MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Vibrio parahaemolyticus O1:K33 str. CDC_K4557 chromosome II

Total Repeats: 29913

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_021822	AAG	2	6	35530	35535	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525852872
502	NC_021822	TGA	2	6	35652	35657	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525852872
503	NC_021822	TTG	2	6	35740	35745	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525852872
504	NC_021822	GAC	2	6	35895	35900	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525852873
505	NC_021822	AAC	2	6	35903	35908	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525852873
506	NC_021822	T	6	6	35922	35927	0 %	100 %	0 %	0 %	525852873
507	NC_021822	GCA	2	6	35976	35981	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525852873
508	NC_021822	GTG	2	6	35984	35989	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525852873
509	NC_021822	CAAT	2	8	36137	36144	50 %	25 %	0 %	25 %	525852873
510	NC_021822	GCAA	2	8	36219	36226	50 %	0 %	25 %	25 %	525852873
511	NC_021822	CAC	2	6	36462	36467	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525852874
512	NC_021822	CCACA	2	10	36494	36503	40 %	0 %	0 %	60 %	525852874
513	NC_021822	TTC	2	6	36549	36554	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525852874
514	NC_021822	ACC	2	6	36582	36587	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525852874
515	NC_021822	CTT	2	6	36614	36619	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525852874
516	NC_021822	GCA	2	6	36637	36642	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525852874
517	NC_021822	ACA	2	6	36658	36663	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525852874
518	NC_021822	CTT	2	6	36689	36694	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525852874
519	NC_021822	ATG	2	6	36712	36717	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525852874
520	NC_021822	ACA	2	6	36781	36786	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525852874
521	NC_021822	CCA	2	6	36832	36837	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525852874
522	NC_021822	TGT	2	6	36860	36865	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525852874
523	NC_021822	GTG	2	6	36870	36875	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525852874
524	NC_021822	CAT	2	6	36987	36992	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525852874
525	NC_021822	CAG	2	6	37010	37015	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525852874
526	NC_021822	GATG	2	8	37029	37036	25 %	25 %	50 %	0 %	525852874
527	NC_021822	TTC	2	6	37074	37079	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525852874
528	NC_021822	GTT	2	6	37101	37106	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525852874
529	NC_021822	GA	4	8	37214	37221	50 %	0 %	50 %	0 %	525852874
530	NC_021822	AAC	2	6	37355	37360	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525854207
531	NC_021822	CGT	2	6	37363	37368	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525854207
532	NC_021822	T	7	7	37388	37394	0 %	100 %	0 %	0 %	525854207
533	NC_021822	A	7	7	37412	37418	100 %	0 %	0 %	0 %	525854207
534	NC_021822	ATT	2	6	37437	37442	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525854207
535	NC_021822	TG	3	6	37470	37475	0 %	50 %	50 %	0 %	525854207
536	NC_021822	GAA	2	6	37489	37494	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525854207
537	NC_021822	A	6	6	37503	37508	100 %	0 %	0 %	0 %	525854207
538	NC_021822	A	6	6	37537	37542	100 %	0 %	0 %	0 %	525854207
539	NC_021822	CAG	2	6	37599	37604	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525854207
540	NC_021822	T	7	7	37610	37616	0 %	100 %	0 %	0 %	525854207
541	NC_021822	ATG	2	6	37704	37709	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525852875
542	NC_021822	T	6	6	37763	37768	0 %	100 %	0 %	0 %	525852875
543	NC_021822	GTTT	2	8	37794	37801	0 %	75 %	25 %	0 %	525852875
544	NC_021822	TTC	2	6	37820	37825	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525852875
545	NC_021822	AAT	2	6	37893	37898	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525852875
546	NC_021822	ATTG	2	8	37909	37916	25 %	50 %	25 %	0 %	525852875
547	NC_021822	A	6	6	37982	37987	100 %	0 %	0 %	0 %	525852875
548	NC_021822	TTCG	2	8	38110	38117	0 %	50 %	25 %	25 %	525852875
549	NC_021822	TTTG	2	8	38132	38139	0 %	75 %	25 %	0 %	525852875
550	NC_021822	GTCA	2	8	38144	38151	25 %	25 %	25 %	25 %	525852875
551	NC_021822	TGGA	2	8	38220	38227	25 %	25 %	50 %	0 %	525852875
552	NC_021822	CAT	2	6	38323	38328	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525852875
553	NC_021822	TTC	2	6	38339	38344	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525852875
554	NC_021822	T	6	6	38353	38358	0 %	100 %	0 %	0 %	525852875
555	NC_021822	CTC	2	6	38363	38368	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525852875
556	NC_021822	CTT	2	6	38468	38473	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525852875
557	NC_021822	GT	3	6	38559	38564	0 %	50 %	50 %	0 %	525852875
558	NC_021822	GA	3	6	39157	39162	50 %	0 %	50 %	0 %	525854208
559	NC_021822	CGT	2	6	39198	39203	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525854208
560	NC_021822	TCG	2	6	39585	39590	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525852876
561	NC_021822	TGA	2	6	39594	39599	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525852876
562	NC_021822	GAT	2	6	39631	39636	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525852876
563	NC_021822	CATC	2	8	39651	39658	25 %	25 %	0 %	50 %	525852876
564	NC_021822	TCA	2	6	39687	39692	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525852876
565	NC_021822	ATTCA	2	10	39746	39755	40 %	40 %	0 %	20 %	525852876
566	NC_021822	GGC	2	6	39870	39875	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525852876
567	NC_021822	GGTGT	2	10	39883	39892	0 %	40 %	60 %	0 %	525852876
568	NC_021822	GTG	2	6	39916	39921	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525852876
569	NC_021822	TCT	2	6	39924	39929	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525852876
570	NC_021822	TGA	2	6	40022	40027	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525852876
571	NC_021822	CTCA	2	8	40028	40035	25 %	25 %	0 %	50 %	525852876
572	NC_021822	AG	3	6	40069	40074	50 %	0 %	50 %	0 %	525852876
573	NC_021822	AAC	2	6	40103	40108	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525852876
574	NC_021822	ACT	2	6	40145	40150	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525852876
575	NC_021822	ATCA	2	8	40234	40241	50 %	25 %	0 %	25 %	525852876
576	NC_021822	TGC	2	6	40253	40258	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525852876
577	NC_021822	CGT	2	6	40265	40270	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525852876
578	NC_021822	CAG	2	6	40381	40386	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525852876
579	NC_021822	A	7	7	40763	40769	100 %	0 %	0 %	0 %	525854209
580	NC_021822	AAG	2	6	40821	40826	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525854209
581	NC_021822	CAAG	2	8	41034	41041	50 %	0 %	25 %	25 %	525852877
582	NC_021822	CCG	3	9	41168	41176	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525852877
583	NC_021822	TCA	2	6	41216	41221	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525852877
584	NC_021822	ACG	2	6	41320	41325	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525852877
585	NC_021822	GAA	2	6	41770	41775	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525852878
586	NC_021822	TCG	2	6	41796	41801	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525852878
587	NC_021822	ATG	2	6	42050	42055	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525852878
588	NC_021822	GCA	2	6	42056	42061	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525852878
589	NC_021822	ATG	2	6	42101	42106	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525852878
590	NC_021822	CGAC	2	8	42137	42144	25 %	0 %	25 %	50 %	525852878
591	NC_021822	TGA	2	6	42234	42239	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525852878
592	NC_021822	GTT	2	6	42274	42279	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525852878
593	NC_021822	AGA	2	6	42291	42296	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525852878
594	NC_021822	TGG	2	6	42311	42316	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525852878
595	NC_021822	CCG	2	6	42333	42338	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525852878
596	NC_021822	AAC	2	6	42442	42447	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525852878
597	NC_021822	AGA	2	6	42534	42539	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525852878
598	NC_021822	GAT	2	6	42559	42564	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525852878
599	NC_021822	AGA	2	6	42606	42611	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525852878
600	NC_021822	GTA	2	6	42814	42819	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525852878
601	NC_021822	CTG	2	6	42887	42892	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525852878
602	NC_021822	GAC	2	6	43014	43019	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525852878
603	NC_021822	TGG	2	6	43023	43028	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525852878
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605	NC_021822	CGC	2	6	43183	43188	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525852878
606	NC_021822	ACGAA	2	10	43193	43202	60 %	0 %	20 %	20 %	525852878
607	NC_021822	ACA	2	6	43223	43228	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525852878
608	NC_021822	TCTTTG	2	12	43289	43300	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	525852878
609	NC_021822	CTT	2	6	43545	43550	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525852878
610	NC_021822	TGA	2	6	43650	43655	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525852878
611	NC_021822	TGC	2	6	43698	43703	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525852878
612	NC_021822	TCG	2	6	43716	43721	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525852878
613	NC_021822	TGG	2	6	43728	43733	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525852878
614	NC_021822	CAT	2	6	43930	43935	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525852879
615	NC_021822	AT	3	6	43953	43958	50 %	50 %	0 %	0 %	525852879
616	NC_021822	CTA	2	6	43993	43998	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525852879
617	NC_021822	AATC	2	8	43999	44006	50 %	25 %	0 %	25 %	525852879
618	NC_021822	TC	3	6	44133	44138	0 %	50 %	0 %	50 %	525852879
619	NC_021822	AAG	2	6	44190	44195	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525852879
620	NC_021822	GATC	2	8	44221	44228	25 %	25 %	25 %	25 %	525852879
621	NC_021822	CAA	2	6	44275	44280	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525852879
622	NC_021822	GTA	2	6	44330	44335	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525852879
623	NC_021822	TCT	2	6	44373	44378	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525852879
624	NC_021822	GAA	2	6	44471	44476	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525852879
625	NC_021822	TTG	2	6	44484	44489	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525852879
626	NC_021822	CATG	2	8	44494	44501	25 %	25 %	25 %	25 %	525852879
627	NC_021822	CAT	2	6	44512	44517	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525852879
628	NC_021822	CCA	2	6	44620	44625	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525852879
629	NC_021822	TCT	2	6	44667	44672	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525852879
630	NC_021822	AACC	2	8	44677	44684	50 %	0 %	0 %	50 %	525852879
631	NC_021822	TGCA	2	8	44696	44703	25 %	25 %	25 %	25 %	525852879
632	NC_021822	TAACG	2	10	44773	44782	40 %	20 %	20 %	20 %	525852879
633	NC_021822	CGA	2	6	44802	44807	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525852879
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637	NC_021822	CTT	2	6	44929	44934	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525852879
638	NC_021822	GCAG	2	8	44992	44999	25 %	0 %	50 %	25 %	525852879
639	NC_021822	TCT	2	6	45030	45035	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525852879
640	NC_021822	ATCG	2	8	45053	45060	25 %	25 %	25 %	25 %	525852879
641	NC_021822	GTTC	2	8	45081	45088	0 %	50 %	25 %	25 %	525852879
642	NC_021822	GCA	2	6	45186	45191	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525852879
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645	NC_021822	CTG	2	6	45420	45425	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525852880
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650	NC_021822	GTT	2	6	45645	45650	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525852881
651	NC_021822	GCCAC	2	10	45656	45665	20 %	0 %	20 %	60 %	525852881
652	NC_021822	ACC	2	6	45680	45685	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525852881
653	NC_021822	TTG	2	6	45787	45792	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525852881
654	NC_021822	GTT	2	6	45798	45803	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525852881
655	NC_021822	TGT	2	6	45936	45941	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525852881
656	NC_021822	ATT	2	6	46006	46011	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525852881
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658	NC_021822	CGC	2	6	46032	46037	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525852881
659	NC_021822	TAA	2	6	46045	46050	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525852881
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661	NC_021822	CGC	2	6	46132	46137	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525852881
662	NC_021822	TCAA	2	8	46151	46158	50 %	25 %	0 %	25 %	525852881
663	NC_021822	TGCG	2	8	46184	46191	0 %	25 %	50 %	25 %	525852881
664	NC_021822	AAC	2	6	46454	46459	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525852881
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671	NC_021822	ATC	2	6	46685	46690	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525852881
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676	NC_021822	TAA	2	6	46965	46970	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525852881
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680	NC_021822	CAA	2	6	47142	47147	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525852881
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682	NC_021822	TTG	2	6	47327	47332	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525852881
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747	NC_021822	TAG	2	6	51083	51088	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525852884
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751	NC_021822	CATC	2	8	51245	51252	25 %	25 %	0 %	50 %	525852884
752	NC_021822	CAC	2	6	51287	51292	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525852884
753	NC_021822	CTG	2	6	51326	51331	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525852884
754	NC_021822	GACA	2	8	51348	51355	50 %	0 %	25 %	25 %	525852884
755	NC_021822	TGA	2	6	51356	51361	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525852884
756	NC_021822	CAAC	2	8	51407	51414	50 %	0 %	0 %	50 %	525852884
757	NC_021822	GCC	2	6	51478	51483	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525852884
758	NC_021822	CGATGA	2	12	51554	51565	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	525852884
759	NC_021822	CCA	2	6	51641	51646	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525852884
760	NC_021822	GGC	2	6	51795	51800	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525852884
761	NC_021822	TGCG	2	8	51806	51813	0 %	25 %	50 %	25 %	525852884
762	NC_021822	AG	4	8	51953	51960	50 %	0 %	50 %	0 %	525854210
763	NC_021822	AGG	2	6	51962	51967	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	525854210
764	NC_021822	GCA	2	6	51974	51979	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525854210
765	NC_021822	TAA	2	6	52699	52704	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525852885
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767	NC_021822	TGG	2	6	52814	52819	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525852885
768	NC_021822	TAC	2	6	52824	52829	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525852885
769	NC_021822	CAC	2	6	52881	52886	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525852885
770	NC_021822	CTG	2	6	52909	52914	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525852885
771	NC_021822	ACT	2	6	52934	52939	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525852885
772	NC_021822	CGG	2	6	53252	53257	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525852885
773	NC_021822	CAG	2	6	53305	53310	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525852885
774	NC_021822	GCG	2	6	53343	53348	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525852885
775	NC_021822	CAAG	2	8	53393	53400	50 %	0 %	25 %	25 %	525852885
776	NC_021822	ACG	2	6	53475	53480	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525852885
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778	NC_021822	ACC	3	9	53864	53872	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525852886
779	NC_021822	TGCAT	2	10	53899	53908	20 %	40 %	20 %	20 %	525852886
780	NC_021822	GCA	2	6	54056	54061	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525852886
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783	NC_021822	GGT	2	6	54201	54206	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525852886
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785	NC_021822	GGA	2	6	54470	54475	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	525852886
786	NC_021822	TGC	2	6	54604	54609	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525852886
787	NC_021822	TGG	2	6	54634	54639	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525852886
788	NC_021822	ATTT	2	8	54743	54750	25 %	75 %	0 %	0 %	525852886
789	NC_021822	GTCG	2	8	54754	54761	0 %	25 %	50 %	25 %	525852886
790	NC_021822	T	6	6	54764	54769	0 %	100 %	0 %	0 %	525852886
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793	NC_021822	TGG	2	6	54870	54875	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525852886
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875	NC_021822	TGT	2	6	58852	58857	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525852889
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880	NC_021822	G	6	6	59049	59054	0 %	0 %	100 %	0 %	525852889
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