MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Variovorax paradoxus B4 chromosome 1

Total Repeats: 148695

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_022247	CGG	2	6	221235	221240	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538392445
6002	NC_022247	CAC	2	6	221247	221252	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	538392445
6003	NC_022247	AGC	2	6	221279	221284	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538392445
6004	NC_022247	GCG	2	6	221291	221296	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538392445
6005	NC_022247	CCA	2	6	221300	221305	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	538392445
6006	NC_022247	GCC	2	6	221362	221367	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538392445
6007	NC_022247	CGG	2	6	221369	221374	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538392445
6008	NC_022247	GCC	3	9	221386	221394	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538392445
6009	NC_022247	GCC	2	6	221428	221433	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538392445
6010	NC_022247	CGG	2	6	221437	221442	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538392445
6011	NC_022247	GCC	2	6	221505	221510	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538392445
6012	NC_022247	G	6	6	221578	221583	0 %	0 %	100 %	0 %	538392445
6013	NC_022247	TGC	2	6	221651	221656	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538392445
6014	NC_022247	CGC	2	6	221731	221736	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538392446
6015	NC_022247	CCA	2	6	221760	221765	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	538392446
6016	NC_022247	CG	3	6	221777	221782	0 %	0 %	50 %	50 %	538392446
6017	NC_022247	GAT	2	6	221865	221870	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538392446
6018	NC_022247	GCT	2	6	221874	221879	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538392446
6019	NC_022247	GCC	2	6	221917	221922	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538392446
6020	NC_022247	TCG	2	6	221969	221974	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538392446
6021	NC_022247	GCC	2	6	221977	221982	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538392446
6022	NC_022247	GC	3	6	221999	222004	0 %	0 %	50 %	50 %	538392446
6023	NC_022247	CGG	2	6	222018	222023	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538392446
6024	NC_022247	CG	3	6	222061	222066	0 %	0 %	50 %	50 %	538392446
6025	NC_022247	A	6	6	222092	222097	100 %	0 %	0 %	0 %	538392446
6026	NC_022247	AAG	2	6	222139	222144	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	538392446
6027	NC_022247	GCCC	2	8	222149	222156	0 %	0 %	25 %	75 %	538392446
6028	NC_022247	GC	3	6	222242	222247	0 %	0 %	50 %	50 %	538392446
6029	NC_022247	CGG	2	6	222248	222253	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538392446
6030	NC_022247	CGA	2	6	222255	222260	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538392446
6031	NC_022247	TGCA	2	8	222299	222306	25 %	25 %	25 %	25 %	538392446
6032	NC_022247	CGG	2	6	222312	222317	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538392446
6033	NC_022247	CGA	2	6	222430	222435	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538392447
6034	NC_022247	GCC	2	6	222466	222471	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538392447
6035	NC_022247	CGCGC	2	10	222474	222483	0 %	0 %	40 %	60 %	538392447
6036	NC_022247	CGA	2	6	222538	222543	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538392447
6037	NC_022247	GC	3	6	222570	222575	0 %	0 %	50 %	50 %	538392447
6038	NC_022247	GCC	2	6	222641	222646	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538392447
6039	NC_022247	TCG	2	6	222648	222653	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538392447
6040	NC_022247	GCC	3	9	222677	222685	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538392447
6041	NC_022247	GC	3	6	222705	222710	0 %	0 %	50 %	50 %	538392447
6042	NC_022247	GCG	2	6	222737	222742	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538392447
6043	NC_022247	AAG	2	6	222758	222763	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	538392447
6044	NC_022247	CGCGC	2	10	222862	222871	0 %	0 %	40 %	60 %	538392447
6045	NC_022247	GTG	2	6	222884	222889	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538392447
6046	NC_022247	CGG	2	6	222931	222936	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538392447
6047	NC_022247	TGCCCA	2	12	223113	223124	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	538392448
6048	NC_022247	AAG	2	6	223189	223194	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	538392448
6049	NC_022247	TCA	2	6	223259	223264	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	538392448
6050	NC_022247	CG	3	6	223265	223270	0 %	0 %	50 %	50 %	538392448
6051	NC_022247	GAG	2	6	223309	223314	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	538392448
6052	NC_022247	TGG	2	6	223316	223321	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538392448
6053	NC_022247	CG	3	6	223322	223327	0 %	0 %	50 %	50 %	538392448
6054	NC_022247	AGA	2	6	223328	223333	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	538392448
6055	NC_022247	TGGCCG	2	12	223373	223384	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	538392448
6056	NC_022247	AGA	3	9	223397	223405	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	538392448
6057	NC_022247	TCT	2	6	223406	223411	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	538392448
6058	NC_022247	GGC	2	6	223453	223458	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538392448
6059	NC_022247	AAG	3	9	223534	223542	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	538392448
6060	NC_022247	CGT	2	6	223551	223556	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538392448
6061	NC_022247	TCG	2	6	223637	223642	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538392448
6062	NC_022247	GCC	2	6	223653	223658	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538392448
6063	NC_022247	GGT	2	6	223683	223688	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538392448
6064	NC_022247	GGT	2	6	223800	223805	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538392448
6065	NC_022247	CTT	2	6	223920	223925	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	538392448
6066	NC_022247	TCGGT	2	10	223964	223973	0 %	40 %	40 %	20 %	538392448
6067	NC_022247	GGC	2	6	224001	224006	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538392448
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6069	NC_022247	ACC	2	6	224111	224116	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	538392448
6070	NC_022247	TCG	2	6	224135	224140	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538392448
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6072	NC_022247	GCC	2	6	224218	224223	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538392448
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6075	NC_022247	CTG	2	6	224299	224304	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538392449
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6081	NC_022247	GGCC	2	8	224477	224484	0 %	0 %	50 %	50 %	538392449
6082	NC_022247	CGC	2	6	224493	224498	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538392449
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6100	NC_022247	CG	3	6	225229	225234	0 %	0 %	50 %	50 %	538392449
6101	NC_022247	TCG	2	6	225254	225259	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538392449
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6108	NC_022247	TCG	2	6	225491	225496	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538392449
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6112	NC_022247	GCTGGT	2	12	225708	225719	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	538392449
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6120	NC_022247	GCTG	2	8	226022	226029	0 %	25 %	50 %	25 %	538392449
6121	NC_022247	GC	3	6	226042	226047	0 %	0 %	50 %	50 %	538392449
6122	NC_022247	ATC	2	6	226081	226086	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	538392449
6123	NC_022247	TGC	2	6	226097	226102	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538392449
6124	NC_022247	GAGC	2	8	226140	226147	25 %	0 %	50 %	25 %	538392449
6125	NC_022247	GCTG	2	8	226148	226155	0 %	25 %	50 %	25 %	538392449
6126	NC_022247	CGG	2	6	226414	226419	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538392450
6127	NC_022247	GCT	2	6	226465	226470	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538392450
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6131	NC_022247	CGA	2	6	226741	226746	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538392450
6132	NC_022247	GGCGCT	2	12	226747	226758	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	538392450
6133	NC_022247	TCGCGA	2	12	226839	226850	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	538392450
6134	NC_022247	GCT	3	9	226867	226875	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538392450
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6142	NC_022247	ACG	2	6	227246	227251	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538392451
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6144	NC_022247	GTC	2	6	227278	227283	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538392451
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6153	NC_022247	TGC	2	6	227672	227677	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538392451
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6210	NC_022247	CG	3	6	229763	229768	0 %	0 %	50 %	50 %	538392453
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6224	NC_022247	GCAC	2	8	230316	230323	25 %	0 %	25 %	50 %	538392454
6225	NC_022247	GC	3	6	230347	230352	0 %	0 %	50 %	50 %	538392454
6226	NC_022247	GC	3	6	230365	230370	0 %	0 %	50 %	50 %	538392454
6227	NC_022247	CGCGC	2	10	230437	230446	0 %	0 %	40 %	60 %	538392455
6228	NC_022247	CG	3	6	230463	230468	0 %	0 %	50 %	50 %	538392455
6229	NC_022247	GCC	2	6	230478	230483	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538392455
6230	NC_022247	TGC	2	6	230491	230496	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538392455
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6232	NC_022247	TGCCG	2	10	230549	230558	0 %	20 %	40 %	40 %	538392455
6233	NC_022247	CGA	2	6	230576	230581	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538392455
6234	NC_022247	GAC	2	6	230601	230606	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538392455
6235	NC_022247	CGTG	2	8	230704	230711	0 %	25 %	50 %	25 %	538392455
6236	NC_022247	ATG	2	6	230715	230720	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538392455
6237	NC_022247	CG	5	10	230732	230741	0 %	0 %	50 %	50 %	538392455
6238	NC_022247	CGA	2	6	230755	230760	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538392455
6239	NC_022247	GATCCA	2	12	230774	230785	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	538392455
6240	NC_022247	GCC	2	6	230805	230810	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538392455
6241	NC_022247	GC	4	8	230817	230824	0 %	0 %	50 %	50 %	538392455
6242	NC_022247	GCT	2	6	230828	230833	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538392455
6243	NC_022247	GCGT	2	8	230837	230844	0 %	25 %	50 %	25 %	538392455
6244	NC_022247	GTG	2	6	230892	230897	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538392455
6245	NC_022247	CCG	2	6	230918	230923	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538392455
6246	NC_022247	TGG	2	6	230941	230946	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538392455
6247	NC_022247	TGC	2	6	230962	230967	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538392455
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6271	NC_022247	CG	3	6	231724	231729	0 %	0 %	50 %	50 %	538392455
6272	NC_022247	GGC	2	6	231783	231788	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538392455
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6274	NC_022247	GC	3	6	231847	231852	0 %	0 %	50 %	50 %	538392455
6275	NC_022247	GCT	3	9	231863	231871	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538392455
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6282	NC_022247	CGG	2	6	232193	232198	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538392455
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6340	NC_022247	CG	3	6	234339	234344	0 %	0 %	50 %	50 %	538392456
6341	NC_022247	GC	3	6	234352	234357	0 %	0 %	50 %	50 %	538392456
6342	NC_022247	TCG	2	6	234363	234368	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538392456
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6349	NC_022247	CG	4	8	234574	234581	0 %	0 %	50 %	50 %	538392456
6350	NC_022247	CGAAG	2	10	234583	234592	40 %	0 %	40 %	20 %	538392456
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6353	NC_022247	GC	3	6	234686	234691	0 %	0 %	50 %	50 %	538392456
6354	NC_022247	CG	3	6	234702	234707	0 %	0 %	50 %	50 %	538392456
6355	NC_022247	CG	3	6	234719	234724	0 %	0 %	50 %	50 %	538392456
6356	NC_022247	GCG	2	6	234732	234737	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538392456
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6358	NC_022247	TC	3	6	234883	234888	0 %	50 %	0 %	50 %	538392456
6359	NC_022247	AAC	2	6	234938	234943	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	538392456
6360	NC_022247	CCCGAG	2	12	234944	234955	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	538392456
6361	NC_022247	GCG	2	6	234995	235000	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538392456
6362	NC_022247	ACG	2	6	235008	235013	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538392456
6363	NC_022247	GC	3	6	235041	235046	0 %	0 %	50 %	50 %	538392456
6364	NC_022247	TGC	2	6	235047	235052	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538392456
6365	NC_022247	ACA	2	6	235068	235073	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	538392456
6366	NC_022247	CCT	2	6	235077	235082	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	538392456
6367	NC_022247	CGA	2	6	235129	235134	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538392456
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6369	NC_022247	TGT	2	6	235284	235289	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	538392456
6370	NC_022247	CGT	2	6	235351	235356	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538392456
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6373	NC_022247	CTG	2	6	235484	235489	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538392456
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6384	NC_022247	ACG	2	6	235953	235958	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538392457
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6386	NC_022247	GCTG	2	8	236014	236021	0 %	25 %	50 %	25 %	538392457
6387	NC_022247	GC	3	6	236063	236068	0 %	0 %	50 %	50 %	538392457
6388	NC_022247	CTTG	2	8	236116	236123	0 %	50 %	25 %	25 %	538392457
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6395	NC_022247	CGCT	2	8	236318	236325	0 %	25 %	25 %	50 %	538392457
6396	NC_022247	TGC	2	6	236343	236348	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538392457
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6399	NC_022247	GCC	2	6	236417	236422	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538392457
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6401	NC_022247	GTG	2	6	236445	236450	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538392457
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6441	NC_022247	CCG	2	6	237912	237917	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538392459
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6445	NC_022247	GC	3	6	238140	238145	0 %	0 %	50 %	50 %	538392459
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6447	NC_022247	CGA	2	6	238175	238180	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538392459
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6450	NC_022247	GCGGT	2	10	238321	238330	0 %	20 %	60 %	20 %	538392459
6451	NC_022247	CCCA	2	8	238341	238348	25 %	0 %	0 %	75 %	538392459
6452	NC_022247	GACG	2	8	238358	238365	25 %	0 %	50 %	25 %	538392459
6453	NC_022247	GGC	2	6	238368	238373	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538392459
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6455	NC_022247	GCCG	2	8	238511	238518	0 %	0 %	50 %	50 %	538392459
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6458	NC_022247	GC	3	6	238560	238565	0 %	0 %	50 %	50 %	538392459
6459	NC_022247	TGC	2	6	238584	238589	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538392459
6460	NC_022247	GTTC	2	8	238633	238640	0 %	50 %	25 %	25 %	538392459
6461	NC_022247	CGCGAG	2	12	238641	238652	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	538392459
6462	NC_022247	CGT	2	6	238711	238716	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538392459
6463	NC_022247	GGC	3	9	238745	238753	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538392459
6464	NC_022247	CTA	2	6	238790	238795	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	538392459
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6466	NC_022247	T	6	6	238806	238811	0 %	100 %	0 %	0 %	538392459
6467	NC_022247	CAA	2	6	238877	238882	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	538392459
6468	NC_022247	CAG	2	6	238889	238894	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538392459
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6470	NC_022247	CG	3	6	239124	239129	0 %	0 %	50 %	50 %	538392460
6471	NC_022247	GGC	2	6	239139	239144	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538392460
6472	NC_022247	TGA	2	6	239153	239158	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538392460
6473	NC_022247	CG	3	6	239237	239242	0 %	0 %	50 %	50 %	538392460
6474	NC_022247	GAA	2	6	239251	239256	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	538392460
6475	NC_022247	GCG	2	6	239294	239299	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538392460
6476	NC_022247	GGC	2	6	239328	239333	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538392460
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6479	NC_022247	AC	3	6	239581	239586	50 %	0 %	0 %	50 %	538392461
6480	NC_022247	CG	3	6	239609	239614	0 %	0 %	50 %	50 %	538392461
6481	NC_022247	GATC	2	8	239713	239720	25 %	25 %	25 %	25 %	538392461
6482	NC_022247	CTTC	2	8	239721	239728	0 %	50 %	0 %	50 %	538392461
6483	NC_022247	GCC	2	6	239762	239767	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538392461
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6485	NC_022247	GCCG	2	8	239806	239813	0 %	0 %	50 %	50 %	538392461
6486	NC_022247	CGC	3	9	239851	239859	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538392461
6487	NC_022247	CG	3	6	239908	239913	0 %	0 %	50 %	50 %	538392461
6488	NC_022247	AGG	2	6	239916	239921	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	538392461
6489	NC_022247	CGGA	2	8	239957	239964	25 %	0 %	50 %	25 %	538392461
6490	NC_022247	CTC	2	6	240062	240067	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	538392461
6491	NC_022247	GCTGCC	2	12	240088	240099	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	538392461
6492	NC_022247	GCA	2	6	240130	240135	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538392461
6493	NC_022247	GCCG	2	8	240157	240164	0 %	0 %	50 %	50 %	538392461
6494	NC_022247	GC	3	6	240222	240227	0 %	0 %	50 %	50 %	538392461
6495	NC_022247	GAC	2	6	240239	240244	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538392461
6496	NC_022247	AAC	2	6	240247	240252	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	538392461
6497	NC_022247	GCC	2	6	240258	240263	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538392461
6498	NC_022247	GCT	2	6	240349	240354	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538392461
6499	NC_022247	TCG	2	6	240366	240371	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538392461
6500	NC_022247	TGC	2	6	240391	240396	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538392461

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