MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Vibrio cholerae LMA3984-4 chromosome chromosome I

Total Repeats: 42053

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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502	NC_017270	AAC	3	9	32510	32518	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384423392
503	NC_017270	CGC	2	6	32615	32620	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384423392
504	NC_017270	CTTCCA	2	12	32722	32733	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	384423392
505	NC_017270	ACC	2	6	32780	32785	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384423392
506	NC_017270	CTG	2	6	32831	32836	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384423392
507	NC_017270	ATG	2	6	32850	32855	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384423392
508	NC_017270	GAC	2	6	32903	32908	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384423392
509	NC_017270	GAA	2	6	32913	32918	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384423392
510	NC_017270	CTT	2	6	32953	32958	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384423392
511	NC_017270	GCCAT	2	10	33202	33211	20 %	20 %	20 %	40 %	384423393
512	NC_017270	TTG	2	6	33257	33262	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384423393
513	NC_017270	TGCG	2	8	33376	33383	0 %	25 %	50 %	25 %	384423393
514	NC_017270	TGGG	2	8	33465	33472	0 %	25 %	75 %	0 %	384423393
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517	NC_017270	GTG	2	6	33752	33757	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384423393
518	NC_017270	TCT	2	6	33801	33806	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384423393
519	NC_017270	CTT	2	6	33835	33840	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384423393
520	NC_017270	CAC	2	6	33881	33886	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384423393
521	NC_017270	GCG	2	6	33890	33895	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384423393
522	NC_017270	TGG	2	6	34133	34138	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384423394
523	NC_017270	TCG	2	6	34142	34147	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384423394
524	NC_017270	TTTG	2	8	34251	34258	0 %	75 %	25 %	0 %	384423394
525	NC_017270	GCT	2	6	34311	34316	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384423394
526	NC_017270	TTG	2	6	34322	34327	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384423394
527	NC_017270	GAA	2	6	34398	34403	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384423394
528	NC_017270	CGG	2	6	34425	34430	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384423394
529	NC_017270	GT	3	6	34508	34513	0 %	50 %	50 %	0 %	384423394
530	NC_017270	CAAT	2	8	34682	34689	50 %	25 %	0 %	25 %	384423394
531	NC_017270	GTT	2	6	34743	34748	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384423394
532	NC_017270	CGC	2	6	34749	34754	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384423394
533	NC_017270	GC	3	6	34753	34758	0 %	0 %	50 %	50 %	384423394
534	NC_017270	CAT	2	6	34761	34766	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384423394
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536	NC_017270	A	6	6	34882	34887	100 %	0 %	0 %	0 %	384423394
537	NC_017270	TAAAG	2	10	34921	34930	60 %	20 %	20 %	0 %	384423394
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539	NC_017270	TGT	2	6	35058	35063	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384423394
540	NC_017270	TTG	2	6	35078	35083	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384423394
541	NC_017270	TTC	2	6	35101	35106	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384423394
542	NC_017270	AAG	2	6	35171	35176	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384423394
543	NC_017270	GGC	2	6	35200	35205	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384423394
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546	NC_017270	CAAG	2	8	35289	35296	50 %	0 %	25 %	25 %	384423394
547	NC_017270	ACA	2	6	35340	35345	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384423394
548	NC_017270	GCA	2	6	35346	35351	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384423394
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553	NC_017270	CTT	2	6	36092	36097	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384423395
554	NC_017270	AGA	2	6	36109	36114	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384423395
555	NC_017270	AGT	2	6	36160	36165	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384423395
556	NC_017270	TTC	2	6	36174	36179	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384423395
557	NC_017270	TTTC	2	8	36352	36359	0 %	75 %	0 %	25 %	384423396
558	NC_017270	GCTGTT	2	12	36373	36384	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	384423396
559	NC_017270	T	7	7	36383	36389	0 %	100 %	0 %	0 %	384423396
560	NC_017270	GCG	2	6	36417	36422	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384423396
561	NC_017270	GCA	2	6	36823	36828	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384423397
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564	NC_017270	TTG	2	6	36922	36927	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384423397
565	NC_017270	CAA	2	6	36965	36970	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384423397
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577	NC_017270	TGA	2	6	37997	38002	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384423398
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596	NC_017270	TGA	2	6	39124	39129	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384423400
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601	NC_017270	GAC	2	6	39395	39400	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384423400
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605	NC_017270	GC	3	6	39625	39630	0 %	0 %	50 %	50 %	384423400
606	NC_017270	GCC	2	6	39671	39676	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384423400
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608	NC_017270	CG	4	8	39803	39810	0 %	0 %	50 %	50 %	384423400
609	NC_017270	GCT	2	6	39812	39817	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384423400
610	NC_017270	C	6	6	39860	39865	0 %	0 %	0 %	100 %	384423400
611	NC_017270	CCCAC	2	10	39909	39918	20 %	0 %	0 %	80 %	384423400
612	NC_017270	ATC	2	6	39965	39970	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384423400
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616	NC_017270	CCA	2	6	40177	40182	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384423400
617	NC_017270	ATG	2	6	40191	40196	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384423400
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620	NC_017270	GAT	2	6	40295	40300	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384423400
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622	NC_017270	T	6	6	40390	40395	0 %	100 %	0 %	0 %	384423401
623	NC_017270	GAC	2	6	40411	40416	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384423401
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756	NC_017270	CTG	2	6	47239	47244	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384423407
757	NC_017270	TGA	2	6	47334	47339	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384423407
758	NC_017270	ATC	2	6	47350	47355	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384423407
759	NC_017270	GCT	2	6	47412	47417	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384423407
760	NC_017270	GCC	2	6	47494	47499	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384423408
761	NC_017270	GCA	2	6	47542	47547	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384423408
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763	NC_017270	ATG	2	6	47633	47638	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384423408
764	NC_017270	ATC	2	6	47644	47649	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384423408
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768	NC_017270	AAAAG	2	10	47960	47969	80 %	0 %	20 %	0 %	384423408
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777	NC_017270	TTC	2	6	48709	48714	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384423409
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784	NC_017270	CAT	2	6	49192	49197	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384423409
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786	NC_017270	AC	3	6	49227	49232	50 %	0 %	0 %	50 %	384423409
787	NC_017270	CTC	2	6	49243	49248	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384423410
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822	NC_017270	GAT	2	6	51050	51055	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384423412
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824	NC_017270	TA	3	6	51089	51094	50 %	50 %	0 %	0 %	384423412
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839	NC_017270	GGT	2	6	51840	51845	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384423413
840	NC_017270	GCG	2	6	51846	51851	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384423413
841	NC_017270	TTA	2	6	51870	51875	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384423413
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856	NC_017270	CAT	2	6	52727	52732	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384423415
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863	NC_017270	CTAT	2	8	53023	53030	25 %	50 %	0 %	25 %	384423415
864	NC_017270	TCA	2	6	53084	53089	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384423415
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867	NC_017270	TAT	2	6	59254	59259	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384423416
868	NC_017270	GCA	2	6	59389	59394	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384423416
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870	NC_017270	CTG	2	6	59451	59456	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384423416
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873	NC_017270	GAAGC	2	10	59774	59783	40 %	0 %	40 %	20 %	384423417
874	NC_017270	TG	3	6	59948	59953	0 %	50 %	50 %	0 %	384423417
875	NC_017270	AG	3	6	60023	60028	50 %	0 %	50 %	0 %	384423417
876	NC_017270	AC	3	6	60053	60058	50 %	0 %	0 %	50 %	384423417
877	NC_017270	TCG	2	6	60247	60252	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384423417
878	NC_017270	TCA	2	6	60259	60264	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384423417
879	NC_017270	CAG	2	6	60281	60286	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384423417
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882	NC_017270	CAT	2	6	60370	60375	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384423417
883	NC_017270	ATC	2	6	60390	60395	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384423417
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999	NC_017270	GAT	2	6	69467	69472	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384423424
1000	NC_017270	GCT	2	6	69587	69592	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384423424

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