MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Vibrio parahaemolyticus O1:K33 str. CDC_K4557 chromosome II

Total Repeats: 29913

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_021822	TGC	2	6	66592	66597	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525852895
1002	NC_021822	CTG	2	6	66608	66613	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525852895
1003	NC_021822	AAGG	2	8	66738	66745	50 %	0 %	50 %	0 %	525852895
1004	NC_021822	CTT	2	6	66765	66770	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525852895
1005	NC_021822	TCA	2	6	66959	66964	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525852895
1006	NC_021822	TGT	2	6	67037	67042	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525852895
1007	NC_021822	GAT	2	6	67044	67049	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525852895
1008	NC_021822	TAA	2	6	67069	67074	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525852895
1009	NC_021822	GCT	3	9	67176	67184	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525852895
1010	NC_021822	T	7	7	67233	67239	0 %	100 %	0 %	0 %	525852895
1011	NC_021822	GCT	2	6	67364	67369	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525852895
1012	NC_021822	TGG	2	6	67384	67389	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525852895
1013	NC_021822	TAA	2	6	67440	67445	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525852895
1014	NC_021822	CAA	2	6	67457	67462	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525852895
1015	NC_021822	ACGA	2	8	67491	67498	50 %	0 %	25 %	25 %	525852895
1016	NC_021822	ATA	2	6	67916	67921	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525852896
1017	NC_021822	CTTG	2	8	68012	68019	0 %	50 %	25 %	25 %	525852896
1018	NC_021822	T	6	6	68080	68085	0 %	100 %	0 %	0 %	525852896
1019	NC_021822	CCG	2	6	68111	68116	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525852896
1020	NC_021822	AG	3	6	68127	68132	50 %	0 %	50 %	0 %	525852896
1021	NC_021822	CA	3	6	68205	68210	50 %	0 %	0 %	50 %	525852896
1022	NC_021822	GTT	2	6	68218	68223	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525852896
1023	NC_021822	CCG	2	6	68226	68231	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525852896
1024	NC_021822	GCA	2	6	68254	68259	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525852896
1025	NC_021822	GCCCG	2	10	68431	68440	0 %	0 %	40 %	60 %	525852896
1026	NC_021822	GCG	2	6	68488	68493	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525852896
1027	NC_021822	T	6	6	68521	68526	0 %	100 %	0 %	0 %	525852896
1028	NC_021822	A	6	6	68602	68607	100 %	0 %	0 %	0 %	525852896
1029	NC_021822	GCT	2	6	68734	68739	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525852896
1030	NC_021822	GGGTA	2	10	68787	68796	20 %	20 %	60 %	0 %	525852896
1031	NC_021822	TTG	2	6	68810	68815	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525852896
1032	NC_021822	ATGA	2	8	68840	68847	50 %	25 %	25 %	0 %	525852896
1033	NC_021822	CTT	2	6	68988	68993	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525852896
1034	NC_021822	CGG	2	6	68994	68999	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525852896
1035	NC_021822	GC	3	6	69042	69047	0 %	0 %	50 %	50 %	525852896
1036	NC_021822	GAC	2	6	69069	69074	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525852896
1037	NC_021822	GAA	2	6	69117	69122	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525852896
1038	NC_021822	GCCAT	2	10	69155	69164	20 %	20 %	20 %	40 %	525852896
1039	NC_021822	TTG	2	6	69185	69190	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525852896
1040	NC_021822	TCA	2	6	69215	69220	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525852896
1041	NC_021822	ATC	2	6	69305	69310	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525852896
1042	NC_021822	GTT	2	6	69388	69393	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525852896
1043	NC_021822	T	6	6	69392	69397	0 %	100 %	0 %	0 %	525852896
1044	NC_021822	A	6	6	69658	69663	100 %	0 %	0 %	0 %	525852897
1045	NC_021822	CAA	4	12	69670	69681	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525852897
1046	NC_021822	AGC	2	6	69731	69736	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525852897
1047	NC_021822	ACT	2	6	69765	69770	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525852897
1048	NC_021822	TGAT	2	8	69824	69831	25 %	50 %	25 %	0 %	525852897
1049	NC_021822	AC	3	6	69865	69870	50 %	0 %	0 %	50 %	525852897
1050	NC_021822	GAT	2	6	69946	69951	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525852897
1051	NC_021822	TG	3	6	70000	70005	0 %	50 %	50 %	0 %	525852897
1052	NC_021822	TTA	2	6	70106	70111	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525852897
1053	NC_021822	A	6	6	70167	70172	100 %	0 %	0 %	0 %	525852897
1054	NC_021822	GAC	2	6	70177	70182	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525852897
1055	NC_021822	TTG	2	6	70402	70407	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525852898
1056	NC_021822	AAG	2	6	70454	70459	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525852898
1057	NC_021822	TG	3	6	70477	70482	0 %	50 %	50 %	0 %	525852898
1058	NC_021822	GCG	2	6	70521	70526	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525852898
1059	NC_021822	GGCG	2	8	70544	70551	0 %	0 %	75 %	25 %	525852898
1060	NC_021822	TTTG	2	8	70563	70570	0 %	75 %	25 %	0 %	525852898
1061	NC_021822	TTC	2	6	70587	70592	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525852898
1062	NC_021822	GCC	2	6	70593	70598	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525852898
1063	NC_021822	CG	3	6	70645	70650	0 %	0 %	50 %	50 %	525852898
1064	NC_021822	ACG	2	6	70785	70790	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525852898
1065	NC_021822	AG	3	6	70803	70808	50 %	0 %	50 %	0 %	525852898
1066	NC_021822	TTC	2	6	70866	70871	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525852898
1067	NC_021822	CAC	2	6	70950	70955	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525852898
1068	NC_021822	CTT	2	6	70961	70966	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525852898
1069	NC_021822	TGT	2	6	70979	70984	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525852898
1070	NC_021822	TTG	2	6	71002	71007	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525852898
1071	NC_021822	AGAA	2	8	71030	71037	75 %	0 %	25 %	0 %	525852898
1072	NC_021822	TCT	2	6	71110	71115	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525852898
1073	NC_021822	GTT	2	6	71145	71150	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525852898
1074	NC_021822	TGTT	2	8	71158	71165	0 %	75 %	25 %	0 %	525852898
1075	NC_021822	GCT	2	6	71167	71172	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525852898
1076	NC_021822	T	7	7	71313	71319	0 %	100 %	0 %	0 %	525852898
1077	NC_021822	GTCA	2	8	71346	71353	25 %	25 %	25 %	25 %	525852898
1078	NC_021822	T	6	6	71671	71676	0 %	100 %	0 %	0 %	525852899
1079	NC_021822	CAT	2	6	71810	71815	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525852899
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1081	NC_021822	TGGC	2	8	71997	72004	0 %	25 %	50 %	25 %	525852899
1082	NC_021822	CGA	2	6	72088	72093	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525852899
1083	NC_021822	AAGC	2	8	72094	72101	50 %	0 %	25 %	25 %	525852899
1084	NC_021822	CCCA	2	8	72174	72181	25 %	0 %	0 %	75 %	525852899
1085	NC_021822	GCC	2	6	72195	72200	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525852899
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1087	NC_021822	TGA	2	6	72253	72258	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525852899
1088	NC_021822	TCT	2	6	72317	72322	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525852899
1089	NC_021822	CCA	2	6	72378	72383	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525852899
1090	NC_021822	TG	3	6	72410	72415	0 %	50 %	50 %	0 %	525852899
1091	NC_021822	TTG	2	6	72500	72505	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525852899
1092	NC_021822	CAA	2	6	72542	72547	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525852899
1093	NC_021822	TGG	2	6	72562	72567	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525852899
1094	NC_021822	CCG	2	6	72581	72586	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525852899
1095	NC_021822	CAG	2	6	72614	72619	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525852899
1096	NC_021822	CAC	2	6	72631	72636	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525852899
1097	NC_021822	GTTG	2	8	72709	72716	0 %	50 %	50 %	0 %	525852899
1098	NC_021822	TTGA	2	8	72782	72789	25 %	50 %	25 %	0 %	525852899
1099	NC_021822	GCA	2	6	72946	72951	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525852899
1100	NC_021822	GCA	2	6	72988	72993	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525852899
1101	NC_021822	ATAA	2	8	73005	73012	75 %	25 %	0 %	0 %	525852899
1102	NC_021822	GATT	2	8	73032	73039	25 %	50 %	25 %	0 %	525852900
1103	NC_021822	CAACT	2	10	73049	73058	40 %	20 %	0 %	40 %	525852900
1104	NC_021822	GAT	2	6	73085	73090	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525852900
1105	NC_021822	CAAG	2	8	73117	73124	50 %	0 %	25 %	25 %	525852900
1106	NC_021822	TTACG	2	10	73132	73141	20 %	40 %	20 %	20 %	525852900
1107	NC_021822	CTT	2	6	73165	73170	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525852900
1108	NC_021822	AAG	3	9	73203	73211	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525852900
1109	NC_021822	CAT	2	6	73214	73219	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525852900
1110	NC_021822	GCA	2	6	73276	73281	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525852900
1111	NC_021822	GCAA	2	8	73301	73308	50 %	0 %	25 %	25 %	525852900
1112	NC_021822	TGA	2	6	73327	73332	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525852900
1113	NC_021822	AAC	2	6	73347	73352	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525852900
1114	NC_021822	T	6	6	73405	73410	0 %	100 %	0 %	0 %	525852900
1115	NC_021822	CAG	2	6	73433	73438	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525852900
1116	NC_021822	ATG	2	6	73460	73465	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525852900
1117	NC_021822	CAA	2	6	73552	73557	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525852900
1118	NC_021822	TAA	2	6	73561	73566	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525852900
1119	NC_021822	TTG	2	6	73632	73637	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525852900
1120	NC_021822	CGG	2	6	73785	73790	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525852900
1121	NC_021822	TGC	2	6	73876	73881	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525852900
1122	NC_021822	ATCA	2	8	73893	73900	50 %	25 %	0 %	25 %	525852900
1123	NC_021822	AACA	2	8	73901	73908	75 %	0 %	0 %	25 %	525852900
1124	NC_021822	ATTC	2	8	73933	73940	25 %	50 %	0 %	25 %	525852900
1125	NC_021822	ATTC	2	8	73963	73970	25 %	50 %	0 %	25 %	525852900
1126	NC_021822	GT	3	6	73974	73979	0 %	50 %	50 %	0 %	525852900
1127	NC_021822	ACT	2	6	74043	74048	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525852900
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1241	NC_021822	GAAGA	2	10	81073	81082	60 %	0 %	40 %	0 %	525852908
1242	NC_021822	GTT	2	6	81087	81092	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525852908
1243	NC_021822	ATCG	2	8	81111	81118	25 %	25 %	25 %	25 %	525852908
1244	NC_021822	ATC	2	6	81313	81318	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525852908
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1251	NC_021822	AAC	2	6	81682	81687	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525852908
1252	NC_021822	CGT	2	6	81704	81709	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525852908
1253	NC_021822	CAAC	2	8	81719	81726	50 %	0 %	0 %	50 %	525852908
1254	NC_021822	AGC	2	6	81855	81860	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525852908
1255	NC_021822	ACT	2	6	81962	81967	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525852908
1256	NC_021822	AAC	2	6	82000	82005	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525852908
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1281	NC_021822	CTT	2	6	83181	83186	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525852908
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1283	NC_021822	CAT	2	6	83274	83279	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525852908
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1372	NC_021822	GA	3	6	89181	89186	50 %	0 %	50 %	0 %	525852914
1373	NC_021822	GCGAGT	2	12	89201	89212	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	525852914
1374	NC_021822	ACAGA	2	10	89220	89229	60 %	0 %	20 %	20 %	525852914
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1500	NC_021822	GTT	2	6	96913	96918	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525852918

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