MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Vibrio parahaemolyticus O1:Kuk str. FDA_R31 chromosome II

Total Repeats: 20881

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021821	ATT	2	6	2455	2460	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525848541
2	NC_021821	GAA	2	6	2471	2476	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525848541
3	NC_021821	TCT	2	6	2481	2486	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525848541
4	NC_021821	CCA	2	6	2536	2541	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525848541
5	NC_021821	CAA	2	6	2550	2555	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525848541
6	NC_021821	TGA	2	6	2609	2614	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525848541
7	NC_021821	AAT	2	6	2646	2651	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525848541
8	NC_021821	ATC	2	6	2655	2660	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525848541
9	NC_021821	GAA	2	6	2702	2707	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525848541
10	NC_021821	ACA	2	6	2750	2755	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525848541
11	NC_021821	TCA	2	6	2756	2761	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525848541
12	NC_021821	GAC	2	6	2835	2840	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525848542
13	NC_021821	CAA	2	6	2898	2903	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525848542
14	NC_021821	TCA	2	6	3200	3205	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525848542
15	NC_021821	CAA	2	6	3222	3227	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525848542
16	NC_021821	TTG	2	6	3239	3244	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525848542
17	NC_021821	GAA	2	6	3470	3475	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525848543
18	NC_021821	AAC	2	6	3519	3524	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525848543
19	NC_021821	TCT	2	6	3701	3706	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525848543
20	NC_021821	CTT	2	6	3727	3732	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525847174
21	NC_021821	CAT	2	6	3741	3746	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525847174
22	NC_021821	TCT	2	6	3892	3897	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525847174
23	NC_021821	CAT	2	6	3957	3962	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525847174
24	NC_021821	GCT	2	6	4035	4040	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525847174
25	NC_021821	CTG	2	6	4054	4059	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525847174
26	NC_021821	TCT	3	9	4157	4165	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525847174
27	NC_021821	GCT	2	6	4409	4414	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525847175
28	NC_021821	CTT	2	6	4445	4450	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525847175
29	NC_021821	TAA	2	6	4457	4462	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525847175
30	NC_021821	CCA	2	6	4478	4483	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525847175
31	NC_021821	TGA	2	6	4665	4670	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525847175
32	NC_021821	GCG	2	6	4740	4745	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525847175
33	NC_021821	ATC	2	6	4746	4751	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525847175
34	NC_021821	TCA	2	6	4789	4794	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525847175
35	NC_021821	CGA	2	6	4833	4838	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525847175
36	NC_021821	CGC	2	6	4880	4885	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525847175
37	NC_021821	ACG	2	6	4904	4909	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525847175
38	NC_021821	TTG	2	6	4917	4922	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525847175
39	NC_021821	TTG	2	6	4926	4931	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525847175
40	NC_021821	CTT	2	6	4967	4972	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525847175
41	NC_021821	TGA	2	6	5047	5052	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525847176
42	NC_021821	GGT	2	6	5073	5078	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525847176
43	NC_021821	CAT	2	6	5140	5145	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525847176
44	NC_021821	TTC	2	6	5357	5362	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525847176
45	NC_021821	TTG	2	6	5366	5371	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525847176
46	NC_021821	AGA	2	6	5389	5394	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525847176
47	NC_021821	GCT	2	6	5462	5467	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525847176
48	NC_021821	TCA	2	6	5585	5590	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525847176
49	NC_021821	CAG	2	6	5595	5600	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525847176
50	NC_021821	TCA	2	6	5612	5617	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525847176
51	NC_021821	ACC	2	6	5650	5655	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525847176
52	NC_021821	CGA	2	6	5706	5711	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525847176
53	NC_021821	CTT	2	6	5761	5766	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525847176
54	NC_021821	TTC	2	6	5770	5775	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525847176
55	NC_021821	AAC	2	6	5965	5970	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525847176
56	NC_021821	CAC	2	6	5973	5978	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525847176
57	NC_021821	TTC	2	6	6019	6024	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525847176
58	NC_021821	GAT	2	6	6071	6076	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525847176
59	NC_021821	ATA	2	6	7284	7289	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525847177
60	NC_021821	CTG	2	6	7328	7333	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525847177
61	NC_021821	TCA	2	6	7387	7392	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525847177
62	NC_021821	CTG	2	6	7397	7402	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525847177
63	NC_021821	TTA	2	6	7441	7446	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525847177
64	NC_021821	GAT	2	6	7493	7498	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525847177
65	NC_021821	CTG	2	6	7535	7540	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525847177
66	NC_021821	CTT	2	6	7541	7546	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525847177
67	NC_021821	TCA	2	6	7547	7552	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525847177
68	NC_021821	CTC	2	6	7569	7574	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525847177
69	NC_021821	TCT	3	9	7681	7689	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525847177
70	NC_021821	CAA	2	6	8035	8040	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525847178
71	NC_021821	GTC	2	6	8121	8126	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525847178
72	NC_021821	CTT	2	6	8140	8145	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525847178
73	NC_021821	TGT	2	6	8197	8202	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525847178
74	NC_021821	ACG	2	6	8368	8373	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525847179
75	NC_021821	CAA	2	6	8484	8489	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525847179
76	NC_021821	TCT	2	6	8500	8505	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525847179
77	NC_021821	TCA	2	6	8563	8568	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525847179
78	NC_021821	TTA	2	6	8623	8628	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525847179
79	NC_021821	ACC	2	6	8635	8640	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525847179
80	NC_021821	TTG	2	6	8843	8848	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525847180
81	NC_021821	CAG	2	6	8866	8871	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525847180
82	NC_021821	TTG	2	6	8937	8942	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525847180
83	NC_021821	GCA	2	6	9235	9240	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525848544
84	NC_021821	AAC	2	6	9279	9284	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525848544
85	NC_021821	TTG	2	6	9357	9362	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525848544
86	NC_021821	TGC	2	6	9511	9516	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525848544
87	NC_021821	GCA	2	6	9571	9576	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525848544
88	NC_021821	AAT	2	6	9652	9657	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525848544
89	NC_021821	ATT	2	6	9789	9794	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525848544
90	NC_021821	AAC	2	6	10157	10162	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525848545
91	NC_021821	TCA	2	6	10213	10218	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525848545
92	NC_021821	GGA	2	6	10536	10541	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	525848545
93	NC_021821	TGA	2	6	10616	10621	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525848545
94	NC_021821	ATG	2	6	10673	10678	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525848545
95	NC_021821	AGC	2	6	10713	10718	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525848545
96	NC_021821	AGA	2	6	10809	10814	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525848545
97	NC_021821	ACA	2	6	10825	10830	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525848545
98	NC_021821	CAA	2	6	11383	11388	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525848545
99	NC_021821	TTC	2	6	11430	11435	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525848545
100	NC_021821	GCA	2	6	11563	11568	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525848545
101	NC_021821	TAA	2	6	11578	11583	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525848545
102	NC_021821	GCA	2	6	11753	11758	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525848546
103	NC_021821	TGA	2	6	11769	11774	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525848546
104	NC_021821	GAT	2	6	11779	11784	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525848546
105	NC_021821	TGT	2	6	11785	11790	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525848546
106	NC_021821	AGT	2	6	11791	11796	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525848546
107	NC_021821	GCA	2	6	12034	12039	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525848546
108	NC_021821	GAA	2	6	12059	12064	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525848546
109	NC_021821	CTG	2	6	12164	12169	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525848546
110	NC_021821	CAC	2	6	12253	12258	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525848546
111	NC_021821	TCA	2	6	12267	12272	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525848546
112	NC_021821	TTC	2	6	12525	12530	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525848546
113	NC_021821	TTC	2	6	12541	12546	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525848546
114	NC_021821	ACC	2	6	12572	12577	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525848546
115	NC_021821	TTC	2	6	12659	12664	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525848546
116	NC_021821	TGA	2	6	12694	12699	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525848546
117	NC_021821	CTA	2	6	12975	12980	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525847181
118	NC_021821	TCT	2	6	13022	13027	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525847181
119	NC_021821	TTA	2	6	13082	13087	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525847181
120	NC_021821	CAA	2	6	13098	13103	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525847181
121	NC_021821	TCA	2	6	13158	13163	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525847181
122	NC_021821	ATT	2	6	13180	13185	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525847181
123	NC_021821	AAT	2	6	13204	13209	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525847181
124	NC_021821	AAC	2	6	13298	13303	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525847181
125	NC_021821	CGG	2	6	13677	13682	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525847181
126	NC_021821	GTT	2	6	13698	13703	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525847181
127	NC_021821	CGC	2	6	13918	13923	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525847182
128	NC_021821	ACA	2	6	13963	13968	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525847182
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238	NC_021821	CAT	2	6	23854	23859	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525848553
239	NC_021821	CGA	2	6	23860	23865	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525848553
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245	NC_021821	AGA	2	6	24478	24483	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525848553
246	NC_021821	CCA	2	6	24485	24490	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525848553
247	NC_021821	CGA	2	6	24596	24601	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525848553
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250	NC_021821	GAA	2	6	24698	24703	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525848553
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252	NC_021821	ACA	2	6	24786	24791	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525848553
253	NC_021821	CAG	2	6	24799	24804	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525848553
254	NC_021821	TGA	2	6	25670	25675	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525847187
255	NC_021821	TGT	2	6	25755	25760	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525847187
256	NC_021821	GAC	2	6	25911	25916	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525847187
257	NC_021821	TCA	2	6	26284	26289	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525847188
258	NC_021821	CGT	2	6	26389	26394	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525847188
259	NC_021821	AAT	2	6	26435	26440	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525847188
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261	NC_021821	CCA	2	6	28042	28047	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525848555
262	NC_021821	CAT	3	9	28126	28134	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525848555
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265	NC_021821	AAT	2	6	28359	28364	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525848556
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267	NC_021821	TAG	2	6	28526	28531	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525848556
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269	NC_021821	CAG	2	6	28791	28796	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525847189
270	NC_021821	TGA	2	6	28814	28819	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525847189
271	NC_021821	GCC	2	6	28899	28904	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525847189
272	NC_021821	CAT	2	6	28937	28942	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525847189
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281	NC_021821	TGT	2	6	29764	29769	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525847190
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284	NC_021821	TGA	2	6	30534	30539	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525847190
285	NC_021821	GGT	2	6	30566	30571	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525847190
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288	NC_021821	TCT	2	6	30907	30912	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525847191
289	NC_021821	TCC	2	6	31125	31130	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525847191
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498	NC_021821	ATT	2	6	51435	51440	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525847203
499	NC_021821	GGA	2	6	51552	51557	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	525847203
500	NC_021821	TCA	2	6	51581	51586	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525847203

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