MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Vibrio parahaemolyticus BB22OP chromosome 1

Total Repeats: 53173

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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5002	NC_019955	TGC	2	6	300286	300291	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433656611
5003	NC_019955	GCT	2	6	300383	300388	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433656611
5004	NC_019955	GAA	2	6	300389	300394	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	433656611
5005	NC_019955	GCT	2	6	300395	300400	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433656611
5006	NC_019955	TTAC	2	8	300545	300552	25 %	50 %	0 %	25 %	433656612
5007	NC_019955	AAT	2	6	300582	300587	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	433656612
5008	NC_019955	ATC	2	6	300645	300650	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433656612
5009	NC_019955	TTG	2	6	300779	300784	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	433656612
5010	NC_019955	CTG	2	6	300819	300824	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433656612
5011	NC_019955	TAG	2	6	300866	300871	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433656612
5012	NC_019955	TGC	2	6	300934	300939	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433656612
5013	NC_019955	TAG	2	6	301174	301179	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433656613
5014	NC_019955	TGC	2	6	301198	301203	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433656613
5015	NC_019955	CAACC	2	10	301305	301314	40 %	0 %	0 %	60 %	433656613
5016	NC_019955	GCT	4	12	301538	301549	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433656613
5017	NC_019955	GCT	2	6	301553	301558	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433656613
5018	NC_019955	GCT	2	6	301568	301573	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433656613
5019	NC_019955	GT	3	6	301583	301588	0 %	50 %	50 %	0 %	433656613
5020	NC_019955	TTG	2	6	301604	301609	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	433656613
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5022	NC_019955	GCTT	2	8	301741	301748	0 %	50 %	25 %	25 %	433656613
5023	NC_019955	AATTT	2	10	301766	301775	40 %	60 %	0 %	0 %	433656613
5024	NC_019955	TCG	2	6	302020	302025	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433656614
5025	NC_019955	AGAA	2	8	302027	302034	75 %	0 %	25 %	0 %	433656614
5026	NC_019955	AGC	2	6	302037	302042	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433656614
5027	NC_019955	CAAA	2	8	302065	302072	75 %	0 %	0 %	25 %	433656614
5028	NC_019955	GCT	2	6	302078	302083	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433656614
5029	NC_019955	AGC	2	6	302094	302099	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433656614
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5031	NC_019955	AAGT	2	8	302110	302117	50 %	25 %	25 %	0 %	433656614
5032	NC_019955	ATT	2	6	302200	302205	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	433656614
5033	NC_019955	ACTTCT	2	12	302206	302217	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	433656614
5034	NC_019955	CAG	2	6	302258	302263	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433656614
5035	NC_019955	ACGT	2	8	302323	302330	25 %	25 %	25 %	25 %	433656614
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5037	NC_019955	GAA	2	6	302377	302382	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	433656614
5038	NC_019955	CAA	2	6	302410	302415	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	433656614
5039	NC_019955	GAAG	2	8	302456	302463	50 %	0 %	50 %	0 %	433656614
5040	NC_019955	T	6	6	302573	302578	0 %	100 %	0 %	0 %	433656614
5041	NC_019955	TCT	2	6	302727	302732	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	433656615
5042	NC_019955	T	6	6	302812	302817	0 %	100 %	0 %	0 %	433656615
5043	NC_019955	CCA	2	6	302874	302879	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433656615
5044	NC_019955	TGTT	2	8	302888	302895	0 %	75 %	25 %	0 %	433656615
5045	NC_019955	TCA	2	6	302970	302975	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433656615
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5049	NC_019955	GCA	2	6	303079	303084	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433656615
5050	NC_019955	AGT	2	6	303101	303106	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433656615
5051	NC_019955	CAAA	2	8	303294	303301	75 %	0 %	0 %	25 %	433656616
5052	NC_019955	CTA	2	6	303331	303336	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433656616
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5054	NC_019955	TTG	2	6	303668	303673	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	433656616
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5056	NC_019955	GCG	2	6	303808	303813	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433656616
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5058	NC_019955	TAT	2	6	303882	303887	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	433656616
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5060	NC_019955	TGA	2	6	303978	303983	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433656616
5061	NC_019955	TCT	2	6	303996	304001	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	433656616
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5063	NC_019955	CGG	2	6	304022	304027	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433656616
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5069	NC_019955	GATG	2	8	304377	304384	25 %	25 %	50 %	0 %	433656616
5070	NC_019955	AAATC	2	10	304408	304417	60 %	20 %	0 %	20 %	433656616
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5093	NC_019955	GTAC	2	8	305890	305897	25 %	25 %	25 %	25 %	433656618
5094	NC_019955	CAAT	2	8	305909	305916	50 %	25 %	0 %	25 %	433656618
5095	NC_019955	CTGCA	2	10	305964	305973	20 %	20 %	20 %	40 %	433656618
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5104	NC_019955	TTGG	2	8	306285	306292	0 %	50 %	50 %	0 %	433656618
5105	NC_019955	ATG	2	6	306338	306343	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433656618
5106	NC_019955	ACT	2	6	306416	306421	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433656618
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5109	NC_019955	CCTT	2	8	306704	306711	0 %	50 %	0 %	50 %	433656618
5110	NC_019955	TGA	2	6	306839	306844	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433656618
5111	NC_019955	TG	3	6	306870	306875	0 %	50 %	50 %	0 %	433656618
5112	NC_019955	AAG	2	6	306974	306979	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	433656618
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5230	NC_019955	GT	3	6	313332	313337	0 %	50 %	50 %	0 %	433656623
5231	NC_019955	A	6	6	313365	313370	100 %	0 %	0 %	0 %	433656623
5232	NC_019955	CAAT	2	8	313426	313433	50 %	25 %	0 %	25 %	433656623
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5236	NC_019955	CGT	2	6	313509	313514	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433656623
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5351	NC_019955	A	7	7	320462	320468	100 %	0 %	0 %	0 %	433656633
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5358	NC_019955	TGAAT	2	10	320960	320969	40 %	40 %	20 %	0 %	433656633
5359	NC_019955	ACCTT	2	10	321092	321101	20 %	40 %	0 %	40 %	433656633
5360	NC_019955	TCC	2	6	321153	321158	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	433656633
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5362	NC_019955	AAGC	2	8	321179	321186	50 %	0 %	25 %	25 %	433656633
5363	NC_019955	CTG	2	6	321229	321234	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433656633
5364	NC_019955	A	6	6	321303	321308	100 %	0 %	0 %	0 %	433656633
5365	NC_019955	GC	3	6	321321	321326	0 %	0 %	50 %	50 %	433656633
5366	NC_019955	TC	4	8	321351	321358	0 %	50 %	0 %	50 %	433656633
5367	NC_019955	CCG	2	6	321379	321384	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433656633
5368	NC_019955	GAC	2	6	321402	321407	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433656633
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5370	NC_019955	GAT	2	6	321579	321584	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433656633
5371	NC_019955	GTG	2	6	321634	321639	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433656633
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5379	NC_019955	AC	3	6	322024	322029	50 %	0 %	0 %	50 %	433656633
5380	NC_019955	AAC	2	6	322125	322130	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	433656633
5381	NC_019955	CTG	2	6	322220	322225	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433656634
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5383	NC_019955	TGA	2	6	322381	322386	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433656634
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5385	NC_019955	TGA	2	6	322468	322473	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433656634
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5391	NC_019955	GAAA	2	8	322771	322778	75 %	0 %	25 %	0 %	433656634
5392	NC_019955	CGC	2	6	322788	322793	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433656634
5393	NC_019955	GC	3	6	322838	322843	0 %	0 %	50 %	50 %	433656634
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5396	NC_019955	GTG	2	6	322923	322928	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433656634
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5402	NC_019955	G	6	6	323410	323415	0 %	0 %	100 %	0 %	433656634
5403	NC_019955	GCG	2	6	323447	323452	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433656634
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5417	NC_019955	GCC	2	6	325021	325026	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433656634
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5481	NC_019955	GTT	2	6	329310	329315	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	433656639
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5484	NC_019955	GAT	2	6	329427	329432	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433656639
5485	NC_019955	CAT	2	6	329457	329462	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433656639
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