MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Vibrio campbellii ATCC BAA-1116 plasmid

Total Repeats: 80

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022271	GA	3	6	673	678	50 %	0 %	50 %	0 %	541872155
2	NC_022271	GT	3	6	810	815	0 %	50 %	50 %	0 %	541872155
3	NC_022271	AT	3	6	1148	1153	50 %	50 %	0 %	0 %	541872156
4	NC_022271	GT	3	6	1210	1215	0 %	50 %	50 %	0 %	541872156
5	NC_022271	CA	3	6	6288	6293	50 %	0 %	0 %	50 %	541872162
6	NC_022271	CA	3	6	6338	6343	50 %	0 %	0 %	50 %	541872162
7	NC_022271	TA	3	6	7076	7081	50 %	50 %	0 %	0 %	541872163
8	NC_022271	GA	3	6	9866	9871	50 %	0 %	50 %	0 %	541872165
9	NC_022271	AT	3	6	10504	10509	50 %	50 %	0 %	0 %	541872165
10	NC_022271	GT	3	6	12465	12470	0 %	50 %	50 %	0 %	541872168
11	NC_022271	CG	3	6	12949	12954	0 %	0 %	50 %	50 %	541872168
12	NC_022271	GA	3	6	13770	13775	50 %	0 %	50 %	0 %	541872168
13	NC_022271	GA	3	6	14420	14425	50 %	0 %	50 %	0 %	541872170
14	NC_022271	GT	3	6	14557	14562	0 %	50 %	50 %	0 %	541872170
15	NC_022271	TG	3	6	14752	14757	0 %	50 %	50 %	0 %	541872171
16	NC_022271	TG	3	6	15026	15031	0 %	50 %	50 %	0 %	541872171
17	NC_022271	TG	3	6	17019	17024	0 %	50 %	50 %	0 %	541872175
18	NC_022271	TG	3	6	17293	17298	0 %	50 %	50 %	0 %	541872175
19	NC_022271	GA	3	6	19571	19576	50 %	0 %	50 %	0 %	541872178
20	NC_022271	GA	3	6	21258	21263	50 %	0 %	50 %	0 %	541872180
21	NC_022271	GC	3	6	21867	21872	0 %	0 %	50 %	50 %	541872180
22	NC_022271	AT	3	6	22785	22790	50 %	50 %	0 %	0 %	541872181
23	NC_022271	TA	3	6	24432	24437	50 %	50 %	0 %	0 %	541872182
24	NC_022271	AG	3	6	25800	25805	50 %	0 %	50 %	0 %	541872184
25	NC_022271	AG	3	6	25954	25959	50 %	0 %	50 %	0 %	541872184
26	NC_022271	TA	3	6	26840	26845	50 %	50 %	0 %	0 %	541872185
27	NC_022271	CT	3	6	30604	30609	0 %	50 %	0 %	50 %	541872148
28	NC_022271	TC	3	6	32273	32278	0 %	50 %	0 %	50 %	541872188
29	NC_022271	TG	3	6	32992	32997	0 %	50 %	50 %	0 %	541872188
30	NC_022271	CT	3	6	33223	33228	0 %	50 %	0 %	50 %	541872188
31	NC_022271	GT	3	6	33727	33732	0 %	50 %	50 %	0 %	541872189
32	NC_022271	AC	3	6	35047	35052	50 %	0 %	0 %	50 %	541872191
33	NC_022271	AG	3	6	36101	36106	50 %	0 %	50 %	0 %	541872191
34	NC_022271	GA	3	6	38592	38597	50 %	0 %	50 %	0 %	541872195
35	NC_022271	AT	3	6	39518	39523	50 %	50 %	0 %	0 %	541872197
36	NC_022271	CA	3	6	39904	39909	50 %	0 %	0 %	50 %	541872198
37	NC_022271	GT	3	6	40902	40907	0 %	50 %	50 %	0 %	541872198
38	NC_022271	TC	3	6	41304	41309	0 %	50 %	0 %	50 %	541872198
39	NC_022271	TG	3	6	41929	41934	0 %	50 %	50 %	0 %	541872198
40	NC_022271	AG	3	6	42086	42091	50 %	0 %	50 %	0 %	541872198
41	NC_022271	TC	3	6	42996	43001	0 %	50 %	0 %	50 %	541872201
42	NC_022271	TG	3	6	46335	46340	0 %	50 %	50 %	0 %	541872149
43	NC_022271	CT	3	6	46785	46790	0 %	50 %	0 %	50 %	541872207
44	NC_022271	GA	3	6	49496	49501	50 %	0 %	50 %	0 %	541872209
45	NC_022271	TC	3	6	51343	51348	0 %	50 %	0 %	50 %	541872212
46	NC_022271	TC	3	6	51479	51484	0 %	50 %	0 %	50 %	541872213
47	NC_022271	TG	3	6	51624	51629	0 %	50 %	50 %	0 %	541872213
48	NC_022271	AG	3	6	53698	53703	50 %	0 %	50 %	0 %	541872215
49	NC_022271	GT	3	6	55052	55057	0 %	50 %	50 %	0 %	541872217
50	NC_022271	CG	3	6	55536	55541	0 %	0 %	50 %	50 %	541872217
51	NC_022271	GA	3	6	56366	56371	50 %	0 %	50 %	0 %	541872217
52	NC_022271	GA	3	6	57015	57020	50 %	0 %	50 %	0 %	541872219
53	NC_022271	GT	3	6	57152	57157	0 %	50 %	50 %	0 %	541872219
54	NC_022271	TG	3	6	57504	57509	0 %	50 %	50 %	0 %	541872220
55	NC_022271	CT	3	6	60271	60276	0 %	50 %	0 %	50 %	541872223
56	NC_022271	AG	3	6	60282	60287	50 %	0 %	50 %	0 %	541872223
57	NC_022271	GC	3	6	60362	60367	0 %	0 %	50 %	50 %	541872223
58	NC_022271	CT	3	6	61289	61294	0 %	50 %	0 %	50 %	541872223
59	NC_022271	GC	3	6	61800	61805	0 %	0 %	50 %	50 %	541872150
60	NC_022271	GC	3	6	61988	61993	0 %	0 %	50 %	50 %	541872150
61	NC_022271	AG	3	6	64291	64296	50 %	0 %	50 %	0 %	541872226
62	NC_022271	TG	3	6	65115	65120	0 %	50 %	50 %	0 %	541872226
63	NC_022271	AG	3	6	65155	65160	50 %	0 %	50 %	0 %	541872226
64	NC_022271	GC	3	6	66351	66356	0 %	0 %	50 %	50 %	541872227
65	NC_022271	TG	3	6	66827	66832	0 %	50 %	50 %	0 %	541872228
66	NC_022271	TG	3	6	67564	67569	0 %	50 %	50 %	0 %	541872229
67	NC_022271	AG	3	6	68448	68453	50 %	0 %	50 %	0 %	541872231
68	NC_022271	CT	3	6	69101	69106	0 %	50 %	0 %	50 %	541872232
69	NC_022271	GT	3	6	69435	69440	0 %	50 %	50 %	0 %	541872232
70	NC_022271	AT	3	6	72253	72258	50 %	50 %	0 %	0 %	541872234
71	NC_022271	CA	3	6	79208	79213	50 %	0 %	0 %	50 %	541872237
72	NC_022271	AG	3	6	79927	79932	50 %	0 %	50 %	0 %	541872237
73	NC_022271	CA	3	6	81875	81880	50 %	0 %	0 %	50 %	541872239
74	NC_022271	AC	3	6	81939	81944	50 %	0 %	0 %	50 %	541872239
75	NC_022271	AG	3	6	82111	82116	50 %	0 %	50 %	0 %	541872239
76	NC_022271	CA	3	6	82318	82323	50 %	0 %	0 %	50 %	541872239
77	NC_022271	AC	3	6	85756	85761	50 %	0 %	0 %	50 %	541872241
78	NC_022271	AG	3	6	86090	86095	50 %	0 %	50 %	0 %	541872241
79	NC_022271	CA	3	6	87247	87252	50 %	0 %	0 %	50 %	541872243
80	NC_022271	AG	4	8	87543	87550	50 %	0 %	50 %	0 %	541872243

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.