MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Variovorax paradoxus B4 chromosome 2

Total Repeats: 22373

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022234	GCG	2	6	64	69	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344195
2	NC_022234	CGC	2	6	244	249	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538344195
3	NC_022234	GGC	2	6	269	274	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344195
4	NC_022234	GCA	2	6	277	282	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538344195
5	NC_022234	GCG	2	6	417	422	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344195
6	NC_022234	GGA	2	6	461	466	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	538344195
7	NC_022234	GGC	2	6	517	522	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344195
8	NC_022234	GGC	2	6	545	550	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344195
9	NC_022234	GGC	2	6	700	705	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344195
10	NC_022234	TGC	2	6	760	765	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344195
11	NC_022234	CGG	2	6	799	804	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344195
12	NC_022234	GGC	2	6	862	867	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344196
13	NC_022234	GCC	2	6	887	892	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538344196
14	NC_022234	GGC	2	6	1168	1173	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344196
15	NC_022234	GAC	2	6	1190	1195	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538344196
16	NC_022234	GGC	2	6	1213	1218	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344196
17	NC_022234	TCA	2	6	1293	1298	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	538344196
18	NC_022234	GGA	2	6	1348	1353	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	538344196
19	NC_022234	GGC	2	6	1356	1361	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344196
20	NC_022234	TGG	2	6	1392	1397	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538344196
21	NC_022234	GGC	2	6	1445	1450	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344196
22	NC_022234	GCC	2	6	1476	1481	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538344196
23	NC_022234	CGG	2	6	1501	1506	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344196
24	NC_022234	CGG	2	6	1509	1514	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344196
25	NC_022234	CGC	3	9	1515	1523	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538344196
26	NC_022234	ATC	2	6	1544	1549	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	538344196
27	NC_022234	GCG	2	6	1551	1556	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344196
28	NC_022234	TGG	2	6	1569	1574	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538344196
29	NC_022234	GGA	2	6	1583	1588	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	538344196
30	NC_022234	TGC	2	6	1665	1670	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344196
31	NC_022234	GGA	2	6	1705	1710	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	538344196
32	NC_022234	GGC	2	6	1801	1806	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344197
33	NC_022234	CCT	2	6	1861	1866	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	538344197
34	NC_022234	GCG	2	6	1887	1892	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344197
35	NC_022234	GCG	2	6	1935	1940	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344197
36	NC_022234	CTG	2	6	1952	1957	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344197
37	NC_022234	CCT	2	6	2029	2034	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	538344197
38	NC_022234	GCA	2	6	2089	2094	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538344197
39	NC_022234	GCG	2	6	2126	2131	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344197
40	NC_022234	GCA	2	6	2137	2142	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538344197
41	NC_022234	TCC	2	6	2211	2216	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	538344197
42	NC_022234	CGG	2	6	2330	2335	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344197
43	NC_022234	GTC	2	6	2350	2355	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344197
44	NC_022234	ACG	2	6	2358	2363	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538344197
45	NC_022234	GGC	2	6	2379	2384	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344197
46	NC_022234	GCC	2	6	2469	2474	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538344197
47	NC_022234	CGC	2	6	2497	2502	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538344197
48	NC_022234	TGA	2	6	2503	2508	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538344197
49	NC_022234	CGA	2	6	2527	2532	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538344197
50	NC_022234	GCC	2	6	2588	2593	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538344197
51	NC_022234	CGG	2	6	2596	2601	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344197
52	NC_022234	TTG	2	6	2631	2636	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	538344197
53	NC_022234	AGG	2	6	2650	2655	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	538344197
54	NC_022234	GGC	2	6	2660	2665	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344197
55	NC_022234	GAA	2	6	2698	2703	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	538344197
56	NC_022234	AGC	2	6	2715	2720	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538344197
57	NC_022234	GCC	2	6	3131	3136	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538344198
58	NC_022234	GCC	2	6	3237	3242	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538344198
59	NC_022234	CGC	2	6	3342	3347	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538344198
60	NC_022234	GCC	2	6	3531	3536	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538344198
61	NC_022234	GGC	2	6	3542	3547	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344198
62	NC_022234	TGC	2	6	3591	3596	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344198
63	NC_022234	CGA	2	6	3622	3627	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538344198
64	NC_022234	GCC	2	6	3701	3706	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538344198
65	NC_022234	CGG	2	6	3789	3794	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344199
66	NC_022234	TGC	2	6	3902	3907	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344199
67	NC_022234	TGA	2	6	3967	3972	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538344199
68	NC_022234	CGT	2	6	3975	3980	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344199
69	NC_022234	CCT	2	6	3985	3990	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	538344199
70	NC_022234	CGG	2	6	4075	4080	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344199
71	NC_022234	AGC	2	6	4134	4139	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538344199
72	NC_022234	AGA	2	6	4158	4163	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	538344199
73	NC_022234	GGC	2	6	4186	4191	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344199
74	NC_022234	CGA	2	6	4198	4203	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538344199
75	NC_022234	TCG	2	6	4257	4262	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344199
76	NC_022234	CGA	2	6	4306	4311	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538344199
77	NC_022234	CCG	2	6	4351	4356	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538344199
78	NC_022234	CGC	2	6	4588	4593	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538344200
79	NC_022234	CGG	3	9	4635	4643	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344200
80	NC_022234	CAG	2	6	4684	4689	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538344200
81	NC_022234	GAC	2	6	4723	4728	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538344200
82	NC_022234	CGC	3	9	4789	4797	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538344200
83	NC_022234	GCG	2	6	4827	4832	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344200
84	NC_022234	CAG	3	9	4852	4860	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538344200
85	NC_022234	GAT	2	6	4897	4902	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538344200
86	NC_022234	CGA	2	6	4903	4908	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538344200
87	NC_022234	GGC	2	6	4960	4965	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344200
88	NC_022234	ACA	2	6	4968	4973	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	538344200
89	NC_022234	CAG	2	6	5029	5034	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538344200
90	NC_022234	CGC	2	6	5050	5055	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538344200
91	NC_022234	GGC	2	6	5110	5115	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344200
92	NC_022234	ATC	2	6	5117	5122	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	538344200
93	NC_022234	GCG	2	6	5124	5129	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344200
94	NC_022234	TCA	2	6	5133	5138	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	538344200
95	NC_022234	GCG	2	6	5160	5165	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344200
96	NC_022234	CGA	2	6	5178	5183	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538344200
97	NC_022234	CGA	2	6	5226	5231	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538344200
98	NC_022234	AGC	2	6	5379	5384	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538344200
99	NC_022234	CCA	2	6	5391	5396	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	538344200
100	NC_022234	CGG	2	6	5414	5419	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344200
101	NC_022234	CGG	2	6	5495	5500	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344201
102	NC_022234	GCG	2	6	5509	5514	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344201
103	NC_022234	CGA	2	6	5659	5664	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538344201
104	NC_022234	TGC	2	6	5764	5769	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344201
105	NC_022234	GCC	3	9	5787	5795	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538344201
106	NC_022234	GCC	2	6	5849	5854	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538344201
107	NC_022234	GCC	2	6	5902	5907	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538344201
108	NC_022234	GCA	2	6	6013	6018	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538344201
109	NC_022234	CGA	2	6	6022	6027	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538344201
110	NC_022234	TCA	2	6	6028	6033	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	538344201
111	NC_022234	TCT	2	6	6049	6054	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	538344201
112	NC_022234	GCC	2	6	6200	6205	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538344201
113	NC_022234	GTC	2	6	6428	6433	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344201
114	NC_022234	CGA	2	6	6486	6491	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538344201
115	NC_022234	CTG	2	6	6536	6541	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344201
116	NC_022234	CGT	2	6	6604	6609	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344201
117	NC_022234	GGC	2	6	6702	6707	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344201
118	NC_022234	GGT	2	6	6718	6723	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538344201
119	NC_022234	TCG	2	6	6747	6752	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344201
120	NC_022234	GAC	2	6	6761	6766	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538344201
121	NC_022234	GCT	2	6	6881	6886	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344201
122	NC_022234	GCA	2	6	7084	7089	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538344201
123	NC_022234	GTG	2	6	7358	7363	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538344201
124	NC_022234	TGG	2	6	7374	7379	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538344201
125	NC_022234	CCG	2	6	7426	7431	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538344201
126	NC_022234	TGT	2	6	7486	7491	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	538344201
127	NC_022234	GTT	2	6	7529	7534	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	538344201
128	NC_022234	GCA	2	6	7537	7542	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538344201
129	NC_022234	GCC	2	6	7566	7571	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538344201
130	NC_022234	GCC	2	6	8188	8193	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538344202
131	NC_022234	GCA	2	6	8255	8260	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538344202
132	NC_022234	GGA	2	6	8354	8359	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	538344202
133	NC_022234	GAT	2	6	8394	8399	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538344202
134	NC_022234	CCA	2	6	8414	8419	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	538344202
135	NC_022234	CCT	2	6	8420	8425	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	538344202
136	NC_022234	CCA	2	6	8495	8500	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	538344202
137	NC_022234	GTG	2	6	8518	8523	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538344202
138	NC_022234	CGG	2	6	8540	8545	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344202
139	NC_022234	CAG	2	6	8569	8574	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538344202
140	NC_022234	CTG	2	6	8607	8612	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344202
141	NC_022234	GAC	2	6	8803	8808	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538344203
142	NC_022234	TCA	2	6	8871	8876	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	538344203
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146	NC_022234	TCG	2	6	9212	9217	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344203
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150	NC_022234	GTC	3	9	9265	9273	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344203
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152	NC_022234	TCG	2	6	9426	9431	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344203
153	NC_022234	GCC	2	6	9476	9481	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538344203
154	NC_022234	CGG	2	6	9528	9533	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344203
155	NC_022234	GGA	2	6	9589	9594	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	538344203
156	NC_022234	CAC	2	6	9698	9703	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	538344203
157	NC_022234	TGC	2	6	9717	9722	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344203
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160	NC_022234	GGT	2	6	9868	9873	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538344203
161	NC_022234	TCT	2	6	9894	9899	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	538344203
162	NC_022234	ACC	2	6	10059	10064	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	538344203
163	NC_022234	GCA	2	6	10066	10071	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538344203
164	NC_022234	GCT	2	6	10096	10101	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344203
165	NC_022234	GCA	2	6	10239	10244	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538344203
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242	NC_022234	ACG	2	6	15430	15435	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538344207
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249	NC_022234	CGA	2	6	15892	15897	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538344208
250	NC_022234	GCA	2	6	15904	15909	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538344208
251	NC_022234	CTG	3	9	16024	16032	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344208
252	NC_022234	TGA	2	6	16048	16053	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538344208
253	NC_022234	TTC	2	6	16172	16177	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	538344208
254	NC_022234	TCG	2	6	16330	16335	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344208
255	NC_022234	GTT	2	6	16363	16368	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	538344208
256	NC_022234	GGT	2	6	16398	16403	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538344209
257	NC_022234	GGC	2	6	16413	16418	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344209
258	NC_022234	CTC	2	6	16449	16454	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	538344209
259	NC_022234	GCC	2	6	16500	16505	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538344209
260	NC_022234	GGC	2	6	16562	16567	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344209
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262	NC_022234	CGT	2	6	16664	16669	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344209
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279	NC_022234	TTC	2	6	17736	17741	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	538344209
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283	NC_022234	TGG	2	6	17998	18003	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538344210
284	NC_022234	GCG	2	6	18012	18017	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344210
285	NC_022234	GGC	2	6	18026	18031	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344210
286	NC_022234	TGA	2	6	18124	18129	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538344210
287	NC_022234	GCT	2	6	18148	18153	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344210
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303	NC_022234	CGG	2	6	19073	19078	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344211
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374	NC_022234	GGA	2	6	22295	22300	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	538344213
375	NC_022234	GAG	2	6	22566	22571	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	538344213
376	NC_022234	GGC	2	6	22589	22594	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344213
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378	NC_022234	CCA	2	6	22992	22997	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	538344214
379	NC_022234	GCA	2	6	23062	23067	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538344214
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381	NC_022234	CAG	2	6	23096	23101	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538344214
382	NC_022234	CCG	2	6	23119	23124	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538344214
383	NC_022234	GCT	2	6	23128	23133	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344214
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497	NC_022234	CGC	2	6	30197	30202	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538344220
498	NC_022234	TCG	2	6	30259	30264	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344220
499	NC_022234	CGC	2	6	30338	30343	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538344221
500	NC_022234	TGG	2	6	30364	30369	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538344221

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