MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Vibrio parahaemolyticus BB22OP chromosome 1

Total Repeats: 1807

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019955	GAAGA	2	10	929	938	60 %	0 %	40 %	0 %	433656324
2	NC_019955	AAATC	2	10	6375	6384	60 %	20 %	0 %	20 %	433656329
3	NC_019955	CCAAA	2	10	12360	12369	60 %	0 %	0 %	40 %	433656335
4	NC_019955	TATGT	2	10	14517	14526	20 %	60 %	20 %	0 %	433656336
5	NC_019955	GTTGG	2	10	16269	16278	0 %	40 %	60 %	0 %	433656339
6	NC_019955	TCGGA	2	10	17270	17279	20 %	20 %	40 %	20 %	433656340
7	NC_019955	TCGAA	2	10	17558	17567	40 %	20 %	20 %	20 %	433656340
8	NC_019955	TTTGG	2	10	23657	23666	0 %	60 %	40 %	0 %	433656344
9	NC_019955	CCCAA	2	10	24829	24838	40 %	0 %	0 %	60 %	433656348
10	NC_019955	GTGTT	2	10	25154	25163	0 %	60 %	40 %	0 %	433656348
11	NC_019955	CGCAA	2	10	25293	25302	40 %	0 %	20 %	40 %	433656348
12	NC_019955	AGCTC	2	10	30174	30183	20 %	20 %	20 %	40 %	433656351
13	NC_019955	CACTT	2	10	32501	32510	20 %	40 %	0 %	40 %	433656353
14	NC_019955	GAATG	2	10	39355	39364	40 %	20 %	40 %	0 %	433656356
15	NC_019955	CCAAG	2	10	42572	42581	40 %	0 %	20 %	40 %	433656359
16	NC_019955	TCGTT	2	10	46140	46149	0 %	60 %	20 %	20 %	433656360
17	NC_019955	TTTTG	2	10	47633	47642	0 %	80 %	20 %	0 %	433656362
18	NC_019955	CGTGG	2	10	47883	47892	0 %	20 %	60 %	20 %	433656362
19	NC_019955	TGAAC	2	10	53700	53709	40 %	20 %	20 %	20 %	433656365
20	NC_019955	CCAAA	2	10	58321	58330	60 %	0 %	0 %	40 %	433656369
21	NC_019955	AAAGC	2	10	58470	58479	60 %	0 %	20 %	20 %	433656369
22	NC_019955	ATGTG	2	10	58810	58819	20 %	40 %	40 %	0 %	433656369
23	NC_019955	GCTTG	2	10	60880	60889	0 %	40 %	40 %	20 %	433656370
24	NC_019955	ATGTG	2	10	63304	63313	20 %	40 %	40 %	0 %	433656372
25	NC_019955	ATCAC	2	10	64907	64916	40 %	20 %	0 %	40 %	433656373
26	NC_019955	GTTTG	2	10	69244	69253	0 %	60 %	40 %	0 %	433656377
27	NC_019955	ACCAA	2	10	69970	69979	60 %	0 %	0 %	40 %	433656379
28	NC_019955	CAACC	2	10	73918	73927	40 %	0 %	0 %	60 %	433656382
29	NC_019955	GTTTG	2	10	75128	75137	0 %	60 %	40 %	0 %	433656383
30	NC_019955	GTTTG	2	10	76652	76661	0 %	60 %	40 %	0 %	433656385
31	NC_019955	GATGC	2	10	77592	77601	20 %	20 %	40 %	20 %	433656385
32	NC_019955	CCAAC	2	10	79279	79288	40 %	0 %	0 %	60 %	433656387
33	NC_019955	CTGAG	2	10	79624	79633	20 %	20 %	40 %	20 %	433656387
34	NC_019955	CTTTG	2	10	85180	85189	0 %	60 %	20 %	20 %	433656389
35	NC_019955	ACGGC	2	10	85365	85374	20 %	0 %	40 %	40 %	433656389
36	NC_019955	CGTCA	2	10	86287	86296	20 %	20 %	20 %	40 %	433656390
37	NC_019955	AAGGA	2	10	87433	87442	60 %	0 %	40 %	0 %	433656391
38	NC_019955	CAAAC	2	10	91590	91599	60 %	0 %	0 %	40 %	433656396
39	NC_019955	CAATC	2	10	91892	91901	40 %	20 %	0 %	40 %	433656396
40	NC_019955	TTTGG	2	10	93267	93276	0 %	60 %	40 %	0 %	433656398
41	NC_019955	GTTGC	2	10	94019	94028	0 %	40 %	40 %	20 %	433656400
42	NC_019955	GTTGG	2	10	97907	97916	0 %	40 %	60 %	0 %	433656404
43	NC_019955	CGTCA	2	10	98186	98195	20 %	20 %	20 %	40 %	433656405
44	NC_019955	GCGAT	2	10	99730	99739	20 %	20 %	40 %	20 %	433656408
45	NC_019955	AGCGA	2	10	101831	101840	40 %	0 %	40 %	20 %	433656408
46	NC_019955	GCCAA	2	10	102489	102498	40 %	0 %	20 %	40 %	433656409
47	NC_019955	CTCAC	2	10	104116	104125	20 %	20 %	0 %	60 %	433656410
48	NC_019955	AACGA	2	10	104799	104808	60 %	0 %	20 %	20 %	433656411
49	NC_019955	TGGTC	2	10	108159	108168	0 %	40 %	40 %	20 %	433656415
50	NC_019955	TGCTC	2	10	110133	110142	0 %	40 %	20 %	40 %	433656417
51	NC_019955	TCTAA	2	10	111294	111303	40 %	40 %	0 %	20 %	433656418
52	NC_019955	TTGGT	2	10	112040	112049	0 %	60 %	40 %	0 %	433656419
53	NC_019955	CGCAG	2	10	115309	115318	20 %	0 %	40 %	40 %	433656420
54	NC_019955	AAATC	2	10	115373	115382	60 %	20 %	0 %	20 %	433656420
55	NC_019955	AAAGT	2	10	115586	115595	60 %	20 %	20 %	0 %	433656420
56	NC_019955	AGAGA	2	10	116556	116565	60 %	0 %	40 %	0 %	433656421
57	NC_019955	TGGCA	2	10	117508	117517	20 %	20 %	40 %	20 %	433656422
58	NC_019955	TGTGG	2	10	119089	119098	0 %	40 %	60 %	0 %	433656423
59	NC_019955	GGAAA	2	10	122821	122830	60 %	0 %	40 %	0 %	433656427
60	NC_019955	AAGAG	2	10	123421	123430	60 %	0 %	40 %	0 %	433656428
61	NC_019955	GGCCA	2	10	127293	127302	20 %	0 %	40 %	40 %	433656430
62	NC_019955	GCCCG	2	10	127432	127441	0 %	0 %	40 %	60 %	433656430
63	NC_019955	ACGTC	2	10	128070	128079	20 %	20 %	20 %	40 %	433656430
64	NC_019955	TTTTC	2	10	128762	128771	0 %	80 %	0 %	20 %	433656431
65	NC_019955	CACTG	2	10	134582	134591	20 %	20 %	20 %	40 %	433656436
66	NC_019955	CGGTC	2	10	136164	136173	0 %	20 %	40 %	40 %	433656438
67	NC_019955	GATAT	2	10	136994	137003	40 %	40 %	20 %	0 %	433656439
68	NC_019955	TGCCA	2	10	137466	137475	20 %	20 %	20 %	40 %	433656439
69	NC_019955	GCTTT	2	10	139019	139028	0 %	60 %	20 %	20 %	433656440
70	NC_019955	CGATG	2	10	139858	139867	20 %	20 %	40 %	20 %	433656440
71	NC_019955	GCCGC	2	10	141047	141056	0 %	0 %	40 %	60 %	433656441
72	NC_019955	TCGTA	2	10	144007	144016	20 %	40 %	20 %	20 %	433656444
73	NC_019955	AACGC	2	10	146098	146107	40 %	0 %	20 %	40 %	433656445
74	NC_019955	GACAT	2	10	146344	146353	40 %	20 %	20 %	20 %	433656445
75	NC_019955	TGGCA	2	10	146652	146661	20 %	20 %	40 %	20 %	433656445
76	NC_019955	CAAAG	2	10	147056	147065	60 %	0 %	20 %	20 %	433656446
77	NC_019955	TGATG	2	10	147806	147815	20 %	40 %	40 %	0 %	433656446
78	NC_019955	CATTG	2	10	148977	148986	20 %	40 %	20 %	20 %	433656448
79	NC_019955	AATTT	2	10	152505	152514	40 %	60 %	0 %	0 %	433656453
80	NC_019955	GCTAC	2	10	152879	152888	20 %	20 %	20 %	40 %	433656453
81	NC_019955	AGCGG	2	10	156733	156742	20 %	0 %	60 %	20 %	433656458
82	NC_019955	TGGTT	2	10	157439	157448	0 %	60 %	40 %	0 %	433656459
83	NC_019955	CTTTG	2	10	158685	158694	0 %	60 %	20 %	20 %	433656461
84	NC_019955	GAAAC	2	10	158935	158944	60 %	0 %	20 %	20 %	433656461
85	NC_019955	GCCGT	2	10	159829	159838	0 %	20 %	40 %	40 %	433656461
86	NC_019955	AGTTC	2	10	162153	162162	20 %	40 %	20 %	20 %	433656462
87	NC_019955	TGGAA	2	10	164222	164231	40 %	20 %	40 %	0 %	433656464
88	NC_019955	ACGCC	2	10	164672	164681	20 %	0 %	20 %	60 %	433656465
89	NC_019955	TTGAT	2	10	165568	165577	20 %	60 %	20 %	0 %	433656466
90	NC_019955	CGTAG	2	10	170218	170227	20 %	20 %	40 %	20 %	433656469
91	NC_019955	TGGAA	2	10	171666	171675	40 %	20 %	40 %	0 %	433656471
92	NC_019955	ATGCC	2	10	174869	174878	20 %	20 %	20 %	40 %	433656474
93	NC_019955	GCGTT	2	10	175105	175114	0 %	40 %	40 %	20 %	433656474
94	NC_019955	TGCCT	2	10	183686	183695	0 %	40 %	20 %	40 %	433656481
95	NC_019955	ACCCA	2	10	186404	186413	40 %	0 %	0 %	60 %	433656483
96	NC_019955	CTATC	2	10	189257	189266	20 %	40 %	0 %	40 %	433656484
97	NC_019955	ACGAT	2	10	191563	191572	40 %	20 %	20 %	20 %	433656487
98	NC_019955	CTAAG	2	10	191632	191641	40 %	20 %	20 %	20 %	433656487
99	NC_019955	TAGAT	2	10	193506	193515	40 %	40 %	20 %	0 %	433656489
100	NC_019955	GAGTT	2	10	194182	194191	20 %	40 %	40 %	0 %	433656491
101	NC_019955	GCGCT	2	10	194815	194824	0 %	20 %	40 %	40 %	433656492
102	NC_019955	CACTC	2	10	196914	196923	20 %	20 %	0 %	60 %	433656495
103	NC_019955	CAATC	2	10	199388	199397	40 %	20 %	0 %	40 %	433656500
104	NC_019955	GAATG	2	10	200431	200440	40 %	20 %	40 %	0 %	433656500
105	NC_019955	TTGAA	2	10	200666	200675	40 %	40 %	20 %	0 %	433656501
106	NC_019955	GAAAA	2	10	201039	201048	80 %	0 %	20 %	0 %	433656501
107	NC_019955	TTCTT	2	10	203338	203347	0 %	80 %	0 %	20 %	433656502
108	NC_019955	TCTAT	2	10	203720	203729	20 %	60 %	0 %	20 %	433656503
109	NC_019955	AATCT	2	10	206258	206267	40 %	40 %	0 %	20 %	433656505
110	NC_019955	TGAGT	2	10	210549	210558	20 %	40 %	40 %	0 %	433656509
111	NC_019955	AGCCA	2	10	211744	211753	40 %	0 %	20 %	40 %	433656510
112	NC_019955	TCTTA	2	10	212784	212793	20 %	60 %	0 %	20 %	433656513
113	NC_019955	GAACT	2	10	214573	214582	40 %	20 %	20 %	20 %	433656514
114	NC_019955	AGCCT	2	10	214604	214613	20 %	20 %	20 %	40 %	433656514
115	NC_019955	GTTTG	2	10	216066	216075	0 %	60 %	40 %	0 %	433656516
116	NC_019955	CAATC	2	10	218382	218391	40 %	20 %	0 %	40 %	433656519
117	NC_019955	GAACT	2	10	221385	221394	40 %	20 %	20 %	20 %	433656523
118	NC_019955	CGTTT	2	10	221574	221583	0 %	60 %	20 %	20 %	433656523
119	NC_019955	TGCTT	2	10	221998	222007	0 %	60 %	20 %	20 %	433656523
120	NC_019955	TGGTG	2	10	222693	222702	0 %	40 %	60 %	0 %	433656524
121	NC_019955	CCGAA	2	10	225419	225428	40 %	0 %	20 %	40 %	433656528
122	NC_019955	AGTGT	2	10	227714	227723	20 %	40 %	40 %	0 %	433656531
123	NC_019955	AGAAT	2	10	228785	228794	60 %	20 %	20 %	0 %	433656533
124	NC_019955	TTATC	2	10	228900	228909	20 %	60 %	0 %	20 %	433656533
125	NC_019955	AGAAA	2	10	231068	231077	80 %	0 %	20 %	0 %	433656535
126	NC_019955	GGTTG	2	10	234126	234135	0 %	40 %	60 %	0 %	433656537
127	NC_019955	AAAAC	2	10	234472	234481	80 %	0 %	0 %	20 %	433656537
128	NC_019955	TCTTT	2	10	235871	235880	0 %	80 %	0 %	20 %	433656539
129	NC_019955	TTTAC	2	10	237879	237888	20 %	60 %	0 %	20 %	433656541
130	NC_019955	GGAAT	2	10	238222	238231	40 %	20 %	40 %	0 %	433656541
131	NC_019955	CGAAG	2	10	248090	248099	40 %	0 %	40 %	20 %	433656549
132	NC_019955	TAAAT	2	10	249112	249121	60 %	40 %	0 %	0 %	433656549
133	NC_019955	ATATT	2	10	251968	251977	40 %	60 %	0 %	0 %	433656552
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