MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Vibrio parahaemolyticus O1:Kuk str. FDA_R31 chromosome I

Total Repeats: 1909

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021847	AAGCA	2	10	556	565	60 %	0 %	20 %	20 %	525952309
2	NC_021847	AACCA	2	10	1528	1537	60 %	0 %	0 %	40 %	525952310
3	NC_021847	TCCAA	2	10	20840	20849	40 %	20 %	0 %	40 %	525949900
4	NC_021847	CCCTG	2	10	24061	24070	0 %	20 %	20 %	60 %	525952312
5	NC_021847	ACCAC	2	10	26713	26722	40 %	0 %	0 %	60 %	525949906
6	NC_021847	ACTTT	2	10	26842	26851	20 %	60 %	0 %	20 %	525949906
7	NC_021847	TTGGT	2	10	27515	27524	0 %	60 %	40 %	0 %	525949907
8	NC_021847	CATTG	2	10	29312	29321	20 %	40 %	20 %	20 %	525949908
9	NC_021847	TGAAG	2	10	32203	32212	40 %	20 %	40 %	0 %	525952313
10	NC_021847	GCTTC	2	10	32553	32562	0 %	40 %	20 %	40 %	525952313
11	NC_021847	GACGC	2	10	34156	34165	20 %	0 %	40 %	40 %	525949914
12	NC_021847	TGCTG	2	10	36400	36409	0 %	40 %	40 %	20 %	525952314
13	NC_021847	AACTT	2	10	38059	38068	40 %	40 %	0 %	20 %	525949917
14	NC_021847	AGTCG	2	10	39547	39556	20 %	20 %	40 %	20 %	525949919
15	NC_021847	TTTCA	2	10	39810	39819	20 %	60 %	0 %	20 %	525949920
16	NC_021847	AGCAA	2	10	41196	41205	60 %	0 %	20 %	20 %	525949921
17	NC_021847	CTTCC	2	10	43974	43983	0 %	40 %	0 %	60 %	525949922
18	NC_021847	TGCCG	2	10	44256	44265	0 %	20 %	40 %	40 %	525949922
19	NC_021847	AACGT	2	10	48907	48916	40 %	20 %	20 %	20 %	525949926
20	NC_021847	ATCAC	2	10	50808	50817	40 %	20 %	0 %	40 %	525949928
21	NC_021847	TGCTC	2	10	54003	54012	0 %	40 %	20 %	40 %	525949930
22	NC_021847	GCTTG	2	10	56861	56870	0 %	40 %	40 %	20 %	525949932
23	NC_021847	GTGAG	2	10	57362	57371	20 %	20 %	60 %	0 %	525949932
24	NC_021847	GATTG	2	10	57937	57946	20 %	40 %	40 %	0 %	525949933
25	NC_021847	CCAGA	2	10	58280	58289	40 %	0 %	20 %	40 %	525949933
26	NC_021847	TTCAT	2	10	63952	63961	20 %	60 %	0 %	20 %	525949937
27	NC_021847	TTGGA	2	10	67649	67658	20 %	40 %	40 %	0 %	525949939
28	NC_021847	GCTGC	2	10	70012	70021	0 %	20 %	40 %	40 %	525949943
29	NC_021847	TCAAA	2	10	70264	70273	60 %	20 %	0 %	20 %	525949944
30	NC_021847	CAAAA	2	10	72419	72428	80 %	0 %	0 %	20 %	525949947
31	NC_021847	AGCAT	2	10	75635	75644	40 %	20 %	20 %	20 %	525949952
32	NC_021847	GCTGC	2	10	78958	78967	0 %	20 %	40 %	40 %	525949954
33	NC_021847	AAAAT	2	10	79754	79763	80 %	20 %	0 %	0 %	525949954
34	NC_021847	CTAAA	2	10	79841	79850	60 %	20 %	0 %	20 %	525949954
35	NC_021847	ATGGA	2	10	79903	79912	40 %	20 %	40 %	0 %	525949954
36	NC_021847	CAAAA	2	10	81680	81689	80 %	0 %	0 %	20 %	525949957
37	NC_021847	CAAAG	2	10	81772	81781	60 %	0 %	20 %	20 %	525949957
38	NC_021847	TGTCA	2	10	81909	81918	20 %	40 %	20 %	20 %	525949958
39	NC_021847	TCACC	2	10	84025	84034	20 %	20 %	0 %	60 %	525949960
40	NC_021847	GAGCA	2	10	85432	85441	40 %	0 %	40 %	20 %	525949961
41	NC_021847	ATCGC	2	10	91019	91028	20 %	20 %	20 %	40 %	525949965
42	NC_021847	GAAGT	2	10	91307	91316	40 %	20 %	40 %	0 %	525949965
43	NC_021847	TTTTG	2	10	91625	91634	0 %	80 %	20 %	0 %	525949965
44	NC_021847	ACCTT	2	10	91937	91946	20 %	40 %	0 %	40 %	525949965
45	NC_021847	ATCGC	2	10	92483	92492	20 %	20 %	20 %	40 %	525949965
46	NC_021847	AATCA	2	10	95765	95774	60 %	20 %	0 %	20 %	525949968
47	NC_021847	TTGCG	2	10	96713	96722	0 %	40 %	40 %	20 %	525949969
48	NC_021847	CTGCT	2	10	99893	99902	0 %	40 %	20 %	40 %	525949971
49	NC_021847	GTTTT	2	10	100184	100193	0 %	80 %	20 %	0 %	525949971
50	NC_021847	TAGTT	2	10	102111	102120	20 %	60 %	20 %	0 %	525949973
51	NC_021847	TACGA	2	10	105424	105433	40 %	20 %	20 %	20 %	525949976
52	NC_021847	ATTTT	2	10	107392	107401	20 %	80 %	0 %	0 %	525949978
53	NC_021847	CAACG	2	10	107784	107793	40 %	0 %	20 %	40 %	525949979
54	NC_021847	TTTCA	2	10	107839	107848	20 %	60 %	0 %	20 %	525949979
55	NC_021847	CAATC	2	10	109262	109271	40 %	20 %	0 %	40 %	525949980
56	NC_021847	ATGGG	2	10	110104	110113	20 %	20 %	60 %	0 %	525949980
57	NC_021847	TGGAT	2	10	113228	113237	20 %	40 %	40 %	0 %	525949983
58	NC_021847	CCACC	2	10	120624	120633	20 %	0 %	0 %	80 %	525949987
59	NC_021847	TTTGG	2	10	126149	126158	0 %	60 %	40 %	0 %	525949991
60	NC_021847	TGGCT	2	10	128111	128120	0 %	40 %	40 %	20 %	525949993
61	NC_021847	TAACA	2	10	132430	132439	60 %	20 %	0 %	20 %	525949998
62	NC_021847	CGCGA	2	10	133035	133044	20 %	0 %	40 %	40 %	525949999
63	NC_021847	TGCGC	3	15	133295	133309	0 %	20 %	40 %	40 %	525949999
64	NC_021847	TTGAT	2	10	133447	133456	20 %	60 %	20 %	0 %	525949999
65	NC_021847	GAAGA	2	10	135936	135945	60 %	0 %	40 %	0 %	525950001
66	NC_021847	ATGCA	2	10	137350	137359	40 %	20 %	20 %	20 %	525950004
67	NC_021847	CCTAA	2	10	142157	142166	40 %	20 %	0 %	40 %	525950008
68	NC_021847	CACTA	2	10	142754	142763	40 %	20 %	0 %	40 %	525950008
69	NC_021847	AACCA	2	10	143898	143907	60 %	0 %	0 %	40 %	525952319
70	NC_021847	TTTCA	2	10	144968	144977	20 %	60 %	0 %	20 %	525950010
71	NC_021847	GTTTC	2	10	147118	147127	0 %	60 %	20 %	20 %	525950012
72	NC_021847	CACGG	2	10	147563	147572	20 %	0 %	40 %	40 %	525950012
73	NC_021847	TCGCT	2	10	149764	149773	0 %	40 %	20 %	40 %	525950014
74	NC_021847	ACCAA	2	10	149973	149982	60 %	0 %	0 %	40 %	525950014
75	NC_021847	AGCGC	2	10	152744	152753	20 %	0 %	40 %	40 %	525950016
76	NC_021847	CAAGA	2	10	153021	153030	60 %	0 %	20 %	20 %	525950016
77	NC_021847	GGATT	2	10	154212	154221	20 %	40 %	40 %	0 %	525952321
78	NC_021847	TGCTG	2	10	154927	154936	0 %	40 %	40 %	20 %	525950018
79	NC_021847	CAAGC	2	10	157352	157361	40 %	0 %	20 %	40 %	525950020
80	NC_021847	TGGAT	2	10	157439	157448	20 %	40 %	40 %	0 %	525950020
81	NC_021847	CTTCA	2	10	161587	161596	20 %	40 %	0 %	40 %	525950023
82	NC_021847	TAACG	2	10	162592	162601	40 %	20 %	20 %	20 %	525950023
83	NC_021847	AAGTT	2	10	165859	165868	40 %	40 %	20 %	0 %	525950025
84	NC_021847	TCAGC	2	10	167154	167163	20 %	20 %	20 %	40 %	525950027
85	NC_021847	GTGGC	2	10	168090	168099	0 %	20 %	60 %	20 %	525950027
86	NC_021847	TGCGC	2	10	170536	170545	0 %	20 %	40 %	40 %	525950028
87	NC_021847	GTACA	2	10	171483	171492	40 %	20 %	20 %	20 %	525950028
88	NC_021847	CACAA	2	10	172610	172619	60 %	0 %	0 %	40 %	525950029
89	NC_021847	ACCGA	2	10	174902	174911	40 %	0 %	20 %	40 %	525950030
90	NC_021847	CACGT	2	10	179753	179762	20 %	20 %	20 %	40 %	525950035
91	NC_021847	TCAAA	2	10	180619	180628	60 %	20 %	0 %	20 %	525950036
92	NC_021847	AAGCA	2	10	186436	186445	60 %	0 %	20 %	20 %	525952323
93	NC_021847	AACCA	2	10	187401	187410	60 %	0 %	0 %	40 %	525952324
94	NC_021847	ATTGC	2	10	194634	194643	20 %	40 %	20 %	20 %	525950041
95	NC_021847	GCTAG	2	10	197637	197646	20 %	20 %	40 %	20 %	525950042
96	NC_021847	ATTTT	2	10	199484	199493	20 %	80 %	0 %	0 %	525950043
97	NC_021847	TTAAG	2	10	200126	200135	40 %	40 %	20 %	0 %	525952326
98	NC_021847	TTCGC	2	10	200449	200458	0 %	40 %	20 %	40 %	525950044
99	NC_021847	CAATC	2	10	201100	201109	40 %	20 %	0 %	40 %	525950045
100	NC_021847	CGCAG	2	10	202853	202862	20 %	0 %	40 %	40 %	525950046
101	NC_021847	TGGCA	2	10	203333	203342	20 %	20 %	40 %	20 %	525950046
102	NC_021847	AGTGA	2	10	204614	204623	40 %	20 %	40 %	0 %	525952328
103	NC_021847	TCCAA	2	10	205996	206005	40 %	20 %	0 %	40 %	525950048
104	NC_021847	GCGTG	2	10	208593	208602	0 %	20 %	60 %	20 %	525950050
105	NC_021847	GCAAA	2	10	208722	208731	60 %	0 %	20 %	20 %	525950050
106	NC_021847	TCAGA	2	10	217780	217789	40 %	20 %	20 %	20 %	525950057
107	NC_021847	CGATG	2	10	217886	217895	20 %	20 %	40 %	20 %	525950057
108	NC_021847	TACGT	2	10	220556	220565	20 %	40 %	20 %	20 %	525950058
109	NC_021847	TTAGC	2	10	220810	220819	20 %	40 %	20 %	20 %	525950058
110	NC_021847	ATTCG	2	10	221906	221915	20 %	40 %	20 %	20 %	525950058
111	NC_021847	TTTGC	2	10	228476	228485	0 %	60 %	20 %	20 %	525952333
112	NC_021847	CAGTC	2	10	229659	229668	20 %	20 %	20 %	40 %	525950064
113	NC_021847	AGCAA	2	10	232193	232202	60 %	0 %	20 %	20 %	525950067
114	NC_021847	AAGCA	2	10	232278	232287	60 %	0 %	20 %	20 %	525950067
115	NC_021847	AAATG	2	10	232621	232630	60 %	20 %	20 %	0 %	525950067
116	NC_021847	CTCTT	2	10	232714	232723	0 %	60 %	0 %	40 %	525950067
117	NC_021847	TAAAG	2	10	232768	232777	60 %	20 %	20 %	0 %	525950067
118	NC_021847	GGTTT	2	10	239826	239835	0 %	60 %	40 %	0 %	525950068
119	NC_021847	TTTTC	2	10	242608	242617	0 %	80 %	0 %	20 %	525950070
120	NC_021847	TTTTC	2	10	246342	246351	0 %	80 %	0 %	20 %	525950072
121	NC_021847	TTTTC	2	10	246663	246672	0 %	80 %	0 %	20 %	525950072
122	NC_021847	GTGAT	2	10	248555	248564	20 %	40 %	40 %	0 %	525950073
123	NC_021847	ACCAA	2	10	249826	249835	60 %	0 %	0 %	40 %	525950074
124	NC_021847	CTTCA	2	10	250071	250080	20 %	40 %	0 %	40 %	525950074
125	NC_021847	CCGTT	2	10	252635	252644	0 %	40 %	20 %	40 %	525950077
126	NC_021847	TTTGG	2	10	253883	253892	0 %	60 %	40 %	0 %	525950077
127	NC_021847	GAAGT	2	10	254879	254888	40 %	20 %	40 %	0 %	525950077
128	NC_021847	AACCC	2	10	255959	255968	40 %	0 %	0 %	60 %	525950079
129	NC_021847	TGCGC	2	10	257938	257947	0 %	20 %	40 %	40 %	525950082
130	NC_021847	ATCGT	2	10	258022	258031	20 %	40 %	20 %	20 %	525950082
131	NC_021847	GCGCT	2	10	259719	259728	0 %	20 %	40 %	40 %	525950083
132	NC_021847	TGGCA	2	10	260481	260490	20 %	20 %	40 %	20 %	525950083
133	NC_021847	TTCAA	2	10	260690	260699	40 %	40 %	0 %	20 %	525952339
134	NC_021847	TTTGT	2	10	261671	261680	0 %	80 %	20 %	0 %	525950084
135	NC_021847	CGTCG	2	10	263102	263111	0 %	20 %	40 %	40 %	525950085
136	NC_021847	AGAAA	2	10	270062	270071	80 %	0 %	20 %	0 %	525950094
137	NC_021847	ACGAT	2	10	271547	271556	40 %	20 %	20 %	20 %	525950096
138	NC_021847	TGCAA	2	10	272252	272261	40 %	20 %	20 %	20 %	525950097
139	NC_021847	ATCGT	2	10	275213	275222	20 %	40 %	20 %	20 %	525950100
140	NC_021847	GCATT	2	10	276310	276319	20 %	40 %	20 %	20 %	525950101
141	NC_021847	CGCCA	2	10	276821	276830	20 %	0 %	20 %	60 %	525950102
142	NC_021847	TGGCA	2	10	277728	277737	20 %	20 %	40 %	20 %	525950103
143	NC_021847	CATCC	2	10	278139	278148	20 %	20 %	0 %	60 %	525950103
144	NC_021847	ATTGG	2	10	278286	278295	20 %	40 %	40 %	0 %	525950103
145	NC_021847	TTCGC	2	10	283491	283500	0 %	40 %	20 %	40 %	525950107
146	NC_021847	CGGTG	2	10	287016	287025	0 %	20 %	60 %	20 %	525950113
147	NC_021847	GATGT	2	10	288297	288306	20 %	40 %	40 %	0 %	525950113
148	NC_021847	ACCGA	2	10	288489	288498	40 %	0 %	20 %	40 %	525950113
149	NC_021847	CGCAC	2	10	288951	288960	20 %	0 %	20 %	60 %	525950113
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151	NC_021847	AAAGC	2	10	293404	293413	60 %	0 %	20 %	20 %	525950117
152	NC_021847	ACTTT	2	10	301171	301180	20 %	60 %	0 %	20 %	525950118
153	NC_021847	CTTTT	2	10	302439	302448	0 %	80 %	0 %	20 %	525952342
154	NC_021847	TGGAT	2	10	303589	303598	20 %	40 %	40 %	0 %	525950120
155	NC_021847	GCATC	2	10	304532	304541	20 %	20 %	20 %	40 %	525950121
156	NC_021847	TACGT	2	10	304860	304869	20 %	40 %	20 %	20 %	525950121
157	NC_021847	GTTTA	2	10	306124	306133	20 %	60 %	20 %	0 %	525950122
158	NC_021847	CAGGC	2	10	306563	306572	20 %	0 %	40 %	40 %	525950123
159	NC_021847	GCAAA	2	10	308318	308327	60 %	0 %	20 %	20 %	525950124
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161	NC_021847	GGCAA	2	10	314178	314187	40 %	0 %	40 %	20 %	525950129
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163	NC_021847	CAACG	2	10	315138	315147	40 %	0 %	20 %	40 %	525950130
164	NC_021847	TGTGG	2	10	315194	315203	0 %	40 %	60 %	0 %	525950130
165	NC_021847	GCTTG	2	10	315624	315633	0 %	40 %	40 %	20 %	525950131
166	NC_021847	TGGAA	2	10	315875	315884	40 %	20 %	40 %	0 %	525950131
167	NC_021847	TCTAG	2	10	317944	317953	20 %	40 %	20 %	20 %	525950132
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169	NC_021847	GGTCA	2	10	321896	321905	20 %	20 %	40 %	20 %	525950135
170	NC_021847	CTGTC	2	10	322684	322693	0 %	40 %	20 %	40 %	525950136
171	NC_021847	CAACA	2	10	325723	325732	60 %	0 %	0 %	40 %	525950140
172	NC_021847	ATTGG	2	10	325956	325965	20 %	40 %	40 %	0 %	525950140
173	NC_021847	TCGGG	2	10	329248	329257	0 %	20 %	60 %	20 %	525950142
174	NC_021847	ATTGA	2	10	330333	330342	40 %	40 %	20 %	0 %	525950144
175	NC_021847	ACCCA	2	10	330503	330512	40 %	0 %	0 %	60 %	525950144
176	NC_021847	ATCAG	2	10	331771	331780	40 %	20 %	20 %	20 %	525950145
177	NC_021847	AGTAA	2	10	332909	332918	60 %	20 %	20 %	0 %	525950146
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179	NC_021847	AAGTG	2	10	342564	342573	40 %	20 %	40 %	0 %	525950149
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191	NC_021847	TTTGG	2	10	362712	362721	0 %	60 %	40 %	0 %	525950165
192	NC_021847	GATTT	2	10	368693	368702	20 %	60 %	20 %	0 %	525950169
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199	NC_021847	GGTAC	2	10	389437	389446	20 %	20 %	40 %	20 %	525950190
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209	NC_021847	TTGAT	2	10	402617	402626	20 %	60 %	20 %	0 %	525950201
210	NC_021847	GACCT	2	10	403273	403282	20 %	20 %	20 %	40 %	525950202
211	NC_021847	GCCAT	2	10	403353	403362	20 %	20 %	20 %	40 %	525950202
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222	NC_021847	ATCGG	2	10	415280	415289	20 %	20 %	40 %	20 %	525950209
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234	NC_021847	TTTTG	2	10	437898	437907	0 %	80 %	20 %	0 %	525950226
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241	NC_021847	ATCAC	2	10	455178	455187	40 %	20 %	0 %	40 %	525950235
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243	NC_021847	ACCAA	2	10	460241	460250	60 %	0 %	0 %	40 %	525950240
244	NC_021847	CAACC	2	10	464189	464198	40 %	0 %	0 %	60 %	525950243
245	NC_021847	GTTTG	2	10	467144	467153	0 %	60 %	40 %	0 %	525950244
246	NC_021847	GATGC	2	10	468084	468093	20 %	20 %	40 %	20 %	525950244
247	NC_021847	CCAAC	2	10	469772	469781	40 %	0 %	0 %	60 %	525950246
248	NC_021847	CTGAG	2	10	470117	470126	20 %	20 %	40 %	20 %	525950246
249	NC_021847	CTCAA	2	10	472948	472957	40 %	20 %	0 %	40 %	525950248
250	NC_021847	CACGC	2	10	473599	473608	20 %	0 %	20 %	60 %	525950248
251	NC_021847	CTTTG	2	10	475651	475660	0 %	60 %	20 %	20 %	525950249
252	NC_021847	ACGGC	2	10	475836	475845	20 %	0 %	40 %	40 %	525950249
253	NC_021847	AAGGA	2	10	477902	477911	60 %	0 %	40 %	0 %	525950251
254	NC_021847	CAAAC	2	10	482073	482082	60 %	0 %	0 %	40 %	525950256
255	NC_021847	CAATC	2	10	482375	482384	40 %	20 %	0 %	40 %	525950256
256	NC_021847	TTTGG	2	10	483750	483759	0 %	60 %	40 %	0 %	525950259
257	NC_021847	GTTGC	2	10	484502	484511	0 %	40 %	40 %	20 %	525950261
258	NC_021847	CGTCA	2	10	488660	488669	20 %	20 %	20 %	40 %	525952362
259	NC_021847	GCGAT	2	10	490204	490213	20 %	20 %	40 %	20 %	525950266
260	NC_021847	AGCGA	2	10	492305	492314	40 %	0 %	40 %	20 %	525950266
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262	NC_021847	AAAGC	2	10	493784	493793	60 %	0 %	20 %	20 %	525950268
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