MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Vibrio campbellii ATCC BAA-1116 chromosome I

Total Repeats: 59490

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_022269	CAT	2	6	230871	230876	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	541866921
3502	NC_022269	CTT	2	6	230881	230886	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	541866921
3503	NC_022269	CCT	2	6	230889	230894	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	541866921
3504	NC_022269	A	6	6	230956	230961	100 %	0 %	0 %	0 %	541866921
3505	NC_022269	CAA	2	6	231013	231018	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	541866921
3506	NC_022269	CAGA	2	8	231098	231105	50 %	0 %	25 %	25 %	541866921
3507	NC_022269	A	6	6	231235	231240	100 %	0 %	0 %	0 %	541866921
3508	NC_022269	ACA	2	6	231266	231271	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	541866921
3509	NC_022269	TCGAA	2	10	231313	231322	40 %	20 %	20 %	20 %	541866921
3510	NC_022269	ATCG	2	8	231328	231335	25 %	25 %	25 %	25 %	541866921
3511	NC_022269	TCG	2	6	231414	231419	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	541866921
3512	NC_022269	TTTG	2	8	231435	231442	0 %	75 %	25 %	0 %	541866921
3513	NC_022269	GC	3	6	231450	231455	0 %	0 %	50 %	50 %	541866921
3514	NC_022269	ACG	2	6	231463	231468	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	541866921
3515	NC_022269	TGG	2	6	231482	231487	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	541866921
3516	NC_022269	CGAGTC	2	12	231644	231655	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	541866921
3517	NC_022269	GTGA	2	8	231876	231883	25 %	25 %	50 %	0 %	541869094
3518	NC_022269	TC	3	6	231959	231964	0 %	50 %	0 %	50 %	541869094
3519	NC_022269	CGA	2	6	232004	232009	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	541869094
3520	NC_022269	CAA	2	6	232047	232052	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	541869094
3521	NC_022269	AC	3	6	232072	232077	50 %	0 %	0 %	50 %	541869094
3522	NC_022269	AG	3	6	232196	232201	50 %	0 %	50 %	0 %	541869094
3523	NC_022269	CCT	2	6	232289	232294	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	541869095
3524	NC_022269	A	6	6	232360	232365	100 %	0 %	0 %	0 %	541869095
3525	NC_022269	GTA	2	6	232414	232419	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	541869095
3526	NC_022269	CTA	2	6	232443	232448	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	541869095
3527	NC_022269	CAA	2	6	232450	232455	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	541869095
3528	NC_022269	ATC	2	6	232478	232483	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	541869095
3529	NC_022269	TA	3	6	232593	232598	50 %	50 %	0 %	0 %	541869095
3530	NC_022269	CT	3	6	232660	232665	0 %	50 %	0 %	50 %	541869095
3531	NC_022269	GA	3	6	232705	232710	50 %	0 %	50 %	0 %	541869095
3532	NC_022269	CTT	2	6	232744	232749	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	541869095
3533	NC_022269	TGC	2	6	232781	232786	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	541869095
3534	NC_022269	CTG	2	6	232797	232802	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	541869095
3535	NC_022269	CTGCA	2	10	232848	232857	20 %	20 %	20 %	40 %	541869095
3536	NC_022269	TTG	2	6	232918	232923	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	541869095
3537	NC_022269	GTG	2	6	232964	232969	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	541869095
3538	NC_022269	CTT	2	6	233064	233069	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	541869095
3539	NC_022269	TATG	2	8	233197	233204	25 %	50 %	25 %	0 %	541869095
3540	NC_022269	ATT	2	6	233597	233602	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	541866922
3541	NC_022269	CAAG	2	8	233626	233633	50 %	0 %	25 %	25 %	541866922
3542	NC_022269	TAG	2	6	233677	233682	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	541866922
3543	NC_022269	AGG	2	6	233743	233748	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	541866922
3544	NC_022269	TTC	2	6	233770	233775	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	541866922
3545	NC_022269	TCT	2	6	233787	233792	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	541866922
3546	NC_022269	ATC	2	6	233812	233817	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	541866922
3547	NC_022269	CATTA	2	10	233960	233969	40 %	40 %	0 %	20 %	541866922
3548	NC_022269	AAGC	2	8	233985	233992	50 %	0 %	25 %	25 %	541866922
3549	NC_022269	GAT	2	6	234000	234005	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	541866922
3550	NC_022269	CAC	2	6	234016	234021	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	541866922
3551	NC_022269	GTC	2	6	234113	234118	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	541866922
3552	NC_022269	GATG	2	8	234191	234198	25 %	25 %	50 %	0 %	541869096
3553	NC_022269	CAT	2	6	234224	234229	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	541869096
3554	NC_022269	TGA	3	9	234247	234255	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	541869096
3555	NC_022269	TGAAT	2	10	234407	234416	40 %	40 %	20 %	0 %	541869096
3556	NC_022269	CTT	2	6	234553	234558	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	541869096
3557	NC_022269	TTG	2	6	234598	234603	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	541869096
3558	NC_022269	TGA	2	6	234665	234670	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	541869096
3559	NC_022269	TAA	2	6	234741	234746	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	541869096
3560	NC_022269	ATC	2	6	234868	234873	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	541866923
3561	NC_022269	AGCT	2	8	234885	234892	25 %	25 %	25 %	25 %	541866923
3562	NC_022269	TGT	2	6	234903	234908	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	541866923
3563	NC_022269	GC	3	6	235327	235332	0 %	0 %	50 %	50 %	541866923
3564	NC_022269	GAA	2	6	235375	235380	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	541866923
3565	NC_022269	CCAG	2	8	235433	235440	25 %	0 %	25 %	50 %	541866923
3566	NC_022269	CGC	2	6	235557	235562	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	541866923
3567	NC_022269	AGC	2	6	235616	235621	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	541866923
3568	NC_022269	CAG	2	6	235656	235661	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	541866923
3569	NC_022269	GCA	2	6	235677	235682	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	541866923
3570	NC_022269	TCA	2	6	235715	235720	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	541866923
3571	NC_022269	ATGG	2	8	235724	235731	25 %	25 %	50 %	0 %	541866923
3572	NC_022269	TGT	2	6	235777	235782	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	541866923
3573	NC_022269	CAT	2	6	235809	235814	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	541866923
3574	NC_022269	CTT	2	6	235851	235856	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	541866923
3575	NC_022269	T	7	7	235886	235892	0 %	100 %	0 %	0 %	541866923
3576	NC_022269	GCCC	2	8	235897	235904	0 %	0 %	25 %	75 %	541866923
3577	NC_022269	GTC	2	6	235906	235911	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	541866923
3578	NC_022269	TTG	2	6	235999	236004	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	541866923
3579	NC_022269	CTT	2	6	236058	236063	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	541866923
3580	NC_022269	AG	3	6	236105	236110	50 %	0 %	50 %	0 %	541866923
3581	NC_022269	CTG	2	6	236163	236168	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	541866923
3582	NC_022269	AGAT	2	8	236203	236210	50 %	25 %	25 %	0 %	541866923
3583	NC_022269	T	7	7	236227	236233	0 %	100 %	0 %	0 %	541866923
3584	NC_022269	CGA	2	6	236241	236246	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	541866923
3585	NC_022269	TTGC	2	8	236618	236625	0 %	50 %	25 %	25 %	541866924
3586	NC_022269	TTA	2	6	236669	236674	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	541866924
3587	NC_022269	TGACGC	2	12	236728	236739	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	541866924
3588	NC_022269	CTG	2	6	236884	236889	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	541866924
3589	NC_022269	GTT	2	6	236891	236896	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	541866924
3590	NC_022269	AGC	2	6	236946	236951	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	541866924
3591	NC_022269	GC	3	6	236954	236959	0 %	0 %	50 %	50 %	541866924
3592	NC_022269	TGA	2	6	236962	236967	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	541866924
3593	NC_022269	CGG	2	6	237070	237075	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	541866924
3594	NC_022269	CTG	2	6	237126	237131	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	541866924
3595	NC_022269	TTCAT	2	10	237154	237163	20 %	60 %	0 %	20 %	541866924
3596	NC_022269	CTG	2	6	237219	237224	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	541866924
3597	NC_022269	TGGA	2	8	237246	237253	25 %	25 %	50 %	0 %	541866924
3598	NC_022269	ACT	2	6	237293	237298	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	541866924
3599	NC_022269	TTAT	2	8	237347	237354	25 %	75 %	0 %	0 %	541866925
3600	NC_022269	GTT	2	6	237377	237382	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	541866925
3601	NC_022269	ACG	2	6	237514	237519	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	541866925
3602	NC_022269	CGG	2	6	237540	237545	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	541866925
3603	NC_022269	TG	3	6	237603	237608	0 %	50 %	50 %	0 %	541866925
3604	NC_022269	GT	3	6	237674	237679	0 %	50 %	50 %	0 %	541866925
3605	NC_022269	GA	3	6	237690	237695	50 %	0 %	50 %	0 %	541866925
3606	NC_022269	TGA	2	6	237748	237753	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	541866925
3607	NC_022269	AG	3	6	237764	237769	50 %	0 %	50 %	0 %	541866925
3608	NC_022269	CAA	2	6	237818	237823	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	541866925
3609	NC_022269	TAA	2	6	237838	237843	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	541866925
3610	NC_022269	TGC	2	6	238069	238074	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	541869097
3611	NC_022269	ATC	2	6	238135	238140	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	541869097
3612	NC_022269	CT	3	6	238201	238206	0 %	50 %	0 %	50 %	541869097
3613	NC_022269	CCA	2	6	238263	238268	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	541869097
3614	NC_022269	GGTC	2	8	238362	238369	0 %	25 %	50 %	25 %	541869097
3615	NC_022269	A	6	6	238411	238416	100 %	0 %	0 %	0 %	541869097
3616	NC_022269	TGAG	2	8	238509	238516	25 %	25 %	50 %	0 %	541869097
3617	NC_022269	TTG	2	6	238700	238705	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	541869097
3618	NC_022269	ATTG	2	8	238755	238762	25 %	50 %	25 %	0 %	541869097
3619	NC_022269	T	6	6	238871	238876	0 %	100 %	0 %	0 %	541869097
3620	NC_022269	CATCG	2	10	238877	238886	20 %	20 %	20 %	40 %	541869097
3621	NC_022269	GAC	2	6	238947	238952	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	541869097
3622	NC_022269	TCA	2	6	238957	238962	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	541869097
3623	NC_022269	TCA	2	6	239044	239049	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	541869097
3624	NC_022269	TAC	2	6	239081	239086	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	541869097
3625	NC_022269	TGGA	2	8	239130	239137	25 %	25 %	50 %	0 %	541869097
3626	NC_022269	CGA	2	6	239228	239233	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	541869097
3627	NC_022269	TCG	2	6	239378	239383	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	541869097
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3629	NC_022269	AT	3	6	239434	239439	50 %	50 %	0 %	0 %	541869097
3630	NC_022269	GTT	2	6	239800	239805	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	541869098
3631	NC_022269	A	6	6	239853	239858	100 %	0 %	0 %	0 %	541869098
3632	NC_022269	CAC	2	6	240092	240097	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	541869098
3633	NC_022269	GAAGG	2	10	240151	240160	40 %	0 %	60 %	0 %	541869098
3634	NC_022269	TTG	2	6	240215	240220	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	541869098
3635	NC_022269	TGA	2	6	240259	240264	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	541869098
3636	NC_022269	TGCT	2	8	240268	240275	0 %	50 %	25 %	25 %	541869098
3637	NC_022269	GAT	2	6	240326	240331	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	541869098
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3639	NC_022269	CTG	2	6	240577	240582	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	541869099
3640	NC_022269	GTTGT	2	10	240670	240679	0 %	60 %	40 %	0 %	541869099
3641	NC_022269	TGC	2	6	240832	240837	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	541869099
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3644	NC_022269	TGG	2	6	241165	241170	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	541869099
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3647	NC_022269	ACA	2	6	241335	241340	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	541869099
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3654	NC_022269	CGGT	2	8	241656	241663	0 %	25 %	50 %	25 %	541869099
3655	NC_022269	AAT	2	6	241717	241722	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	541869099
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3658	NC_022269	T	6	6	241876	241881	0 %	100 %	0 %	0 %	541869099
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3660	NC_022269	GATAG	2	10	242001	242010	40 %	20 %	40 %	0 %	541869099
3661	NC_022269	CTG	2	6	242011	242016	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	541869099
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3665	NC_022269	TGAG	2	8	242595	242602	25 %	25 %	50 %	0 %	541869100
3666	NC_022269	TCA	2	6	242648	242653	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	541869100
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3689	NC_022269	T	6	6	243710	243715	0 %	100 %	0 %	0 %	541869101
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3732	NC_022269	AAGA	2	8	247079	247086	75 %	0 %	25 %	0 %	541866928
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3745	NC_022269	TTATCT	2	12	248337	248348	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	541866930
3746	NC_022269	GAA	2	6	248363	248368	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	541866930
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3854	NC_022269	TGAGT	2	10	254252	254261	20 %	40 %	40 %	0 %	541869105
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3858	NC_022269	AT	4	8	254485	254492	50 %	50 %	0 %	0 %	541869105
3859	NC_022269	AAGTT	2	10	254617	254626	40 %	40 %	20 %	0 %	541869105
3860	NC_022269	ACCT	2	8	255244	255251	25 %	25 %	0 %	50 %	541866931
3861	NC_022269	CAT	2	6	255459	255464	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	541866931
3862	NC_022269	CAT	2	6	255474	255479	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	541866931
3863	NC_022269	GCG	2	6	255701	255706	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	541866931
3864	NC_022269	AC	3	6	255707	255712	50 %	0 %	0 %	50 %	541866931
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3986	NC_022269	TC	3	6	263149	263154	0 %	50 %	0 %	50 %	541866936
3987	NC_022269	AAC	2	6	263167	263172	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	541866936
3988	NC_022269	AAGC	2	8	263182	263189	50 %	0 %	25 %	25 %	541866936
3989	NC_022269	ATGG	2	8	263209	263216	25 %	25 %	50 %	0 %	541866936
3990	NC_022269	AC	3	6	263221	263226	50 %	0 %	0 %	50 %	541866936
3991	NC_022269	CCAA	2	8	263289	263296	50 %	0 %	0 %	50 %	541866936
3992	NC_022269	A	7	7	263370	263376	100 %	0 %	0 %	0 %	541866936
3993	NC_022269	AGC	2	6	263389	263394	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	541866936
3994	NC_022269	TTG	2	6	263396	263401	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	541866936
3995	NC_022269	GCA	2	6	263443	263448	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	541866936
3996	NC_022269	CTGA	2	8	263560	263567	25 %	25 %	25 %	25 %	541866936
3997	NC_022269	GGCA	2	8	263574	263581	25 %	0 %	50 %	25 %	541866936
3998	NC_022269	GCG	2	6	263593	263598	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	541866936
3999	NC_022269	AGGGCG	2	12	263618	263629	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	541866936
4000	NC_022269	ATTG	2	8	263697	263704	25 %	50 %	25 %	0 %	541866936

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