MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Vibrio parahaemolyticus BB22OP chromosome 1

Total Repeats: 53173

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2001	NC_019955	ATC	2	6	122167	122172	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433656427
2002	NC_019955	CGATAC	2	12	122277	122288	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	433656427
2003	NC_019955	CGC	2	6	122398	122403	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433656427
2004	NC_019955	GA	3	6	122457	122462	50 %	0 %	50 %	0 %	433656427
2005	NC_019955	TCA	2	6	122489	122494	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433656427
2006	NC_019955	GTA	2	6	122695	122700	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433656427
2007	NC_019955	CGA	2	6	122771	122776	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433656427
2008	NC_019955	GGAAA	2	10	122821	122830	60 %	0 %	40 %	0 %	433656427
2009	NC_019955	CAA	2	6	122832	122837	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	433656427
2010	NC_019955	GA	3	6	122875	122880	50 %	0 %	50 %	0 %	433656427
2011	NC_019955	TCT	2	6	123266	123271	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	433656428
2012	NC_019955	CTA	2	6	123327	123332	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433656428
2013	NC_019955	TGAT	2	8	123362	123369	25 %	50 %	25 %	0 %	433656428
2014	NC_019955	CGAT	2	8	123377	123384	25 %	25 %	25 %	25 %	433656428
2015	NC_019955	CAAG	2	8	123388	123395	50 %	0 %	25 %	25 %	433656428
2016	NC_019955	AAGAG	2	10	123421	123430	60 %	0 %	40 %	0 %	433656428
2017	NC_019955	ATC	2	6	123445	123450	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433656428
2018	NC_019955	AAT	2	6	123517	123522	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	433656428
2019	NC_019955	TGTT	2	8	123665	123672	0 %	75 %	25 %	0 %	433656428
2020	NC_019955	GCA	2	6	123705	123710	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433656428
2021	NC_019955	TTG	2	6	123715	123720	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	433656428
2022	NC_019955	TCC	2	6	123746	123751	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	433656428
2023	NC_019955	GAT	2	6	123847	123852	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433656428
2024	NC_019955	AGC	2	6	123908	123913	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433656428
2025	NC_019955	GTA	2	6	123952	123957	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433656428
2026	NC_019955	TCA	2	6	124071	124076	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433656428
2027	NC_019955	TGC	2	6	124105	124110	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433656428
2028	NC_019955	GTT	2	6	124116	124121	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	433656428
2029	NC_019955	TCA	2	6	124187	124192	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433656428
2030	NC_019955	CCA	2	6	124193	124198	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433656428
2031	NC_019955	TGC	2	6	124229	124234	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433656428
2032	NC_019955	TTG	2	6	124310	124315	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	433656428
2033	NC_019955	GTTT	2	8	124353	124360	0 %	75 %	25 %	0 %	433656428
2034	NC_019955	GGC	2	6	124383	124388	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433656428
2035	NC_019955	AC	3	6	124500	124505	50 %	0 %	0 %	50 %	433656428
2036	NC_019955	GAC	2	6	124633	124638	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433656428
2037	NC_019955	CAA	2	6	124644	124649	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	433656428
2038	NC_019955	GTA	2	6	124741	124746	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433656428
2039	NC_019955	TCAAAC	2	12	124784	124795	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	433656428
2040	NC_019955	TGA	2	6	124854	124859	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433656428
2041	NC_019955	TTC	2	6	124997	125002	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	433656428
2042	NC_019955	TGA	2	6	125211	125216	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433656428
2043	NC_019955	GAT	2	6	125254	125259	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433656428
2044	NC_019955	TCG	2	6	125303	125308	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433656428
2045	NC_019955	CGA	2	6	125318	125323	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433656428
2046	NC_019955	TCA	2	6	125481	125486	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433656428
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2049	NC_019955	ATC	2	6	125636	125641	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433656428
2050	NC_019955	CTTG	2	8	125864	125871	0 %	50 %	25 %	25 %	433656429
2051	NC_019955	TAA	2	6	125901	125906	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	433656429
2052	NC_019955	GAAA	2	8	125931	125938	75 %	0 %	25 %	0 %	433656429
2053	NC_019955	TCT	3	9	126026	126034	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	433656429
2054	NC_019955	ACGT	2	8	126123	126130	25 %	25 %	25 %	25 %	433656429
2055	NC_019955	GCG	2	6	126208	126213	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433656429
2056	NC_019955	TG	3	6	126229	126234	0 %	50 %	50 %	0 %	433656429
2057	NC_019955	GGC	2	6	126360	126365	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433656429
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2061	NC_019955	TTG	2	6	126628	126633	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	433656429
2062	NC_019955	CGA	2	6	126714	126719	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433656429
2063	NC_019955	GGC	2	6	126728	126733	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433656429
2064	NC_019955	GAT	2	6	126774	126779	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433656429
2065	NC_019955	TCT	2	6	126802	126807	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	433656429
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2067	NC_019955	CGG	2	6	126932	126937	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433656429
2068	NC_019955	ATG	2	6	126961	126966	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433656429
2069	NC_019955	CTTG	2	8	126998	127005	0 %	50 %	25 %	25 %	433656429
2070	NC_019955	GAG	2	6	127129	127134	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	433656429
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2072	NC_019955	GTC	2	6	127167	127172	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433656429
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2079	NC_019955	GCCCG	2	10	127432	127441	0 %	0 %	40 %	60 %	433656430
2080	NC_019955	CG	3	6	127458	127463	0 %	0 %	50 %	50 %	433656430
2081	NC_019955	TGA	2	6	127541	127546	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433656430
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2083	NC_019955	GAT	3	9	127648	127656	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433656430
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2085	NC_019955	T	6	6	127836	127841	0 %	100 %	0 %	0 %	433656430
2086	NC_019955	CAG	2	6	127843	127848	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433656430
2087	NC_019955	GGC	2	6	127918	127923	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433656430
2088	NC_019955	TTG	2	6	127924	127929	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	433656430
2089	NC_019955	GTTG	2	8	127938	127945	0 %	50 %	50 %	0 %	433656430
2090	NC_019955	TGAG	2	8	127952	127959	25 %	25 %	50 %	0 %	433656430
2091	NC_019955	CGT	2	6	127961	127966	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433656430
2092	NC_019955	CAAC	2	8	127989	127996	50 %	0 %	0 %	50 %	433656430
2093	NC_019955	CGA	2	6	128061	128066	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433656430
2094	NC_019955	ACGTC	2	10	128070	128079	20 %	20 %	20 %	40 %	433656430
2095	NC_019955	ATGC	2	8	128139	128146	25 %	25 %	25 %	25 %	433656430
2096	NC_019955	ACA	2	6	128199	128204	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	433656430
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2100	NC_019955	TG	3	6	128551	128556	0 %	50 %	50 %	0 %	433656431
2101	NC_019955	CGAT	2	8	128560	128567	25 %	25 %	25 %	25 %	433656431
2102	NC_019955	GTT	2	6	128568	128573	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	433656431
2103	NC_019955	GAA	2	6	128622	128627	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	433656431
2104	NC_019955	CAGTTG	2	12	128628	128639	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	433656431
2105	NC_019955	TAC	2	6	128696	128701	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433656431
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2107	NC_019955	TTTTC	2	10	128762	128771	0 %	80 %	0 %	20 %	433656431
2108	NC_019955	CTT	2	6	128777	128782	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	433656431
2109	NC_019955	GCT	2	6	128794	128799	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433656431
2110	NC_019955	AGT	2	6	129227	129232	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433656432
2111	NC_019955	GTC	2	6	129315	129320	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433656432
2112	NC_019955	CGC	2	6	129329	129334	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433656432
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2114	NC_019955	GCT	2	6	129412	129417	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433656432
2115	NC_019955	TCT	2	6	129418	129423	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	433656432
2116	NC_019955	TGC	2	6	129531	129536	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433656432
2117	NC_019955	ACG	2	6	129561	129566	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433656432
2118	NC_019955	AAGC	2	8	129626	129633	50 %	0 %	25 %	25 %	433656432
2119	NC_019955	TTG	2	6	129677	129682	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	433656432
2120	NC_019955	TGA	2	6	129719	129724	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433656432
2121	NC_019955	CCG	2	6	129727	129732	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433656432
2122	NC_019955	GTA	2	6	129735	129740	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433656432
2123	NC_019955	CCG	2	6	129760	129765	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433656432
2124	NC_019955	TAC	2	6	129900	129905	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433656432
2125	NC_019955	GTT	2	6	129937	129942	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	433656432
2126	NC_019955	GTG	3	9	129993	130001	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433656432
2127	NC_019955	CAA	2	6	130007	130012	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	433656432
2128	NC_019955	TTC	2	6	130023	130028	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	433656432
2129	NC_019955	TGC	2	6	130155	130160	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433656432
2130	NC_019955	GTC	2	6	130167	130172	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433656432
2131	NC_019955	GAA	2	6	130179	130184	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	433656432
2132	NC_019955	GAA	2	6	130227	130232	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	433656432
2133	NC_019955	CAA	2	6	130247	130252	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	433656432
2134	NC_019955	TTG	2	6	130337	130342	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	433656432
2135	NC_019955	CAT	2	6	130422	130427	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433656432
2136	NC_019955	CCAG	2	8	130455	130462	25 %	0 %	25 %	50 %	433656432
2137	NC_019955	TGA	2	6	130467	130472	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433656432
2138	NC_019955	CTT	2	6	130490	130495	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	433656432
2139	NC_019955	GAA	2	6	130497	130502	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	433656432
2140	NC_019955	TGC	2	6	130537	130542	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433656432
2141	NC_019955	CAA	2	6	130574	130579	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	433656432
2142	NC_019955	GTTG	2	8	131229	131236	0 %	50 %	50 %	0 %	433656433
2143	NC_019955	GCT	2	6	131241	131246	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433656433
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2150	NC_019955	GTT	2	6	131746	131751	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	433656433
2151	NC_019955	CAA	2	6	131872	131877	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	433656433
2152	NC_019955	CAT	2	6	131883	131888	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433656433
2153	NC_019955	CTGT	2	8	132067	132074	0 %	50 %	25 %	25 %	433656433
2154	NC_019955	TGA	2	6	132075	132080	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433656433
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2159	NC_019955	CGT	2	6	132289	132294	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433656433
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2162	NC_019955	TCA	2	6	132491	132496	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433656433
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2164	NC_019955	AACG	2	8	132660	132667	50 %	0 %	25 %	25 %	433656433
2165	NC_019955	GTC	2	6	132692	132697	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433656433
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2187	NC_019955	TTC	2	6	134117	134122	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	433656435
2188	NC_019955	CTT	2	6	134128	134133	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	433656435
2189	NC_019955	ATA	2	6	134169	134174	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	433656435
2190	NC_019955	TAA	2	6	134261	134266	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	433656435
2191	NC_019955	AG	3	6	134324	134329	50 %	0 %	50 %	0 %	433656436
2192	NC_019955	T	6	6	134373	134378	0 %	100 %	0 %	0 %	433656436
2193	NC_019955	TCT	2	6	134384	134389	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	433656436
2194	NC_019955	TGC	2	6	134527	134532	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433656436
2195	NC_019955	CAT	2	6	134540	134545	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433656436
2196	NC_019955	CACTG	2	10	134582	134591	20 %	20 %	20 %	40 %	433656436
2197	NC_019955	GGT	2	6	134631	134636	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433656436
2198	NC_019955	CTT	2	6	134639	134644	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	433656436
2199	NC_019955	TGC	2	6	134651	134656	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433656436
2200	NC_019955	GCTGAT	2	12	134657	134668	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	433656436
2201	NC_019955	GCA	2	6	134793	134798	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433656436
2202	NC_019955	CGT	2	6	134812	134817	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433656436
2203	NC_019955	T	6	6	134892	134897	0 %	100 %	0 %	0 %	433656436
2204	NC_019955	CAAA	2	8	134926	134933	75 %	0 %	0 %	25 %	433656436
2205	NC_019955	A	6	6	134931	134936	100 %	0 %	0 %	0 %	433656436
2206	NC_019955	GCC	2	6	134964	134969	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433656436
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2208	NC_019955	TAAG	2	8	134992	134999	50 %	25 %	25 %	0 %	433656436
2209	NC_019955	TTGT	2	8	135075	135082	0 %	75 %	25 %	0 %	433656436
2210	NC_019955	GAT	2	6	135101	135106	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433656436
2211	NC_019955	GCA	2	6	135132	135137	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433656436
2212	NC_019955	TCG	2	6	135183	135188	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433656436
2213	NC_019955	GAAG	2	8	135210	135217	50 %	0 %	50 %	0 %	433656436
2214	NC_019955	AGT	2	6	135222	135227	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433656436
2215	NC_019955	TCT	2	6	135303	135308	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	433656437
2216	NC_019955	GAC	2	6	135331	135336	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433656437
2217	NC_019955	ACC	2	6	135373	135378	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433656437
2218	NC_019955	GAC	2	6	135394	135399	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433656437
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2220	NC_019955	GTG	2	6	135509	135514	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433656437
2221	NC_019955	ACT	2	6	135545	135550	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433656437
2222	NC_019955	TG	3	6	135560	135565	0 %	50 %	50 %	0 %	433656437
2223	NC_019955	ATTA	2	8	135618	135625	50 %	50 %	0 %	0 %	433656437
2224	NC_019955	CAA	2	6	135788	135793	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	433656438
2225	NC_019955	TGA	2	6	135876	135881	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433656438
2226	NC_019955	ATG	2	6	135884	135889	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433656438
2227	NC_019955	TCA	2	6	135897	135902	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433656438
2228	NC_019955	TCG	2	6	136005	136010	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433656438
2229	NC_019955	GC	3	6	136057	136062	0 %	0 %	50 %	50 %	433656438
2230	NC_019955	AAG	2	6	136064	136069	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	433656438
2231	NC_019955	A	7	7	136121	136127	100 %	0 %	0 %	0 %	433656438
2232	NC_019955	CGT	2	6	136138	136143	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433656438
2233	NC_019955	CGGTC	2	10	136164	136173	0 %	20 %	40 %	40 %	433656438
2234	NC_019955	CAA	2	6	136180	136185	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	433656438
2235	NC_019955	GCA	2	6	136248	136253	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433656438
2236	NC_019955	GTG	2	6	136544	136549	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433656438
2237	NC_019955	GC	3	6	136579	136584	0 %	0 %	50 %	50 %	433656438
2238	NC_019955	GCG	2	6	136610	136615	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433656438
2239	NC_019955	TTC	3	9	136687	136695	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	433656439
2240	NC_019955	TCGT	2	8	136706	136713	0 %	50 %	25 %	25 %	433656439
2241	NC_019955	CTT	2	6	136752	136757	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	433656439
2242	NC_019955	TCC	2	6	136802	136807	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	433656439
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2364	NC_019955	TCA	2	6	143763	143768	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433656444
2365	NC_019955	TGAT	2	8	143829	143836	25 %	50 %	25 %	0 %	433656444
2366	NC_019955	ATC	2	6	143879	143884	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433656444
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2368	NC_019955	ATC	2	6	143927	143932	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433656444
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2486	NC_019955	GAA	2	6	150158	150163	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	433656450
2487	NC_019955	TTGAAG	2	12	150210	150221	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433656450
2488	NC_019955	GC	3	6	150237	150242	0 %	0 %	50 %	50 %	433656450
2489	NC_019955	GAAA	2	8	150279	150286	75 %	0 %	25 %	0 %	433656450
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2498	NC_019955	TTG	2	6	150697	150702	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	433656451
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