MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Vibrio parahaemolyticus O1:K33 str. CDC_K4557 chromosome I

Total Repeats: 54922

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_021848	AAT	2	6	223951	223956	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525957662
3502	NC_021848	ATG	2	6	224012	224017	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525957662
3503	NC_021848	AG	3	6	224047	224052	50 %	0 %	50 %	0 %	525957662
3504	NC_021848	CACC	2	8	224115	224122	25 %	0 %	0 %	75 %	525957662
3505	NC_021848	TCT	2	6	224237	224242	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525957662
3506	NC_021848	TCA	2	6	224328	224333	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525957662
3507	NC_021848	TTG	2	6	224380	224385	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525957662
3508	NC_021848	GCT	2	6	224425	224430	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525957662
3509	NC_021848	TC	3	6	224454	224459	0 %	50 %	0 %	50 %	525957662
3510	NC_021848	AGGT	2	8	224466	224473	25 %	25 %	50 %	0 %	525957662
3511	NC_021848	AG	3	6	224569	224574	50 %	0 %	50 %	0 %	525957662
3512	NC_021848	CGA	2	6	224597	224602	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525957662
3513	NC_021848	CAG	2	6	224722	224727	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525957662
3514	NC_021848	TGT	2	6	224781	224786	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525957662
3515	NC_021848	TTC	2	6	224824	224829	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525957662
3516	NC_021848	CAATT	2	10	224926	224935	40 %	40 %	0 %	20 %	525957662
3517	NC_021848	TTG	2	6	224971	224976	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525957662
3518	NC_021848	TAA	3	9	224998	225006	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525957662
3519	NC_021848	GGAGTG	2	12	225024	225035	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	525957662
3520	NC_021848	GTT	2	6	225069	225074	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525957662
3521	NC_021848	CGTACT	2	12	225087	225098	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	525957662
3522	NC_021848	AG	3	6	225126	225131	50 %	0 %	50 %	0 %	525957662
3523	NC_021848	AAT	2	6	225164	225169	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525957662
3524	NC_021848	TTC	2	6	225232	225237	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525957662
3525	NC_021848	GAA	2	6	225267	225272	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525957662
3526	NC_021848	AG	3	6	225277	225282	50 %	0 %	50 %	0 %	525957662
3527	NC_021848	CAC	2	6	225371	225376	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525959929
3528	NC_021848	AGC	2	6	225411	225416	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525959929
3529	NC_021848	TGT	2	6	225435	225440	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525959929
3530	NC_021848	CTA	2	6	225482	225487	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525959929
3531	NC_021848	TTG	2	6	225507	225512	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525959929
3532	NC_021848	CAG	2	6	225524	225529	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525959929
3533	NC_021848	ACA	2	6	225617	225622	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525959929
3534	NC_021848	AAT	2	6	225627	225632	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525959929
3535	NC_021848	CCA	2	6	225635	225640	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525959929
3536	NC_021848	ATC	2	6	225643	225648	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525959929
3537	NC_021848	TCAA	2	8	225652	225659	50 %	25 %	0 %	25 %	525959929
3538	NC_021848	T	6	6	225675	225680	0 %	100 %	0 %	0 %	525959929
3539	NC_021848	TTAG	2	8	226002	226009	25 %	50 %	25 %	0 %	525957663
3540	NC_021848	CAT	2	6	226127	226132	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525957663
3541	NC_021848	ATG	3	9	226155	226163	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525957663
3542	NC_021848	CTT	2	6	226183	226188	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525957663
3543	NC_021848	TCTACT	2	12	226212	226223	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	525957663
3544	NC_021848	GAT	2	6	226283	226288	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525957663
3545	NC_021848	TGA	2	6	226300	226305	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525957663
3546	NC_021848	AC	3	6	226318	226323	50 %	0 %	0 %	50 %	525957663
3547	NC_021848	CCA	2	6	226344	226349	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525957663
3548	NC_021848	GC	3	6	226369	226374	0 %	0 %	50 %	50 %	525957663
3549	NC_021848	T	6	6	226432	226437	0 %	100 %	0 %	0 %	525957663
3550	NC_021848	GTT	3	9	226452	226460	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525957663
3551	NC_021848	TTGCG	2	10	226492	226501	0 %	40 %	40 %	20 %	525957663
3552	NC_021848	GTTTG	2	10	226548	226557	0 %	60 %	40 %	0 %	525957663
3553	NC_021848	GCC	2	6	226604	226609	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525957663
3554	NC_021848	TGA	2	6	226669	226674	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525957663
3555	NC_021848	CAG	2	6	226696	226701	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525957663
3556	NC_021848	TCT	2	6	226752	226757	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525957663
3557	NC_021848	GTT	2	6	226798	226803	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525957663
3558	NC_021848	TGT	2	6	226831	226836	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525957663
3559	NC_021848	GT	4	8	226835	226842	0 %	50 %	50 %	0 %	525957663
3560	NC_021848	ATGG	2	8	226961	226968	25 %	25 %	50 %	0 %	525957664
3561	NC_021848	T	6	6	226999	227004	0 %	100 %	0 %	0 %	525957664
3562	NC_021848	TC	3	6	227030	227035	0 %	50 %	0 %	50 %	525957664
3563	NC_021848	GTT	2	6	227041	227046	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525957664
3564	NC_021848	TGG	2	6	227076	227081	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525957664
3565	NC_021848	T	6	6	227097	227102	0 %	100 %	0 %	0 %	525957664
3566	NC_021848	T	6	6	227134	227139	0 %	100 %	0 %	0 %	525957664
3567	NC_021848	TTAA	2	8	227176	227183	50 %	50 %	0 %	0 %	525957664
3568	NC_021848	GCATG	2	10	227227	227236	20 %	20 %	40 %	20 %	525957664
3569	NC_021848	GA	3	6	227259	227264	50 %	0 %	50 %	0 %	525957664
3570	NC_021848	AGA	2	6	227325	227330	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525957664
3571	NC_021848	ATCA	2	8	227336	227343	50 %	25 %	0 %	25 %	525957664
3572	NC_021848	CAT	2	6	227364	227369	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525957664
3573	NC_021848	CT	3	6	227929	227934	0 %	50 %	0 %	50 %	525957665
3574	NC_021848	GGAA	2	8	227970	227977	50 %	0 %	50 %	0 %	525957665
3575	NC_021848	CAA	2	6	227992	227997	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525957665
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3577	NC_021848	TCG	2	6	228093	228098	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525957665
3578	NC_021848	TGT	2	6	228164	228169	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525957665
3579	NC_021848	GAA	2	6	228259	228264	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525957665
3580	NC_021848	AGCA	2	8	228308	228315	50 %	0 %	25 %	25 %	525957665
3581	NC_021848	AAC	2	6	228316	228321	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525957665
3582	NC_021848	TAGCT	2	10	228411	228420	20 %	40 %	20 %	20 %	525957665
3583	NC_021848	TAC	2	6	228458	228463	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525957665
3584	NC_021848	CGC	2	6	228466	228471	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525957665
3585	NC_021848	GAA	2	6	228583	228588	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525957665
3586	NC_021848	TTG	2	6	228592	228597	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525957665
3587	NC_021848	CGA	2	6	228619	228624	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525957665
3588	NC_021848	CAG	2	6	228646	228651	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525957665
3589	NC_021848	AAC	2	6	228655	228660	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525957665
3590	NC_021848	GAA	2	6	228790	228795	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525957666
3591	NC_021848	CTA	2	6	228817	228822	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525957666
3592	NC_021848	AACT	2	8	228879	228886	50 %	25 %	0 %	25 %	525957666
3593	NC_021848	CAT	2	6	228960	228965	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525957666
3594	NC_021848	TTC	2	6	228989	228994	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525957666
3595	NC_021848	AAGA	2	8	229003	229010	75 %	0 %	25 %	0 %	525957666
3596	NC_021848	GGC	2	6	229021	229026	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525957666
3597	NC_021848	TCT	2	6	229045	229050	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525957666
3598	NC_021848	CTT	2	6	229080	229085	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525957666
3599	NC_021848	GGT	2	6	229108	229113	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525957666
3600	NC_021848	TAC	2	6	229123	229128	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525957666
3601	NC_021848	CGTT	2	8	229163	229170	0 %	50 %	25 %	25 %	525957666
3602	NC_021848	GTC	2	6	229175	229180	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525957666
3603	NC_021848	AGC	2	6	229190	229195	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525957666
3604	NC_021848	AAG	2	6	229211	229216	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525957666
3605	NC_021848	CAT	2	6	229235	229240	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525957666
3606	NC_021848	AGC	2	6	229373	229378	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525957666
3607	NC_021848	GATG	2	8	229407	229414	25 %	25 %	50 %	0 %	525957666
3608	NC_021848	GTG	2	6	229427	229432	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525957666
3609	NC_021848	GCTG	2	8	229564	229571	0 %	25 %	50 %	25 %	525957666
3610	NC_021848	AAC	2	6	229597	229602	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525957666
3611	NC_021848	CTA	2	6	229612	229617	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525957666
3612	NC_021848	CGTG	2	8	229707	229714	0 %	25 %	50 %	25 %	525957666
3613	NC_021848	CTT	2	6	229719	229724	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525957666
3614	NC_021848	CTG	2	6	229742	229747	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525957666
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3616	NC_021848	GTG	2	6	229793	229798	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525957666
3617	NC_021848	TCT	2	6	229807	229812	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525957666
3618	NC_021848	GCT	2	6	229822	229827	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525957666
3619	NC_021848	TAC	2	6	229961	229966	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525957666
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3622	NC_021848	AGA	2	6	230151	230156	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525957666
3623	NC_021848	ACT	2	6	230166	230171	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525957666
3624	NC_021848	AGA	2	6	230172	230177	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525957666
3625	NC_021848	TCT	2	6	230194	230199	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525957666
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3628	NC_021848	TAC	2	6	230380	230385	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525957666
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3647	NC_021848	CATT	2	8	231155	231162	25 %	50 %	0 %	25 %	525957666
3648	NC_021848	CTG	2	6	231164	231169	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525957666
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3653	NC_021848	GAA	3	9	231482	231490	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525957667
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3657	NC_021848	GCA	2	6	231692	231697	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525957667
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3723	NC_021848	TGG	2	6	234779	234784	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525957668
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3729	NC_021848	A	6	6	234957	234962	100 %	0 %	0 %	0 %	525957668
3730	NC_021848	AAG	3	9	234969	234977	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525957668
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3737	NC_021848	AGT	2	6	235554	235559	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525957669
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3739	NC_021848	GTT	2	6	235662	235667	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525957669
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3742	NC_021848	TTG	2	6	236158	236163	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525957670
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3849	NC_021848	T	6	6	241983	241988	0 %	100 %	0 %	0 %	525957675
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