MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Vibrio parahaemolyticus O1:K33 str. CDC_K4557 chromosome I

Total Repeats: 54922

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_021848	CG	3	6	61790	61795	0 %	0 %	50 %	50 %	525957530
1002	NC_021848	TCA	2	6	61848	61853	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525957530
1003	NC_021848	CGAC	2	8	61907	61914	25 %	0 %	25 %	50 %	525957530
1004	NC_021848	TCA	2	6	62105	62110	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525957530
1005	NC_021848	CAC	2	6	62190	62195	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525957530
1006	NC_021848	TCA	2	6	62217	62222	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525957530
1007	NC_021848	CCA	2	6	62225	62230	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525957530
1008	NC_021848	CTG	2	6	62277	62282	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525957530
1009	NC_021848	GA	3	6	62294	62299	50 %	0 %	50 %	0 %	525957530
1010	NC_021848	ATC	2	6	62314	62319	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525957530
1011	NC_021848	GAC	2	6	62553	62558	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525957530
1012	NC_021848	CTT	2	6	62598	62603	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525957530
1013	NC_021848	TCT	2	6	63020	63025	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525957531
1014	NC_021848	TAC	2	6	63040	63045	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525957531
1015	NC_021848	GCG	2	6	63083	63088	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525957531
1016	NC_021848	CG	4	8	63087	63094	0 %	0 %	50 %	50 %	525957531
1017	NC_021848	CGAG	2	8	63164	63171	25 %	0 %	50 %	25 %	525957532
1018	NC_021848	GCC	2	6	63252	63257	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525957532
1019	NC_021848	ATT	2	6	63291	63296	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525957532
1020	NC_021848	T	7	7	63295	63301	0 %	100 %	0 %	0 %	525957532
1021	NC_021848	GTT	2	6	63368	63373	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525957532
1022	NC_021848	GTG	2	6	63626	63631	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525957532
1023	NC_021848	ACG	2	6	63705	63710	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525957532
1024	NC_021848	GCT	2	6	63788	63793	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525957532
1025	NC_021848	TGCT	2	8	63862	63869	0 %	50 %	25 %	25 %	525957532
1026	NC_021848	AGT	2	6	63926	63931	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525957532
1027	NC_021848	CGCAA	2	10	63952	63961	40 %	0 %	20 %	40 %	525957532
1028	NC_021848	AAC	2	6	63990	63995	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525957532
1029	NC_021848	ATG	2	6	64035	64040	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525957533
1030	NC_021848	TTC	2	6	64049	64054	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525957533
1031	NC_021848	CTTG	2	8	64087	64094	0 %	50 %	25 %	25 %	525957533
1032	NC_021848	TTC	2	6	64148	64153	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525957533
1033	NC_021848	CAAA	2	8	64168	64175	75 %	0 %	0 %	25 %	525957533
1034	NC_021848	CGTG	2	8	64266	64273	0 %	25 %	50 %	25 %	525957533
1035	NC_021848	TC	3	6	64315	64320	0 %	50 %	0 %	50 %	525957533
1036	NC_021848	GT	3	6	64362	64367	0 %	50 %	50 %	0 %	525957533
1037	NC_021848	CGA	2	6	64372	64377	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525957533
1038	NC_021848	T	6	6	64403	64408	0 %	100 %	0 %	0 %	525957533
1039	NC_021848	TTA	2	6	64499	64504	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525957534
1040	NC_021848	ATCG	2	8	64534	64541	25 %	25 %	25 %	25 %	525957534
1041	NC_021848	CATA	2	8	64545	64552	50 %	25 %	0 %	25 %	525957534
1042	NC_021848	T	6	6	64623	64628	0 %	100 %	0 %	0 %	525957534
1043	NC_021848	TTGA	2	8	64651	64658	25 %	50 %	25 %	0 %	525957534
1044	NC_021848	GAA	2	6	64666	64671	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525957534
1045	NC_021848	AGA	2	6	64880	64885	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525957535
1046	NC_021848	GCA	2	6	64886	64891	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525957535
1047	NC_021848	GAA	2	6	65008	65013	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525957535
1048	NC_021848	TTCAA	2	10	65018	65027	40 %	40 %	0 %	20 %	525957535
1049	NC_021848	CATG	2	8	65085	65092	25 %	25 %	25 %	25 %	525957535
1050	NC_021848	CAT	2	6	65109	65114	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525957535
1051	NC_021848	CTT	2	6	65136	65141	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525957535
1052	NC_021848	GAA	2	6	65152	65157	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525957535
1053	NC_021848	TTG	2	6	65161	65166	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525957535
1054	NC_021848	CAA	2	6	65172	65177	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525957535
1055	NC_021848	CT	3	6	65213	65218	0 %	50 %	0 %	50 %	525957535
1056	NC_021848	TTAA	2	8	65225	65232	50 %	50 %	0 %	0 %	525957535
1057	NC_021848	TGC	2	6	65253	65258	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525957535
1058	NC_021848	TTGCCT	2	12	65282	65293	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	525957535
1059	NC_021848	TTG	2	6	65305	65310	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525957535
1060	NC_021848	GTC	2	6	65407	65412	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525957535
1061	NC_021848	CTT	2	6	65481	65486	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525957535
1062	NC_021848	TGA	2	6	65502	65507	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525957535
1063	NC_021848	TCT	2	6	65585	65590	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525957535
1064	NC_021848	ATG	2	6	65777	65782	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525957535
1065	NC_021848	CGGT	2	8	65798	65805	0 %	25 %	50 %	25 %	525957535
1066	NC_021848	ATC	2	6	65887	65892	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525957535
1067	NC_021848	TGT	2	6	66036	66041	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525957535
1068	NC_021848	CAG	2	6	66042	66047	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525957535
1069	NC_021848	TTC	2	6	66085	66090	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525957535
1070	NC_021848	CTT	2	6	66096	66101	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525957535
1071	NC_021848	CTT	2	6	66132	66137	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525957535
1072	NC_021848	TTG	2	6	66145	66150	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525957535
1073	NC_021848	GCA	2	6	66171	66176	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525957535
1074	NC_021848	TTG	2	6	66187	66192	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525957535
1075	NC_021848	CTT	2	6	66356	66361	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525959911
1076	NC_021848	ACGT	2	8	66432	66439	25 %	25 %	25 %	25 %	525959911
1077	NC_021848	GAT	2	6	66486	66491	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525959911
1078	NC_021848	CAA	2	6	66543	66548	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525959911
1079	NC_021848	CAC	2	6	66602	66607	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525959911
1080	NC_021848	TTC	2	6	66654	66659	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525959911
1081	NC_021848	CAA	2	6	66660	66665	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525959911
1082	NC_021848	ATG	2	6	66727	66732	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525959911
1083	NC_021848	GTC	2	6	66834	66839	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525959911
1084	NC_021848	ATGGTG	2	12	66841	66852	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	525959911
1085	NC_021848	CAA	2	6	66875	66880	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525959911
1086	NC_021848	GGT	2	6	66894	66899	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525959911
1087	NC_021848	GAC	2	6	66969	66974	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525959911
1088	NC_021848	T	6	6	67003	67008	0 %	100 %	0 %	0 %	525959911
1089	NC_021848	CCA	2	6	67089	67094	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525957536
1090	NC_021848	TGA	2	6	67123	67128	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525957536
1091	NC_021848	GAGC	2	8	67152	67159	25 %	0 %	50 %	25 %	525957536
1092	NC_021848	TTTG	2	8	67287	67294	0 %	75 %	25 %	0 %	525957536
1093	NC_021848	GAC	2	6	67321	67326	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525957536
1094	NC_021848	TGC	2	6	67350	67355	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525957536
1095	NC_021848	GCT	2	6	67478	67483	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525957536
1096	NC_021848	CAG	2	6	67495	67500	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525957536
1097	NC_021848	AGT	2	6	67589	67594	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525957537
1098	NC_021848	CCAA	2	8	67608	67615	50 %	0 %	0 %	50 %	525957537
1099	NC_021848	TTG	2	6	67622	67627	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525957537
1100	NC_021848	TGA	2	6	67657	67662	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525957537
1101	NC_021848	CGA	2	6	67789	67794	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525957537
1102	NC_021848	GTT	2	6	67868	67873	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525957537
1103	NC_021848	GAT	2	6	67880	67885	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525957537
1104	NC_021848	TAA	2	6	68004	68009	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525957537
1105	NC_021848	CGA	3	9	68020	68028	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525957537
1106	NC_021848	AAAT	2	8	68040	68047	75 %	25 %	0 %	0 %	525957537
1107	NC_021848	AT	3	6	68064	68069	50 %	50 %	0 %	0 %	525957537
1108	NC_021848	TCT	2	6	68211	68216	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525957538
1109	NC_021848	GCG	2	6	68363	68368	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525957538
1110	NC_021848	AGCAT	2	10	68394	68403	40 %	20 %	20 %	20 %	525957538
1111	NC_021848	ATA	2	6	68514	68519	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525957538
1112	NC_021848	TTC	2	6	68542	68547	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525957538
1113	NC_021848	CAC	2	6	68554	68559	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525957538
1114	NC_021848	GA	3	6	68568	68573	50 %	0 %	50 %	0 %	525957538
1115	NC_021848	TCT	2	6	68580	68585	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525957538
1116	NC_021848	CTG	2	6	68655	68660	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525957538
1117	NC_021848	CTT	2	6	68686	68691	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525957538
1118	NC_021848	TGCAAG	2	12	68706	68717	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	525957538
1119	NC_021848	AG	3	6	68797	68802	50 %	0 %	50 %	0 %	525957538
1120	NC_021848	GCT	2	6	68883	68888	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525957538
1121	NC_021848	TGC	2	6	68936	68941	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525957538
1122	NC_021848	TTG	2	6	68946	68951	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525957538
1123	NC_021848	TCA	2	6	69036	69041	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525957538
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1125	NC_021848	ACA	2	6	69277	69282	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525957539
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1245	NC_021848	T	6	6	76767	76772	0 %	100 %	0 %	0 %	525957548
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1247	NC_021848	TGCT	2	8	76832	76839	0 %	50 %	25 %	25 %	525957548
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