MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Vibrio parahaemolyticus BB22OP chromosome 1

Total Repeats: 53173

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_019955	TGAT	2	8	330201	330208	25 %	50 %	25 %	0 %	433656639
5502	NC_019955	CAA	2	6	330214	330219	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	433656640
5503	NC_019955	A	6	6	330236	330241	100 %	0 %	0 %	0 %	433656640
5504	NC_019955	CGG	2	6	330312	330317	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433656640
5505	NC_019955	CGG	2	6	330345	330350	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433656640
5506	NC_019955	CGC	2	6	330403	330408	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433656640
5507	NC_019955	TGG	2	6	330420	330425	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433656640
5508	NC_019955	TGG	2	6	330519	330524	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433656640
5509	NC_019955	GCG	2	6	330551	330556	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433656640
5510	NC_019955	GGC	2	6	330592	330597	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433656640
5511	NC_019955	CAT	2	6	330706	330711	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433656640
5512	NC_019955	TGG	2	6	330771	330776	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433656640
5513	NC_019955	GT	3	6	331280	331285	0 %	50 %	50 %	0 %	433656641
5514	NC_019955	TCGTCT	2	12	331296	331307	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	433656641
5515	NC_019955	AAC	2	6	331351	331356	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	433656641
5516	NC_019955	GAA	2	6	331371	331376	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	433656641
5517	NC_019955	ACG	2	6	331444	331449	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433656641
5518	NC_019955	ACA	2	6	331487	331492	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	433656641
5519	NC_019955	CCG	2	6	331510	331515	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433656641
5520	NC_019955	TGG	2	6	331532	331537	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433656641
5521	NC_019955	CG	3	6	331541	331546	0 %	0 %	50 %	50 %	433656641
5522	NC_019955	CGA	2	6	331629	331634	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433656641
5523	NC_019955	AGCA	2	8	331659	331666	50 %	0 %	25 %	25 %	433656641
5524	NC_019955	ACC	2	6	331747	331752	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433656641
5525	NC_019955	GCC	2	6	331840	331845	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433656641
5526	NC_019955	A	6	6	331860	331865	100 %	0 %	0 %	0 %	433656641
5527	NC_019955	TGA	2	6	331905	331910	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433656641
5528	NC_019955	CAAG	2	8	331997	332004	50 %	0 %	25 %	25 %	433656641
5529	NC_019955	TGA	2	6	332022	332027	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433656641
5530	NC_019955	GAT	2	6	332158	332163	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433656642
5531	NC_019955	GAC	2	6	332240	332245	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433656642
5532	NC_019955	TAT	2	6	332249	332254	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	433656642
5533	NC_019955	TTTC	2	8	332288	332295	0 %	75 %	0 %	25 %	433656642
5534	NC_019955	TGGT	2	8	332412	332419	0 %	50 %	50 %	0 %	433656642
5535	NC_019955	TGC	3	9	332568	332576	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433656642
5536	NC_019955	CTG	2	6	332595	332600	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433656642
5537	NC_019955	TG	3	6	332613	332618	0 %	50 %	50 %	0 %	433656642
5538	NC_019955	GCA	2	6	332677	332682	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433656642
5539	NC_019955	TGT	2	6	332712	332717	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	433656642
5540	NC_019955	CCA	2	6	332766	332771	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433656642
5541	NC_019955	TTTGAT	2	12	332804	332815	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	433656642
5542	NC_019955	TGT	2	6	332853	332858	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	433656642
5543	NC_019955	ACT	2	6	332863	332868	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433656642
5544	NC_019955	GCA	2	6	332916	332921	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433656642
5545	NC_019955	GGT	2	6	332955	332960	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433656642
5546	NC_019955	CCG	2	6	333011	333016	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433656642
5547	NC_019955	CAAC	2	8	333043	333050	50 %	0 %	0 %	50 %	433656642
5548	NC_019955	TTG	2	6	333158	333163	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	433656642
5549	NC_019955	ATT	2	6	333230	333235	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	433656642
5550	NC_019955	TAC	2	6	333276	333281	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433656642
5551	NC_019955	T	6	6	333314	333319	0 %	100 %	0 %	0 %	433656642
5552	NC_019955	TGC	2	6	333384	333389	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433656642
5553	NC_019955	CAGTAT	2	12	333401	333412	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	433656642
5554	NC_019955	TGGC	2	8	333436	333443	0 %	25 %	50 %	25 %	433656642
5555	NC_019955	GTG	2	6	333455	333460	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433656642
5556	NC_019955	TGG	2	6	333550	333555	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433656642
5557	NC_019955	TACCT	2	10	333568	333577	20 %	40 %	0 %	40 %	433656642
5558	NC_019955	GATG	2	8	333610	333617	25 %	25 %	50 %	0 %	433656642
5559	NC_019955	GGT	2	6	333625	333630	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433656642
5560	NC_019955	TTG	3	9	333644	333652	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	433656642
5561	NC_019955	GAT	2	6	333721	333726	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433656643
5562	NC_019955	TTGAG	2	10	333761	333770	20 %	40 %	40 %	0 %	433656643
5563	NC_019955	CATC	2	8	333852	333859	25 %	25 %	0 %	50 %	433656643
5564	NC_019955	ACA	2	6	333977	333982	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	433656643
5565	NC_019955	GCA	2	6	334050	334055	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433656643
5566	NC_019955	GTT	2	6	334133	334138	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	433656643
5567	NC_019955	A	7	7	334224	334230	100 %	0 %	0 %	0 %	433656643
5568	NC_019955	CAT	2	6	334270	334275	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433656643
5569	NC_019955	CTTTGT	2	12	334305	334316	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	433656643
5570	NC_019955	GGTG	2	8	334338	334345	0 %	25 %	75 %	0 %	433656643
5571	NC_019955	TTCG	2	8	334393	334400	0 %	50 %	25 %	25 %	433656643
5572	NC_019955	GCT	2	6	334402	334407	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433656643
5573	NC_019955	ATG	2	6	334413	334418	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433656643
5574	NC_019955	ATA	2	6	334589	334594	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	433656644
5575	NC_019955	TTG	2	6	334629	334634	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	433656644
5576	NC_019955	TCA	3	9	334676	334684	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433656644
5577	NC_019955	GCT	3	9	334710	334718	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433656644
5578	NC_019955	CGC	2	6	334738	334743	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433656644
5579	NC_019955	AAGT	2	8	334757	334764	50 %	25 %	25 %	0 %	433656644
5580	NC_019955	TTGC	2	8	334830	334837	0 %	50 %	25 %	25 %	433656644
5581	NC_019955	GTT	2	6	334970	334975	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	433656645
5582	NC_019955	ACG	2	6	334986	334991	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433656645
5583	NC_019955	CAG	2	6	335013	335018	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433656645
5584	NC_019955	CAAG	2	8	335025	335032	50 %	0 %	25 %	25 %	433656645
5585	NC_019955	CGA	2	6	335144	335149	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433656645
5586	NC_019955	CGT	2	6	335159	335164	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433656645
5587	NC_019955	TCAG	2	8	335167	335174	25 %	25 %	25 %	25 %	433656645
5588	NC_019955	CGT	2	6	335208	335213	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433656645
5589	NC_019955	CCA	2	6	335376	335381	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433656645
5590	NC_019955	GAA	2	6	335394	335399	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	433656645
5591	NC_019955	TAA	2	6	335415	335420	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	433656645
5592	NC_019955	CAC	2	6	335434	335439	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433656645
5593	NC_019955	CCA	2	6	335454	335459	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433656645
5594	NC_019955	AGA	2	6	335477	335482	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	433656645
5595	NC_019955	ATG	2	6	335494	335499	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433656645
5596	NC_019955	CCA	2	6	335526	335531	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433656645
5597	NC_019955	CAA	2	6	335547	335552	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	433656645
5598	NC_019955	AAAC	2	8	335567	335574	75 %	0 %	0 %	25 %	433656645
5599	NC_019955	TGC	2	6	335652	335657	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433656645
5600	NC_019955	GACC	2	8	335675	335682	25 %	0 %	25 %	50 %	433656645
5601	NC_019955	GGT	2	6	335683	335688	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433656645
5602	NC_019955	ATC	2	6	335691	335696	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433656645
5603	NC_019955	TAC	2	6	335802	335807	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433656645
5604	NC_019955	CAG	2	6	335868	335873	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433656645
5605	NC_019955	CAA	2	6	335906	335911	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	433656645
5606	NC_019955	TCA	2	6	335918	335923	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433656645
5607	NC_019955	CAA	2	6	335954	335959	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	433656645
5608	NC_019955	GCC	2	6	335968	335973	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433656645
5609	NC_019955	ACCGAT	2	12	335985	335996	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	433656645
5610	NC_019955	CCA	2	6	336014	336019	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433656645
5611	NC_019955	CTT	2	6	336071	336076	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	433656645
5612	NC_019955	TCAG	2	8	336253	336260	25 %	25 %	25 %	25 %	433656645
5613	NC_019955	GTA	2	6	336399	336404	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433656645
5614	NC_019955	AC	3	6	336421	336426	50 %	0 %	0 %	50 %	433656645
5615	NC_019955	TGAA	2	8	336446	336453	50 %	25 %	25 %	0 %	433656645
5616	NC_019955	GCA	2	6	336464	336469	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433656645
5617	NC_019955	GAC	2	6	336482	336487	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433656645
5618	NC_019955	CCA	2	6	336614	336619	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433656645
5619	NC_019955	TGC	2	6	336627	336632	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433656645
5620	NC_019955	GCT	2	6	336673	336678	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433656645
5621	NC_019955	TCA	2	6	336722	336727	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433656645
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5652	NC_019955	TGT	2	6	338243	338248	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	433656647
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5724	NC_019955	TGG	2	6	342620	342625	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433656652
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5732	NC_019955	CGT	3	9	342831	342839	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433656652
5733	NC_019955	TGAAG	2	10	342881	342890	40 %	20 %	40 %	0 %	433656652
5734	NC_019955	CA	3	6	342936	342941	50 %	0 %	0 %	50 %	433656653
5735	NC_019955	A	6	6	342941	342946	100 %	0 %	0 %	0 %	433656653
5736	NC_019955	TGG	2	6	342949	342954	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433656653
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5738	NC_019955	CAT	2	6	343036	343041	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433656653
5739	NC_019955	AAC	2	6	343076	343081	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	433656653
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5741	NC_019955	GCG	2	6	343452	343457	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433656654
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5984	NC_019955	CAT	2	6	356730	356735	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433656667
5985	NC_019955	CCG	2	6	356766	356771	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433656667
5986	NC_019955	CCGC	2	8	356954	356961	0 %	0 %	25 %	75 %	433656667
5987	NC_019955	GAT	2	6	356977	356982	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433656667
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5991	NC_019955	CGT	2	6	357507	357512	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433656667
5992	NC_019955	GTC	2	6	357677	357682	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433656668
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