MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Vibrio parahaemolyticus O1:Kuk str. FDA_R31 chromosome I

Total Repeats: 55669

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_021847	GTG	2	6	160814	160819	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525950022
2502	NC_021847	CT	3	6	160839	160844	0 %	50 %	0 %	50 %	525950022
2503	NC_021847	TCG	2	6	160973	160978	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525950022
2504	NC_021847	GGT	2	6	161004	161009	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525950022
2505	NC_021847	AGA	2	6	161162	161167	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525950022
2506	NC_021847	TGT	2	6	161207	161212	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525950022
2507	NC_021847	AACA	2	8	161227	161234	75 %	0 %	0 %	25 %	525950022
2508	NC_021847	CCA	2	6	161264	161269	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525950022
2509	NC_021847	CA	3	6	161276	161281	50 %	0 %	0 %	50 %	525950022
2510	NC_021847	GAA	2	6	161310	161315	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525950022
2511	NC_021847	CGCA	2	8	161317	161324	25 %	0 %	25 %	50 %	525950022
2512	NC_021847	TCA	2	6	161330	161335	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525950022
2513	NC_021847	ATGA	2	8	161347	161354	50 %	25 %	25 %	0 %	525950022
2514	NC_021847	TCC	2	6	161366	161371	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525950023
2515	NC_021847	CTT	2	6	161385	161390	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525950023
2516	NC_021847	GTAAAC	2	12	161397	161408	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	525950023
2517	NC_021847	CCA	2	6	161430	161435	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525950023
2518	NC_021847	TTC	2	6	161506	161511	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525950023
2519	NC_021847	CAT	2	6	161566	161571	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525950023
2520	NC_021847	CTTCA	2	10	161587	161596	20 %	40 %	0 %	40 %	525950023
2521	NC_021847	AAG	2	6	161603	161608	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525950023
2522	NC_021847	AG	3	6	161630	161635	50 %	0 %	50 %	0 %	525950023
2523	NC_021847	AAC	2	6	161657	161662	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525950023
2524	NC_021847	TCT	2	6	161714	161719	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525950023
2525	NC_021847	CACT	2	8	161864	161871	25 %	25 %	0 %	50 %	525950023
2526	NC_021847	GA	3	6	161898	161903	50 %	0 %	50 %	0 %	525950023
2527	NC_021847	TGG	2	6	161917	161922	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525950023
2528	NC_021847	GAA	2	6	161995	162000	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525950023
2529	NC_021847	CAT	2	6	162040	162045	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525950023
2530	NC_021847	AACC	2	8	162084	162091	50 %	0 %	0 %	50 %	525950023
2531	NC_021847	GCA	2	6	162135	162140	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525950023
2532	NC_021847	CAAA	2	8	162168	162175	75 %	0 %	0 %	25 %	525950023
2533	NC_021847	CAA	2	6	162238	162243	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525950023
2534	NC_021847	GCC	2	6	162376	162381	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525950023
2535	NC_021847	GCC	2	6	162412	162417	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525950023
2536	NC_021847	TGA	2	6	162465	162470	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525950023
2537	NC_021847	CCA	2	6	162488	162493	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525950023
2538	NC_021847	AAG	2	6	162502	162507	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525950023
2539	NC_021847	AGAA	2	8	162577	162584	75 %	0 %	25 %	0 %	525950023
2540	NC_021847	TAACG	2	10	162592	162601	40 %	20 %	20 %	20 %	525950023
2541	NC_021847	CGTT	2	8	162662	162669	0 %	50 %	25 %	25 %	525950023
2542	NC_021847	AGA	2	6	162693	162698	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525950023
2543	NC_021847	ATG	2	6	162893	162898	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525950023
2544	NC_021847	AAT	2	6	162933	162938	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525950023
2545	NC_021847	TACC	2	8	162981	162988	25 %	25 %	0 %	50 %	525950023
2546	NC_021847	A	6	6	163078	163083	100 %	0 %	0 %	0 %	525950023
2547	NC_021847	GAA	2	6	163569	163574	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525950024
2548	NC_021847	TCG	2	6	163636	163641	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525950024
2549	NC_021847	TCAATT	2	12	163682	163693	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	525950024
2550	NC_021847	TAT	2	6	163754	163759	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525950024
2551	NC_021847	CTA	2	6	163763	163768	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525950024
2552	NC_021847	GTT	2	6	163857	163862	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525952322
2553	NC_021847	GGT	2	6	163941	163946	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525952322
2554	NC_021847	GCA	2	6	163977	163982	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525952322
2555	NC_021847	CGG	2	6	164042	164047	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525952322
2556	NC_021847	TGC	2	6	164083	164088	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525952322
2557	NC_021847	TTGC	2	8	164097	164104	0 %	50 %	25 %	25 %	525952322
2558	NC_021847	GT	3	6	164193	164198	0 %	50 %	50 %	0 %	525952322
2559	NC_021847	ATC	2	6	164202	164207	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525952322
2560	NC_021847	GGCGTT	2	12	164241	164252	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	525952322
2561	NC_021847	TGG	2	6	164333	164338	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525952322
2562	NC_021847	TC	3	6	164416	164421	0 %	50 %	0 %	50 %	525952322
2563	NC_021847	GTG	2	6	164511	164516	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525952322
2564	NC_021847	TGA	2	6	164593	164598	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525952322
2565	NC_021847	ATC	2	6	164625	164630	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525952322
2566	NC_021847	TTC	2	6	164634	164639	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525952322
2567	NC_021847	CAG	2	6	164719	164724	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525952322
2568	NC_021847	TGA	2	6	164846	164851	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525952322
2569	NC_021847	TGC	2	6	164888	164893	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525952322
2570	NC_021847	CAT	2	6	164921	164926	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525952322
2571	NC_021847	GGT	2	6	164988	164993	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525952322
2572	NC_021847	GCG	2	6	164997	165002	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525952322
2573	NC_021847	AGA	2	6	165094	165099	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525952322
2574	NC_021847	GCT	2	6	165104	165109	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525952322
2575	NC_021847	GGC	2	6	165212	165217	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525952322
2576	NC_021847	TCC	2	6	165219	165224	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525952322
2577	NC_021847	TGA	2	6	165238	165243	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525952322
2578	NC_021847	CAA	2	6	165266	165271	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525952322
2579	NC_021847	GTATCA	2	12	165301	165312	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	525952322
2580	NC_021847	GCA	2	6	165382	165387	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525952322
2581	NC_021847	TCG	2	6	165448	165453	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525952322
2582	NC_021847	CAG	2	6	165475	165480	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525952322
2583	NC_021847	AAG	2	6	165490	165495	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525952322
2584	NC_021847	AAG	2	6	165775	165780	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525950025
2585	NC_021847	AAGTT	2	10	165859	165868	40 %	40 %	20 %	0 %	525950025
2586	NC_021847	TC	3	6	165906	165911	0 %	50 %	0 %	50 %	525950025
2587	NC_021847	CAA	2	6	165960	165965	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525950025
2588	NC_021847	AG	3	6	166049	166054	50 %	0 %	50 %	0 %	525950025
2589	NC_021847	TAC	2	6	166092	166097	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525950025
2590	NC_021847	CTT	2	6	166355	166360	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525950026
2591	NC_021847	TCAT	2	8	166414	166421	25 %	50 %	0 %	25 %	525950026
2592	NC_021847	AGA	2	6	166472	166477	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525950026
2593	NC_021847	TAC	2	6	166620	166625	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525950026
2594	NC_021847	ACA	3	9	166664	166672	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525950026
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2596	NC_021847	ACC	2	6	166724	166729	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525950027
2597	NC_021847	CGA	2	6	166773	166778	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525950027
2598	NC_021847	GC	3	6	166804	166809	0 %	0 %	50 %	50 %	525950027
2599	NC_021847	CAGC	2	8	166828	166835	25 %	0 %	25 %	50 %	525950027
2600	NC_021847	GCA	2	6	166886	166891	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525950027
2601	NC_021847	ATT	2	6	166961	166966	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525950027
2602	NC_021847	GGC	2	6	167078	167083	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525950027
2603	NC_021847	TCAGC	2	10	167154	167163	20 %	20 %	20 %	40 %	525950027
2604	NC_021847	TTG	2	6	167183	167188	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525950027
2605	NC_021847	AAG	2	6	167225	167230	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525950027
2606	NC_021847	GGC	2	6	167309	167314	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525950027
2607	NC_021847	AACA	2	8	167352	167359	75 %	0 %	0 %	25 %	525950027
2608	NC_021847	GGC	2	6	167387	167392	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525950027
2609	NC_021847	CT	3	6	167434	167439	0 %	50 %	0 %	50 %	525950027
2610	NC_021847	CTCA	2	8	167453	167460	25 %	25 %	0 %	50 %	525950027
2611	NC_021847	TCT	2	6	167496	167501	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525950027
2612	NC_021847	CAG	2	6	167509	167514	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525950027
2613	NC_021847	TCG	2	6	167526	167531	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525950027
2614	NC_021847	CAG	3	9	167553	167561	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525950027
2615	NC_021847	TGGC	2	8	167613	167620	0 %	25 %	50 %	25 %	525950027
2616	NC_021847	TCA	2	6	167657	167662	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525950027
2617	NC_021847	ACG	2	6	167733	167738	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525950027
2618	NC_021847	ACCATC	2	12	167741	167752	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	525950027
2619	NC_021847	ATA	2	6	167805	167810	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525950027
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2621	NC_021847	ACAA	2	8	167991	167998	75 %	0 %	0 %	25 %	525950027
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2747	NC_021847	A	7	7	174771	174777	100 %	0 %	0 %	0 %	525950030
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2986	NC_021847	CTT	2	6	196230	196235	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525950041
2987	NC_021847	AC	3	6	196242	196247	50 %	0 %	0 %	50 %	525950041
2988	NC_021847	TTGC	2	8	196398	196405	0 %	50 %	25 %	25 %	525950042
2989	NC_021847	GTC	2	6	196418	196423	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525950042
2990	NC_021847	T	6	6	196457	196462	0 %	100 %	0 %	0 %	525950042
2991	NC_021847	GA	3	6	196484	196489	50 %	0 %	50 %	0 %	525950042
2992	NC_021847	GCA	2	6	196642	196647	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525950042
2993	NC_021847	TAGT	2	8	196648	196655	25 %	50 %	25 %	0 %	525950042
2994	NC_021847	GAA	2	6	196715	196720	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525950042
2995	NC_021847	TTGA	2	8	196749	196756	25 %	50 %	25 %	0 %	525950042
2996	NC_021847	TGC	2	6	196832	196837	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525950042
2997	NC_021847	CAT	2	6	196862	196867	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525950042
2998	NC_021847	CTG	3	9	197113	197121	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525950042
2999	NC_021847	CCAA	2	8	197237	197244	50 %	0 %	0 %	50 %	525950042
3000	NC_021847	CAA	2	6	197257	197262	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525950042

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