MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Variovorax paradoxus B4 chromosome 2

Total Repeats: 32115

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_022234	GCA	2	6	41917	41922	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538344231
1002	NC_022234	TGC	2	6	42007	42012	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344231
1003	NC_022234	CG	3	6	42020	42025	0 %	0 %	50 %	50 %	538344231
1004	NC_022234	CGG	2	6	42064	42069	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344231
1005	NC_022234	GAA	2	6	42113	42118	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	538344231
1006	NC_022234	TGA	2	6	42133	42138	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538344231
1007	NC_022234	GCC	2	6	42151	42156	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538344231
1008	NC_022234	CTTCGC	2	12	42193	42204	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	538344231
1009	NC_022234	ATG	2	6	42216	42221	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538344231
1010	NC_022234	GCG	2	6	42321	42326	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344231
1011	NC_022234	CGGC	2	8	42427	42434	0 %	0 %	50 %	50 %	538344231
1012	NC_022234	TGC	2	6	42435	42440	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344231
1013	NC_022234	TGTCC	2	10	42776	42785	0 %	40 %	20 %	40 %	538344232
1014	NC_022234	CTTGC	2	10	42787	42796	0 %	40 %	20 %	40 %	538344232
1015	NC_022234	GCC	2	6	42822	42827	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538344232
1016	NC_022234	CGC	2	6	42835	42840	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538344232
1017	NC_022234	GCA	2	6	42898	42903	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538344232
1018	NC_022234	CCGC	2	8	42915	42922	0 %	0 %	25 %	75 %	538344232
1019	NC_022234	CG	3	6	42932	42937	0 %	0 %	50 %	50 %	538344232
1020	NC_022234	CAA	2	6	42947	42952	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	538344232
1021	NC_022234	CAT	2	6	42962	42967	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	538344232
1022	NC_022234	GC	3	6	43011	43016	0 %	0 %	50 %	50 %	538344232
1023	NC_022234	GGT	2	6	43040	43045	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538344232
1024	NC_022234	CGA	2	6	43073	43078	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538344232
1025	NC_022234	CGA	2	6	43097	43102	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538344232
1026	NC_022234	GC	3	6	43134	43139	0 %	0 %	50 %	50 %	538344232
1027	NC_022234	GAA	2	6	43217	43222	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	538344232
1028	NC_022234	CGA	2	6	43271	43276	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538344232
1029	NC_022234	CGAT	2	8	43282	43289	25 %	25 %	25 %	25 %	538344232
1030	NC_022234	TTG	2	6	43290	43295	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	538344232
1031	NC_022234	CGG	2	6	43355	43360	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344232
1032	NC_022234	GCT	2	6	43385	43390	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344232
1033	NC_022234	GCT	2	6	43403	43408	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344232
1034	NC_022234	GGC	2	6	43449	43454	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344232
1035	NC_022234	GCGT	2	8	43472	43479	0 %	25 %	50 %	25 %	538344232
1036	NC_022234	C	6	6	43593	43598	0 %	0 %	0 %	100 %	538344232
1037	NC_022234	GCG	2	6	43607	43612	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344232
1038	NC_022234	GCC	2	6	43668	43673	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538344233
1039	NC_022234	GCA	2	6	43841	43846	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538344233
1040	NC_022234	CGC	2	6	43853	43858	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538344233
1041	NC_022234	CG	3	6	43862	43867	0 %	0 %	50 %	50 %	538344233
1042	NC_022234	GCT	2	6	43883	43888	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344233
1043	NC_022234	CGG	2	6	43898	43903	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344233
1044	NC_022234	GC	3	6	43957	43962	0 %	0 %	50 %	50 %	538344233
1045	NC_022234	GGC	2	6	43971	43976	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344233
1046	NC_022234	CG	3	6	43985	43990	0 %	0 %	50 %	50 %	538344233
1047	NC_022234	CAC	3	9	44022	44030	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	538344233
1048	NC_022234	GCG	2	6	44069	44074	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344233
1049	NC_022234	GAT	2	6	44103	44108	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538344233
1050	NC_022234	GC	3	6	44140	44145	0 %	0 %	50 %	50 %	538344233
1051	NC_022234	CGA	2	6	44159	44164	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538344233
1052	NC_022234	CCA	2	6	44198	44203	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	538344233
1053	NC_022234	CGG	2	6	44210	44215	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344233
1054	NC_022234	GGC	2	6	44249	44254	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344233
1055	NC_022234	GCC	2	6	44257	44262	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538344233
1056	NC_022234	CG	4	8	44264	44271	0 %	0 %	50 %	50 %	538344233
1057	NC_022234	GCG	2	6	44291	44296	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344233
1058	NC_022234	CG	3	6	44346	44351	0 %	0 %	50 %	50 %	538344233
1059	NC_022234	CGG	2	6	44381	44386	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344233
1060	NC_022234	GTG	2	6	44404	44409	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538344233
1061	NC_022234	GCCC	2	8	44432	44439	0 %	0 %	25 %	75 %	538344233
1062	NC_022234	CGGCG	2	10	44450	44459	0 %	0 %	60 %	40 %	538344233
1063	NC_022234	TGGTG	2	10	44465	44474	0 %	40 %	60 %	0 %	538344233
1064	NC_022234	GC	3	6	44479	44484	0 %	0 %	50 %	50 %	538344233
1065	NC_022234	CGG	2	6	46510	46515	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344234
1066	NC_022234	CAG	2	6	46530	46535	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538344234
1067	NC_022234	GCC	2	6	46536	46541	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538344234
1068	NC_022234	AGC	2	6	46542	46547	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538344234
1069	NC_022234	TGCGC	2	10	46555	46564	0 %	20 %	40 %	40 %	538344234
1070	NC_022234	CGG	2	6	46668	46673	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344234
1071	NC_022234	TCG	2	6	46710	46715	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344234
1072	NC_022234	CGT	2	6	46720	46725	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344234
1073	NC_022234	GCG	2	6	46745	46750	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344234
1074	NC_022234	TCG	2	6	46782	46787	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344234
1075	NC_022234	TTC	2	6	46793	46798	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	538344234
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1077	NC_022234	CAG	2	6	46817	46822	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538344234
1078	NC_022234	GCCG	2	8	46823	46830	0 %	0 %	50 %	50 %	538344234
1079	NC_022234	CTTGC	2	10	46853	46862	0 %	40 %	20 %	40 %	538344234
1080	NC_022234	CGGC	2	8	46870	46877	0 %	0 %	50 %	50 %	538344234
1081	NC_022234	CTT	2	6	46880	46885	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	538344234
1082	NC_022234	TGG	2	6	47086	47091	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538344234
1083	NC_022234	ACC	2	6	47094	47099	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	538344234
1084	NC_022234	CG	3	6	47110	47115	0 %	0 %	50 %	50 %	538344234
1085	NC_022234	TGC	2	6	47151	47156	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344234
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1088	NC_022234	CGC	3	9	47318	47326	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538344234
1089	NC_022234	GTG	2	6	47340	47345	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538344234
1090	NC_022234	GGC	2	6	47398	47403	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344234
1091	NC_022234	CGG	2	6	47500	47505	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344234
1092	NC_022234	GATG	2	8	47506	47513	25 %	25 %	50 %	0 %	538344234
1093	NC_022234	GGTG	2	8	47524	47531	0 %	25 %	75 %	0 %	538344234
1094	NC_022234	TCG	2	6	47532	47537	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344234
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1096	NC_022234	GAG	2	6	47609	47614	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	538344234
1097	NC_022234	TGCGG	2	10	47622	47631	0 %	20 %	60 %	20 %	538344234
1098	NC_022234	GCA	2	6	47635	47640	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538344234
1099	NC_022234	CG	3	6	47679	47684	0 %	0 %	50 %	50 %	538344234
1100	NC_022234	CAGCC	2	10	47697	47706	20 %	0 %	20 %	60 %	538344234
1101	NC_022234	CG	3	6	47755	47760	0 %	0 %	50 %	50 %	538344234
1102	NC_022234	CGG	2	6	47818	47823	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344234
1103	NC_022234	TG	3	6	47845	47850	0 %	50 %	50 %	0 %	538344234
1104	NC_022234	CG	4	8	47918	47925	0 %	0 %	50 %	50 %	538344235
1105	NC_022234	GC	3	6	47937	47942	0 %	0 %	50 %	50 %	538344235
1106	NC_022234	CTG	2	6	47970	47975	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344235
1107	NC_022234	CAC	2	6	48072	48077	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	538344235
1108	NC_022234	GCC	2	6	48079	48084	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538344235
1109	NC_022234	GCCG	2	8	48090	48097	0 %	0 %	50 %	50 %	538344235
1110	NC_022234	CTC	2	6	48147	48152	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	538344235
1111	NC_022234	GC	3	6	48183	48188	0 %	0 %	50 %	50 %	538344235
1112	NC_022234	CG	4	8	48211	48218	0 %	0 %	50 %	50 %	538344235
1113	NC_022234	GCC	2	6	48276	48281	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538344235
1114	NC_022234	CGC	2	6	48308	48313	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538344235
1115	NC_022234	GGTC	2	8	48338	48345	0 %	25 %	50 %	25 %	538344235
1116	NC_022234	TGC	2	6	48346	48351	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344235
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1118	NC_022234	CGCC	2	8	48389	48396	0 %	0 %	25 %	75 %	538344235
1119	NC_022234	CGA	2	6	48437	48442	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538344235
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1121	NC_022234	GCC	2	6	48498	48503	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538344235
1122	NC_022234	CGTG	2	8	48572	48579	0 %	25 %	50 %	25 %	538344235
1123	NC_022234	CGGC	2	8	48611	48618	0 %	0 %	50 %	50 %	538344235
1124	NC_022234	GC	5	10	48617	48626	0 %	0 %	50 %	50 %	538344235
1125	NC_022234	TGCGA	2	10	48634	48643	20 %	20 %	40 %	20 %	538344235
1126	NC_022234	CGC	5	15	48647	48661	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538344235
1127	NC_022234	AGC	2	6	48691	48696	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538344235
1128	NC_022234	CCA	2	6	48725	48730	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	538344235
1129	NC_022234	GCC	3	9	48738	48746	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538344235
1130	NC_022234	GCC	2	6	48748	48753	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538344235
1131	NC_022234	TGCGCG	2	12	48793	48804	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	538344235
1132	NC_022234	GGAA	2	8	48828	48835	50 %	0 %	50 %	0 %	538344235
1133	NC_022234	TGTCT	2	10	48863	48872	0 %	60 %	20 %	20 %	538344235
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1137	NC_022234	GCGCA	2	10	48998	49007	20 %	0 %	40 %	40 %	538344236
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1142	NC_022234	CGA	2	6	49141	49146	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538344236
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1161	NC_022234	GCG	2	6	49882	49887	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344237
1162	NC_022234	GGGC	2	8	49898	49905	0 %	0 %	75 %	25 %	538344237
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1166	NC_022234	CGCT	2	8	50074	50081	0 %	25 %	25 %	50 %	538344237
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1245	NC_022234	TGC	2	6	53420	53425	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344240
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1249	NC_022234	CGC	2	6	53480	53485	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538344240
1250	NC_022234	GAAG	2	8	53508	53515	50 %	0 %	50 %	0 %	538344240
1251	NC_022234	GCCG	2	8	53562	53569	0 %	0 %	50 %	50 %	538344240
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1379	NC_022234	GGC	3	9	58906	58914	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344245
1380	NC_022234	GTT	2	6	59014	59019	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	538344245
1381	NC_022234	GCC	2	6	59054	59059	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538344245
1382	NC_022234	CGG	2	6	59088	59093	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344245
1383	NC_022234	TCC	2	6	59138	59143	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	538344245
1384	NC_022234	GAT	2	6	59191	59196	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538344245
1385	NC_022234	CG	3	6	59199	59204	0 %	0 %	50 %	50 %	538344245
1386	NC_022234	GC	4	8	59212	59219	0 %	0 %	50 %	50 %	538344245
1387	NC_022234	ACGGC	2	10	59231	59240	20 %	0 %	40 %	40 %	538344245
1388	NC_022234	CG	3	6	59247	59252	0 %	0 %	50 %	50 %	538344245
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1400	NC_022234	CGT	2	6	59566	59571	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344246
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1453	NC_022234	GTG	3	9	61579	61587	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538344248
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1474	NC_022234	GCA	2	6	63127	63132	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538344251
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1488	NC_022234	GGT	2	6	63509	63514	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538344251
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1492	NC_022234	CAG	2	6	63728	63733	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538344251
1493	NC_022234	GCC	2	6	63797	63802	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538344251
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1497	NC_022234	GC	4	8	63900	63907	0 %	0 %	50 %	50 %	538344251
1498	NC_022234	CAC	2	6	63908	63913	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	538344251
1499	NC_022234	CG	3	6	63944	63949	0 %	0 %	50 %	50 %	538344251
1500	NC_022234	AGC	2	6	63957	63962	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538344251

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