MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Vibrio parahaemolyticus BB22OP chromosome 1

Total Repeats: 53173

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_019955	CAC	2	6	179656	179661	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433656479
3002	NC_019955	GA	3	6	179667	179672	50 %	0 %	50 %	0 %	433656479
3003	NC_019955	GTA	2	6	179679	179684	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433656479
3004	NC_019955	TAG	2	6	179716	179721	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433656479
3005	NC_019955	TTAA	2	8	179785	179792	50 %	50 %	0 %	0 %	433656480
3006	NC_019955	AAG	2	6	179811	179816	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	433656480
3007	NC_019955	TCA	2	6	179886	179891	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433656480
3008	NC_019955	GTT	2	6	179961	179966	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	433656480
3009	NC_019955	GTC	2	6	179999	180004	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433656480
3010	NC_019955	AGAT	3	12	180038	180049	50 %	25 %	25 %	0 %	433656480
3011	NC_019955	TCT	2	6	180057	180062	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	433656480
3012	NC_019955	ATT	2	6	180125	180130	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	433656480
3013	NC_019955	CCA	2	6	180138	180143	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433656480
3014	NC_019955	ATG	2	6	180294	180299	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433656480
3015	NC_019955	GAT	2	6	180317	180322	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433656480
3016	NC_019955	TCG	2	6	180354	180359	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433656480
3017	NC_019955	TCA	2	6	180393	180398	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433656480
3018	NC_019955	TGT	2	6	180406	180411	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	433656480
3019	NC_019955	GTC	2	6	180434	180439	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433656480
3020	NC_019955	CAT	2	6	180517	180522	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433656480
3021	NC_019955	ACCAGC	2	12	180650	180661	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	433656480
3022	NC_019955	TCA	2	6	180717	180722	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433656480
3023	NC_019955	TCA	2	6	180771	180776	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433656480
3024	NC_019955	GAT	2	6	180851	180856	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433656480
3025	NC_019955	GCC	2	6	180971	180976	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433656480
3026	NC_019955	TTG	2	6	181033	181038	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	433656480
3027	NC_019955	TGC	2	6	181091	181096	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433656480
3028	NC_019955	GTA	2	6	181242	181247	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433656480
3029	NC_019955	GTT	2	6	181262	181267	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	433656480
3030	NC_019955	GTA	2	6	181274	181279	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433656480
3031	NC_019955	GAA	2	6	181322	181327	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	433656480
3032	NC_019955	CCA	2	6	181335	181340	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433656480
3033	NC_019955	CTG	2	6	181369	181374	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433656480
3034	NC_019955	AGT	2	6	181430	181435	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433656480
3035	NC_019955	GTC	2	6	181436	181441	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433656480
3036	NC_019955	AAG	2	6	181446	181451	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	433656480
3037	NC_019955	AGC	2	6	181499	181504	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433656480
3038	NC_019955	CAT	2	6	181627	181632	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433656480
3039	NC_019955	GTTG	2	8	181694	181701	0 %	50 %	50 %	0 %	433656480
3040	NC_019955	ATG	2	6	181764	181769	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433656480
3041	NC_019955	TCG	2	6	181815	181820	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433656480
3042	NC_019955	CCG	2	6	181821	181826	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433656480
3043	NC_019955	TTC	2	6	181874	181879	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	433656480
3044	NC_019955	ATG	2	6	181887	181892	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433656480
3045	NC_019955	TAC	2	6	181895	181900	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433656480
3046	NC_019955	CAG	2	6	181927	181932	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433656480
3047	NC_019955	CCG	2	6	181935	181940	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433656480
3048	NC_019955	CCA	2	6	182001	182006	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433656480
3049	NC_019955	GAT	2	6	182148	182153	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433656480
3050	NC_019955	CTTC	2	8	182229	182236	0 %	50 %	0 %	50 %	433656480
3051	NC_019955	GC	3	6	182244	182249	0 %	0 %	50 %	50 %	433656480
3052	NC_019955	TTG	2	6	182294	182299	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	433656480
3053	NC_019955	CTG	2	6	182329	182334	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433656480
3054	NC_019955	GCA	2	6	183357	183362	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433656481
3055	NC_019955	TGA	2	6	183398	183403	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433656481
3056	NC_019955	TTA	2	6	183512	183517	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	433656481
3057	NC_019955	TGG	2	6	183569	183574	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433656481
3058	NC_019955	CTTT	2	8	183580	183587	0 %	75 %	0 %	25 %	433656481
3059	NC_019955	CCT	2	6	183658	183663	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	433656481
3060	NC_019955	TCG	2	6	183676	183681	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433656481
3061	NC_019955	TGCCT	2	10	183686	183695	0 %	40 %	20 %	40 %	433656481
3062	NC_019955	G	6	6	183758	183763	0 %	0 %	100 %	0 %	433656481
3063	NC_019955	TGA	2	6	183773	183778	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433656481
3064	NC_019955	CTT	2	6	183797	183802	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	433656481
3065	NC_019955	ATC	2	6	183914	183919	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433656481
3066	NC_019955	TGT	2	6	184030	184035	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	433656481
3067	NC_019955	TTA	2	6	184092	184097	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	433656481
3068	NC_019955	AGT	2	6	184130	184135	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433656481
3069	NC_019955	TGC	2	6	184165	184170	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433656481
3070	NC_019955	ATT	2	6	184182	184187	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	433656481
3071	NC_019955	AAGT	2	8	184247	184254	50 %	25 %	25 %	0 %	433656482
3072	NC_019955	TATC	2	8	184322	184329	25 %	50 %	0 %	25 %	433656482
3073	NC_019955	TTA	2	6	184401	184406	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	433656482
3074	NC_019955	CGTT	2	8	184425	184432	0 %	50 %	25 %	25 %	433656482
3075	NC_019955	TTC	2	6	184455	184460	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	433656482
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3077	NC_019955	G	8	8	184506	184513	0 %	0 %	100 %	0 %	433656482
3078	NC_019955	GC	3	6	184648	184653	0 %	0 %	50 %	50 %	433656482
3079	NC_019955	GTT	2	6	184689	184694	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	433656482
3080	NC_019955	GGC	2	6	184753	184758	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433656482
3081	NC_019955	TTGA	2	8	184783	184790	25 %	50 %	25 %	0 %	433656482
3082	NC_019955	GTT	2	6	184881	184886	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	433656482
3083	NC_019955	TGGA	2	8	184887	184894	25 %	25 %	50 %	0 %	433656482
3084	NC_019955	TGC	2	6	185055	185060	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433656482
3085	NC_019955	CCA	2	6	185110	185115	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433656482
3086	NC_019955	GCA	2	6	185139	185144	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433656482
3087	NC_019955	TGT	2	6	185184	185189	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	433656482
3088	NC_019955	GTACTG	2	12	185200	185211	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	433656482
3089	NC_019955	A	6	6	185260	185265	100 %	0 %	0 %	0 %	433656482
3090	NC_019955	A	7	7	185325	185331	100 %	0 %	0 %	0 %	433656483
3091	NC_019955	GACT	2	8	185390	185397	25 %	25 %	25 %	25 %	433656483
3092	NC_019955	TGG	2	6	185563	185568	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433656483
3093	NC_019955	ACA	2	6	185770	185775	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	433656483
3094	NC_019955	AGA	2	6	185846	185851	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	433656483
3095	NC_019955	GTT	3	9	185852	185860	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	433656483
3096	NC_019955	CGTCCT	2	12	185877	185888	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	433656483
3097	NC_019955	GAA	2	6	185909	185914	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	433656483
3098	NC_019955	ATG	2	6	185938	185943	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433656483
3099	NC_019955	CTA	2	6	185954	185959	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433656483
3100	NC_019955	AACC	2	8	185974	185981	50 %	0 %	0 %	50 %	433656483
3101	NC_019955	TTA	2	6	185990	185995	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	433656483
3102	NC_019955	A	6	6	186009	186014	100 %	0 %	0 %	0 %	433656483
3103	NC_019955	TGG	2	6	186051	186056	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433656483
3104	NC_019955	TAC	2	6	186072	186077	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433656483
3105	NC_019955	TGG	2	6	186278	186283	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433656483
3106	NC_019955	TGA	2	6	186314	186319	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433656483
3107	NC_019955	ACCCA	2	10	186404	186413	40 %	0 %	0 %	60 %	433656483
3108	NC_019955	GCG	2	6	186480	186485	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433656483
3109	NC_019955	AGCTGA	2	12	186649	186660	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	433656483
3110	NC_019955	A	6	6	186696	186701	100 %	0 %	0 %	0 %	433656483
3111	NC_019955	CTTT	2	8	186712	186719	0 %	75 %	0 %	25 %	433656483
3112	NC_019955	ACTA	2	8	186801	186808	50 %	25 %	0 %	25 %	433656483
3113	NC_019955	ACATGG	2	12	186853	186864	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	433656483
3114	NC_019955	AAG	2	6	186867	186872	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	433656483
3115	NC_019955	ATT	2	6	186903	186908	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	433656483
3116	NC_019955	CGTT	2	8	186947	186954	0 %	50 %	25 %	25 %	433656483
3117	NC_019955	GTTG	2	8	186967	186974	0 %	50 %	50 %	0 %	433656483
3118	NC_019955	GTT	2	6	187013	187018	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	433656483
3119	NC_019955	GAA	2	6	187067	187072	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	433656483
3120	NC_019955	GTT	2	6	187116	187121	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	433656483
3121	NC_019955	TGA	2	6	187127	187132	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433656483
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3123	NC_019955	TTG	2	6	189151	189156	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	433656484
3124	NC_019955	ATCT	2	8	189195	189202	25 %	50 %	0 %	25 %	433656484
3125	NC_019955	GCA	2	6	189221	189226	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433656484
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3233	NC_019955	GTT	2	6	196291	196296	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	433656494
3234	NC_019955	CAC	2	6	196393	196398	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433656494
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3236	NC_019955	CTG	2	6	196488	196493	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433656494
3237	NC_019955	TGC	2	6	196495	196500	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433656494
3238	NC_019955	TCT	2	6	196508	196513	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	433656494
3239	NC_019955	GCG	2	6	196556	196561	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433656494
3240	NC_019955	TCA	2	6	196712	196717	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433656495
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3242	NC_019955	AGC	2	6	196769	196774	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433656495
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3353	NC_019955	GTA	2	6	202280	202285	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433656502
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3361	NC_019955	CT	3	6	202893	202898	0 %	50 %	0 %	50 %	433656502
3362	NC_019955	CCA	2	6	202905	202910	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433656502
3363	NC_019955	CAT	2	6	202912	202917	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433656502
3364	NC_019955	GCT	2	6	202981	202986	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433656502
3365	NC_019955	GAT	2	6	203045	203050	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433656502
3366	NC_019955	GA	3	6	203104	203109	50 %	0 %	50 %	0 %	433656502
3367	NC_019955	GATA	2	8	203119	203126	50 %	25 %	25 %	0 %	433656502
3368	NC_019955	ATC	2	6	203189	203194	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433656502
3369	NC_019955	ATT	2	6	203196	203201	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	433656502
3370	NC_019955	GCTT	2	8	203211	203218	0 %	50 %	25 %	25 %	433656502
3371	NC_019955	TTTC	2	8	203226	203233	0 %	75 %	0 %	25 %	433656502
3372	NC_019955	GCT	2	6	203277	203282	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433656502
3373	NC_019955	CCT	2	6	203332	203337	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	433656502
3374	NC_019955	TTCTT	2	10	203338	203347	0 %	80 %	0 %	20 %	433656502
3375	NC_019955	TAGA	2	8	203399	203406	50 %	25 %	25 %	0 %	433656502
3376	NC_019955	ACCATC	2	12	203408	203419	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	433656502
3377	NC_019955	GAC	2	6	203425	203430	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433656502
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3379	NC_019955	TCTAT	2	10	203720	203729	20 %	60 %	0 %	20 %	433656503
3380	NC_019955	AGCG	2	8	203814	203821	25 %	0 %	50 %	25 %	433656503
3381	NC_019955	CAT	2	6	203847	203852	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433656503
3382	NC_019955	GAC	3	9	203861	203869	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433656503
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3384	NC_019955	TTTC	2	8	203903	203910	0 %	75 %	0 %	25 %	433656503
3385	NC_019955	CAC	2	6	204081	204086	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433656503
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3389	NC_019955	TTG	2	6	204202	204207	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	433656503
3390	NC_019955	CAG	2	6	204311	204316	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433656503
3391	NC_019955	TGC	2	6	204366	204371	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433656503
3392	NC_019955	CTT	2	6	204551	204556	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	433656503
3393	NC_019955	GC	3	6	204558	204563	0 %	0 %	50 %	50 %	433656503
3394	NC_019955	ATC	2	6	204583	204588	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433656503
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3396	NC_019955	ACTC	2	8	205009	205016	25 %	25 %	0 %	50 %	433656504
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3400	NC_019955	CGG	2	6	205167	205172	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433656504
3401	NC_019955	ATCA	2	8	205185	205192	50 %	25 %	0 %	25 %	433656504
3402	NC_019955	GTG	2	6	205193	205198	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433656504
3403	NC_019955	TG	3	6	205316	205321	0 %	50 %	50 %	0 %	433656504
3404	NC_019955	CAG	3	9	205343	205351	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433656504
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3474	NC_019955	TTTC	2	8	209208	209215	0 %	75 %	0 %	25 %	433656508
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3479	NC_019955	TGAT	2	8	209555	209562	25 %	50 %	25 %	0 %	433656509
3480	NC_019955	AAGA	2	8	209569	209576	75 %	0 %	25 %	0 %	433656509
3481	NC_019955	ATG	3	9	209590	209598	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433656509
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3484	NC_019955	TTGA	2	8	209818	209825	25 %	50 %	25 %	0 %	433656509
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