MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Vibrio cholerae LMA3984-4 chromosome chromosome I

Total Repeats: 42053

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_017270	GC	3	6	262829	262834	0 %	0 %	50 %	50 %	384423594
4002	NC_017270	GCT	2	6	262877	262882	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384423594
4003	NC_017270	CAT	2	6	262915	262920	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384423594
4004	NC_017270	ATCA	2	8	262987	262994	50 %	25 %	0 %	25 %	384423594
4005	NC_017270	CAC	2	6	263101	263106	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384423594
4006	NC_017270	CCG	2	6	263132	263137	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384423594
4007	NC_017270	TGG	2	6	263184	263189	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384423594
4008	NC_017270	TAGG	2	8	263193	263200	25 %	25 %	50 %	0 %	384423594
4009	NC_017270	TTC	2	6	263254	263259	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384423594
4010	NC_017270	ACC	2	6	263261	263266	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384423594
4011	NC_017270	CTGC	2	8	263273	263280	0 %	25 %	25 %	50 %	384423594
4012	NC_017270	CAA	2	6	263346	263351	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384423594
4013	NC_017270	CGC	2	6	263365	263370	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384423594
4014	NC_017270	TGT	2	6	263469	263474	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384423594
4015	NC_017270	CG	3	6	263477	263482	0 %	0 %	50 %	50 %	384423594
4016	NC_017270	TGCGC	2	10	263519	263528	0 %	20 %	40 %	40 %	384423594
4017	NC_017270	TGGG	2	8	263531	263538	0 %	25 %	75 %	0 %	384423594
4018	NC_017270	GTG	2	6	263592	263597	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384423594
4019	NC_017270	GAT	2	6	263800	263805	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384423594
4020	NC_017270	ATC	2	6	263907	263912	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384423595
4021	NC_017270	ATCA	2	8	263936	263943	50 %	25 %	0 %	25 %	384423595
4022	NC_017270	GCA	2	6	264003	264008	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384423595
4023	NC_017270	GAA	2	6	264029	264034	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384423595
4024	NC_017270	CGG	2	6	264079	264084	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384423595
4025	NC_017270	GCCGAT	2	12	264134	264145	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	384423595
4026	NC_017270	CAG	2	6	264204	264209	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384423595
4027	NC_017270	TCAGC	2	10	264223	264232	20 %	20 %	20 %	40 %	384423595
4028	NC_017270	CCA	2	6	264277	264282	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384423595
4029	NC_017270	CCA	2	6	264312	264317	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384423595
4030	NC_017270	TCAAA	2	10	264328	264337	60 %	20 %	0 %	20 %	384423595
4031	NC_017270	CAC	2	6	264361	264366	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384423595
4032	NC_017270	ACGT	2	8	264377	264384	25 %	25 %	25 %	25 %	384423595
4033	NC_017270	TTTG	2	8	264385	264392	0 %	75 %	25 %	0 %	384423595
4034	NC_017270	CGA	2	6	264397	264402	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384423595
4035	NC_017270	GAT	2	6	264461	264466	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384423595
4036	NC_017270	ATG	2	6	264507	264512	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384423595
4037	NC_017270	AGA	2	6	264564	264569	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384423595
4038	NC_017270	CA	3	6	264614	264619	50 %	0 %	0 %	50 %	384423595
4039	NC_017270	GGCT	3	12	264620	264631	0 %	25 %	50 %	25 %	384423595
4040	NC_017270	TGT	3	9	264673	264681	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384423595
4041	NC_017270	AG	4	8	264683	264690	50 %	0 %	50 %	0 %	384423595
4042	NC_017270	CTT	2	6	264727	264732	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384423595
4043	NC_017270	TGG	2	6	264765	264770	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384423595
4044	NC_017270	TGA	2	6	264802	264807	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384423595
4045	NC_017270	CT	3	6	264837	264842	0 %	50 %	0 %	50 %	384423595
4046	NC_017270	CTT	2	6	264850	264855	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384423595
4047	NC_017270	AAG	2	6	264868	264873	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384423595
4048	NC_017270	AGT	2	6	264889	264894	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384423595
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4050	NC_017270	CAC	2	6	265025	265030	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384423595
4051	NC_017270	T	6	6	265050	265055	0 %	100 %	0 %	0 %	384423595
4052	NC_017270	GCA	2	6	265056	265061	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384423595
4053	NC_017270	CCG	2	6	265080	265085	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384423595
4054	NC_017270	CAGC	2	8	265108	265115	25 %	0 %	25 %	50 %	384423595
4055	NC_017270	CAC	3	9	265160	265168	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384423595
4056	NC_017270	TCA	2	6	265198	265203	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384423595
4057	NC_017270	CAT	2	6	265207	265212	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384423595
4058	NC_017270	GCC	2	6	265235	265240	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384423595
4059	NC_017270	CGTC	2	8	265269	265276	0 %	25 %	25 %	50 %	384423595
4060	NC_017270	CAT	2	6	265277	265282	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384423595
4061	NC_017270	GA	3	6	265362	265367	50 %	0 %	50 %	0 %	384423595
4062	NC_017270	CGC	2	6	265375	265380	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384423595
4063	NC_017270	CAA	2	6	265405	265410	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384423595
4064	NC_017270	GTT	2	6	265460	265465	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384423595
4065	NC_017270	CTG	2	6	265508	265513	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384423596
4066	NC_017270	ACA	2	6	265558	265563	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384423596
4067	NC_017270	GCG	2	6	265788	265793	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384423597
4068	NC_017270	A	7	7	265821	265827	100 %	0 %	0 %	0 %	384423597
4069	NC_017270	CAA	2	6	265892	265897	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384423597
4070	NC_017270	GCT	2	6	265954	265959	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384423597
4071	NC_017270	GATC	2	8	266032	266039	25 %	25 %	25 %	25 %	384423597
4072	NC_017270	GC	3	6	266070	266075	0 %	0 %	50 %	50 %	384423597
4073	NC_017270	A	7	7	266078	266084	100 %	0 %	0 %	0 %	384423597
4074	NC_017270	ATG	2	6	266088	266093	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384423597
4075	NC_017270	CTG	2	6	266095	266100	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384423597
4076	NC_017270	TAGAG	2	10	266148	266157	40 %	20 %	40 %	0 %	384423597
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4080	NC_017270	GACG	2	8	266622	266629	25 %	0 %	50 %	25 %	384423598
4081	NC_017270	GAA	2	6	266631	266636	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384423598
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4084	NC_017270	CG	3	6	266824	266829	0 %	0 %	50 %	50 %	384423598
4085	NC_017270	GAA	2	6	266852	266857	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384423598
4086	NC_017270	CAAG	2	8	266860	266867	50 %	0 %	25 %	25 %	384423598
4087	NC_017270	TTG	2	6	266926	266931	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384423598
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4089	NC_017270	GCA	2	6	266951	266956	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384423598
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4091	NC_017270	AGTG	2	8	267092	267099	25 %	25 %	50 %	0 %	384423598
4092	NC_017270	AAC	2	6	267216	267221	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384423598
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4097	NC_017270	CAG	2	6	267435	267440	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384423598
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4101	NC_017270	TGAG	2	8	267586	267593	25 %	25 %	50 %	0 %	384423598
4102	NC_017270	GCA	2	6	267599	267604	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384423598
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4104	NC_017270	TGC	2	6	267748	267753	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384423598
4105	NC_017270	TGT	2	6	267847	267852	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384423598
4106	NC_017270	GGT	2	6	267923	267928	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384423598
4107	NC_017270	TCA	2	6	268634	268639	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384423599
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4109	NC_017270	ATG	2	6	268691	268696	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384423599
4110	NC_017270	CTTC	2	8	268715	268722	0 %	50 %	0 %	50 %	384423599
4111	NC_017270	AGCG	2	8	268729	268736	25 %	0 %	50 %	25 %	384423599
4112	NC_017270	GCTG	2	8	268758	268765	0 %	25 %	50 %	25 %	384423599
4113	NC_017270	TTG	2	6	268773	268778	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384423599
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4118	NC_017270	CTTG	2	8	269041	269048	0 %	50 %	25 %	25 %	384423599
4119	NC_017270	TTGGT	2	10	269079	269088	0 %	60 %	40 %	0 %	384423599
4120	NC_017270	TTGG	2	8	269124	269131	0 %	50 %	50 %	0 %	384423599
4121	NC_017270	GC	3	6	269145	269150	0 %	0 %	50 %	50 %	384423599
4122	NC_017270	CTG	2	6	269175	269180	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384423599
4123	NC_017270	TCT	2	6	269258	269263	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384423599
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4127	NC_017270	CTG	2	6	269600	269605	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384423599
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4230	NC_017270	ACCAA	2	10	275172	275181	60 %	0 %	0 %	40 %	384423604
4231	NC_017270	TGAT	2	8	275193	275200	25 %	50 %	25 %	0 %	384423604
4232	NC_017270	GTTG	2	8	275235	275242	0 %	50 %	50 %	0 %	384423604
4233	NC_017270	GCC	2	6	275301	275306	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384423604
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4238	NC_017270	CCA	3	9	275563	275571	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384423604
4239	NC_017270	TCT	2	6	275674	275679	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384423604
4240	NC_017270	GTG	2	6	275701	275706	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384423604
4241	NC_017270	ATC	2	6	275715	275720	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384423604
4242	NC_017270	CAATC	2	10	275741	275750	40 %	20 %	0 %	40 %	384423604
4243	NC_017270	GTT	2	6	276003	276008	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384423604
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4246	NC_017270	GTG	2	6	276163	276168	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384423604
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4265	NC_017270	GCC	2	6	277397	277402	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384423605
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4347	NC_017270	GCT	2	6	281949	281954	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384423609
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4351	NC_017270	CG	3	6	282023	282028	0 %	0 %	50 %	50 %	384423609
4352	NC_017270	TCA	2	6	282035	282040	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384423609
4353	NC_017270	GCG	2	6	282050	282055	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384423609
4354	NC_017270	AG	3	6	282056	282061	50 %	0 %	50 %	0 %	384423609
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4357	NC_017270	T	7	7	282207	282213	0 %	100 %	0 %	0 %	384423609
4358	NC_017270	GGCA	2	8	282271	282278	25 %	0 %	50 %	25 %	384423609
4359	NC_017270	CGA	2	6	282291	282296	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384423609
4360	NC_017270	ATC	2	6	282317	282322	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384423609
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4362	NC_017270	AGC	2	6	282383	282388	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384423609
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4364	NC_017270	CCT	2	6	282411	282416	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384423609
4365	NC_017270	AAGG	2	8	282512	282519	50 %	0 %	50 %	0 %	384423609
4366	NC_017270	GAT	2	6	282545	282550	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384423609
4367	NC_017270	TCT	2	6	282612	282617	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384423609
4368	NC_017270	CG	3	6	282712	282717	0 %	0 %	50 %	50 %	384423609
4369	NC_017270	T	7	7	282721	282727	0 %	100 %	0 %	0 %	384423609
4370	NC_017270	T	6	6	282886	282891	0 %	100 %	0 %	0 %	384423610
4371	NC_017270	CAT	2	6	282925	282930	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384423610
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4377	NC_017270	GTA	2	6	283124	283129	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384423610
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4390	NC_017270	TGA	2	6	284454	284459	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384423612
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4394	NC_017270	AGT	2	6	284600	284605	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384423612
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4396	NC_017270	AGTACC	2	12	284761	284772	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	384423612
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4401	NC_017270	TTG	2	6	285461	285466	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384423613
4402	NC_017270	ATC	2	6	285498	285503	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384423613
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4404	NC_017270	ATC	2	6	285573	285578	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384423613
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4425	NC_017270	AAC	2	6	286750	286755	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384423614
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4469	NC_017270	CGA	2	6	289902	289907	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384423616
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4484	NC_017270	GTTG	2	8	290991	290998	0 %	50 %	50 %	0 %	384423618
4485	NC_017270	GTGCT	2	10	290999	291008	0 %	40 %	40 %	20 %	384423618
4486	NC_017270	GCT	2	6	291018	291023	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384423618
4487	NC_017270	T	6	6	291097	291102	0 %	100 %	0 %	0 %	384423618
4488	NC_017270	GC	3	6	291164	291169	0 %	0 %	50 %	50 %	384423618
4489	NC_017270	C	6	6	291193	291198	0 %	0 %	0 %	100 %	384423618
4490	NC_017270	CTTG	2	8	291216	291223	0 %	50 %	25 %	25 %	384423618
4491	NC_017270	TGC	2	6	291320	291325	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384423618
4492	NC_017270	AGC	2	6	291347	291352	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384423618
4493	NC_017270	GC	3	6	291415	291420	0 %	0 %	50 %	50 %	384423618
4494	NC_017270	TCAG	2	8	291434	291441	25 %	25 %	25 %	25 %	384423618
4495	NC_017270	GCA	2	6	291525	291530	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384423618
4496	NC_017270	ATG	2	6	291551	291556	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384423618
4497	NC_017270	ATG	2	6	291590	291595	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384423618
4498	NC_017270	CCGAG	2	10	291642	291651	20 %	0 %	40 %	40 %	384423618
4499	NC_017270	CAC	2	6	291652	291657	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384423618
4500	NC_017270	AGC	2	6	291660	291665	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384423618

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