MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Vibrio parahaemolyticus BB22OP chromosome 2

Total Repeats: 29140

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
19001	NC_019971	TCA	2	6	1179483	1179488	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433660217
19002	NC_019971	ACC	2	6	1179498	1179503	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433660217
19003	NC_019971	AAT	2	6	1179560	1179565	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	433660217
19004	NC_019971	CCAT	2	8	1179891	1179898	25 %	25 %	0 %	50 %	433660217
19005	NC_019971	GA	3	6	1179913	1179918	50 %	0 %	50 %	0 %	433660217
19006	NC_019971	AC	3	6	1180045	1180050	50 %	0 %	0 %	50 %	433660217
19007	NC_019971	CCA	2	6	1180083	1180088	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433660217
19008	NC_019971	CGG	2	6	1180091	1180096	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433660217
19009	NC_019971	TGC	2	6	1180104	1180109	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433660217
19010	NC_019971	TTC	2	6	1180265	1180270	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	433660217
19011	NC_019971	TC	4	8	1180269	1180276	0 %	50 %	0 %	50 %	433660217
19012	NC_019971	AAT	2	6	1180305	1180310	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	433660217
19013	NC_019971	TCA	3	9	1180315	1180323	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433660217
19014	NC_019971	ACG	2	6	1180343	1180348	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433660218
19015	NC_019971	CGC	2	6	1180390	1180395	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433660218
19016	NC_019971	TTA	2	6	1180425	1180430	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	433660218
19017	NC_019971	AGC	2	6	1180431	1180436	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433660218
19018	NC_019971	ATG	2	6	1180476	1180481	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433660218
19019	NC_019971	CCA	2	6	1180525	1180530	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433660218
19020	NC_019971	ACA	2	6	1180531	1180536	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	433660218
19021	NC_019971	TTG	2	6	1180554	1180559	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	433660218
19022	NC_019971	ATG	2	6	1180569	1180574	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433660218
19023	NC_019971	AGT	2	6	1180593	1180598	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433660218
19024	NC_019971	TCA	2	6	1180620	1180625	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433660218
19025	NC_019971	GC	3	6	1180643	1180648	0 %	0 %	50 %	50 %	433660218
19026	NC_019971	TGC	2	6	1180677	1180682	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433660218
19027	NC_019971	AGT	2	6	1180735	1180740	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433660218
19028	NC_019971	TCGTTG	2	12	1180770	1180781	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	433660218
19029	NC_019971	CGA	2	6	1180828	1180833	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433660218
19030	NC_019971	TCT	2	6	1180878	1180883	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	433660218
19031	NC_019971	TGT	2	6	1180891	1180896	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	433660218
19032	NC_019971	CACGC	2	10	1181048	1181057	20 %	0 %	20 %	60 %	433660218
19033	NC_019971	TCG	2	6	1181073	1181078	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433660218
19034	NC_019971	TGT	2	6	1181092	1181097	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	433660218
19035	NC_019971	TCA	2	6	1181146	1181151	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433660218
19036	NC_019971	GTT	2	6	1181293	1181298	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	433660219
19037	NC_019971	TGT	2	6	1181317	1181322	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	433660219
19038	NC_019971	TCT	2	6	1181336	1181341	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	433660219
19039	NC_019971	ATAC	2	8	1181360	1181367	50 %	25 %	0 %	25 %	433660219
19040	NC_019971	TACA	2	8	1181401	1181408	50 %	25 %	0 %	25 %	433660219
19041	NC_019971	GCC	2	6	1181437	1181442	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433660219
19042	NC_019971	CTT	2	6	1181466	1181471	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	433660219
19043	NC_019971	CGC	2	6	1181493	1181498	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433660219
19044	NC_019971	TCG	2	6	1181582	1181587	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433660219
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19046	NC_019971	GACA	2	8	1181786	1181793	50 %	0 %	25 %	25 %	433660219
19047	NC_019971	ACC	2	6	1181825	1181830	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433660219
19048	NC_019971	CTT	2	6	1181880	1181885	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	433660219
19049	NC_019971	AAG	2	6	1182006	1182011	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	433660219
19050	NC_019971	CCG	2	6	1182150	1182155	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433660219
19051	NC_019971	CCA	2	6	1182174	1182179	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433660219
19052	NC_019971	GCC	2	6	1182277	1182282	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433660219
19053	NC_019971	CCA	2	6	1182363	1182368	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433660219
19054	NC_019971	GTA	2	6	1182407	1182412	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433660219
19055	NC_019971	TAA	2	6	1182509	1182514	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	433660220
19056	NC_019971	TTG	2	6	1182547	1182552	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	433660220
19057	NC_019971	ATG	2	6	1182596	1182601	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433660220
19058	NC_019971	ACC	2	6	1182757	1182762	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433660220
19059	NC_019971	GAT	3	9	1182763	1182771	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433660220
19060	NC_019971	GAATT	2	10	1182781	1182790	40 %	40 %	20 %	0 %	433660220
19061	NC_019971	AAAC	2	8	1182819	1182826	75 %	0 %	0 %	25 %	433660220
19062	NC_019971	CAC	2	6	1182849	1182854	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433660220
19063	NC_019971	CA	4	8	1182873	1182880	50 %	0 %	0 %	50 %	433660220
19064	NC_019971	AG	3	6	1182886	1182891	50 %	0 %	50 %	0 %	433660220
19065	NC_019971	AGA	2	6	1183035	1183040	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	433660220
19066	NC_019971	GATT	2	8	1183074	1183081	25 %	50 %	25 %	0 %	433660220
19067	NC_019971	CCA	2	6	1183106	1183111	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433660220
19068	NC_019971	CG	3	6	1183123	1183128	0 %	0 %	50 %	50 %	433660220
19069	NC_019971	AAG	2	6	1183133	1183138	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	433660220
19070	NC_019971	TCGCAA	2	12	1183167	1183178	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	433660220
19071	NC_019971	CGA	2	6	1183224	1183229	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433660220
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19073	NC_019971	GCCAAA	2	12	1183312	1183323	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	433660220
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19081	NC_019971	CG	3	6	1183965	1183970	0 %	0 %	50 %	50 %	433660221
19082	NC_019971	GAA	2	6	1183998	1184003	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	433660221
19083	NC_019971	ATG	2	6	1184020	1184025	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433660221
19084	NC_019971	ATC	2	6	1184026	1184031	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433660221
19085	NC_019971	ACC	2	6	1184073	1184078	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433660221
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19087	NC_019971	CCG	2	6	1184120	1184125	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433660221
19088	NC_019971	TCA	2	6	1184144	1184149	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433660221
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19100	NC_019971	CCA	2	6	1184506	1184511	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433660222
19101	NC_019971	CGGCG	2	10	1184612	1184621	0 %	0 %	60 %	40 %	433660222
19102	NC_019971	GAT	2	6	1184636	1184641	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433660222
19103	NC_019971	ACCAC	2	10	1184661	1184670	40 %	0 %	0 %	60 %	433660222
19104	NC_019971	CAG	2	6	1184726	1184731	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433660222
19105	NC_019971	ATTC	2	8	1184767	1184774	25 %	50 %	0 %	25 %	433660222
19106	NC_019971	CTT	2	6	1184785	1184790	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	433660222
19107	NC_019971	CTGG	2	8	1184812	1184819	0 %	25 %	50 %	25 %	433660222
19108	NC_019971	AG	3	6	1184822	1184827	50 %	0 %	50 %	0 %	433660222
19109	NC_019971	AATGC	2	10	1184844	1184853	40 %	20 %	20 %	20 %	433660222
19110	NC_019971	AG	3	6	1184906	1184911	50 %	0 %	50 %	0 %	433660222
19111	NC_019971	CAC	3	9	1184930	1184938	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433660222
19112	NC_019971	GTTT	2	8	1184968	1184975	0 %	75 %	25 %	0 %	433660222
19113	NC_019971	CAC	2	6	1185041	1185046	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433660222
19114	NC_019971	CGC	2	6	1185119	1185124	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433660222
19115	NC_019971	GAT	2	6	1185167	1185172	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433660222
19116	NC_019971	TGA	2	6	1185199	1185204	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433660222
19117	NC_019971	CA	3	6	1185283	1185288	50 %	0 %	0 %	50 %	433660222
19118	NC_019971	CAC	2	6	1185367	1185372	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433660222
19119	NC_019971	GCA	2	6	1185424	1185429	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433660222
19120	NC_019971	TCT	2	6	1185505	1185510	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	433660222
19121	NC_019971	CAT	2	6	1185530	1185535	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433660222
19122	NC_019971	CG	3	6	1185571	1185576	0 %	0 %	50 %	50 %	433660222
19123	NC_019971	CAT	2	6	1185620	1185625	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433660222
19124	NC_019971	CAA	2	6	1185640	1185645	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	433660222
19125	NC_019971	ACCA	2	8	1185677	1185684	50 %	0 %	0 %	50 %	433660222
19126	NC_019971	GC	3	6	1185756	1185761	0 %	0 %	50 %	50 %	433660222
19127	NC_019971	A	6	6	1185783	1185788	100 %	0 %	0 %	0 %	433660222
19128	NC_019971	GGT	2	6	1185836	1185841	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433660222
19129	NC_019971	GA	3	6	1185852	1185857	50 %	0 %	50 %	0 %	433660222
19130	NC_019971	CTG	2	6	1185917	1185922	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433660222
19131	NC_019971	ATC	2	6	1185962	1185967	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433660222
19132	NC_019971	ATG	2	6	1185999	1186004	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433660222
19133	NC_019971	CTTTGG	2	12	1186078	1186089	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	433660222
19134	NC_019971	CTT	2	6	1186111	1186116	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	433660222
19135	NC_019971	CATG	2	8	1186117	1186124	25 %	25 %	25 %	25 %	433660222
19136	NC_019971	GATA	2	8	1186132	1186139	50 %	25 %	25 %	0 %	433660222
19137	NC_019971	TGC	2	6	1186365	1186370	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433660222
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19139	NC_019971	TTC	2	6	1186459	1186464	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	433660223
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19142	NC_019971	TTC	2	6	1186618	1186623	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	433660223
19143	NC_019971	ATG	2	6	1186634	1186639	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433660223
19144	NC_019971	TTC	2	6	1186660	1186665	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	433660223
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19147	NC_019971	GTT	2	6	1186891	1186896	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	433660223
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19217	NC_019971	GCCAA	2	10	1191012	1191021	40 %	0 %	20 %	40 %	433660228
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19219	NC_019971	GCA	2	6	1191174	1191179	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433660228
19220	NC_019971	ATTG	2	8	1191360	1191367	25 %	50 %	25 %	0 %	433660228
19221	NC_019971	CT	3	6	1191400	1191405	0 %	50 %	0 %	50 %	433660228
19222	NC_019971	TTGA	2	8	1191415	1191422	25 %	50 %	25 %	0 %	433660228
19223	NC_019971	CAA	2	6	1191439	1191444	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	433660228
19224	NC_019971	GGC	2	6	1191483	1191488	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433660228
19225	NC_019971	ACC	2	6	1191532	1191537	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433660228
19226	NC_019971	TTGTT	2	10	1191625	1191634	0 %	80 %	20 %	0 %	433660228
19227	NC_019971	GGC	2	6	1191652	1191657	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433660228
19228	NC_019971	A	7	7	1191677	1191683	100 %	0 %	0 %	0 %	433660228
19229	NC_019971	AGC	2	6	1191694	1191699	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433660228
19230	NC_019971	AGC	2	6	1191748	1191753	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433660228
19231	NC_019971	TCCGAC	2	12	1191778	1191789	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	433660228
19232	NC_019971	ACCA	2	8	1191842	1191849	50 %	0 %	0 %	50 %	433660228
19233	NC_019971	CTA	2	6	1191999	1192004	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433660228
19234	NC_019971	CAC	2	6	1192005	1192010	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433660228
19235	NC_019971	GAT	2	6	1192020	1192025	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433660228
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19334	NC_019971	CATC	2	8	1198504	1198511	25 %	25 %	0 %	50 %	433660233
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19346	NC_019971	GC	3	6	1199331	1199336	0 %	0 %	50 %	50 %	433660234
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19466	NC_019971	GCG	2	6	1208013	1208018	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433660242
19467	NC_019971	TATT	2	8	1208046	1208053	25 %	75 %	0 %	0 %	433660242
19468	NC_019971	CCA	2	6	1208101	1208106	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433660242
19469	NC_019971	TTA	2	6	1208109	1208114	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	433660242
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19491	NC_019971	CT	3	6	1209544	1209549	0 %	50 %	0 %	50 %	433660242
19492	NC_019971	TCA	3	9	1209565	1209573	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433660242
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19496	NC_019971	TGA	2	6	1209830	1209835	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433660242
19497	NC_019971	GTAC	2	8	1209883	1209890	25 %	25 %	25 %	25 %	433660242
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