MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Variovorax paradoxus B4 chromosome 1

Total Repeats: 148695

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_022247	GCT	2	6	148513	148518	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538392378
4002	NC_022247	ACC	2	6	148541	148546	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	538392378
4003	NC_022247	GC	4	8	148563	148570	0 %	0 %	50 %	50 %	538392378
4004	NC_022247	CTT	2	6	148582	148587	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	538392378
4005	NC_022247	GCG	2	6	148603	148608	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538392378
4006	NC_022247	CG	3	6	148607	148612	0 %	0 %	50 %	50 %	538392378
4007	NC_022247	CAC	2	6	148630	148635	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	538392378
4008	NC_022247	GGT	2	6	148636	148641	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538392378
4009	NC_022247	CCA	2	6	148656	148661	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	538392378
4010	NC_022247	TCG	2	6	148664	148669	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538392378
4011	NC_022247	GCC	2	6	148681	148686	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538392378
4012	NC_022247	CGT	2	6	148713	148718	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538392378
4013	NC_022247	GCCGT	2	10	148724	148733	0 %	20 %	40 %	40 %	538392378
4014	NC_022247	GGC	2	6	148993	148998	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538392378
4015	NC_022247	TGGCG	2	10	149004	149013	0 %	20 %	60 %	20 %	538392378
4016	NC_022247	GCG	2	6	149029	149034	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538392379
4017	NC_022247	GCT	2	6	149058	149063	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538392379
4018	NC_022247	GCC	3	9	149064	149072	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538392379
4019	NC_022247	GGC	2	6	149102	149107	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538392379
4020	NC_022247	CGGC	2	8	149174	149181	0 %	0 %	50 %	50 %	538392379
4021	NC_022247	GC	4	8	149191	149198	0 %	0 %	50 %	50 %	538392379
4022	NC_022247	TGC	2	6	149263	149268	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538392379
4023	NC_022247	GTT	2	6	149292	149297	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	538392379
4024	NC_022247	AAG	2	6	149314	149319	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	538392379
4025	NC_022247	CGAG	2	8	149348	149355	25 %	0 %	50 %	25 %	538392379
4026	NC_022247	CCGC	2	8	149432	149439	0 %	0 %	25 %	75 %	538392379
4027	NC_022247	CGG	2	6	149451	149456	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538392379
4028	NC_022247	GCC	2	6	149469	149474	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538392379
4029	NC_022247	CGC	2	6	149481	149486	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538392379
4030	NC_022247	TGT	2	6	149528	149533	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	538392379
4031	NC_022247	GCG	2	6	149534	149539	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538392379
4032	NC_022247	TGGT	2	8	149605	149612	0 %	50 %	50 %	0 %	538392379
4033	NC_022247	CTG	2	6	149613	149618	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538392379
4034	NC_022247	TGC	2	6	149686	149691	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538392379
4035	NC_022247	AG	3	6	149708	149713	50 %	0 %	50 %	0 %	538392379
4036	NC_022247	CGA	2	6	149763	149768	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538392379
4037	NC_022247	AG	3	6	149769	149774	50 %	0 %	50 %	0 %	538392379
4038	NC_022247	GAT	2	6	149799	149804	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538392379
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4040	NC_022247	GCC	3	9	150061	150069	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538392380
4041	NC_022247	GC	3	6	150074	150079	0 %	0 %	50 %	50 %	538392380
4042	NC_022247	CGC	2	6	150114	150119	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538392380
4043	NC_022247	GCC	2	6	150127	150132	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538392380
4044	NC_022247	CCG	2	6	150134	150139	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538392380
4045	NC_022247	CCA	2	6	150176	150181	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	538392380
4046	NC_022247	GC	3	6	150208	150213	0 %	0 %	50 %	50 %	538392380
4047	NC_022247	GGC	2	6	150234	150239	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538392380
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4049	NC_022247	GGC	2	6	150298	150303	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538392380
4050	NC_022247	CAG	2	6	150315	150320	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538392380
4051	NC_022247	GCC	2	6	150355	150360	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538392380
4052	NC_022247	CAC	2	6	150387	150392	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	538392380
4053	NC_022247	CCG	2	6	150437	150442	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538392380
4054	NC_022247	GC	3	6	150458	150463	0 %	0 %	50 %	50 %	538392380
4055	NC_022247	CAG	2	6	150483	150488	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538392380
4056	NC_022247	CCA	2	6	150500	150505	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	538392380
4057	NC_022247	GCCA	2	8	150508	150515	25 %	0 %	25 %	50 %	538392380
4058	NC_022247	TGT	2	6	150548	150553	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	538392380
4059	NC_022247	CAGTGC	2	12	150579	150590	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	538392380
4060	NC_022247	CGC	2	6	150602	150607	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538392380
4061	NC_022247	CGG	2	6	150677	150682	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538392380
4062	NC_022247	CCA	2	6	150731	150736	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	538392380
4063	NC_022247	CGG	2	6	150812	150817	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538392380
4064	NC_022247	GCA	2	6	150830	150835	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538392380
4065	NC_022247	GCC	2	6	150843	150848	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538392380
4066	NC_022247	CGA	2	6	150905	150910	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538392380
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4068	NC_022247	ATCGTC	2	12	150943	150954	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	538392380
4069	NC_022247	CCAGC	2	10	151017	151026	20 %	0 %	20 %	60 %	538392380
4070	NC_022247	CAG	2	6	151038	151043	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538392380
4071	NC_022247	GCTGGC	2	12	151077	151088	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	538392380
4072	NC_022247	CAG	2	6	151089	151094	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538392380
4073	NC_022247	CG	3	6	151109	151114	0 %	0 %	50 %	50 %	538392380
4074	NC_022247	GC	3	6	151124	151129	0 %	0 %	50 %	50 %	538392380
4075	NC_022247	CAG	2	6	151155	151160	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538392380
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4080	NC_022247	TCG	2	6	151324	151329	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538392380
4081	NC_022247	GTC	2	6	151341	151346	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538392380
4082	NC_022247	GCCGG	2	10	151399	151408	0 %	0 %	60 %	40 %	538392381
4083	NC_022247	TGC	2	6	151453	151458	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538392381
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4085	NC_022247	CG	3	6	151480	151485	0 %	0 %	50 %	50 %	538392381
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4100	NC_022247	CGT	2	6	152224	152229	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538392381
4101	NC_022247	CGTG	2	8	152239	152246	0 %	25 %	50 %	25 %	538392381
4102	NC_022247	CTT	2	6	152288	152293	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	538392381
4103	NC_022247	GAC	2	6	152375	152380	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538392381
4104	NC_022247	TGC	2	6	152401	152406	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538392381
4105	NC_022247	CA	3	6	152505	152510	50 %	0 %	0 %	50 %	538392382
4106	NC_022247	AGGA	2	8	152514	152521	50 %	0 %	50 %	0 %	538392382
4107	NC_022247	GC	4	8	152547	152554	0 %	0 %	50 %	50 %	538392382
4108	NC_022247	TCG	2	6	152556	152561	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538392382
4109	NC_022247	GC	3	6	152661	152666	0 %	0 %	50 %	50 %	538392382
4110	NC_022247	TGA	2	6	152695	152700	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538392382
4111	NC_022247	GC	4	8	152763	152770	0 %	0 %	50 %	50 %	538392382
4112	NC_022247	CTG	3	9	152783	152791	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538392382
4113	NC_022247	CGGCG	2	10	152809	152818	0 %	0 %	60 %	40 %	538392382
4114	NC_022247	GAA	2	6	152843	152848	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	538392382
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4116	NC_022247	TGC	2	6	153022	153027	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538392382
4117	NC_022247	CGC	2	6	153028	153033	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538392382
4118	NC_022247	GC	3	6	153032	153037	0 %	0 %	50 %	50 %	538392382
4119	NC_022247	CAG	2	6	153062	153067	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538392382
4120	NC_022247	TCG	2	6	153111	153116	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538392382
4121	NC_022247	TC	3	6	153207	153212	0 %	50 %	0 %	50 %	538392383
4122	NC_022247	CACG	2	8	153235	153242	25 %	0 %	25 %	50 %	538392383
4123	NC_022247	CAG	2	6	153277	153282	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538392383
4124	NC_022247	GCA	2	6	153294	153299	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538392383
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4126	NC_022247	GCA	2	6	153381	153386	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538392383
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4232	NC_022247	CGG	2	6	156965	156970	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538392386
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4240	NC_022247	GCGG	2	8	157599	157606	0 %	0 %	75 %	25 %	538392387
4241	NC_022247	TGG	2	6	157629	157634	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538392387
4242	NC_022247	AGGC	2	8	157656	157663	25 %	0 %	50 %	25 %	538392387
4243	NC_022247	GACGCT	2	12	157666	157677	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	538392387
4244	NC_022247	GTC	2	6	157690	157695	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538392387
4245	NC_022247	TCG	2	6	157697	157702	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538392387
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4247	NC_022247	GCGA	2	8	157751	157758	25 %	0 %	50 %	25 %	538392387
4248	NC_022247	GCCG	2	8	157770	157777	0 %	0 %	50 %	50 %	538392387
4249	NC_022247	GTCACG	2	12	157787	157798	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	538392387
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4265	NC_022247	GATGCC	2	12	158310	158321	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	538392388
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4341	NC_022247	GCGCA	2	10	160945	160954	20 %	0 %	40 %	40 %	538392390
4342	NC_022247	GC	3	6	160966	160971	0 %	0 %	50 %	50 %	538392390
4343	NC_022247	CGG	2	6	161013	161018	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538392390
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4347	NC_022247	CGCC	2	8	161129	161136	0 %	0 %	25 %	75 %	538392391
4348	NC_022247	AGC	2	6	161173	161178	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538392391
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4350	NC_022247	ACG	2	6	161222	161227	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538392391
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4352	NC_022247	CAG	2	6	161370	161375	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538392391
4353	NC_022247	GTG	2	6	161446	161451	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538392391
4354	NC_022247	C	6	6	161485	161490	0 %	0 %	0 %	100 %	538392391
4355	NC_022247	CATCG	2	10	161499	161508	20 %	20 %	20 %	40 %	538392391
4356	NC_022247	CCG	2	6	161564	161569	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538392391
4357	NC_022247	GCCCAG	2	12	161580	161591	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	538392391
4358	NC_022247	CGG	2	6	161615	161620	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538392391
4359	NC_022247	GCA	3	9	161633	161641	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538392391
4360	NC_022247	TGC	2	6	161698	161703	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538392391
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4478	NC_022247	GCGG	2	8	165503	165510	0 %	0 %	75 %	25 %	538392395
4479	NC_022247	GTG	2	6	165517	165522	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538392395
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4482	NC_022247	CGA	3	9	165705	165713	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538392395
4483	NC_022247	TTC	2	6	165718	165723	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	538392395
4484	NC_022247	CGC	2	6	165745	165750	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538392395
4485	NC_022247	CCG	2	6	165752	165757	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538392395
4486	NC_022247	TGG	2	6	165800	165805	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538392395
4487	NC_022247	GC	3	6	165832	165837	0 %	0 %	50 %	50 %	538392395
4488	NC_022247	CGG	2	6	165870	165875	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538392395
4489	NC_022247	CCG	2	6	165876	165881	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538392395
4490	NC_022247	ACG	4	12	165899	165910	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538392395
4491	NC_022247	CGT	2	6	165918	165923	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538392395
4492	NC_022247	GCT	3	9	165972	165980	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538392395
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