MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Vibrio parahaemolyticus BB22OP chromosome 1

Total Repeats: 37545

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019955	GCA	2	6	408	413	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433656323
2	NC_019955	TCT	2	6	414	419	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	433656323
3	NC_019955	TCT	2	6	480	485	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	433656323
4	NC_019955	TGC	2	6	596	601	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433656323
5	NC_019955	CAC	2	6	769	774	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433656323
6	NC_019955	TAA	2	6	790	795	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	433656323
7	NC_019955	ATT	2	6	909	914	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	433656324
8	NC_019955	GTC	2	6	952	957	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433656324
9	NC_019955	TGC	2	6	989	994	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433656324
10	NC_019955	GCT	2	6	1047	1052	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433656324
11	NC_019955	GAC	2	6	1101	1106	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433656324
12	NC_019955	GGT	2	6	1161	1166	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433656324
13	NC_019955	TTG	2	6	1268	1273	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	433656324
14	NC_019955	CCA	2	6	1365	1370	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433656324
15	NC_019955	TCA	2	6	1436	1441	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433656324
16	NC_019955	CAG	2	6	1458	1463	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433656324
17	NC_019955	GAT	2	6	1468	1473	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433656324
18	NC_019955	GCA	2	6	1509	1514	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433656324
19	NC_019955	GAC	2	6	1602	1607	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433656324
20	NC_019955	CTT	2	6	1656	1661	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	433656324
21	NC_019955	GAT	2	6	1684	1689	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433656324
22	NC_019955	TCT	2	6	1736	1741	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	433656324
23	NC_019955	CCA	2	6	1794	1799	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433656324
24	NC_019955	TGC	2	6	1811	1816	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433656324
25	NC_019955	GCT	2	6	1853	1858	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433656324
26	NC_019955	GCT	2	6	1958	1963	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433656324
27	NC_019955	AAT	2	6	2209	2214	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	433656324
28	NC_019955	ACC	2	6	2221	2226	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433656324
29	NC_019955	GAA	2	6	2493	2498	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	433656325
30	NC_019955	AAG	4	12	2500	2511	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	433656325
31	NC_019955	TCT	2	6	2540	2545	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	433656325
32	NC_019955	GTT	2	6	2566	2571	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	433656325
33	NC_019955	TCT	2	6	2579	2584	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	433656325
34	NC_019955	AGT	2	6	2611	2616	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433656325
35	NC_019955	GTA	2	6	2625	2630	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433656325
36	NC_019955	GAA	2	6	2664	2669	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	433656325
37	NC_019955	CAT	2	6	2793	2798	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433656325
38	NC_019955	GTC	2	6	2820	2825	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433656325
39	NC_019955	CAC	2	6	2918	2923	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433656325
40	NC_019955	GAT	2	6	2943	2948	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433656325
41	NC_019955	CTG	2	6	3062	3067	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433656325
42	NC_019955	TTG	2	6	3075	3080	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	433656325
43	NC_019955	AGC	2	6	3228	3233	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433656325
44	NC_019955	AGT	2	6	3239	3244	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433656325
45	NC_019955	TGC	2	6	3255	3260	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433656325
46	NC_019955	ACC	2	6	3387	3392	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433656325
47	NC_019955	GTT	2	6	3441	3446	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	433656325
48	NC_019955	GTT	2	6	3453	3458	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	433656325
49	NC_019955	GCT	2	6	3624	3629	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433656325
50	NC_019955	CAA	2	6	3650	3655	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	433656325
51	NC_019955	TGA	2	6	3676	3681	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433656325
52	NC_019955	TGA	2	6	3714	3719	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433656325
53	NC_019955	CAG	2	6	3728	3733	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433656325
54	NC_019955	CCA	2	6	3766	3771	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433656325
55	NC_019955	TCA	2	6	3859	3864	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433656325
56	NC_019955	TGC	2	6	3887	3892	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433656325
57	NC_019955	TTG	2	6	3945	3950	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	433656325
58	NC_019955	AAC	2	6	4280	4285	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	433656326
59	NC_019955	TTC	2	6	4322	4327	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	433656326
60	NC_019955	CAA	2	6	4335	4340	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	433656326
61	NC_019955	ATG	2	6	4487	4492	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433656326
62	NC_019955	ATT	2	6	4606	4611	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	433656327
63	NC_019955	ACG	2	6	4637	4642	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433656327
64	NC_019955	CGA	2	6	5066	5071	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433656328
65	NC_019955	CTT	2	6	5108	5113	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	433656328
66	NC_019955	ACC	2	6	5137	5142	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433656328
67	NC_019955	CTT	2	6	5169	5174	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	433656328
68	NC_019955	TCA	2	6	5227	5232	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433656328
69	NC_019955	GCT	3	9	5282	5290	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433656328
70	NC_019955	CCA	2	6	5293	5298	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433656328
71	NC_019955	ATC	2	6	5343	5348	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433656328
72	NC_019955	CTG	2	6	5355	5360	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433656328
73	NC_019955	TTC	2	6	5383	5388	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	433656328
74	NC_019955	GTC	2	6	5535	5540	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433656328
75	NC_019955	TCG	2	6	5557	5562	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433656328
76	NC_019955	GAT	2	6	5631	5636	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433656328
77	NC_019955	ATC	2	6	5716	5721	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433656328
78	NC_019955	CAC	3	9	5777	5785	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433656329
79	NC_019955	AGT	2	6	5923	5928	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433656329
80	NC_019955	TCA	2	6	5929	5934	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433656329
81	NC_019955	GAT	2	6	6044	6049	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433656329
82	NC_019955	GCA	2	6	6051	6056	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433656329
83	NC_019955	CCA	2	6	6130	6135	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433656329
84	NC_019955	TAA	2	6	6162	6167	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	433656329
85	NC_019955	GAA	2	6	6203	6208	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	433656329
86	NC_019955	GCA	2	6	6352	6357	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433656329
87	NC_019955	CAT	2	6	6759	6764	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433656330
88	NC_019955	GTA	2	6	6822	6827	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433656330
89	NC_019955	ATA	2	6	7253	7258	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	433656330
90	NC_019955	AAT	2	6	7562	7567	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	433656331
91	NC_019955	TCG	2	6	7597	7602	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433656331
92	NC_019955	GCA	2	6	7712	7717	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433656332
93	NC_019955	AAG	2	6	7723	7728	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	433656332
94	NC_019955	CGG	2	6	7963	7968	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433656332
95	NC_019955	GAC	2	6	8037	8042	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433656332
96	NC_019955	GCG	2	6	8142	8147	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433656332
97	NC_019955	AGC	2	6	8171	8176	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433656332
98	NC_019955	GGT	2	6	8199	8204	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433656332
99	NC_019955	AAC	2	6	8259	8264	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	433656332
100	NC_019955	GTG	2	6	8277	8282	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433656332
101	NC_019955	GAA	2	6	8343	8348	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	433656332
102	NC_019955	CTA	2	6	8357	8362	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433656332
103	NC_019955	CAA	2	6	8408	8413	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	433656332
104	NC_019955	AAG	2	6	8425	8430	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	433656332
105	NC_019955	TTC	2	6	8433	8438	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	433656332
106	NC_019955	TTG	2	6	8454	8459	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	433656332
107	NC_019955	ATC	2	6	8475	8480	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433656332
108	NC_019955	GCC	2	6	8570	8575	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433656332
109	NC_019955	TGA	2	6	8602	8607	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433656332
110	NC_019955	GCC	2	6	8737	8742	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433656332
111	NC_019955	CTG	2	6	8781	8786	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433656332
112	NC_019955	ACA	2	6	8815	8820	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	433656332
113	NC_019955	TAC	2	6	8841	8846	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433656332
114	NC_019955	CTG	2	6	8865	8870	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433656332
115	NC_019955	CGT	2	6	8877	8882	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433656332
116	NC_019955	TGG	2	6	8972	8977	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433656332
117	NC_019955	AGC	2	6	9019	9024	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433656332
118	NC_019955	TCT	2	6	9081	9086	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	433656332
119	NC_019955	ACA	2	6	9194	9199	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	433656333
120	NC_019955	AGA	2	6	9263	9268	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	433656333
121	NC_019955	ATC	2	6	9411	9416	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433656333
122	NC_019955	TAC	2	6	9609	9614	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433656333
123	NC_019955	ATC	2	6	9729	9734	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433656333
124	NC_019955	AAC	2	6	9834	9839	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	433656333
125	NC_019955	CGC	2	6	9885	9890	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433656333
126	NC_019955	CAA	2	6	9908	9913	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	433656333
127	NC_019955	TGA	2	6	9932	9937	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433656333
128	NC_019955	TGC	2	6	9959	9964	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433656333
129	NC_019955	GTG	2	6	9988	9993	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433656333
130	NC_019955	AAC	2	6	10035	10040	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	433656333
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251	NC_019955	TTC	2	6	19436	19441	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	433656341
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253	NC_019955	GAA	2	6	19480	19485	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	433656341
254	NC_019955	CTT	2	6	19527	19532	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	433656341
255	NC_019955	TCT	2	6	19610	19615	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	433656341
256	NC_019955	TCT	2	6	19637	19642	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	433656341
257	NC_019955	GCT	3	9	19691	19699	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433656341
258	NC_019955	CTG	2	6	19707	19712	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433656341
259	NC_019955	CTG	2	6	19761	19766	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433656341
260	NC_019955	GAC	2	6	19776	19781	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433656341
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376	NC_019955	GAT	2	6	28843	28848	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433656351
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380	NC_019955	CAA	2	6	29043	29048	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	433656351
381	NC_019955	TCA	2	6	29211	29216	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433656351
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496	NC_019955	CCA	3	9	44053	44061	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433656359
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