MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Variovorax paradoxus B4 chromosome 1

Total Repeats: 4569

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022247	ACCAC	2	10	1374	1383	40 %	0 %	0 %	60 %	538392232
2	NC_022247	GCATC	2	10	2447	2456	20 %	20 %	20 %	40 %	538392233
3	NC_022247	CCGCG	2	10	5379	5388	0 %	0 %	40 %	60 %	538392234
4	NC_022247	GATGG	2	10	5860	5869	20 %	20 %	60 %	0 %	538392235
5	NC_022247	GCGCG	2	10	8830	8839	0 %	0 %	60 %	40 %	538392239
6	NC_022247	ACGCC	2	10	11155	11164	20 %	0 %	20 %	60 %	538392242
7	NC_022247	GGCCA	2	10	13997	14006	20 %	0 %	40 %	40 %	538392245
8	NC_022247	TGCGC	2	10	14564	14573	0 %	20 %	40 %	40 %	538392246
9	NC_022247	CACGG	2	10	15200	15209	20 %	0 %	40 %	40 %	538392247
10	NC_022247	CGGTG	2	10	18032	18041	0 %	20 %	60 %	20 %	538392250
11	NC_022247	GGCGT	2	10	18888	18897	0 %	20 %	60 %	20 %	538392250
12	NC_022247	TGCCA	2	10	20579	20588	20 %	20 %	20 %	40 %	538392252
13	NC_022247	TTTTC	2	10	20784	20793	0 %	80 %	0 %	20 %	538392252
14	NC_022247	GCGCA	2	10	21157	21166	20 %	0 %	40 %	40 %	538392253
15	NC_022247	CGCGG	2	10	24354	24363	0 %	0 %	60 %	40 %	538392254
16	NC_022247	CATCG	2	10	27155	27164	20 %	20 %	20 %	40 %	538392256
17	NC_022247	GCCGC	2	10	28304	28313	0 %	0 %	40 %	60 %	538392257
18	NC_022247	TGCGC	2	10	28464	28473	0 %	20 %	40 %	40 %	538392257
19	NC_022247	GCGCC	2	10	29462	29471	0 %	0 %	40 %	60 %	538392258
20	NC_022247	GCGCC	2	10	32385	32394	0 %	0 %	40 %	60 %	538392262
21	NC_022247	GCGCG	2	10	35357	35366	0 %	0 %	60 %	40 %	538392264
22	NC_022247	TCGCC	2	10	35699	35708	0 %	20 %	20 %	60 %	538392264
23	NC_022247	TGGCA	2	10	38800	38809	20 %	20 %	40 %	20 %	538392268
24	NC_022247	AGCGC	2	10	39441	39450	20 %	0 %	40 %	40 %	538392268
25	NC_022247	AGGCC	2	10	39998	40007	20 %	0 %	40 %	40 %	538392269
26	NC_022247	CAGGC	2	10	41217	41226	20 %	0 %	40 %	40 %	538392270
27	NC_022247	TCGCC	2	10	41680	41689	0 %	20 %	20 %	60 %	538392270
28	NC_022247	CGCGG	2	10	43044	43053	0 %	0 %	60 %	40 %	538392271
29	NC_022247	GCCCG	2	10	49546	49555	0 %	0 %	40 %	60 %	538392279
30	NC_022247	GCGCG	2	10	49633	49642	0 %	0 %	60 %	40 %	538392279
31	NC_022247	GCGCG	2	10	51294	51303	0 %	0 %	60 %	40 %	538392281
32	NC_022247	GCAAG	2	10	51684	51693	40 %	0 %	40 %	20 %	538392281
33	NC_022247	ATGGC	2	10	53735	53744	20 %	20 %	40 %	20 %	538392283
34	NC_022247	ACGCG	2	10	54809	54818	20 %	0 %	40 %	40 %	538392285
35	NC_022247	GGCCG	2	10	56921	56930	0 %	0 %	60 %	40 %	538392289
36	NC_022247	GCCGC	2	10	57746	57755	0 %	0 %	40 %	60 %	538392291
37	NC_022247	ACGCC	2	10	57835	57844	20 %	0 %	20 %	60 %	538392291
38	NC_022247	GCAGG	2	10	58085	58094	20 %	0 %	60 %	20 %	538392291
39	NC_022247	TGCGC	2	10	59511	59520	0 %	20 %	40 %	40 %	538392293
40	NC_022247	TGCGC	2	10	60072	60081	0 %	20 %	40 %	40 %	538392294
41	NC_022247	GCGCG	2	10	62117	62126	0 %	0 %	60 %	40 %	538392297
42	NC_022247	GCGGA	2	10	64119	64128	20 %	0 %	60 %	20 %	538392299
43	NC_022247	CGGCG	2	10	65667	65676	0 %	0 %	60 %	40 %	538392300
44	NC_022247	TCGCG	2	10	68560	68569	0 %	20 %	40 %	40 %	538392303
45	NC_022247	CGCGC	2	10	68600	68609	0 %	0 %	40 %	60 %	538392303
46	NC_022247	CGCGG	2	10	69425	69434	0 %	0 %	60 %	40 %	538392304
47	NC_022247	CAGCG	2	10	72011	72020	20 %	0 %	40 %	40 %	538392306
48	NC_022247	AGCCC	2	10	73675	73684	20 %	0 %	20 %	60 %	538392307
49	NC_022247	AGGGC	2	10	76085	76094	20 %	0 %	60 %	20 %	538392309
50	NC_022247	TTTCA	2	10	76644	76653	20 %	60 %	0 %	20 %	538392309
51	NC_022247	CGCGC	2	10	76731	76740	0 %	0 %	40 %	60 %	538392310
52	NC_022247	TGGTC	2	10	77106	77115	0 %	40 %	40 %	20 %	538392310
53	NC_022247	GCGCG	2	10	78652	78661	0 %	0 %	60 %	40 %	538392312
54	NC_022247	CGGCG	2	10	79875	79884	0 %	0 %	60 %	40 %	538392313
55	NC_022247	GCCGC	2	10	80905	80914	0 %	0 %	40 %	60 %	538392314
56	NC_022247	TCGCC	2	10	82017	82026	0 %	20 %	20 %	60 %	538392314
57	NC_022247	TGCCG	2	10	82474	82483	0 %	20 %	40 %	40 %	538392315
58	NC_022247	AGCGC	2	10	83852	83861	20 %	0 %	40 %	40 %	538392315
59	NC_022247	CGCGC	2	10	84181	84190	0 %	0 %	40 %	60 %	538392315
60	NC_022247	GCAGT	2	10	85984	85993	20 %	20 %	40 %	20 %	538392317
61	NC_022247	GCCAC	2	10	86052	86061	20 %	0 %	20 %	60 %	538392318
62	NC_022247	ACCGC	2	10	86174	86183	20 %	0 %	20 %	60 %	538392318
63	NC_022247	GCGCC	2	10	86400	86409	0 %	0 %	40 %	60 %	538392318
64	NC_022247	CGCGC	2	10	86932	86941	0 %	0 %	40 %	60 %	538392318
65	NC_022247	CGAAG	2	10	87393	87402	40 %	0 %	40 %	20 %	538392319
66	NC_022247	GGCGA	2	10	90824	90833	20 %	0 %	60 %	20 %	538392322
67	NC_022247	TCTCT	2	10	91678	91687	0 %	60 %	0 %	40 %	538392323
68	NC_022247	CCCGG	2	10	94319	94328	0 %	0 %	40 %	60 %	538392325
69	NC_022247	GCGCG	2	10	94355	94364	0 %	0 %	60 %	40 %	538392325
70	NC_022247	GCGCC	2	10	94508	94517	0 %	0 %	40 %	60 %	538392325
71	NC_022247	GCCGC	2	10	94738	94747	0 %	0 %	40 %	60 %	538392325
72	NC_022247	GCCGC	2	10	96321	96330	0 %	0 %	40 %	60 %	538392326
73	NC_022247	GGCGC	2	10	99876	99885	0 %	0 %	60 %	40 %	538392329
74	NC_022247	CGATG	2	10	104293	104302	20 %	20 %	40 %	20 %	538392335
75	NC_022247	GCGCG	2	10	104874	104883	0 %	0 %	60 %	40 %	538392336
76	NC_022247	GCGCA	2	10	105754	105763	20 %	0 %	40 %	40 %	538392336
77	NC_022247	GCAGG	2	10	105949	105958	20 %	0 %	60 %	20 %	538392336
78	NC_022247	TTGGC	2	10	106050	106059	0 %	40 %	40 %	20 %	538392336
79	NC_022247	TGGCC	2	10	107050	107059	0 %	20 %	40 %	40 %	538392338
80	NC_022247	CCAGC	2	10	107794	107803	20 %	0 %	20 %	60 %	538392339
81	NC_022247	GGCGC	2	10	107943	107952	0 %	0 %	60 %	40 %	538392339
82	NC_022247	CGAAG	2	10	109225	109234	40 %	0 %	40 %	20 %	538392340
83	NC_022247	GCGCG	2	10	110249	110258	0 %	0 %	60 %	40 %	538392342
84	NC_022247	TGGCG	2	10	110831	110840	0 %	20 %	60 %	20 %	538392342
85	NC_022247	CGGGC	2	10	110846	110855	0 %	0 %	60 %	40 %	538392342
86	NC_022247	GGCCT	2	10	111993	112002	0 %	20 %	40 %	40 %	538392343
87	NC_022247	CTCGA	2	10	112683	112692	20 %	20 %	20 %	40 %	538392343
88	NC_022247	CGGCT	2	10	113715	113724	0 %	20 %	40 %	40 %	538392344
89	NC_022247	AGGCC	2	10	113845	113854	20 %	0 %	40 %	40 %	538392344
90	NC_022247	GCCGC	2	10	113997	114006	0 %	0 %	40 %	60 %	538392344
91	NC_022247	GCCGT	2	10	114018	114027	0 %	20 %	40 %	40 %	538392344
92	NC_022247	CGCGC	2	10	114458	114467	0 %	0 %	40 %	60 %	538392344
93	NC_022247	TGCGC	2	10	114592	114601	0 %	20 %	40 %	40 %	538392344
94	NC_022247	CGGTG	2	10	114691	114700	0 %	20 %	60 %	20 %	538392344
95	NC_022247	CGCGC	2	10	116637	116646	0 %	0 %	40 %	60 %	538392346
96	NC_022247	GGGGC	2	10	117132	117141	0 %	0 %	80 %	20 %	538392347
97	NC_022247	GCCAG	2	10	117167	117176	20 %	0 %	40 %	40 %	538392347
98	NC_022247	CAGTG	2	10	119379	119388	20 %	20 %	40 %	20 %	538392349
99	NC_022247	CAGCT	2	10	119647	119656	20 %	20 %	20 %	40 %	538392349
100	NC_022247	GCCGC	2	10	120039	120048	0 %	0 %	40 %	60 %	538392349
101	NC_022247	CCGCG	2	10	121215	121224	0 %	0 %	40 %	60 %	538392351
102	NC_022247	GGCGC	2	10	121814	121823	0 %	0 %	60 %	40 %	538392351
103	NC_022247	GCCGT	2	10	122709	122718	0 %	20 %	40 %	40 %	538392352
104	NC_022247	GCCGC	2	10	123279	123288	0 %	0 %	40 %	60 %	538392353
105	NC_022247	GCGCG	2	10	124071	124080	0 %	0 %	60 %	40 %	538392353
106	NC_022247	CGGCG	2	10	124349	124358	0 %	0 %	60 %	40 %	538392353
107	NC_022247	GCCGC	2	10	126756	126765	0 %	0 %	40 %	60 %	538392356
108	NC_022247	GCGCG	2	10	126877	126886	0 %	0 %	60 %	40 %	538392356
109	NC_022247	CGCGC	2	10	127248	127257	0 %	0 %	40 %	60 %	538392357
110	NC_022247	CCGCG	2	10	131327	131336	0 %	0 %	40 %	60 %	538392361
111	NC_022247	CCGCG	2	10	131734	131743	0 %	0 %	40 %	60 %	538392362
112	NC_022247	GCGCG	2	10	131840	131849	0 %	0 %	60 %	40 %	538392362
113	NC_022247	ACGAC	2	10	133196	133205	40 %	0 %	20 %	40 %	538392363
114	NC_022247	CACAA	2	10	133269	133278	60 %	0 %	0 %	40 %	538392363
115	NC_022247	GGCAG	2	10	135626	135635	20 %	0 %	60 %	20 %	538392365
116	NC_022247	GGCCT	2	10	135809	135818	0 %	20 %	40 %	40 %	538392365
117	NC_022247	CGCGC	2	10	137058	137067	0 %	0 %	40 %	60 %	538392367
118	NC_022247	TGCGG	2	10	137629	137638	0 %	20 %	60 %	20 %	538392367
119	NC_022247	CGAAT	2	10	138458	138467	40 %	20 %	20 %	20 %	538392368
120	NC_022247	GCGCC	2	10	138826	138835	0 %	0 %	40 %	60 %	538392368
121	NC_022247	CCGCG	2	10	139104	139113	0 %	0 %	40 %	60 %	538392369
122	NC_022247	AGGGC	2	10	139554	139563	20 %	0 %	60 %	20 %	538392369
123	NC_022247	ATGGA	2	10	139721	139730	40 %	20 %	40 %	0 %	538392369
124	NC_022247	GGTCG	2	10	139866	139875	0 %	20 %	60 %	20 %	538392370
125	NC_022247	TGGCC	2	10	140414	140423	0 %	20 %	40 %	40 %	538392370
126	NC_022247	CGGGT	2	10	140535	140544	0 %	20 %	60 %	20 %	538392370
127	NC_022247	TGCGC	2	10	141542	141551	0 %	20 %	40 %	40 %	538392371
128	NC_022247	CTTCG	2	10	141840	141849	0 %	40 %	20 %	40 %	538392372
129	NC_022247	GCCTT	2	10	142953	142962	0 %	40 %	20 %	40 %	538392372
130	NC_022247	GCCGT	2	10	148724	148733	0 %	20 %	40 %	40 %	538392378
131	NC_022247	TGGCG	2	10	149004	149013	0 %	20 %	60 %	20 %	538392378
132	NC_022247	CCAGC	2	10	151017	151026	20 %	0 %	20 %	60 %	538392380
133	NC_022247	GCCGG	2	10	151399	151408	0 %	0 %	60 %	40 %	538392381
134	NC_022247	CGGCG	2	10	152809	152818	0 %	0 %	60 %	40 %	538392382
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257	NC_022247	CCGCG	2	10	301783	301792	0 %	0 %	40 %	60 %	538392511
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261	NC_022247	CCGCA	2	10	302828	302837	20 %	0 %	20 %	60 %	538392511
262	NC_022247	AGGCC	2	10	303075	303084	20 %	0 %	40 %	40 %	538392512
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