MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Vibrio parahaemolyticus BB22OP chromosome 2

Total Repeats: 29140

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_019971	AGA	2	6	93822	93827	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	433659262
1502	NC_019971	ATG	2	6	93889	93894	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433659262
1503	NC_019971	GAA	2	6	93958	93963	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	433659262
1504	NC_019971	GAA	2	6	94003	94008	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	433659262
1505	NC_019971	GAA	2	6	94063	94068	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	433659262
1506	NC_019971	AAG	2	6	94070	94075	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	433659262
1507	NC_019971	ACA	2	6	94097	94102	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	433659262
1508	NC_019971	AATT	2	8	94103	94110	50 %	50 %	0 %	0 %	433659262
1509	NC_019971	A	6	6	94155	94160	100 %	0 %	0 %	0 %	433659262
1510	NC_019971	TTA	2	6	94231	94236	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	433659262
1511	NC_019971	CTA	2	6	94419	94424	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433659263
1512	NC_019971	TTG	2	6	94431	94436	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	433659263
1513	NC_019971	TGAT	2	8	94503	94510	25 %	50 %	25 %	0 %	433659263
1514	NC_019971	GCG	2	6	94619	94624	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433659263
1515	NC_019971	CGG	2	6	94639	94644	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433659263
1516	NC_019971	TAT	2	6	94645	94650	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	433659263
1517	NC_019971	AGTG	2	8	94720	94727	25 %	25 %	50 %	0 %	433659263
1518	NC_019971	ATTCC	2	10	94767	94776	20 %	40 %	0 %	40 %	433659263
1519	NC_019971	GAT	2	6	94805	94810	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433659263
1520	NC_019971	TGC	2	6	94827	94832	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433659263
1521	NC_019971	TGAC	2	8	94839	94846	25 %	25 %	25 %	25 %	433659263
1522	NC_019971	TGG	2	6	94857	94862	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433659263
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1524	NC_019971	TAA	2	6	94876	94881	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	433659263
1525	NC_019971	TAC	2	6	94973	94978	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433659263
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1527	NC_019971	CGG	2	6	95175	95180	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433659263
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1529	NC_019971	CAA	2	6	95323	95328	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	433659263
1530	NC_019971	CAG	2	6	95337	95342	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433659263
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1533	NC_019971	TGA	2	6	95572	95577	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433659263
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1535	NC_019971	GAAC	2	8	95668	95675	50 %	0 %	25 %	25 %	433659263
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1538	NC_019971	TGA	2	6	95773	95778	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433659263
1539	NC_019971	TGG	2	6	95793	95798	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433659263
1540	NC_019971	TGG	2	6	95810	95815	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433659263
1541	NC_019971	CA	3	6	95877	95882	50 %	0 %	0 %	50 %	433659263
1542	NC_019971	GAA	2	6	95888	95893	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	433659263
1543	NC_019971	CG	3	6	95919	95924	0 %	0 %	50 %	50 %	433659263
1544	NC_019971	ATT	2	6	95942	95947	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	433659263
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1546	NC_019971	CAT	2	6	95959	95964	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433659263
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1550	NC_019971	CAGA	2	8	96162	96169	50 %	0 %	25 %	25 %	433659263
1551	NC_019971	GAA	2	6	96295	96300	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	433659263
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1553	NC_019971	TGC	2	6	96343	96348	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433659263
1554	NC_019971	TGC	2	6	96375	96380	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433659263
1555	NC_019971	ACA	2	6	96417	96422	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	433659263
1556	NC_019971	A	6	6	96504	96509	100 %	0 %	0 %	0 %	433659263
1557	NC_019971	ATGT	2	8	96529	96536	25 %	50 %	25 %	0 %	433659263
1558	NC_019971	TGA	2	6	96538	96543	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433659263
1559	NC_019971	ACT	2	6	96593	96598	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433659263
1560	NC_019971	CGC	2	6	96669	96674	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433659263
1561	NC_019971	GCA	2	6	96686	96691	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433659263
1562	NC_019971	AACC	2	8	96799	96806	50 %	0 %	0 %	50 %	433659263
1563	NC_019971	AGA	2	6	96898	96903	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	433659263
1564	NC_019971	AAC	2	6	96932	96937	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	433659263
1565	NC_019971	GCG	2	6	97028	97033	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433659263
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1567	NC_019971	TTC	2	6	97058	97063	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	433659263
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1570	NC_019971	GCAG	2	8	97363	97370	25 %	0 %	50 %	25 %	433659264
1571	NC_019971	ATGA	2	8	97479	97486	50 %	25 %	25 %	0 %	433659264
1572	NC_019971	CG	3	6	97492	97497	0 %	0 %	50 %	50 %	433659264
1573	NC_019971	TGCG	2	8	97520	97527	0 %	25 %	50 %	25 %	433659264
1574	NC_019971	CAT	2	6	97556	97561	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433659264
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1589	NC_019971	CAT	2	6	98598	98603	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433659266
1590	NC_019971	TGGT	2	8	98628	98635	0 %	50 %	50 %	0 %	433659266
1591	NC_019971	GAC	2	6	98744	98749	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433659266
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1595	NC_019971	CAT	2	6	98969	98974	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433659266
1596	NC_019971	ATC	2	6	98977	98982	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433659266
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1602	NC_019971	GATTA	2	10	99183	99192	40 %	40 %	20 %	0 %	433659266
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1609	NC_019971	CGA	2	6	99846	99851	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433659267
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1614	NC_019971	TCG	2	6	100202	100207	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433659267
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1622	NC_019971	TCA	2	6	100535	100540	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433659267
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1624	NC_019971	TGA	2	6	100799	100804	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433659268
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1626	NC_019971	CTG	2	6	100895	100900	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433659268
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1986	NC_019971	CTG	2	6	122315	122320	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433659291
1987	NC_019971	TTGG	2	8	122323	122330	0 %	50 %	50 %	0 %	433659291
1988	NC_019971	CCA	2	6	122416	122421	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433659291
1989	NC_019971	CGA	2	6	122426	122431	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433659291
1990	NC_019971	GTG	2	6	122443	122448	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433659291
1991	NC_019971	T	6	6	122484	122489	0 %	100 %	0 %	0 %	433659291
1992	NC_019971	TTGGTT	2	12	122494	122505	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	433659291
1993	NC_019971	CAAT	2	8	122612	122619	50 %	25 %	0 %	25 %	433659291
1994	NC_019971	CTG	2	6	122633	122638	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433659291
1995	NC_019971	TGA	2	6	122705	122710	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433659291
1996	NC_019971	TTG	2	6	122862	122867	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	433659291
1997	NC_019971	GTC	2	6	122868	122873	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433659291
1998	NC_019971	TTC	2	6	123003	123008	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	433659292
1999	NC_019971	GCT	2	6	123103	123108	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433659292
2000	NC_019971	GCA	2	6	123109	123114	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433659292

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