MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Variovorax paradoxus B4 chromosome 1

Total Repeats: 148695

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_022247	CTA	2	6	203817	203822	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	538392430
5502	NC_022247	GCC	2	6	203844	203849	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538392430
5503	NC_022247	CGAC	2	8	203891	203898	25 %	0 %	25 %	50 %	538392430
5504	NC_022247	CTG	2	6	203929	203934	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538392430
5505	NC_022247	TGA	3	9	203936	203944	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538392430
5506	NC_022247	GCG	2	6	204007	204012	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538392430
5507	NC_022247	CG	4	8	204011	204018	0 %	0 %	50 %	50 %	538392430
5508	NC_022247	GCACG	2	10	204036	204045	20 %	0 %	40 %	40 %	538392430
5509	NC_022247	CGT	2	6	204138	204143	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538392430
5510	NC_022247	CTG	2	6	204204	204209	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538392431
5511	NC_022247	CGG	2	6	204212	204217	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538392431
5512	NC_022247	GAA	2	6	204224	204229	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	538392431
5513	NC_022247	CTG	2	6	204234	204239	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538392431
5514	NC_022247	CGC	2	6	204248	204253	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538392431
5515	NC_022247	CCG	2	6	204277	204282	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538392431
5516	NC_022247	GC	3	6	204298	204303	0 %	0 %	50 %	50 %	538392431
5517	NC_022247	CGT	2	6	204320	204325	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538392431
5518	NC_022247	CAG	2	6	204396	204401	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538392431
5519	NC_022247	CG	3	6	204443	204448	0 %	0 %	50 %	50 %	538392431
5520	NC_022247	GCA	2	6	204458	204463	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538392431
5521	NC_022247	CAC	2	6	204543	204548	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	538392431
5522	NC_022247	GCC	2	6	204559	204564	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538392431
5523	NC_022247	CGA	2	6	204572	204577	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538392431
5524	NC_022247	TGC	2	6	204598	204603	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538392431
5525	NC_022247	GC	3	6	204602	204607	0 %	0 %	50 %	50 %	538392431
5526	NC_022247	GCT	2	6	204635	204640	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538392431
5527	NC_022247	ACCAG	2	10	204652	204661	40 %	0 %	20 %	40 %	538392431
5528	NC_022247	CGG	2	6	204668	204673	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538392431
5529	NC_022247	GCC	2	6	204677	204682	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538392431
5530	NC_022247	TGC	2	6	204724	204729	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538392431
5531	NC_022247	GC	3	6	204769	204774	0 %	0 %	50 %	50 %	538392431
5532	NC_022247	CGC	2	6	204787	204792	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538392431
5533	NC_022247	GC	3	6	204800	204805	0 %	0 %	50 %	50 %	538392431
5534	NC_022247	GCC	2	6	204809	204814	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538392431
5535	NC_022247	CGA	2	6	204905	204910	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538392431
5536	NC_022247	GCT	2	6	204947	204952	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538392431
5537	NC_022247	GC	3	6	204972	204977	0 %	0 %	50 %	50 %	538392431
5538	NC_022247	GGC	2	6	205007	205012	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538392431
5539	NC_022247	GCG	2	6	205024	205029	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538392431
5540	NC_022247	ACC	2	6	205062	205067	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	538392431
5541	NC_022247	CCA	2	6	205112	205117	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	538392431
5542	NC_022247	GGC	2	6	205119	205124	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538392431
5543	NC_022247	CGC	2	6	205163	205168	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538392431
5544	NC_022247	GCT	2	6	205175	205180	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538392431
5545	NC_022247	CAGC	2	8	205193	205200	25 %	0 %	25 %	50 %	538392431
5546	NC_022247	GCCTG	2	10	205201	205210	0 %	20 %	40 %	40 %	538392431
5547	NC_022247	GCAAC	2	10	205214	205223	40 %	0 %	20 %	40 %	538392431
5548	NC_022247	GCG	2	6	205236	205241	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538392431
5549	NC_022247	GCG	3	9	205282	205290	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538392431
5550	NC_022247	CGGGC	2	10	205300	205309	0 %	0 %	60 %	40 %	538392431
5551	NC_022247	CGG	2	6	205313	205318	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538392431
5552	NC_022247	GCA	2	6	205331	205336	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538392431
5553	NC_022247	TCG	2	6	205345	205350	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538392431
5554	NC_022247	CG	3	6	205468	205473	0 %	0 %	50 %	50 %	538392431
5555	NC_022247	CGGC	2	8	205477	205484	0 %	0 %	50 %	50 %	538392431
5556	NC_022247	GCC	3	9	205506	205514	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538392431
5557	NC_022247	TCG	2	6	205519	205524	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538392431
5558	NC_022247	GC	3	6	205527	205532	0 %	0 %	50 %	50 %	538392431
5559	NC_022247	CAC	3	9	205570	205578	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	538392432
5560	NC_022247	CTG	2	6	205616	205621	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538392432
5561	NC_022247	GCC	2	6	205651	205656	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538392432
5562	NC_022247	CGC	2	6	205663	205668	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538392432
5563	NC_022247	GC	3	6	205685	205690	0 %	0 %	50 %	50 %	538392432
5564	NC_022247	TCG	2	6	205761	205766	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538392432
5565	NC_022247	CCG	2	6	205802	205807	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538392432
5566	NC_022247	CGA	2	6	205867	205872	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538392432
5567	NC_022247	CGA	2	6	205894	205899	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538392432
5568	NC_022247	ACG	2	6	205908	205913	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538392432
5569	NC_022247	CGC	2	6	205921	205926	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538392432
5570	NC_022247	GC	3	6	205925	205930	0 %	0 %	50 %	50 %	538392432
5571	NC_022247	ACC	2	6	205953	205958	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	538392432
5572	NC_022247	AGC	2	6	205959	205964	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538392432
5573	NC_022247	TGC	2	6	206040	206045	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538392432
5574	NC_022247	CTT	2	6	206050	206055	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	538392432
5575	NC_022247	GCC	2	6	206120	206125	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538392432
5576	NC_022247	GCT	2	6	206128	206133	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538392432
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5578	NC_022247	CGC	2	6	206221	206226	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538392432
5579	NC_022247	GCG	2	6	206332	206337	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538392432
5580	NC_022247	TCG	2	6	206361	206366	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538392432
5581	NC_022247	CGC	2	6	206369	206374	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538392432
5582	NC_022247	GAT	2	6	206512	206517	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538392433
5583	NC_022247	CAA	2	6	206590	206595	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	538392433
5584	NC_022247	CGGC	2	8	206655	206662	0 %	0 %	50 %	50 %	538392433
5585	NC_022247	ACC	2	6	206696	206701	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	538392433
5586	NC_022247	AGG	2	6	206709	206714	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	538392433
5587	NC_022247	CG	5	10	206767	206776	0 %	0 %	50 %	50 %	538392433
5588	NC_022247	GC	4	8	206880	206887	0 %	0 %	50 %	50 %	538392433
5589	NC_022247	GC	3	6	206908	206913	0 %	0 %	50 %	50 %	538392433
5590	NC_022247	CTA	2	6	206917	206922	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	538392433
5591	NC_022247	CGA	2	6	207019	207024	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538392433
5592	NC_022247	ACA	2	6	207033	207038	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	538392433
5593	NC_022247	TCA	3	9	207057	207065	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	538392433
5594	NC_022247	GC	3	6	207171	207176	0 %	0 %	50 %	50 %	538392433
5595	NC_022247	GGCG	2	8	207223	207230	0 %	0 %	75 %	25 %	538392433
5596	NC_022247	TCA	2	6	207237	207242	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	538392433
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5600	NC_022247	TCG	2	6	207357	207362	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538392433
5601	NC_022247	GCT	2	6	207366	207371	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538392433
5602	NC_022247	CAC	2	6	207376	207381	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	538392433
5603	NC_022247	GCT	2	6	207433	207438	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538392433
5604	NC_022247	AGC	2	6	207460	207465	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538392433
5605	NC_022247	AAC	2	6	207561	207566	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	538392434
5606	NC_022247	CTC	2	6	207570	207575	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	538392434
5607	NC_022247	GCC	2	6	207624	207629	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538392434
5608	NC_022247	GCG	2	6	207630	207635	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538392434
5609	NC_022247	CG	3	6	207649	207654	0 %	0 %	50 %	50 %	538392434
5610	NC_022247	CGGGC	2	10	207669	207678	0 %	0 %	60 %	40 %	538392434
5611	NC_022247	TGG	2	6	207697	207702	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538392434
5612	NC_022247	CGGGC	2	10	207710	207719	0 %	0 %	60 %	40 %	538392434
5613	NC_022247	GTG	2	6	207768	207773	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538392434
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5619	NC_022247	TGG	2	6	207951	207956	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538392434
5620	NC_022247	GCCG	2	8	207961	207968	0 %	0 %	50 %	50 %	538392434
5621	NC_022247	CCG	2	6	207975	207980	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538392434
5622	NC_022247	CGC	3	9	207997	208005	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538392434
5623	NC_022247	CGGC	2	8	208011	208018	0 %	0 %	50 %	50 %	538392434
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5625	NC_022247	CCGC	2	8	208076	208083	0 %	0 %	25 %	75 %	538392434
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5650	NC_022247	GC	3	6	208671	208676	0 %	0 %	50 %	50 %	538392435
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5740	NC_022247	TCG	2	6	212276	212281	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538392437
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5742	NC_022247	GAA	2	6	212349	212354	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	538392437
5743	NC_022247	CGA	2	6	212370	212375	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538392437
5744	NC_022247	CGA	2	6	212379	212384	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538392437
5745	NC_022247	CAT	2	6	212394	212399	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	538392437
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5747	NC_022247	CGA	2	6	212487	212492	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538392437
5748	NC_022247	ATG	2	6	212647	212652	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538392437
5749	NC_022247	CGC	2	6	212655	212660	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538392437
5750	NC_022247	GGC	2	6	212745	212750	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538392437
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5762	NC_022247	CGC	2	6	213178	213183	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538392438
5763	NC_022247	TGG	2	6	213198	213203	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538392438
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5765	NC_022247	CGC	2	6	213231	213236	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538392438
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5849	NC_022247	TCGTT	2	10	215749	215758	0 %	60 %	20 %	20 %	538392440
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5852	NC_022247	GCTG	2	8	215870	215877	0 %	25 %	50 %	25 %	538392440
5853	NC_022247	GCC	2	6	215937	215942	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538392440
5854	NC_022247	TCAG	2	8	216063	216070	25 %	25 %	25 %	25 %	538392441
5855	NC_022247	GC	3	6	216072	216077	0 %	0 %	50 %	50 %	538392441
5856	NC_022247	CAC	2	6	216085	216090	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	538392441
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5858	NC_022247	TGCGGC	2	12	216117	216128	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	538392441
5859	NC_022247	ATC	2	6	216149	216154	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	538392441
5860	NC_022247	TGC	2	6	216218	216223	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538392441
5861	NC_022247	GC	3	6	216222	216227	0 %	0 %	50 %	50 %	538392441
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5863	NC_022247	CGG	2	6	216402	216407	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538392441
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5973	NC_022247	GGT	2	6	220399	220404	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538392444
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5975	NC_022247	GC	3	6	220419	220424	0 %	0 %	50 %	50 %	538392444
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5981	NC_022247	CGG	3	9	220518	220526	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538392444
5982	NC_022247	ACA	2	6	220562	220567	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	538392444
5983	NC_022247	GCG	2	6	220620	220625	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538392444
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5985	NC_022247	CGG	2	6	220644	220649	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538392444
5986	NC_022247	TCT	2	6	220664	220669	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	538392444
5987	NC_022247	CG	3	6	220688	220693	0 %	0 %	50 %	50 %	538392444
5988	NC_022247	GAC	2	6	220744	220749	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538392444
5989	NC_022247	GC	3	6	220811	220816	0 %	0 %	50 %	50 %	538392445
5990	NC_022247	CGT	2	6	220857	220862	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538392445
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