MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Vibrio cholerae LMA3984-4 chromosome chromosome I

Total Repeats: 5503

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017270	GCTC	2	8	985	992	0 %	25 %	25 %	50 %	384423364
2	NC_017270	TTGG	2	8	1554	1561	0 %	50 %	50 %	0 %	384423364
3	NC_017270	ATCA	2	8	1779	1786	50 %	25 %	0 %	25 %	384423364
4	NC_017270	ATGA	2	8	1964	1971	50 %	25 %	25 %	0 %	384423364
5	NC_017270	GCGT	2	8	2060	2067	0 %	25 %	50 %	25 %	384423364
6	NC_017270	ACTT	2	8	2269	2276	25 %	50 %	0 %	25 %	384423365
7	NC_017270	ACCA	2	8	2347	2354	50 %	0 %	0 %	50 %	384423365
8	NC_017270	CCAA	2	8	2541	2548	50 %	0 %	0 %	50 %	384423365
9	NC_017270	CAAC	2	8	2904	2911	50 %	0 %	0 %	50 %	384423365
10	NC_017270	TTTG	2	8	3024	3031	0 %	75 %	25 %	0 %	384423365
11	NC_017270	CATA	2	8	3305	3312	50 %	25 %	0 %	25 %	384423365
12	NC_017270	CACT	2	8	3479	3486	25 %	25 %	0 %	50 %	384423365
13	NC_017270	GAAA	2	8	3846	3853	75 %	0 %	25 %	0 %	384423365
14	NC_017270	CAAG	2	8	4164	4171	50 %	0 %	25 %	25 %	384423366
15	NC_017270	GCGA	2	8	4366	4373	25 %	0 %	50 %	25 %	384423366
16	NC_017270	TTGA	2	8	4886	4893	25 %	50 %	25 %	0 %	384423368
17	NC_017270	CACC	2	8	5080	5087	25 %	0 %	0 %	75 %	384423368
18	NC_017270	GAGG	2	8	5782	5789	25 %	0 %	75 %	0 %	384423369
19	NC_017270	CAAC	2	8	6018	6025	50 %	0 %	0 %	50 %	384423369
20	NC_017270	CAGA	2	8	6560	6567	50 %	0 %	25 %	25 %	384423370
21	NC_017270	ATCA	2	8	6777	6784	50 %	25 %	0 %	25 %	384423370
22	NC_017270	CAAA	2	8	6878	6885	75 %	0 %	0 %	25 %	384423370
23	NC_017270	CAAC	2	8	8191	8198	50 %	0 %	0 %	50 %	384423372
24	NC_017270	CTTT	2	8	8376	8383	0 %	75 %	0 %	25 %	384423372
25	NC_017270	CGTG	2	8	8407	8414	0 %	25 %	50 %	25 %	384423372
26	NC_017270	GATT	2	8	8476	8483	25 %	50 %	25 %	0 %	384423372
27	NC_017270	CGTG	2	8	8485	8492	0 %	25 %	50 %	25 %	384423372
28	NC_017270	ACCA	2	8	8663	8670	50 %	0 %	0 %	50 %	384423372
29	NC_017270	GCAG	2	8	9065	9072	25 %	0 %	50 %	25 %	384423373
30	NC_017270	CTCA	2	8	9260	9267	25 %	25 %	0 %	50 %	384423373
31	NC_017270	CCAA	2	8	9312	9319	50 %	0 %	0 %	50 %	384423373
32	NC_017270	CGGA	2	8	10161	10168	25 %	0 %	50 %	25 %	384423374
33	NC_017270	AGCA	2	8	10477	10484	50 %	0 %	25 %	25 %	384423374
34	NC_017270	TCAA	2	8	10592	10599	50 %	25 %	0 %	25 %	384423374
35	NC_017270	CTCG	2	8	14016	14023	0 %	25 %	25 %	50 %	384423375
36	NC_017270	GAGC	2	8	14030	14037	25 %	0 %	50 %	25 %	384423375
37	NC_017270	CCAA	2	8	14279	14286	50 %	0 %	0 %	50 %	384423375
38	NC_017270	TTAA	2	8	14440	14447	50 %	50 %	0 %	0 %	384423376
39	NC_017270	TATC	2	8	14976	14983	25 %	50 %	0 %	25 %	384423377
40	NC_017270	CAAT	2	8	15405	15412	50 %	25 %	0 %	25 %	384423378
41	NC_017270	CGAC	2	8	15963	15970	25 %	0 %	25 %	50 %	384423378
42	NC_017270	GCGA	2	8	16253	16260	25 %	0 %	50 %	25 %	384423378
43	NC_017270	GCCA	2	8	16792	16799	25 %	0 %	25 %	50 %	384423379
44	NC_017270	TTGG	2	8	17054	17061	0 %	50 %	50 %	0 %	384423379
45	NC_017270	CGGT	2	8	17618	17625	0 %	25 %	50 %	25 %	384423379
46	NC_017270	GTGC	2	8	18164	18171	0 %	25 %	50 %	25 %	384423379
47	NC_017270	TGCT	2	8	18403	18410	0 %	50 %	25 %	25 %	384423379
48	NC_017270	TTGG	2	8	18452	18459	0 %	50 %	50 %	0 %	384423379
49	NC_017270	AAGT	2	8	18979	18986	50 %	25 %	25 %	0 %	384423380
50	NC_017270	AAGT	2	8	19204	19211	50 %	25 %	25 %	0 %	384423380
51	NC_017270	TGGA	2	8	20327	20334	25 %	25 %	50 %	0 %	384423381
52	NC_017270	TTGC	2	8	20491	20498	0 %	50 %	25 %	25 %	384423381
53	NC_017270	CGAT	2	8	22189	22196	25 %	25 %	25 %	25 %	384423385
54	NC_017270	GCTG	2	8	22427	22434	0 %	25 %	50 %	25 %	384423385
55	NC_017270	ACCA	2	8	22456	22463	50 %	0 %	0 %	50 %	384423385
56	NC_017270	AATC	2	8	22592	22599	50 %	25 %	0 %	25 %	384423385
57	NC_017270	GTGA	2	8	22743	22750	25 %	25 %	50 %	0 %	384423385
58	NC_017270	AGGC	2	8	23924	23931	25 %	0 %	50 %	25 %	384423386
59	NC_017270	ACCG	2	8	24019	24026	25 %	0 %	25 %	50 %	384423386
60	NC_017270	CTGG	2	8	24411	24418	0 %	25 %	50 %	25 %	384423386
61	NC_017270	AGGT	2	8	24917	24924	25 %	25 %	50 %	0 %	384423387
62	NC_017270	TGCG	2	8	25168	25175	0 %	25 %	50 %	25 %	384423387
63	NC_017270	GTTT	2	8	25307	25314	0 %	75 %	25 %	0 %	384423387
64	NC_017270	CCGC	2	8	25421	25428	0 %	0 %	25 %	75 %	384423387
65	NC_017270	CGAT	2	8	25505	25512	25 %	25 %	25 %	25 %	384423387
66	NC_017270	CCTT	2	8	27366	27373	0 %	50 %	0 %	50 %	384423389
67	NC_017270	CTTG	2	8	27557	27564	0 %	50 %	25 %	25 %	384423389
68	NC_017270	GTCG	2	8	28190	28197	0 %	25 %	50 %	25 %	384423390
69	NC_017270	CATC	2	8	28975	28982	25 %	25 %	0 %	50 %	384423390
70	NC_017270	TGCG	2	8	33376	33383	0 %	25 %	50 %	25 %	384423393
71	NC_017270	TGGG	2	8	33465	33472	0 %	25 %	75 %	0 %	384423393
72	NC_017270	TTTG	2	8	34251	34258	0 %	75 %	25 %	0 %	384423394
73	NC_017270	CAAT	2	8	34682	34689	50 %	25 %	0 %	25 %	384423394
74	NC_017270	CCAA	2	8	35001	35008	50 %	0 %	0 %	50 %	384423394
75	NC_017270	CAAG	2	8	35289	35296	50 %	0 %	25 %	25 %	384423394
76	NC_017270	TTTC	2	8	36352	36359	0 %	75 %	0 %	25 %	384423396
77	NC_017270	GCCA	2	8	36972	36979	25 %	0 %	25 %	50 %	384423397
78	NC_017270	GGTT	2	8	37950	37957	0 %	50 %	50 %	0 %	384423398
79	NC_017270	TCGC	2	8	37975	37982	0 %	25 %	25 %	50 %	384423398
80	NC_017270	GGTG	2	8	38106	38113	0 %	25 %	75 %	0 %	384423398
81	NC_017270	ACTG	2	8	38524	38531	25 %	25 %	25 %	25 %	384423399
82	NC_017270	TGGT	2	8	38539	38546	0 %	50 %	50 %	0 %	384423399
83	NC_017270	GCTG	2	8	38844	38851	0 %	25 %	50 %	25 %	384423399
84	NC_017270	GCCA	2	8	39104	39111	25 %	0 %	25 %	50 %	384423400
85	NC_017270	CAAC	2	8	39464	39471	50 %	0 %	0 %	50 %	384423400
86	NC_017270	ACGT	2	8	40124	40131	25 %	25 %	25 %	25 %	384423400
87	NC_017270	GTGA	2	8	40633	40640	25 %	25 %	50 %	0 %	384423401
88	NC_017270	ATCA	2	8	40681	40688	50 %	25 %	0 %	25 %	384423401
89	NC_017270	ACTC	2	8	41043	41050	25 %	25 %	0 %	50 %	384423401
90	NC_017270	ACCA	2	8	41212	41219	50 %	0 %	0 %	50 %	384423401
91	NC_017270	TGGC	2	8	41555	41562	0 %	25 %	50 %	25 %	384423401
92	NC_017270	AGCG	2	8	41668	41675	25 %	0 %	50 %	25 %	384423401
93	NC_017270	CAAT	2	8	42234	42241	50 %	25 %	0 %	25 %	384423402
94	NC_017270	AGTG	2	8	42996	43003	25 %	25 %	50 %	0 %	384423402
95	NC_017270	TCGC	2	8	43573	43580	0 %	25 %	25 %	50 %	384423403
96	NC_017270	CATC	2	8	43631	43638	25 %	25 %	0 %	50 %	384423403
97	NC_017270	ATTT	2	8	44076	44083	25 %	75 %	0 %	0 %	384423404
98	NC_017270	GGAC	2	8	44305	44312	25 %	0 %	50 %	25 %	384423404
99	NC_017270	CAAG	2	8	45191	45198	50 %	0 %	25 %	25 %	384423405
100	NC_017270	GGTG	2	8	45308	45315	0 %	25 %	75 %	0 %	384423405
101	NC_017270	CAGC	2	8	45447	45454	25 %	0 %	25 %	50 %	384423405
102	NC_017270	GCAG	2	8	45776	45783	25 %	0 %	50 %	25 %	384423405
103	NC_017270	AAGC	2	8	46037	46044	50 %	0 %	25 %	25 %	384423406
104	NC_017270	TCGC	2	8	46242	46249	0 %	25 %	25 %	50 %	384423406
105	NC_017270	CTCA	2	8	46561	46568	25 %	25 %	0 %	50 %	384423406
106	NC_017270	CAAT	2	8	46651	46658	50 %	25 %	0 %	25 %	384423406
107	NC_017270	GCTA	2	8	46965	46972	25 %	25 %	25 %	25 %	384423406
108	NC_017270	GCGA	2	8	49184	49191	25 %	0 %	50 %	25 %	384423409
109	NC_017270	CAGA	2	8	49449	49456	50 %	0 %	25 %	25 %	384423410
110	NC_017270	GCTA	2	8	50060	50067	25 %	25 %	25 %	25 %	384423411
111	NC_017270	GCCA	2	8	50164	50171	25 %	0 %	25 %	50 %	384423411
112	NC_017270	CGTG	2	8	50218	50225	0 %	25 %	50 %	25 %	384423411
113	NC_017270	AATG	2	8	51059	51066	50 %	25 %	25 %	0 %	384423412
114	NC_017270	AATC	2	8	51273	51280	50 %	25 %	0 %	25 %	384423412
115	NC_017270	CGAT	2	8	52159	52166	25 %	25 %	25 %	25 %	384423413
116	NC_017270	ATCC	2	8	52288	52295	25 %	25 %	0 %	50 %	384423414
117	NC_017270	AGTG	2	8	52454	52461	25 %	25 %	50 %	0 %	384423414
118	NC_017270	TGCT	2	8	52641	52648	0 %	50 %	25 %	25 %	384423415
119	NC_017270	CTAT	2	8	53023	53030	25 %	50 %	0 %	25 %	384423415
120	NC_017270	CAAG	2	8	59762	59769	50 %	0 %	25 %	25 %	384423417
121	NC_017270	AGTT	2	8	60498	60505	25 %	50 %	25 %	0 %	384423417
122	NC_017270	TTAA	2	8	61058	61065	50 %	50 %	0 %	0 %	384423417
123	NC_017270	TTGG	2	8	61188	61195	0 %	50 %	50 %	0 %	384423417
124	NC_017270	CAAA	2	8	61248	61255	75 %	0 %	0 %	25 %	384423417
125	NC_017270	GATT	2	8	61272	61279	25 %	50 %	25 %	0 %	384423417
126	NC_017270	CGCT	2	8	61957	61964	0 %	25 %	25 %	50 %	384423418
127	NC_017270	CTTG	2	8	62096	62103	0 %	50 %	25 %	25 %	384423418
128	NC_017270	GGTT	2	8	62733	62740	0 %	50 %	50 %	0 %	384423418
129	NC_017270	ATTG	2	8	62795	62802	25 %	50 %	25 %	0 %	384423418
130	NC_017270	GCCA	2	8	62947	62954	25 %	0 %	25 %	50 %	384423418
131	NC_017270	TGGT	2	8	63142	63149	0 %	50 %	50 %	0 %	384423419
132	NC_017270	TGGG	2	8	63458	63465	0 %	25 %	75 %	0 %	384423419
133	NC_017270	GATT	2	8	64113	64120	25 %	50 %	25 %	0 %	384423421
134	NC_017270	TGAA	2	8	65059	65066	50 %	25 %	25 %	0 %	384423422
135	NC_017270	AAGC	2	8	65190	65197	50 %	0 %	25 %	25 %	384423422
136	NC_017270	CTTT	2	8	65628	65635	0 %	75 %	0 %	25 %	384423422
137	NC_017270	AGCG	2	8	66559	66566	25 %	0 %	50 %	25 %	384423423
138	NC_017270	CGAT	2	8	67351	67358	25 %	25 %	25 %	25 %	384423423
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