MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Vibrio campbellii ATCC BAA-1116 plasmid

Total Repeats: 1112

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_022271	CAC	2	6	37145	37150	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	541872193
502	NC_022271	TCT	2	6	37215	37220	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	541872193
503	NC_022271	CGT	2	6	37300	37305	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	541872193
504	NC_022271	GAC	2	6	37306	37311	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	541872193
505	NC_022271	AAT	2	6	37448	37453	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	541872193
506	NC_022271	CAT	2	6	37514	37519	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	541872193
507	NC_022271	CAA	2	6	37522	37527	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	541872193
508	NC_022271	GCTT	2	8	37656	37663	0 %	50 %	25 %	25 %	541872193
509	NC_022271	GGTT	2	8	37676	37683	0 %	50 %	50 %	0 %	541872193
510	NC_022271	T	6	6	37682	37687	0 %	100 %	0 %	0 %	541872193
511	NC_022271	GGC	2	6	37820	37825	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	541872194
512	NC_022271	CCA	2	6	37860	37865	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	541872194
513	NC_022271	ATA	2	6	37866	37871	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	541872194
514	NC_022271	GCT	2	6	38041	38046	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	541872195
515	NC_022271	GCG	2	6	38062	38067	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	541872195
516	NC_022271	GAACA	2	10	38140	38149	60 %	0 %	20 %	20 %	541872195
517	NC_022271	CAA	2	6	38176	38181	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	541872195
518	NC_022271	GAT	2	6	38190	38195	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	541872195
519	NC_022271	ACC	2	6	38235	38240	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	541872195
520	NC_022271	GAAA	2	8	38360	38367	75 %	0 %	25 %	0 %	541872195
521	NC_022271	AAG	2	6	38397	38402	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	541872195
522	NC_022271	ACA	2	6	38446	38451	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	541872195
523	NC_022271	CAAT	2	8	38468	38475	50 %	25 %	0 %	25 %	541872195
524	NC_022271	C	6	6	38543	38548	0 %	0 %	0 %	100 %	541872195
525	NC_022271	GA	3	6	38592	38597	50 %	0 %	50 %	0 %	541872195
526	NC_022271	ATC	2	6	38634	38639	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	541872195
527	NC_022271	TAA	2	6	38647	38652	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	541872195
528	NC_022271	ACG	2	6	38681	38686	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	541872195
529	NC_022271	GGT	2	6	38700	38705	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	541872195
530	NC_022271	ATC	2	6	38746	38751	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	541872195
531	NC_022271	CAT	2	6	38762	38767	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	541872195
532	NC_022271	ACA	2	6	38803	38808	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	541872195
533	NC_022271	CAA	2	6	38849	38854	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	541872195
534	NC_022271	TCC	2	6	38917	38922	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	541872196
535	NC_022271	T	6	6	38955	38960	0 %	100 %	0 %	0 %	541872196
536	NC_022271	ATC	2	6	38967	38972	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	541872196
537	NC_022271	TTTTC	2	10	39020	39029	0 %	80 %	0 %	20 %	541872196
538	NC_022271	TAGTTT	2	12	39083	39094	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	541872196
539	NC_022271	TAG	2	6	39114	39119	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	541872196
540	NC_022271	CAT	2	6	39276	39281	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	541872197
541	NC_022271	TCT	2	6	39334	39339	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	541872197
542	NC_022271	GTT	2	6	39352	39357	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	541872197
543	NC_022271	GAC	2	6	39380	39385	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	541872197
544	NC_022271	TTCG	2	8	39389	39396	0 %	50 %	25 %	25 %	541872197
545	NC_022271	TGC	2	6	39407	39412	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	541872197
546	NC_022271	GTT	2	6	39440	39445	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	541872197
547	NC_022271	GTC	2	6	39480	39485	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	541872197
548	NC_022271	AT	3	6	39518	39523	50 %	50 %	0 %	0 %	541872197
549	NC_022271	CAT	2	6	39569	39574	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	541872197
550	NC_022271	TTC	2	6	39597	39602	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	541872197
551	NC_022271	TTGA	2	8	39657	39664	25 %	50 %	25 %	0 %	541872197
552	NC_022271	ACC	2	6	39724	39729	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	541872197
553	NC_022271	CAA	2	6	39752	39757	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	541872197
554	NC_022271	AGT	2	6	39849	39854	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	541872198
555	NC_022271	CA	3	6	39904	39909	50 %	0 %	0 %	50 %	541872198
556	NC_022271	GAT	2	6	39935	39940	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	541872198
557	NC_022271	TCA	2	6	39951	39956	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	541872198
558	NC_022271	AAC	2	6	39982	39987	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	541872198
559	NC_022271	TGTT	2	8	40127	40134	0 %	75 %	25 %	0 %	541872198
560	NC_022271	TCT	2	6	40170	40175	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	541872198
561	NC_022271	TGA	2	6	40184	40189	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	541872198
562	NC_022271	TCAT	2	8	40203	40210	25 %	50 %	0 %	25 %	541872198
563	NC_022271	TCA	2	6	40237	40242	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	541872198
564	NC_022271	AAG	2	6	40332	40337	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	541872198
565	NC_022271	AACA	2	8	40338	40345	75 %	0 %	0 %	25 %	541872198
566	NC_022271	TAG	2	6	40397	40402	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	541872198
567	NC_022271	TTGC	2	8	40432	40439	0 %	50 %	25 %	25 %	541872198
568	NC_022271	CAAG	2	8	40473	40480	50 %	0 %	25 %	25 %	541872198
569	NC_022271	GCA	2	6	40546	40551	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	541872198
570	NC_022271	TCA	2	6	40585	40590	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	541872198
571	NC_022271	TATC	2	8	40594	40601	25 %	50 %	0 %	25 %	541872198
572	NC_022271	TCA	2	6	40620	40625	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	541872198
573	NC_022271	AAG	2	6	40680	40685	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	541872198
574	NC_022271	TCT	2	6	40734	40739	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	541872198
575	NC_022271	CCTT	2	8	40740	40747	0 %	50 %	0 %	50 %	541872198
576	NC_022271	CCA	2	6	40764	40769	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	541872198
577	NC_022271	A	6	6	40838	40843	100 %	0 %	0 %	0 %	541872198
578	NC_022271	CGT	2	6	40865	40870	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	541872198
579	NC_022271	GT	3	6	40902	40907	0 %	50 %	50 %	0 %	541872198
580	NC_022271	AGT	2	6	41047	41052	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	541872198
581	NC_022271	GTG	2	6	41092	41097	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	541872198
582	NC_022271	CTAT	2	8	41214	41221	25 %	50 %	0 %	25 %	541872198
583	NC_022271	TC	3	6	41304	41309	0 %	50 %	0 %	50 %	541872198
584	NC_022271	ATCA	2	8	41375	41382	50 %	25 %	0 %	25 %	541872198
585	NC_022271	GTTG	2	8	41439	41446	0 %	50 %	50 %	0 %	541872198
586	NC_022271	GAA	2	6	41504	41509	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	541872198
587	NC_022271	TGG	2	6	41521	41526	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	541872198
588	NC_022271	GTT	2	6	41531	41536	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	541872198
589	NC_022271	AAGA	2	8	41650	41657	75 %	0 %	25 %	0 %	541872198
590	NC_022271	TCT	2	6	41760	41765	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	541872198
591	NC_022271	GTA	2	6	41807	41812	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	541872198
592	NC_022271	TG	3	6	41929	41934	0 %	50 %	50 %	0 %	541872198
593	NC_022271	T	6	6	41985	41990	0 %	100 %	0 %	0 %	541872198
594	NC_022271	AAGG	2	8	42000	42007	50 %	0 %	50 %	0 %	541872198
595	NC_022271	AG	3	6	42086	42091	50 %	0 %	50 %	0 %	541872198
596	NC_022271	GTCA	2	8	42128	42135	25 %	25 %	25 %	25 %	541872198
597	NC_022271	TGAA	2	8	42203	42210	50 %	25 %	25 %	0 %	541872199
598	NC_022271	AAG	2	6	42241	42246	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	541872199
599	NC_022271	CATTT	2	10	42259	42268	20 %	60 %	0 %	20 %	541872199
600	NC_022271	GAA	2	6	42360	42365	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	541872199
601	NC_022271	CAGT	2	8	42383	42390	25 %	25 %	25 %	25 %	541872199
602	NC_022271	CAA	2	6	42396	42401	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	541872199
603	NC_022271	GAT	2	6	42420	42425	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	541872199
604	NC_022271	TTC	2	6	42486	42491	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	541872199
605	NC_022271	GCC	2	6	42558	42563	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	541872200
606	NC_022271	C	6	6	42589	42594	0 %	0 %	0 %	100 %	541872200
607	NC_022271	T	7	7	42598	42604	0 %	100 %	0 %	0 %	541872200
608	NC_022271	GCG	2	6	42723	42728	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	541872200
609	NC_022271	ACAA	2	8	42740	42747	75 %	0 %	0 %	25 %	541872200
610	NC_022271	CAT	2	6	42755	42760	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	541872200
611	NC_022271	TTA	2	6	42832	42837	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	541872201
612	NC_022271	GCTT	2	8	42872	42879	0 %	50 %	25 %	25 %	541872201
613	NC_022271	TGG	2	6	42880	42885	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	541872201
614	NC_022271	TC	3	6	42996	43001	0 %	50 %	0 %	50 %	541872201
615	NC_022271	TAA	2	6	43037	43042	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	541872201
616	NC_022271	GGC	2	6	43048	43053	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	541872201
617	NC_022271	ATC	2	6	43054	43059	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	541872201
618	NC_022271	AGT	2	6	43061	43066	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	541872201
619	NC_022271	GGT	2	6	43104	43109	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	541872201
620	NC_022271	ACTCA	2	10	43420	43429	40 %	20 %	0 %	40 %	541872201
621	NC_022271	TTC	2	6	43439	43444	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	541872202
622	NC_022271	TTG	2	6	43471	43476	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	541872202
623	NC_022271	TCA	2	6	43515	43520	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	541872202
624	NC_022271	TCA	2	6	43617	43622	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	541872202
625	NC_022271	TGA	2	6	43641	43646	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	541872202
626	NC_022271	T	6	6	43686	43691	0 %	100 %	0 %	0 %	541872202
627	NC_022271	CAA	2	6	43765	43770	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	541872202
628	NC_022271	T	7	7	43771	43777	0 %	100 %	0 %	0 %	541872202
629	NC_022271	ATC	2	6	43778	43783	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	541872202
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634	NC_022271	CATTT	2	10	44020	44029	20 %	60 %	0 %	20 %	541872203
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651	NC_022271	AAGT	2	8	45493	45500	50 %	25 %	25 %	0 %	541872206
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663	NC_022271	TAC	2	6	45890	45895	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	541872149
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669	NC_022271	TTG	2	6	46122	46127	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	541872149
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748	NC_022271	TCA	2	6	53431	53436	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	541872215
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752	NC_022271	TGC	2	6	53575	53580	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	541872215
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755	NC_022271	AG	3	6	53698	53703	50 %	0 %	50 %	0 %	541872215
756	NC_022271	TGC	2	6	53716	53721	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	541872215
757	NC_022271	CGAAA	2	10	53740	53749	60 %	0 %	20 %	20 %	541872215
758	NC_022271	GCG	2	6	53750	53755	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	541872215
759	NC_022271	TGA	2	6	53776	53781	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	541872215
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761	NC_022271	AGC	2	6	53874	53879	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	541872215
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774	NC_022271	CGA	2	6	55010	55015	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	541872217
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783	NC_022271	CAAC	2	8	55435	55442	50 %	0 %	0 %	50 %	541872217
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868	NC_022271	ATT	2	6	62754	62759	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	541872225
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870	NC_022271	GTT	2	6	62785	62790	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	541872225
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872	NC_022271	GAG	2	6	64225	64230	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	541872226
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880	NC_022271	TCTT	2	8	64661	64668	0 %	75 %	0 %	25 %	541872226
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