	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549687880
4496	NC_022528	CTG	2	6	273384	273389	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549687880
4497	NC_022528	CTT	2	6	273402	273407	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549687880
4498	NC_022528	AGTGA	2	10	273418	273427	40 %	20 %	40 %	0 %	549687880
4499	NC_022528	ATG	2	6	273506	273511	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549687880
4500	NC_022528	GGGAT	2	10	273573	273582	20 %	20 %	60 %	0 %	549687880

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