MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Vibrio parahaemolyticus BB22OP chromosome 2

Total Repeats: 19992

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019971	TGA	2	6	1159	1164	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433659171
2	NC_019971	AAG	2	6	1186	1191	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	433659171
3	NC_019971	CTG	2	6	1230	1235	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433659171
4	NC_019971	CAG	2	6	1318	1323	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433659171
5	NC_019971	CAA	2	6	1341	1346	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	433659171
6	NC_019971	TTG	2	6	1353	1358	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	433659171
7	NC_019971	TGC	2	6	1384	1389	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433659171
8	NC_019971	TGC	2	6	1479	1484	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433659171
9	NC_019971	CAA	2	6	1527	1532	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	433659171
10	NC_019971	TTG	2	6	1613	1618	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	433659171
11	NC_019971	CCA	2	6	1640	1645	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433659171
12	NC_019971	ATG	2	6	1646	1651	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433659171
13	NC_019971	CAC	2	6	1719	1724	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433659171
14	NC_019971	GAT	2	6	1820	1825	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433659171
15	NC_019971	TGA	2	6	1827	1832	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433659171
16	NC_019971	GTT	2	6	1843	1848	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	433659171
17	NC_019971	ATC	2	6	1872	1877	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433659171
18	NC_019971	CGC	2	6	1923	1928	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433659171
19	NC_019971	AGA	2	6	2128	2133	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	433659171
20	NC_019971	CGT	2	6	2202	2207	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433659171
21	NC_019971	GAA	2	6	2213	2218	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	433659171
22	NC_019971	CTA	2	6	2219	2224	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433659171
23	NC_019971	ATT	2	6	2232	2237	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	433659171
24	NC_019971	TCT	2	6	2238	2243	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	433659171
25	NC_019971	CCA	2	6	2249	2254	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433659171
26	NC_019971	TGC	2	6	2556	2561	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433659171
27	NC_019971	CAG	2	6	2651	2656	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433659171
28	NC_019971	CAT	2	6	2674	2679	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433659171
29	NC_019971	AGA	2	6	2884	2889	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	433659171
30	NC_019971	TTG	3	9	3500	3508	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	433659172
31	NC_019971	TGC	2	6	3620	3625	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433659172
32	NC_019971	CAG	2	6	3723	3728	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433659172
33	NC_019971	TTG	2	6	3743	3748	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	433659172
34	NC_019971	AGG	2	6	3862	3867	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	433659172
35	NC_019971	CAT	2	6	3875	3880	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433659172
36	NC_019971	TCA	2	6	3932	3937	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433659173
37	NC_019971	CTG	2	6	3947	3952	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433659173
38	NC_019971	AGT	2	6	3981	3986	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433659173
39	NC_019971	CAA	2	6	4045	4050	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	433659173
40	NC_019971	TTC	2	6	4135	4140	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	433659173
41	NC_019971	ATT	2	6	4280	4285	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	433659173
42	NC_019971	CCG	2	6	4334	4339	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433659173
43	NC_019971	TCT	2	6	4370	4375	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	433659173
44	NC_019971	CCA	2	6	4383	4388	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433659173
45	NC_019971	TGC	2	6	4430	4435	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433659173
46	NC_019971	GAT	2	6	4467	4472	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433659173
47	NC_019971	TCT	2	6	4736	4741	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	433659173
48	NC_019971	GAA	4	12	6086	6097	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	433659174
49	NC_019971	CAG	2	6	6129	6134	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433659174
50	NC_019971	GAA	2	6	6191	6196	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	433659174
51	NC_019971	CCA	2	6	6565	6570	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433659175
52	NC_019971	ACT	2	6	6577	6582	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433659175
53	NC_019971	TTG	2	6	6598	6603	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	433659175
54	NC_019971	ACA	2	6	6700	6705	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	433659175
55	NC_019971	TCC	2	6	6745	6750	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	433659175
56	NC_019971	ACC	2	6	6859	6864	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433659175
57	NC_019971	TGA	2	6	6877	6882	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433659175
58	NC_019971	ATG	2	6	6972	6977	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433659175
59	NC_019971	TCG	2	6	7150	7155	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433659175
60	NC_019971	GCG	2	6	7165	7170	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433659175
61	NC_019971	TGC	2	6	7171	7176	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433659175
62	NC_019971	AGG	2	6	7189	7194	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	433659175
63	NC_019971	CAA	2	6	7214	7219	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	433659175
64	NC_019971	GAT	2	6	7242	7247	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433659175
65	NC_019971	TGC	2	6	7286	7291	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433659175
66	NC_019971	TGA	2	6	7357	7362	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433659175
67	NC_019971	CAA	2	6	7364	7369	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	433659175
68	NC_019971	AAG	2	6	7432	7437	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	433659175
69	NC_019971	TTG	2	6	7510	7515	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	433659175
70	NC_019971	TAA	2	6	7700	7705	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	433659176
71	NC_019971	GCG	2	6	7894	7899	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433659176
72	NC_019971	AGC	2	6	7975	7980	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433659176
73	NC_019971	CTG	2	6	8038	8043	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433659176
74	NC_019971	TTC	2	6	8139	8144	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	433659176
75	NC_019971	GTT	2	6	8258	8263	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	433659176
76	NC_019971	TTG	2	6	8268	8273	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	433659176
77	NC_019971	TAA	2	6	8311	8316	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	433659176
78	NC_019971	GCG	2	6	8329	8334	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433659176
79	NC_019971	GCA	2	6	8338	8343	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433659176
80	NC_019971	AAG	2	6	8583	8588	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	433659177
81	NC_019971	ATC	2	6	8756	8761	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433659177
82	NC_019971	GCG	2	6	9027	9032	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433659177
83	NC_019971	TGA	2	6	9076	9081	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433659177
84	NC_019971	TTG	2	6	9089	9094	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	433659177
85	NC_019971	ATT	2	6	9242	9247	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	433659177
86	NC_019971	GCT	2	6	9259	9264	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433659177
87	NC_019971	GCA	2	6	9286	9291	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433659177
88	NC_019971	ATC	2	6	9308	9313	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433659177
89	NC_019971	ATT	2	6	9341	9346	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	433659177
90	NC_019971	TTA	2	6	9422	9427	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	433659177
91	NC_019971	GAT	2	6	9428	9433	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433659177
92	NC_019971	AAC	2	6	9626	9631	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	433659177
93	NC_019971	TGG	2	6	9748	9753	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433659177
94	NC_019971	CAT	2	6	9793	9798	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433659177
95	NC_019971	GGT	2	6	9868	9873	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433659177
96	NC_019971	GTT	2	6	10007	10012	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	433659177
97	NC_019971	GAA	2	6	10064	10069	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	433659177
98	NC_019971	ATC	2	6	10196	10201	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433659177
99	NC_019971	AGA	2	6	10225	10230	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	433659177
100	NC_019971	CAG	2	6	10232	10237	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433659177
101	NC_019971	TTG	2	6	10266	10271	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	433659177
102	NC_019971	GCC	2	6	10481	10486	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433659178
103	NC_019971	TGA	2	6	10487	10492	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433659178
104	NC_019971	CGT	2	6	10522	10527	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433659178
105	NC_019971	AGA	2	6	10574	10579	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	433659178
106	NC_019971	TGA	2	6	10604	10609	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433659178
107	NC_019971	ATG	2	6	10664	10669	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433659178
108	NC_019971	GAA	2	6	10806	10811	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	433659179
109	NC_019971	GGT	2	6	10910	10915	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433659179
110	NC_019971	CGG	3	9	11017	11025	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433659179
111	NC_019971	TGG	2	6	11068	11073	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433659179
112	NC_019971	TCG	2	6	11085	11090	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433659179
113	NC_019971	ATG	2	6	11255	11260	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433659179
114	NC_019971	AGA	2	6	11290	11295	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	433659179
115	NC_019971	CTC	2	6	11316	11321	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	433659179
116	NC_019971	TTC	2	6	11330	11335	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	433659179
117	NC_019971	GCA	2	6	11357	11362	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433659179
118	NC_019971	GAA	2	6	11387	11392	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	433659179
119	NC_019971	CGA	2	6	11479	11484	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433659179
120	NC_019971	CAG	2	6	11489	11494	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433659179
121	NC_019971	CCG	2	6	11671	11676	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433659181
122	NC_019971	CAA	2	6	11712	11717	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	433659181
123	NC_019971	TAA	2	6	11738	11743	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	433659181
124	NC_019971	GAA	2	6	11754	11759	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	433659181
125	NC_019971	TAA	2	6	11837	11842	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	433659181
126	NC_019971	TCC	2	6	11887	11892	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	433659181
127	NC_019971	CAC	2	6	12132	12137	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433659181
128	NC_019971	ATC	2	6	12262	12267	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433659181
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253	NC_019971	TTG	2	6	21781	21786	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	433659191
254	NC_019971	CTG	2	6	21816	21821	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433659191
255	NC_019971	GTT	2	6	21832	21837	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	433659191
256	NC_019971	TTC	2	6	21895	21900	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	433659191
257	NC_019971	TCG	2	6	21920	21925	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433659191
258	NC_019971	TGT	2	6	21948	21953	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	433659191
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261	NC_019971	TGA	2	6	21996	22001	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433659191
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265	NC_019971	CAT	2	6	22678	22683	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433659191
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499	NC_019971	GTT	2	6	43171	43176	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	433659215
500	NC_019971	AGC	2	6	43322	43327	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433659215

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