MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Vibrio parahaemolyticus O1:K33 str. CDC_K4557 chromosome II

Total Repeats: 29913

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
20501	NC_021822	TCA	2	6	1237606	1237611	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525853748
20502	NC_021822	CAA	3	9	1237616	1237624	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525853748
20503	NC_021822	TAT	2	6	1237759	1237764	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525853749
20504	NC_021822	ATC	3	9	1237769	1237777	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525853749
20505	NC_021822	ACC	2	6	1238003	1238008	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525853749
20506	NC_021822	TC	3	6	1238016	1238021	0 %	50 %	0 %	50 %	525853749
20507	NC_021822	TGT	2	6	1238023	1238028	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525853749
20508	NC_021822	TAG	2	6	1238061	1238066	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525853749
20509	NC_021822	CAC	2	6	1238109	1238114	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525853749
20510	NC_021822	AAAC	2	8	1238125	1238132	75 %	0 %	0 %	25 %	525853749
20511	NC_021822	ATG	3	9	1238133	1238141	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525853749
20512	NC_021822	GCCC	2	8	1238195	1238202	0 %	0 %	25 %	75 %	525853749
20513	NC_021822	TTG	2	6	1238204	1238209	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525853749
20514	NC_021822	ACA	2	6	1238220	1238225	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525853749
20515	NC_021822	ACGGT	2	10	1238235	1238244	20 %	20 %	40 %	20 %	525853749
20516	NC_021822	AGA	2	6	1238251	1238256	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525853749
20517	NC_021822	ACA	2	6	1238319	1238324	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525853749
20518	NC_021822	GCA	2	6	1238335	1238340	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525853749
20519	NC_021822	ATT	2	6	1238364	1238369	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525853749
20520	NC_021822	TCA	2	6	1238748	1238753	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525853750
20521	NC_021822	AAG	2	6	1238812	1238817	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525853750
20522	NC_021822	CTT	3	9	1238829	1238837	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525853750
20523	NC_021822	GAT	2	6	1238838	1238843	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525853750
20524	NC_021822	TGA	2	6	1238911	1238916	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525853750
20525	NC_021822	GTTT	2	8	1238937	1238944	0 %	75 %	25 %	0 %	525853750
20526	NC_021822	GTA	2	6	1238991	1238996	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525853750
20527	NC_021822	AAC	3	9	1238997	1239005	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525853750
20528	NC_021822	AAC	2	6	1239056	1239061	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525853750
20529	NC_021822	CAG	3	9	1239070	1239078	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525853750
20530	NC_021822	GAC	2	6	1239086	1239091	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525853750
20531	NC_021822	CGG	2	6	1239100	1239105	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525853750
20532	NC_021822	GGT	2	6	1239174	1239179	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525853750
20533	NC_021822	CTG	2	6	1239244	1239249	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525853750
20534	NC_021822	TG	3	6	1239256	1239261	0 %	50 %	50 %	0 %	525853750
20535	NC_021822	CAT	2	6	1239498	1239503	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525853751
20536	NC_021822	CGC	2	6	1239522	1239527	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525853751
20537	NC_021822	AGA	2	6	1239618	1239623	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525853751
20538	NC_021822	TCG	2	6	1239662	1239667	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525853751
20539	NC_021822	GCCA	2	8	1239676	1239683	25 %	0 %	25 %	50 %	525853751
20540	NC_021822	GACAA	2	10	1239782	1239791	60 %	0 %	20 %	20 %	525853751
20541	NC_021822	GAA	2	6	1239799	1239804	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525853751
20542	NC_021822	ATG	2	6	1239850	1239855	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525853751
20543	NC_021822	TCA	2	6	1239953	1239958	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525853751
20544	NC_021822	AAG	2	6	1239962	1239967	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525853751
20545	NC_021822	CGA	2	6	1240004	1240009	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525853751
20546	NC_021822	TAC	2	6	1240011	1240016	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525853751
20547	NC_021822	CAA	2	6	1240036	1240041	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525853751
20548	NC_021822	TGC	2	6	1240125	1240130	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525853752
20549	NC_021822	ACC	2	6	1240145	1240150	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525853752
20550	NC_021822	CAA	2	6	1240169	1240174	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525853752
20551	NC_021822	T	6	6	1240175	1240180	0 %	100 %	0 %	0 %	525853752
20552	NC_021822	TAC	2	6	1240247	1240252	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525853752
20553	NC_021822	TTTG	2	8	1240288	1240295	0 %	75 %	25 %	0 %	525853752
20554	NC_021822	TTGC	2	8	1240298	1240305	0 %	50 %	25 %	25 %	525853752
20555	NC_021822	TTG	2	6	1240352	1240357	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525853752
20556	NC_021822	GCG	2	6	1240464	1240469	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525853752
20557	NC_021822	TTGGTT	2	12	1240487	1240498	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525853752
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20560	NC_021822	ACA	2	6	1240755	1240760	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525854401
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20563	NC_021822	TGT	2	6	1241124	1241129	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525853753
20564	NC_021822	CGC	2	6	1241131	1241136	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525853753
20565	NC_021822	TTG	2	6	1241144	1241149	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525853753
20566	NC_021822	CTTT	2	8	1241175	1241182	0 %	75 %	0 %	25 %	525853753
20567	NC_021822	TGA	2	6	1241216	1241221	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525853753
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20569	NC_021822	A	7	7	1241421	1241427	100 %	0 %	0 %	0 %	525853753
20570	NC_021822	GGTT	2	8	1241437	1241444	0 %	50 %	50 %	0 %	525853753
20571	NC_021822	CTT	2	6	1241484	1241489	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525853753
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20574	NC_021822	TTGT	2	8	1241556	1241563	0 %	75 %	25 %	0 %	525853753
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20582	NC_021822	AGT	2	6	1241981	1241986	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525853754
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20584	NC_021822	TTC	2	6	1242020	1242025	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525853754
20585	NC_021822	AC	3	6	1242029	1242034	50 %	0 %	0 %	50 %	525853754
20586	NC_021822	TGAAGT	2	12	1242228	1242239	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525853755
20587	NC_021822	A	6	6	1242256	1242261	100 %	0 %	0 %	0 %	525853755
20588	NC_021822	A	7	7	1242328	1242334	100 %	0 %	0 %	0 %	525853755
20589	NC_021822	ACA	2	6	1242464	1242469	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525853755
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20599	NC_021822	GC	3	6	1243092	1243097	0 %	0 %	50 %	50 %	525853756
20600	NC_021822	AAT	2	6	1243109	1243114	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525853756
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20605	NC_021822	CG	3	6	1243364	1243369	0 %	0 %	50 %	50 %	525853756
20606	NC_021822	CAA	2	6	1243389	1243394	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525853756
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20609	NC_021822	TGC	2	6	1243806	1243811	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525853757
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20613	NC_021822	GAAA	2	8	1243999	1244006	75 %	0 %	25 %	0 %	525853757
20614	NC_021822	GTGTT	2	10	1244045	1244054	0 %	60 %	40 %	0 %	525853757
20615	NC_021822	ACG	2	6	1244202	1244207	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525853757
20616	NC_021822	AGAA	2	8	1244246	1244253	75 %	0 %	25 %	0 %	525853757
20617	NC_021822	A	6	6	1244280	1244285	100 %	0 %	0 %	0 %	525853757
20618	NC_021822	CTAC	2	8	1244308	1244315	25 %	25 %	0 %	50 %	525853757
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20620	NC_021822	AG	3	6	1244359	1244364	50 %	0 %	50 %	0 %	525853758
20621	NC_021822	CTAC	2	8	1244446	1244453	25 %	25 %	0 %	50 %	525853758
20622	NC_021822	CTAT	2	8	1244496	1244503	25 %	50 %	0 %	25 %	525853758
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20625	NC_021822	TGA	3	9	1244650	1244658	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525853758
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20733	NC_021822	TGG	2	6	1251237	1251242	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525853764
20734	NC_021822	TCA	2	6	1251262	1251267	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525853764
20735	NC_021822	CAT	2	6	1251269	1251274	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525853764
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20967	NC_021822	TAT	2	6	1267576	1267581	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525854407
20968	NC_021822	CAA	2	6	1267666	1267671	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525854407
20969	NC_021822	GC	3	6	1267717	1267722	0 %	0 %	50 %	50 %	525854407
20970	NC_021822	GCT	2	6	1267734	1267739	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525854407
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20972	NC_021822	AGC	2	6	1267872	1267877	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525854407
20973	NC_021822	GATA	2	8	1267906	1267913	50 %	25 %	25 %	0 %	525854407
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20975	NC_021822	CTC	2	6	1270371	1270376	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525854408
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20979	NC_021822	TGA	2	6	1270679	1270684	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525854408
20980	NC_021822	TCG	2	6	1270696	1270701	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525854408
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20982	NC_021822	TCTA	2	8	1270746	1270753	25 %	50 %	0 %	25 %	525854408
20983	NC_021822	GT	3	6	1270754	1270759	0 %	50 %	50 %	0 %	525854408
20984	NC_021822	TCA	2	6	1270792	1270797	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525854408
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20994	NC_021822	GCA	2	6	1271582	1271587	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525853777
20995	NC_021822	ATT	2	6	1271610	1271615	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525853777
20996	NC_021822	TTC	2	6	1271630	1271635	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525853777
20997	NC_021822	TGC	2	6	1271638	1271643	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525853777
20998	NC_021822	CAG	2	6	1271672	1271677	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525853777
20999	NC_021822	CGA	2	6	1271753	1271758	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525853777
21000	NC_021822	ATCC	2	8	1271765	1271772	25 %	25 %	0 %	50 %	525853777

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